BioLiP

>protein
SLVVFPFKHEHPEVLLHNVRVAAAHPRVHEVLCIGYERDQTYEAVERAAPEISRATGTPVSVRLQERLGTLRPGKGDGMN
TALRYFLEETQWERIHFYDADITSFGPDWITKAEEAADFGYGLVRHYFPRASTDAMITWMITRTGFALLWPHTELSWIEQ
PLGGELLMRREVAAMLYEDERVRRRSDWGIDTLYTFVTVQQGVSIYECYIPEGKAHRLDLRTMLVECFAAIQSLQHEVVG
QPAIHRQEHPHRVPVHIAERVGYDVEATLHRLMQHWTPRQVELLELFTTPVREGLRTCQRRPAFNFMDEMAWAATYHVLL
EHFQPGDPDWEELLFKLWTTRVLNYTMTVALRGYDYAQQYLYRMLGRYRYQAALE

The query sequence (length=375) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2bo6:A	380	380	1.0000	0.9868	0.9868	0.0	2bo6:B, 2bo7:A, 2bo7:B, 2bo7:C, 2bo7:D, 2bo7:E, 2bo7:F, 2bo7:G, 2bo7:H, 2bo7:I, 2bo7:J, 2bo8:A, 2bo8:B, 2bo8:C, 2bo8:D, 2bo8:E, 2bo8:F, 2bo8:G, 2bo8:H, 2bo8:I, 2bo8:J, 2y4k:A, 2y4k:B, 2y4l:A, 2y4l:B, 2y4m:A, 2y4m:B
2	3ckq:A	302	145	0.1173	0.1457	0.3034	0.001	3ckn:A, 3cko:A, 3ckv:A
3	7pe4:A	310	144	0.1173	0.1419	0.3056	0.024	7p8g:A, 7pd5:A, 7pdo:A, 7pho:A, 7pho:B, 7qi9:A, 7qi9:B, 7qib:A, 7qib:B, 7qoq:A, 7qoq:B
4	4dec:A	284	149	0.1093	0.1444	0.2752	0.091	4de7:A, 3e25:A, 5jsx:A, 5jt0:A, 5juc:A, 5jud:A, 4y6n:A, 4y6u:A, 4y7f:A, 4y7g:A, 4y9x:A
5	3f1y:A	318	103	0.0747	0.0881	0.2718	0.27	3f1y:C, 3kia:A, 3kia:C, 3o3p:A, 3o3p:B
6	5l7j:A	406	98	0.0800	0.0739	0.3061	0.75	6ia6:A, 5l7l:A
7	1og6:C	298	61	0.0560	0.0705	0.3443	2.3	1og6:A, 1og6:B
8	7mgv:A	333	41	0.0267	0.0300	0.2439	3.1	7mgv:B
9	7twz:A	298	61	0.0533	0.0671	0.3279	3.9	7twz:B, 7twz:C, 7twz:D, 7twz:E, 7twz:F
10	7yb9:A	430	64	0.0533	0.0465	0.3125	8.1	7bmi:A, 7bmj:A, 7bmj:C, 7e6j:A, 5jqy:A, 5jtc:A, 5jz6:A, 5jz8:A, 5jza:A, 5jzu:A, 6q9f:A, 6q9i:A, 6rk9:A, 6rk9:B, 7yb8:A, 7yba:A, 7ybb:A, 7ybc:A, 6yyu:A, 6yyv:A, 6yyw:A, 6yyx:A, 6yyy:A, 6z6q:A, 6z6r:A

[Back]