BioLiP

>protein
SLTHRKFGGSGGSPFSGLSSIAVRSGSYLDAIIIDGVHHGGSGGNLSPTFTFGSGEYISNMTIRSGDYIDNISFETNMGR
RFGPYGGSGGSANTLSNVKVIQINGSAGDYLDSLDIYYEQY

The query sequence (length=121) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3ll2:A	123	123	0.9917	0.9756	0.9756	1.85e-79	2guc:A, 2guc:B, 2gud:A, 2gud:B, 2hyq:A, 2hyq:B, 2hyr:A, 2hyr:B, 2nuo:A, 2nuo:B, 7ria:A, 7ria:B, 7rib:A, 7rib:B, 7rib:C, 7rkg:A, 7rkg:B, 7rki:A, 7rki:B
2	1zgs:A	442	145	0.3223	0.0882	0.2690	1.37e-05	4mq0:A, 1zgs:B
3	1zgs:A	442	108	0.2645	0.0724	0.2963	0.004	4mq0:A, 1zgs:B
4	1zgs:A	442	82	0.2231	0.0611	0.3293	0.022	4mq0:A, 1zgs:B
5	4pit:B	144	133	0.3058	0.2569	0.2782	2.30e-05	2bmz:A, 2bmz:B, 2bn0:A, 2bn0:B, 8hyf:A, 3mit:A, 3mit:B, 3miu:A, 3miu:B, 3miv:B, 4pik:B, 4pik:C, 4pik:D, 4pik:A, 4pit:A, 4pit:C, 4pit:D, 1x1v:A, 1x1v:B
6	1j4u:A	149	51	0.1570	0.1275	0.3725	7.69e-04	1j4u:B, 1j4u:C, 1j4u:D, 1vbo:A, 1vbo:B, 1vbo:C, 1vbo:E, 1vbo:G, 1vbo:H, 1vbo:D, 1vbo:F, 1vbp:A, 1vbp:B
7	5m6o:A	150	51	0.1570	0.1267	0.3725	0.001	5m6o:B, 5m6o:C, 5m6o:D, 5tqz:A, 5tqz:B, 5tqz:C, 5tqz:D
8	5yrf:B	142	45	0.1157	0.0986	0.3111	0.050	5yrf:A, 5yrg:A, 5yrg:B, 5yri:B, 5yri:A, 5yrj:A, 5yrj:B, 5yrl:A, 5yrl:B, 5yrm:B
9	4ddn:A	154	55	0.1405	0.1104	0.3091	0.49	4ddn:B, 4ddn:C, 4ddn:D, 3r51:A, 3r52:A, 3r52:B, 3r52:C, 3r52:D
10	2xq1:B	494	59	0.1488	0.0364	0.3051	1.6	2xq1:C, 2xq1:D, 2xq1:E, 2xq1:F, 2xq1:G, 2xq1:H, 2xq1:I, 2xq1:J, 2xq1:K, 2xq1:L, 2xq1:M, 2xq1:N, 2xq1:O, 2xq1:P
11	8ro4:A	339	56	0.1818	0.0649	0.3929	2.2	8ro4:C, 8ro4:D, 8ro4:B, 8ro4:E, 8ro4:F
12	6rjn:A	502	59	0.1405	0.0339	0.2881	4.3	6rjn:B, 6rjn:C, 6rjn:D
13	5z1x:A	495	40	0.1157	0.0283	0.3500	5.5	5z1x:B, 5z22:A
14	3gd7:A	378	49	0.1322	0.0423	0.3265	5.7	3gd7:B, 3gd7:C, 3gd7:D, 6uk1:A, 6uk1:B, 6uk1:C, 6uk1:D
15	8v7z:A	1104	49	0.1322	0.0145	0.3265	6.3
16	5uak:A	1139	49	0.1322	0.0140	0.3265	6.3	2bbs:B, 7svr:A, 8v81:A
17	6msm:A	1181	49	0.1322	0.0135	0.3265	6.3	8eig:A, 8eio:A, 8eiq:A, 8fzq:A, 6gjq:A, 6gjq:C, 6gjq:E, 6gjq:G, 6gjs:A, 6gk4:A, 6gk4:D, 6gkd:A, 6gkd:L, 6gkd:F, 6gkd:I, 6gkd:O, 6gkd:R, 8gls:A, 6o1v:A, 6o2p:A, 2pze:A, 2pze:B, 2pzf:A, 2pzf:B, 2pzg:A, 2pzg:B, 7sv7:A, 7svd:A, 5tf7:A, 5tf8:A, 5tfa:A, 5tfb:A, 5tfc:A, 5tfd:A, 5tff:A, 5tfg:A, 5tfi:A, 5tfj:A, 5tgk:A, 8ubr:A, 6wbs:A, 6wbs:B, 6ze1:A
18	7p18:A	558	40	0.1240	0.0269	0.3750	8.9	7p18:B
19	2vr5:A	715	87	0.2149	0.0364	0.2989	9.3	2vr5:B

[Back]