BioLiP

>protein
SMKIDVVTIFPEYLQPVRQAGLVDVAVHDLRRWTHDVSVDDSPYGGGPGMVMKPTVWGDALDEICTSETLLVVPTPAGYP
FTQETAWQWSTEDHLVIACGRYEGIDQRVADDAATRMRVREVSIGDYVLNGGEAAALVIIEAVLRLVPGVSLLEGPSYTR
PPSWRGMDVPPVLLSGDHAKIAAWRAEQSRQRTIERRPDLLGFDSP

The query sequence (length=206) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6qqs:B	204	206	0.9903	1.0000	0.9903	3.87e-147	6qqw:B, 6qqz:B, 6qr0:B, 6qr1:B, 6qr2:B, 6qr5:B, 6qrf:B
2	6qrb:A	220	219	0.9757	0.9136	0.9178	4.98e-139	6nw6:A, 6nw6:B, 6nw7:A, 6nw7:B, 6qo2:A, 6qo2:B, 6qo3:A, 6qo3:B, 6qo4:A, 6qo4:B, 6qo6:A, 6qo6:B, 6qoa:A, 6qoa:B, 6qoc:A, 6qoc:B, 6qod:A, 6qod:B, 6qoe:B, 6qof:A, 6qof:B, 6qog:A, 6qoh:A, 6qoh:B, 6qoi:A, 6qoi:B, 6qoj:A, 6qoj:B, 6qok:A, 6qok:B, 6qol:A, 6qol:B, 6qom:A, 6qon:A, 6qon:B, 6qoo:A, 6qoo:B, 6qop:A, 6qop:B, 6qoq:A, 6qoq:B, 6qor:A, 6qor:B, 6qos:A, 6qos:B, 6qot:A, 6qot:B, 6qou:A, 6qou:B, 6qov:A, 6qov:B, 6qow:A, 6qow:B, 6qox:B, 6qqq:A, 6qqq:B, 6qqr:B, 6qqs:A, 6qqt:A, 6qqt:B, 6qqu:A, 6qqu:B, 6qqv:A, 6qqv:B, 6qqw:A, 6qqx:A, 6qqx:B, 6qqy:A, 6qqy:B, 6qqz:A, 6qr0:A, 6qr1:A, 6qr2:A, 6qr3:A, 6qr3:B, 6qr4:A, 6qr4:B, 6qr5:A, 6qr6:A, 6qr6:B, 6qr7:A, 6qr7:B, 6qr8:A, 6qr8:B, 6qr9:A, 6qr9:B, 6qra:A, 6qra:B, 6qrb:B, 6qrc:A, 6qrc:B, 6qrd:A, 6qrd:B, 6qre:A, 6qre:B, 6qrf:A, 6qrg:A, 6qrg:B, 7rez:A, 7rez:B, 7rf0:A, 7rf0:B
3	6w15:A	202	202	0.7670	0.7822	0.7822	1.27e-109
4	5zhk:A	208	209	0.7524	0.7452	0.7416	3.18e-105	6jof:A, 5zhj:A, 5zhl:A
5	8fci:A	197	204	0.7379	0.7716	0.7451	7.12e-101	8fci:B
6	7kff:A	249	229	0.6796	0.5622	0.6114	3.29e-89
7	4ig6:A	223	227	0.4903	0.4529	0.4449	3.09e-56
8	8b1n:B	410	225	0.4320	0.2171	0.3956	5.01e-45
9	8b1n:A	433	225	0.4320	0.2055	0.3956	7.06e-45	8byh:A, 8byh:B, 8ri0:A, 8ri0:B
10	1p9p:A	235	217	0.4369	0.3830	0.4147	2.52e-43
11	8apw:A	250	223	0.4320	0.3560	0.3991	6.16e-42	8apt:A, 8apu:A, 8apv:A, 3axz:A, 5d9f:A, 4mcb:A, 4mcb:B, 4mcc:A, 4mcc:B, 4mcd:A, 1uak:A, 1ual:A, 1uam:A, 4ypw:A, 4ypx:A, 4ypy:A, 4ypz:A, 4yq0:A, 4yq1:A, 4yq2:A, 4yq3:A, 4yq4:A, 4yq5:A, 4yq6:A, 4yq7:A, 4yq8:A, 4yq9:A, 4yqa:A, 4yqb:A, 4yqc:A, 4yqd:A, 4yqg:A, 4yqi:A, 4yqj:A, 4yqk:A, 4yql:A, 4yqn:A, 4yqo:A, 4yqp:A, 4yqq:A, 4yqr:A, 4yqs:A, 4yqt:A, 4yvg:A, 4yvh:A, 4yvi:A, 4yvi:B, 4yvj:A, 4yvj:B, 4yvk:A, 4yvk:B
12	7mys:A	239	228	0.3883	0.3347	0.3509	1.74e-39	7mys:B
13	5wyr:B	248	227	0.4223	0.3508	0.3833	4.71e-39	6afk:A, 6afk:B, 6jki:A, 6jki:B, 6joe:A, 6joe:B, 5wyq:A, 5wyq:B, 5wyr:A, 5zhm:A, 5zhm:B, 5zhn:A, 5zhn:B
14	4h3z:B	256	233	0.4126	0.3320	0.3648	5.02e-39	4h3y:A, 4h3y:B, 4h3z:A
15	2ynm:D	488	57	0.0971	0.0410	0.3509	0.088
16	3nns:A	117	84	0.1019	0.1795	0.2500	0.18	3nns:B
17	4ec0:B	200	72	0.0825	0.0850	0.2361	5.1	5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
18	6s18:A	143	37	0.0583	0.0839	0.3243	5.3	6s18:B, 6s38:A, 6s38:B
19	4w5k:A	380	106	0.1456	0.0789	0.2830	6.5	4w5k:B
20	4xfj:B	397	47	0.0728	0.0378	0.3191	6.9	4xfj:A
21	3eh1:A	737	96	0.1262	0.0353	0.2708	8.1
22	6p25:B	690	29	0.0485	0.0145	0.3448	8.6	6p2r:B

[Back]