BioLiP

>protein
SLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCA
WQRGLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFTAAHQLGHVFNMLHDNS
KPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLHLPVTFPGKDYDADRQCQLTFG
PDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCL

The query sequence (length=293) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3b2z:F	293	293	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3b2z:A, 3b2z:B, 3b2z:C, 3b2z:D, 3b2z:E, 3b2z:G, 3b2z:H, 2rjp:A, 2rjp:B, 2rjp:C, 2rjp:D, 4wk7:A, 4wke:A, 4wki:A
2	2jih:B	286	290	0.5904	0.6049	0.5966	1.10e-132	2jih:A, 3q2g:A, 3q2g:B, 3q2h:A, 3q2h:B, 2v4b:A, 2v4b:B
3	2rjq:A	292	293	0.4676	0.4692	0.4676	1.77e-99	3b8z:A, 3b8z:B, 3hy7:A, 3hy7:B, 3hy9:A, 3hy9:B, 3hyg:A, 3hyg:B, 3ljt:A, 6yjm:A, 6yjm:B
4	6qig:A	581	295	0.3276	0.1652	0.3254	3.31e-37	3ghm:A, 3ghn:A, 3vn4:A
5	3k7n:A	396	219	0.1911	0.1414	0.2557	2.48e-15
6	1yp1:A	199	205	0.2082	0.3065	0.2976	1.82e-12
7	2dw1:A	415	220	0.2082	0.1470	0.2773	4.55e-12	2dw0:A, 2dw0:B, 2dw1:B, 2dw2:B, 2dw2:A
8	3hdb:A	417	214	0.2014	0.1415	0.2757	5.92e-12
9	3dsl:A	416	221	0.2082	0.1466	0.2760	1.15e-11	3dsl:B
10	2e3x:A	416	217	0.2082	0.1466	0.2811	1.46e-11
11	1dth:A	202	216	0.2253	0.3267	0.3056	1.52e-11	1atl:A, 1atl:B, 1dth:B, 1htd:A, 1htd:B
12	6x5x:A	200	217	0.2048	0.3000	0.2765	3.07e-11
13	1nd1:A	202	224	0.2082	0.3020	0.2723	3.76e-11	2w12:A, 2w13:A, 2w14:A, 2w15:A
14	2aig:P	201	218	0.2150	0.3134	0.2890	4.59e-11	3aig:A, 4aig:A, 1iag:A
15	1qua:A	197	211	0.1945	0.2893	0.2701	2.48e-10
16	4q1l:A	202	219	0.2082	0.3020	0.2785	9.97e-10
17	1kuf:A	201	216	0.1843	0.2687	0.2500	1.40e-09	1kug:A, 1kui:A, 1kuk:A
18	3gbo:A	200	222	0.2116	0.3100	0.2793	5.26e-09
19	1bsw:A	197	166	0.1433	0.2132	0.2530	8.24e-09	1bud:A
20	4j4m:B	200	215	0.1877	0.2750	0.2558	3.22e-08	4j4m:A
21	4dd8:D	208	219	0.1980	0.2788	0.2648	6.01e-08	4dd8:A, 4dd8:B, 4dd8:C
22	9clp:A	420	299	0.2491	0.1738	0.2441	9.87e-08
23	1r54:A	206	219	0.2014	0.2864	0.2694	1.68e-07	1r55:A
24	1wni:A	198	214	0.1741	0.2576	0.2383	2.90e-07
25	3k7l:A	409	162	0.1399	0.1002	0.2531	3.36e-06
26	2ero:A	426	221	0.1980	0.1362	0.2624	6.22e-05	2ero:B, 2erp:A, 2erp:B, 2erq:A, 2erq:B
27	5y2z:G	462	231	0.1741	0.1104	0.2208	0.001
28	5y2z:G	462	17	0.0375	0.0238	0.6471	6.5
29	3g5c:A	486	231	0.1741	0.1049	0.2208	0.001	3g5c:B, 8hpy:A, 8hpy:B, 8hq0:A, 8hq0:B, 8hq0:C, 8hq1:A, 8hq1:B, 8hq1:C, 8hq2:A, 8hq2:B, 5y2z:A, 5y2z:C, 5y2z:E, 5y2z:I, 5y2z:K, 5y31:A, 5y31:C, 8y6b:A, 8y6b:B, 8y6b:C
30	3g5c:A	486	17	0.0375	0.0226	0.6471	6.2	3g5c:B, 8hpy:A, 8hpy:B, 8hq0:A, 8hq0:B, 8hq0:C, 8hq1:A, 8hq1:B, 8hq1:C, 8hq2:A, 8hq2:B, 5y2z:A, 5y2z:C, 5y2z:E, 5y2z:I, 5y2z:K, 5y31:A, 5y31:C, 8y6b:A, 8y6b:B, 8y6b:C
31	8esv:A	446	277	0.1980	0.1300	0.2094	0.13	6bdz:A, 6be6:B, 6be6:A, 6be6:C, 6be6:D
32	8snl:A	656	256	0.1980	0.0884	0.2266	1.4	2a8h:A, 2a8h:B, 3b92:A, 1bkc:A, 1bkc:C, 1bkc:E, 1bkc:I, 3cki:A, 2ddf:A, 2ddf:B, 3e8r:A, 3e8r:B, 3edz:A, 3edz:B, 3ewj:A, 3ewj:B, 2fv5:A, 2fv5:B, 2fv9:A, 2fv9:B, 3g42:A, 3g42:B, 3g42:C, 3g42:D, 2i47:A, 2i47:B, 2i47:C, 2i47:D, 3kmc:A, 3kmc:B, 3kme:A, 3kme:B, 3l0t:A, 3l0t:B, 3l0v:A, 3l0v:B, 3le9:A, 3le9:B, 3lea:A, 3lea:B, 3lgp:A, 3lgp:B, 3o64:A, 3o64:B, 2oi0:A, 8snm:B, 8snn:A, 8sno:A, 1zxc:A, 1zxc:B
33	2vqa:A	356	44	0.0478	0.0393	0.3182	4.4	2vqa:B, 2vqa:C
34	5xfa:A	581	56	0.0580	0.0293	0.3036	4.5	5xf9:A, 5xf9:E, 5xfa:E
35	3uoz:A	540	48	0.0546	0.0296	0.3333	6.9	3uov:A, 3uov:B, 3uox:A, 3uox:B, 3uoy:A, 3uoy:B, 3uoz:B, 3up4:A, 3up4:B, 3up5:A, 3up5:B

[Back]