BioLiP

>protein
SMAFPKRLEYGGHALVWSGDWSAAGARKAIAGAARAGYDYIEIALLDPWQIDVALTKDLLQEYNLRAHASLGLSAATDVT
STDPAIVAKGDELLRKATDVLYALGGSELCGVIYCALGKYPGPASRENRANSVAAMQRLADYAADKGINIDLEVVNRYET
NIMNTGLEGLAFLDEVNRPNAFLHLDTYHMNIEENGMAKSVLAAGDRLGYVHIGESHRGYLGTGNVDFASFFAALKQIDY
RGPITFESFSSEIVDPKLSNTLCVWRNLWHDSDDLAGKALEFIKQRY

The query sequence (length=287) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7cj5:A	292	285	0.9930	0.9760	1.0000	0.0	7cj4:A, 7cj4:B, 7cj5:B, 7cj6:A, 7cj6:B, 7cj7:A, 7cj7:B, 7cj8:A, 7cj8:B, 7cj8:C, 7cj8:D, 7cj8:E, 7cj8:F, 7cj9:A, 7cj9:B, 7cj9:C, 7cj9:D, 7cj9:E, 7cj9:F, 7cj9:G, 7cj9:H
2	5zfs:B	294	279	0.5331	0.5204	0.5484	6.28e-109	5zfs:A
3	3vyl:A	297	273	0.3972	0.3838	0.4176	1.04e-74	3vyl:B, 3vyl:C, 3vyl:D, 3vyl:E, 3vyl:F, 3vyl:G, 3vyl:H
4	7ern:C	284	278	0.3554	0.3592	0.3669	5.64e-56	7erm:A, 7erm:B, 7erm:C, 7erm:D, 7ern:A, 7ern:B, 7ern:D, 7ero:A, 7ero:B, 7ero:C, 7ero:D
5	7dz4:C	286	279	0.3519	0.3531	0.3620	2.61e-55	7dz2:A, 7dz2:B, 7dz2:C, 7dz2:D, 7dz3:A, 7dz3:B, 7dz3:C, 7dz3:D, 7dz4:A, 7dz4:B, 7dz4:D, 7dz5:A, 7dz5:B, 7dz5:C, 7dz5:D, 7dz6:A, 7dz6:B, 7dz6:C, 7dz6:D
6	4pfh:A	298	283	0.3101	0.2987	0.3145	4.42e-39	5j8l:A, 5j8l:B, 5j8l:C, 5j8l:D, 2ou4:A, 2ou4:B, 2ou4:C, 2ou4:D, 4pfh:B, 4pgl:A, 4pgl:B, 4pgl:C, 4pgl:D, 4q7i:A, 4q7i:B, 2qul:A, 2qul:B, 2qul:C, 2qul:D, 2qum:A, 2qum:B, 2qum:C, 2qum:D, 2qun:A, 2qun:B, 2qun:C, 2qun:D, 4xsl:A, 4xsl:B, 4xsl:C, 4xsl:D, 4xsm:A, 4xsm:B, 4xsm:C, 4xsm:D, 4ytq:A, 4ytq:B, 4ytq:C, 4ytq:D, 4ytr:A, 4ytr:B, 4ytr:C, 4ytr:D, 4yts:A, 4yts:B, 4yts:C, 4yts:D, 4ytt:A, 4ytt:B, 4ytt:C, 4ytt:D, 4ytu:A, 4ytu:B, 4ytu:C, 4ytu:D
7	2hk1:A	289	266	0.2718	0.2699	0.2932	1.32e-32	2hk1:B, 2hk1:C, 2hk1:D
8	3vnl:A	291	272	0.2578	0.2543	0.2721	6.41e-27	7e9w:A, 7e9w:B, 7e9w:C, 7e9w:D, 3vni:A, 3vni:B, 3vni:C, 3vni:D, 3vnj:A, 3vnj:B, 3vnj:C, 3vnj:D, 3vnk:A, 3vnk:B, 3vnk:C, 3vnk:D, 3vnl:B, 3vnl:C, 3vnl:D, 3vnm:A, 3vnm:B, 3vnm:C, 3vnm:D
9	7x7w:A	288	290	0.2892	0.2882	0.2862	8.79e-27	7x7w:B
10	5h1w:A	270	244	0.2718	0.2889	0.3197	3.60e-26	5b7y:A, 5b7y:B, 5b80:A, 5b80:B, 5h1w:B, 5h6h:A, 5h6h:B
11	6wn6:B	264	223	0.2091	0.2273	0.2691	1.95e-15	6wn6:A, 6wn6:C, 6wn6:D
12	2qw5:A	327	230	0.1986	0.1743	0.2478	1.17e-12	2qw5:B
13	1i6n:A	278	234	0.1951	0.2014	0.2393	5.44e-09
14	3kws:A	265	176	0.1568	0.1698	0.2557	7.54e-09	3kws:B
15	3cqj:A	276	182	0.1638	0.1703	0.2582	3.44e-07	3cqj:B, 3cqk:A, 3cqk:B
16	3ngf:B	260	213	0.1568	0.1731	0.2113	5.14e-06	3ngf:A
17	3tva:A	282	152	0.1429	0.1454	0.2697	1.89e-05	3tva:B
18	1k77:A	260	228	0.1812	0.2000	0.2281	1.31e-04
19	3wqo:A	271	125	0.1045	0.1107	0.2400	0.003	3wqo:B
20	5hmq:D	624	130	0.0976	0.0449	0.2154	0.030	5hmq:A, 5hmq:B, 5hmq:C, 5hmq:E, 5hmq:F
21	6yx5:B	339	71	0.0732	0.0619	0.2958	0.16
22	7vpf:A	273	133	0.1010	0.1062	0.2180	0.23	7vpf:B
23	6mss:A	181	69	0.0697	0.1105	0.2899	0.36
24	1txo:B	236	22	0.0523	0.0636	0.6818	0.64	2cm1:A, 1txo:A
25	5vkt:A	353	43	0.0557	0.0453	0.3721	0.96	5vkt:B
26	5j7i:B	456	85	0.0976	0.0614	0.3294	1.8	5j7i:C, 5j7i:D
27	3zd7:A	623	128	0.1045	0.0482	0.2344	2.6	8g7t:C
28	5x7o:A	1247	123	0.1045	0.0241	0.2439	2.8	5x7o:B, 5x7p:B, 5x7p:A, 5x7q:A, 5x7q:B, 5x7r:A, 5x7r:B, 5x7s:A, 5x7s:B
29	1yqd:A	359	35	0.0488	0.0390	0.4000	4.5	1yqd:B, 1yqx:A, 1yqx:B
30	1e6y:F	247	52	0.0662	0.0769	0.3654	6.5	1e6y:C, 8gf5:E
31	2c1w:B	276	67	0.0662	0.0688	0.2836	6.5	2c1w:A, 2c1w:C
32	8ro4:A	339	22	0.0383	0.0324	0.5000	7.3	8ro4:C, 8ro4:D, 8ro4:B, 8ro4:E, 8ro4:F

[Back]