BioLiP

>protein
SMKFQYKEDHPFEYRKKEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARVPDLDKRKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRPEDALFFF
VNNTIPPTSATMGQLYEDNHEEDYFLYVAYSDESV

The query sequence (length=115) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5yip:A	123	114	0.9913	0.9268	1.0000	7.46e-81	7aa7:A, 7aa7:B, 7aa9:A, 7aa9:E, 7aa9:C, 7aa9:I, 7aa9:G, 7aa9:K, 7cdb:A, 7cdb:B, 6hoi:B, 6hoi:A, 6hol:A, 6hol:B, 7jhx:A, 7jhx:B, 2l8j:A, 5lxh:A, 5lxh:B, 5lxh:C, 5lxi:D, 5lxi:B, 8x8a:A, 6yoo:A
2	3dow:A	119	115	0.8696	0.8403	0.8696	6.54e-72	6a9x:D, 8afi:E, 8afi:G, 8afi:A, 8afi:I, 8afi:M, 8afi:O, 8afi:C, 8afi:K, 7bv4:A, 7bv4:E, 7bv4:B, 7bv4:G, 3d32:A, 3d32:B, 7ea7:B, 7fb5:A, 8t2n:A, 8t2n:C, 8t31:A, 8t31:C, 8t31:E, 8t31:G, 8t31:I, 8t32:A, 8t33:A, 7vec:A, 7vec:B, 7vec:C, 7vec:D, 7vec:E, 7vec:F, 7vec:G, 7vec:H, 7vec:I, 7vec:J, 7vec:L, 8w6a:A, 8w6a:G, 8w6a:B, 8w6a:D, 3wim:A, 4xc2:A, 4xc2:B, 4xc2:C, 4xc2:D, 5yir:D, 5yir:A, 5yir:B, 7zkr:A, 7zl7:C, 7zl7:A
3	5azf:A	119	114	0.7739	0.7479	0.7807	2.39e-63	5azf:B, 5azg:A, 5azg:B, 8tgf:A
4	6h8c:A	116	113	0.6000	0.5948	0.6106	4.28e-47
5	7brn:A	133	115	0.5565	0.4812	0.5565	1.41e-44	3vxw:A, 6wy6:A, 6wy6:B, 2zpn:A, 2zpn:D, 2zpn:B, 2zpn:C
6	5l83:B	112	110	0.5391	0.5536	0.5636	2.96e-44	5l83:A
7	6aaf:A	112	110	0.5391	0.5536	0.5636	2.95e-43
8	3h9d:B	116	111	0.4522	0.4483	0.4685	1.82e-35
9	4eoy:A	124	117	0.4087	0.3790	0.4017	1.62e-26	4eoy:B, 4eoy:C
10	5dpw:A	115	110	0.3826	0.3826	0.4000	4.23e-25	5dpw:C, 5dpw:E, 5dpw:G, 5dpw:I, 5dpw:K, 5dpw:M, 5dpw:O
11	5cx3:A	119	110	0.3304	0.3193	0.3455	1.96e-19	5cx3:B, 5cx3:C, 5cx3:D, 7r9w:A, 7r9z:A, 7ra0:A, 6tbe:A
12	5e6o:A	117	110	0.3478	0.3419	0.3636	3.74e-18	5e6o:B, 5e6o:C, 5e6o:D
13	7elg:A	122	110	0.3130	0.2951	0.3273	1.12e-17	5d94:A, 7ga8:A, 7ga9:A, 7gaa:A, 7gab:A, 7gac:A, 7gad:A, 7gae:A, 7gaf:A, 7gag:A, 7gah:A, 7gai:A, 7gaj:A, 7gak:A, 7gal:A, 7gam:A, 7gan:A, 7gao:A, 7gaq:A, 7gar:A, 7gas:A, 5gmv:B, 5gmv:A, 2k6q:A, 2lue:A, 2n9x:A, 8q7k:A, 8q7k:B, 5wrd:A, 5wrd:B, 5xad:A, 5xad:B, 5yiq:A, 5yis:B, 5yis:A, 2zjd:A, 2zjd:C
14	4naw:A	88	56	0.1391	0.1818	0.2857	0.43	4naw:E, 4naw:I, 4naw:M
15	5ykt:A	453	28	0.0870	0.0221	0.3571	0.48	5ykt:B
16	1j78:B	447	36	0.1130	0.0291	0.3611	1.0	1j7e:A, 1j7e:B
17	4o6h:B	204	25	0.1043	0.0588	0.4800	2.2	8cnl:B, 8cnl:A, 8cnl:C, 8cnl:D, 8cnl:E, 8cnl:F, 8cnl:G, 8cnl:H, 4o6h:A, 4o6h:C, 4o6h:D, 4o6h:E, 4o6h:F, 4o6h:G, 4o6h:H, 4o6i:A, 4o6i:B
18	4ar9:A	392	72	0.1826	0.0536	0.2917	3.8	4ar8:A, 4ar8:B, 4ar9:B
19	7mjy:A	448	73	0.1652	0.0424	0.2603	5.2	7mjv:A, 7mjw:A, 7mjw:B, 7mjx:B, 7mjx:A, 7mjz:A
20	6z1p:Ao	330	26	0.0870	0.0303	0.3846	6.3
21	1glc:F	161	19	0.0609	0.0435	0.3684	7.9	1f3z:A, 1gle:F, 2mp0:B, 1o2f:A
22	1ec9:D	444	18	0.0870	0.0225	0.5556	9.6	1ec7:A, 1ec7:B, 1ec7:C, 1ec7:D, 1ec8:A, 1ec8:B, 1ec8:C, 1ec8:D, 1ec9:A, 1ec9:B, 1ec9:C, 1ecq:A, 1ecq:B, 1ecq:C, 1ecq:D, 4gyp:A, 4gyp:B, 1jct:A, 1jct:B, 1jdf:A, 1jdf:B, 1jdf:C, 1jdf:D, 3pwg:A, 3pwg:B, 3pwg:C, 3pwg:D, 3pwi:A, 3pwi:B

[Back]