Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SLVKALQMAQQNFVITDASLPDNPIVYASRGFLTLTGYSLDQILGRNCRFLQGPETDPRAVDKIRNAITKGVDTSVCLLN
YRQDGTTFWNLFFVAGLRDSKGNIVNYVGVQSKVSEDYAKLLVNEQNI

The query sequence (length=128) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3ue6:E 138 128 1.0000 0.9275 1.0000 2.02e-92 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
2 6i21:A 135 128 0.7266 0.6889 0.7266 5.14e-69 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
3 6t74:B 141 126 0.7188 0.6525 0.7302 1.87e-67 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
4 4hhd:A 152 110 0.4688 0.3947 0.5455 3.26e-41 4hhd:B
5 2z6d:A 118 115 0.4688 0.5085 0.5217 1.17e-40 2z6d:B
6 8qi8:A 110 106 0.4609 0.5364 0.5566 5.39e-40 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
7 2wkp:A 320 110 0.4688 0.1875 0.5455 2.31e-38 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
8 7tbq:A 375 110 0.4688 0.1600 0.5455 6.83e-38 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
9 7qf2:AAA 117 102 0.4375 0.4786 0.5490 9.26e-37 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
10 2z6c:A 121 115 0.4141 0.4380 0.4609 1.12e-36 2z6c:B
11 5hzi:A 476 110 0.4609 0.1239 0.5364 1.46e-36 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
12 5hzh:A 320 106 0.4531 0.1812 0.5472 2.07e-36
13 4eeu:A 109 102 0.4297 0.5046 0.5392 3.41e-36 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
14 7tcd:A 436 111 0.4531 0.1330 0.5225 1.18e-35 4wf0:A, 4wf0:B
15 1g28:A 104 104 0.3984 0.4904 0.4904 1.30e-33 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
16 6gb3:A 120 106 0.3672 0.3917 0.4434 1.25e-31 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
17 8pm1:A 109 106 0.3828 0.4495 0.4623 2.72e-31 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
18 2mwg:A 261 121 0.4141 0.2031 0.4380 4.19e-30 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
19 8j68:A 129 112 0.3750 0.3721 0.4286 6.38e-30 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
20 4gcz:B 378 113 0.3906 0.1323 0.4425 1.79e-28 4gcz:A
21 6hmj:A 359 115 0.3672 0.1309 0.4087 2.01e-28 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
22 6ph4:B 460 122 0.3594 0.1000 0.3770 1.03e-26 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
23 7oo9:A 106 104 0.3828 0.4623 0.4712 1.03e-25 7oo9:B
24 4r3a:A 318 100 0.3203 0.1289 0.4100 1.41e-23 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
25 8a5r:AAA 206 104 0.3281 0.2039 0.4038 1.93e-23 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
26 8c05:A 305 117 0.3438 0.1443 0.3761 3.99e-23
27 4r3a:B 278 86 0.2891 0.1331 0.4302 3.04e-21
28 5svu:B 135 121 0.3359 0.3185 0.3554 7.69e-21 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
29 4wuj:C 145 108 0.3516 0.3103 0.4167 8.04e-21 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
30 7wa4:B 107 100 0.3047 0.3645 0.3900 9.55e-21
31 7r5n:B 151 114 0.2891 0.2450 0.3246 2.21e-19 7r5n:A
32 3hjk:A 150 112 0.3047 0.2600 0.3482 8.82e-19 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
33 7yx0:A 166 103 0.2891 0.2229 0.3592 1.18e-18 7yx0:C
34 7a6p:A 149 103 0.2734 0.2349 0.3398 1.57e-18 7a6p:B
35 7r56:A 137 102 0.2734 0.2555 0.3431 6.78e-18 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
36 8a6x:B 368 111 0.2812 0.0978 0.3243 1.55e-17 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
37 4hj6:B 178 82 0.2812 0.2022 0.4390 1.88e-16 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
38 7yid:A 660 102 0.1953 0.0379 0.2451 1.76e-09 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
39 2gj3:A 119 93 0.2344 0.2521 0.3226 3.54e-08 2gj3:B
40 3ewk:A 227 91 0.1484 0.0837 0.2088 0.002
41 3ewk:A 227 116 0.2031 0.1145 0.2241 0.002
42 2cu0:A 358 83 0.1562 0.0559 0.2410 0.12 2cu0:B
43 4tqm:A 402 32 0.1250 0.0398 0.5000 0.22
44 7ev9:A 382 36 0.0938 0.0314 0.3333 1.3 7ev9:E, 7ev9:I, 8oyi:A, 8oyi:E, 8oyi:I, 3rgb:A, 3rgb:E, 3rgb:I, 7s4h:A, 7s4h:E, 7s4h:I, 7s4i:A, 7s4i:E, 7s4i:I, 7s4j:A, 7s4j:E, 7s4j:I, 7s4k:A, 7s4k:E, 7s4k:I, 8sqw:A, 8sqw:E, 8sqw:I, 8sr1:A, 8sr1:E, 8sr1:I, 8sr2:A, 8sr2:E, 8sr2:I, 8sr4:A, 8sr4:E, 8sr4:I, 8sr5:A, 8sr5:E, 8sr5:I, 7t4o:A, 7t4o:E, 7t4o:I, 7t4p:A, 7t4p:E, 7t4p:I, 1yew:A, 1yew:E, 1yew:I
45 5ohe:F 155 30 0.0938 0.0774 0.4000 3.0 5ohe:A, 5ohe:B, 5ohe:C, 5ohe:D, 5ohe:E, 5ohe:G, 5ohe:H, 5ohf:A, 5ohf:B, 5ohf:C, 5ohf:D, 5ohf:E, 5ohf:F, 5ohf:G, 5ohf:H, 6otd:A
46 5wam:B 97 23 0.0781 0.1031 0.4348 6.6
47 1aha:A 246 32 0.1172 0.0610 0.4688 6.8 1ahb:A, 5cf9:B, 5cix:A, 5cso:A, 5cst:A, 4emf:A, 4emr:A, 4f9n:A, 4fxa:A, 4fz9:A, 4guw:A, 4h0z:A, 4hoa:A, 4i47:A, 5ilw:A, 5ilx:A, 4jtp:A, 4k2z:A, 4kpv:A, 6loq:A, 6lor:A, 6lov:A, 6low:A, 6loy:A, 6loz:A, 6lp0:A, 4lt4:A, 4lwx:A, 4m5a:A, 1mrg:A, 1mrh:A, 3mry:A, 3my6:A, 3n1d:A, 3n1n:A, 3n2d:A, 3n31:A, 3n3x:A, 3n5d:A, 3nfm:A, 3njs:A, 3nx9:A, 4o0o:A, 4o4q:A, 4o8e:A, 3q4p:A, 4q9f:A, 3qji:A, 3rl9:A, 3sj6:A, 3u6t:A, 3u6z:A, 3u70:A, 3u8f:A, 3v14:A, 3v2k:A, 5wv1:A, 5y48:A, 4yp2:B, 4zt8:A, 4zu0:A, 4zz6:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218