Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SLTRIDHIGIACHDLDATVEFYRATYGFEVFHTEVNEEQGVREAMLKINDTSDGGASYLQLLEPTREDSAVGKWLAKNGE
GVHHIAFGTADVDADAADIRDKGVRVLYDEPRRGSMGSRITFLHPKDCHGVLTELVTSAAVESP

The query sequence (length=144) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6wf7:A 144 144 1.0000 1.0000 1.0000 1.01e-105 6wf6:A, 6wf6:B, 6wfh:A, 6wfi:A, 6xbq:A, 6xbr:A, 6xbs:A, 6xbt:A, 6xbv:A
2 3oa4:A 138 133 0.3333 0.3478 0.3609 2.71e-29
3 6qh4:C 138 135 0.3125 0.3261 0.3333 2.53e-19 6qh4:A, 6qh4:B, 6qh4:D, 3rmu:A, 3rmu:B, 3rmu:C, 3rmu:D
4 7yvv:A 335 112 0.2361 0.1015 0.3036 1.88e-06
5 3zgj:B 343 108 0.2292 0.0962 0.3056 7.46e-06 3zgj:A
6 2r5v:A 346 134 0.2986 0.1243 0.3209 5.68e-05 2r5v:B
7 2r5v:A 346 88 0.1667 0.0694 0.2727 1.3 2r5v:B
8 5hmq:D 624 109 0.2431 0.0561 0.3211 5.29e-04 5hmq:A, 5hmq:B, 5hmq:C, 5hmq:E, 5hmq:F
9 3l7t:B 133 112 0.1944 0.2105 0.2500 0.024
10 6bbx:A 121 126 0.2014 0.2397 0.2302 0.026 6bbx:B, 5ujp:A, 5ujp:B, 5umx:A, 5umx:B, 5umy:A, 5umy:B, 5w27:A, 5w27:B
11 1lqk:A 134 40 0.1042 0.1119 0.3750 0.16 1lqk:B, 1lqo:A, 1lqo:B, 1lqp:A, 1lqp:B, 1nki:A, 1nki:B, 1nnr:A, 1nnr:B
12 7x5r:A 386 105 0.1875 0.0699 0.2571 0.17 7cjk:A, 7cqr:A, 7cqs:A, 7e0x:A, 7ezq:A, 8gwd:A, 8h6a:A, 8h6b:A, 8how:A, 8hwr:A, 8hx2:A, 8hx4:A, 8hxf:A, 8hxg:A, 8hxh:A, 8hym:A, 8hyo:A, 8hyp:A, 8hys:A, 8hz6:A, 8hz7:A, 8hz9:A, 8hza:A, 8hzu:A, 8i0g:A, 8i0y:A, 8i15:A, 8i2p:A, 8i2s:A, 8i2u:A, 8i36:A, 8iok:A, 6isd:A, 6isd:B, 8j3c:A, 6j63:A, 6j63:B, 6j63:C, 6j63:D, 8j8w:A, 8j8x:A, 6jx9:A, 6lgt:A, 6m6d:A, 1sp9:B, 1sqd:A, 1tfz:A, 1tg5:A, 7v6x:A, 7vc8:A, 7vo8:A, 8who:A, 8whp:A, 8whq:A, 8wi6:A, 7wj8:A, 7wjj:A, 7wjk:A, 8wqm:A, 7x5s:A, 7x5u:A, 7x5w:A, 7x5x:A, 7x5y:A, 7x5z:A, 7x62:A, 7x64:A, 7x67:A, 7x69:A, 7x6m:A, 7x6n:A, 7x8d:A, 7x8h:A, 7x8i:A, 5xgk:B, 5xgk:C, 5xgk:D, 7xvh:A, 5ywg:A, 5ywg:B, 5ywh:A, 5ywh:B, 5ywi:A, 5ywk:A, 5ywk:B, 5yy6:A, 5yy7:A, 5yy7:B
13 2y5t:A 222 48 0.1250 0.0811 0.3750 0.26 5gir:H, 5gir:A, 5gis:H
14 7xnt:C 320 110 0.1944 0.0875 0.2545 0.35
