BioLiP

>protein
SMKIDVVTIFPEYLQPVRQSLPGKAIDAGLVDVAVHDLRRWTHDVHKSVDDSPYGGGPGMVMKPTVWGDALDEICTSETL
LVVPTPAGYPFTQETAWQWSTEDHLVIACGRYEGIDQRVADDAATRMRVREVSIGDYVLNGGEAAALVIIEAVLRLVPGV
LGNSLLEGPSYTRPPSWRGMDVPPVLLSGDHAKIAAWRAEQSRQRTIERRPDLL

The query sequence (length=214) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6qrb:A	220	219	1.0000	0.9727	0.9772	5.81e-155	6nw6:A, 6nw6:B, 6nw7:A, 6nw7:B, 6qo2:A, 6qo2:B, 6qo3:A, 6qo3:B, 6qo4:A, 6qo4:B, 6qo6:A, 6qo6:B, 6qoa:A, 6qoa:B, 6qoc:A, 6qoc:B, 6qod:A, 6qod:B, 6qoe:B, 6qof:A, 6qof:B, 6qog:A, 6qoh:A, 6qoh:B, 6qoi:A, 6qoi:B, 6qoj:A, 6qoj:B, 6qok:A, 6qok:B, 6qol:A, 6qol:B, 6qom:A, 6qon:A, 6qon:B, 6qoo:A, 6qoo:B, 6qop:A, 6qop:B, 6qoq:A, 6qoq:B, 6qor:A, 6qor:B, 6qos:A, 6qos:B, 6qot:A, 6qot:B, 6qou:A, 6qou:B, 6qov:A, 6qov:B, 6qow:A, 6qow:B, 6qox:B, 6qqq:A, 6qqq:B, 6qqr:B, 6qqs:A, 6qqt:A, 6qqt:B, 6qqu:A, 6qqu:B, 6qqv:A, 6qqv:B, 6qqw:A, 6qqx:A, 6qqx:B, 6qqy:A, 6qqy:B, 6qqz:A, 6qr0:A, 6qr1:A, 6qr2:A, 6qr3:A, 6qr3:B, 6qr4:A, 6qr4:B, 6qr5:A, 6qr6:A, 6qr6:B, 6qr7:A, 6qr7:B, 6qr8:A, 6qr8:B, 6qr9:A, 6qr9:B, 6qra:A, 6qra:B, 6qrb:B, 6qrc:A, 6qrc:B, 6qrd:A, 6qrd:B, 6qre:A, 6qre:B, 6qrf:A, 6qrg:A, 6qrg:B, 7rez:A, 7rez:B, 7rf0:A, 7rf0:B
2	6qqs:B	204	214	0.9299	0.9755	0.9299	1.04e-137	6qqw:B, 6qqz:B, 6qr0:B, 6qr1:B, 6qr2:B, 6qr5:B, 6qrf:B
3	5zhk:A	208	212	0.7617	0.7837	0.7689	2.92e-116	6jof:A, 5zhj:A, 5zhl:A
4	6w15:A	202	213	0.7430	0.7871	0.7465	4.36e-112
5	8fci:A	197	214	0.7196	0.7817	0.7196	1.02e-103	8fci:B
6	7kff:A	249	229	0.6963	0.5984	0.6507	3.86e-102
7	4ig6:A	223	227	0.4907	0.4709	0.4626	4.21e-65
8	8b1n:B	410	225	0.4533	0.2366	0.4311	8.04e-54
9	8b1n:A	433	225	0.4533	0.2240	0.4311	1.16e-53	8byh:A, 8byh:B, 8ri0:A, 8ri0:B
10	1p9p:A	235	217	0.4393	0.4000	0.4332	3.96e-53
11	8apw:A	250	223	0.4299	0.3680	0.4126	1.60e-49	8apt:A, 8apu:A, 8apv:A, 3axz:A, 5d9f:A, 4mcb:A, 4mcb:B, 4mcc:A, 4mcc:B, 4mcd:A, 1uak:A, 1ual:A, 1uam:A, 4ypw:A, 4ypx:A, 4ypy:A, 4ypz:A, 4yq0:A, 4yq1:A, 4yq2:A, 4yq3:A, 4yq4:A, 4yq5:A, 4yq6:A, 4yq7:A, 4yq8:A, 4yq9:A, 4yqa:A, 4yqb:A, 4yqc:A, 4yqd:A, 4yqg:A, 4yqi:A, 4yqj:A, 4yqk:A, 4yql:A, 4yqn:A, 4yqo:A, 4yqp:A, 4yqq:A, 4yqr:A, 4yqs:A, 4yqt:A, 4yvg:A, 4yvh:A, 4yvi:A, 4yvi:B, 4yvj:A, 4yvj:B, 4yvk:A, 4yvk:B
12	5wyr:B	248	227	0.4206	0.3629	0.3965	1.30e-46	6afk:A, 6afk:B, 6jki:A, 6jki:B, 6joe:A, 6joe:B, 5wyq:A, 5wyq:B, 5wyr:A, 5zhm:A, 5zhm:B, 5zhn:A, 5zhn:B
13	7mys:A	239	222	0.3738	0.3347	0.3604	6.97e-44	7mys:B
14	4h3z:B	256	233	0.3972	0.3320	0.3648	1.01e-41	4h3y:A, 4h3y:B, 4h3z:A
15	7fjg:A	384	144	0.1776	0.0990	0.2639	0.010	8i29:A
16	3af5:A	638	61	0.1028	0.0345	0.3607	0.87	3af6:A
17	3eh1:A	737	96	0.1215	0.0353	0.2708	0.89
18	5edu:B	723	73	0.1075	0.0318	0.3151	0.94	5edu:A, 5iqz:A
19	9bct:M	648	43	0.0748	0.0247	0.3721	1.3	9bct:J, 9bcu:J, 9bcu:M
20	6ieh:B	929	48	0.0794	0.0183	0.3542	1.6	6ieg:B, 7s7b:A, 7s7b:E, 7s7c:A
21	3ht5:A	335	57	0.0981	0.0627	0.3684	3.5	5u3f:A, 5u3f:B
22	3dtf:A	363	56	0.0981	0.0579	0.3750	4.1	3dtf:B, 3dtg:A, 3dtg:B, 3jz6:A, 3jz6:B
23	6s18:A	143	37	0.0561	0.0839	0.3243	4.9	6s18:B, 6s38:A, 6s38:B
24	2ynm:D	488	49	0.0701	0.0307	0.3061	6.7
25	4xfj:B	397	47	0.0701	0.0378	0.3191	6.9	4xfj:A
26	6p25:B	690	29	0.0467	0.0145	0.3448	8.5	6p2r:B
27	8u19:A	403	44	0.0607	0.0323	0.2955	8.9	8u09:A, 8u1i:A
28	5gvh:A	311	54	0.0794	0.0547	0.3148	8.9

[Back]