15 6bnn:A 282 141 0.2361 0.1206 0.2411 0.42 6bnx:A, 6bnz:A, 5d7z:A
16 5ec3:A 376 46 0.1042 0.0399 0.3261 0.67 8im2:A, 8im2:B, 8im2:C, 8im2:D, 8im2:E, 8im2:F, 8im3:A, 8im3:B, 8im3:C, 8im3:D, 8im3:E, 8im3:F, 3isq:A, 1sqi:A
17 5ec3:A 376 114 0.1875 0.0718 0.2368 0.81 8im2:A, 8im2:B, 8im2:C, 8im2:D, 8im2:E, 8im2:F, 8im3:A, 8im3:B, 8im3:C, 8im3:D, 8im3:E, 8im3:F, 3isq:A, 1sqi:A
18 6xwl:C 477 91 0.1875 0.0566 0.2967 0.69 6xwl:F, 6xwl:A, 6xwl:B, 6xwl:D, 6xwl:E, 6xyl:A, 6xyl:B, 6xyl:C, 6xyl:D, 6xyl:E, 6xyl:F, 6y21:D, 6y21:A, 6y21:B, 6z3s:D, 6z3s:A, 6z3s:B, 6zs7:D, 6zs7:A, 6zs7:B, 6zs7:C, 6zs7:E, 6zs7:F
19 1t47:A 362 117 0.2083 0.0829 0.2564 0.70 1t47:B
20 2c21:A 139 108 0.1944 0.2014 0.2593 0.72 2c21:B, 2c21:C, 2c21:D, 2c21:E, 2c21:F
21 5znh:A 314 126 0.2292 0.1051 0.2619 0.86 5zsx:A, 5zsz:A
22 7pm4:A 431 88 0.1736 0.0580 0.2841 1.1 7pm4:B, 7pm4:C, 7pm4:D
23 6p29:A 134 31 0.0833 0.0896 0.3871 1.2 6p29:B
24 1cjx:A 352 54 0.1111 0.0455 0.2963 1.3 1cjx:D, 1cjx:B, 1cjx:C, 7x8e:A, 7x8e:B, 7x8e:C, 7x8e:D, 7x8e:E, 7x8e:F, 7x8e:G, 7x8e:H, 7xnt:G, 7xnt:A, 7xnt:B
25 8jbw:A 364 46 0.0972 0.0385 0.3043 1.6
26 5umw:B 134 27 0.0764 0.0821 0.4074 1.7 5umw:E, 5umw:A
27 8hyj:A 1141 35 0.0972 0.0123 0.4000 2.3
28 5nqz:A 267 50 0.1250 0.0674 0.3600 2.5 5nqz:B
29 8itf:R 299 30 0.0764 0.0368 0.3667 3.1 8iw4:R, 8iw7:R, 8iwe:R, 8iwm:R
30 1sqi:B 342 87 0.1597 0.0673 0.2644 3.2
31 1sqi:B 342 29 0.0764 0.0322 0.3793 8.6
32 8j59:B 388 49 0.0972 0.0361 0.2857 3.2 8j59:A
33 7e6p:H 217 48 0.1181 0.0783 0.3542 5.8 8h8q:H
34 7ojr:A 445 55 0.1250 0.0404 0.3273 6.4 7oml:A
35 5zcr:A 725 43 0.0972 0.0193 0.3256 7.0 5zcr:B
36 6mg0:B 1687 33 0.0903 0.0077 0.3939 7.9
37 6mfz:A 1789 33 0.0903 0.0073 0.3939 8.2 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
38 6on3:B 148 26 0.0694 0.0676 0.3846 8.4 6on1:A, 6on1:B, 6on1:C, 6on1:D, 6on1:E, 6on1:F, 6on3:A, 6on3:C, 6on3:D, 6on3:F, 6on3:E
39 5whs:A 713 31 0.0833 0.0168 0.3871 9.0 5whq:A, 5whq:B, 5whs:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218