BioLiP

>protein
SLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGL
NTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFTAAHQLGHVFNMLHDNSKPCIS
LNSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLHLPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPPCA
ALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRC

The query sequence (length=278) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3b2z:F	293	292	1.0000	0.9488	0.9521	0.0	3b2z:A, 3b2z:B, 3b2z:C, 3b2z:D, 3b2z:E, 3b2z:G, 3b2z:H, 2rjp:A, 2rjp:B, 2rjp:C, 2rjp:D, 4wk7:A, 4wke:A, 4wki:A
2	2jih:B	286	281	0.6223	0.6049	0.6157	5.54e-133	2jih:A, 3q2g:A, 3q2g:B, 3q2h:A, 3q2h:B, 2v4b:A, 2v4b:B
3	2rjq:A	292	290	0.4892	0.4658	0.4690	2.51e-96	3b8z:A, 3b8z:B, 3hy7:A, 3hy7:B, 3hy9:A, 3hy9:B, 3hyg:A, 3hyg:B, 3ljt:A, 6yjm:A, 6yjm:B
4	6qig:A	581	290	0.3309	0.1583	0.3172	7.31e-37	3ghm:A, 3ghn:A, 3vn4:A
5	3k7n:A	396	218	0.2050	0.1439	0.2615	2.58e-13
6	3hdb:A	417	290	0.2698	0.1799	0.2586	5.19e-13
7	2e3x:A	416	212	0.2158	0.1442	0.2830	1.54e-12
8	2dw1:A	415	292	0.2842	0.1904	0.2705	5.68e-12	2dw0:A, 2dw0:B, 2dw1:B, 2dw2:B, 2dw2:A
9	3dsl:A	416	215	0.2158	0.1442	0.2791	7.73e-12	3dsl:B
10	1dth:A	202	209	0.2266	0.3119	0.3014	1.22e-11	1atl:A, 1atl:B, 1dth:B, 1htd:A, 1htd:B
11	6x5x:A	200	214	0.2122	0.2950	0.2757	1.64e-11
12	1nd1:A	202	218	0.2230	0.3069	0.2844	1.67e-11	2w12:A, 2w13:A, 2w14:A, 2w15:A
13	2aig:P	201	212	0.2266	0.3134	0.2972	2.30e-11	3aig:A, 4aig:A, 1iag:A
14	1yp1:A	199	203	0.2194	0.3065	0.3005	3.94e-11
15	9clp:A	420	287	0.2626	0.1738	0.2544	1.21e-09
16	4q1l:A	202	215	0.2122	0.2921	0.2744	2.26e-09
17	3gbo:A	200	211	0.2158	0.3000	0.2844	2.43e-09
18	1qua:A	197	210	0.2014	0.2843	0.2667	2.72e-09
19	1kuf:A	201	213	0.1942	0.2687	0.2535	2.41e-08	1kug:A, 1kui:A, 1kuk:A
20	1r54:A	206	212	0.2050	0.2767	0.2689	3.09e-08	1r55:A
21	1wni:A	198	211	0.1835	0.2576	0.2417	2.45e-07
22	1bsw:A	197	165	0.1475	0.2081	0.2485	2.74e-07	1bud:A
23	4j4m:B	200	208	0.1978	0.2750	0.2644	3.06e-07	4j4m:A
24	4dd8:D	208	218	0.2086	0.2788	0.2661	1.04e-06	4dd8:A, 4dd8:B, 4dd8:C
25	3k7l:A	409	208	0.1691	0.1149	0.2260	1.89e-06
26	2ero:A	426	215	0.1978	0.1291	0.2558	1.60e-04	2ero:B, 2erp:A, 2erp:B, 2erq:A, 2erq:B
27	5y2z:G	462	230	0.1835	0.1104	0.2217	2.39e-04
28	3g5c:A	486	230	0.1835	0.1049	0.2217	2.71e-04	3g5c:B, 8hpy:A, 8hpy:B, 8hq0:A, 8hq0:B, 8hq0:C, 8hq1:A, 8hq1:B, 8hq1:C, 8hq2:A, 8hq2:B, 5y2z:A, 5y2z:C, 5y2z:E, 5y2z:I, 5y2z:K, 5y31:A, 5y31:C, 8y6b:A, 8y6b:B, 8y6b:C
29	8esv:A	446	78	0.0719	0.0448	0.2564	1.2	6bdz:A, 6be6:B, 6be6:A, 6be6:C, 6be6:D
30	8snl:A	656	254	0.2122	0.0899	0.2323	2.6	2a8h:A, 2a8h:B, 3b92:A, 1bkc:A, 1bkc:C, 1bkc:E, 1bkc:I, 3cki:A, 2ddf:A, 2ddf:B, 3e8r:A, 3e8r:B, 3edz:A, 3edz:B, 3ewj:A, 3ewj:B, 2fv5:A, 2fv5:B, 2fv9:A, 2fv9:B, 3g42:A, 3g42:B, 3g42:C, 3g42:D, 2i47:A, 2i47:B, 2i47:C, 2i47:D, 3kmc:A, 3kmc:B, 3kme:A, 3kme:B, 3l0t:A, 3l0t:B, 3l0v:A, 3l0v:B, 3le9:A, 3le9:B, 3lea:A, 3lea:B, 3lgp:A, 3lgp:B, 3o64:A, 3o64:B, 2oi0:A, 8snm:B, 8snn:A, 8sno:A, 1zxc:A, 1zxc:B
31	2vqa:A	356	44	0.0504	0.0393	0.3182	4.6	2vqa:B, 2vqa:C

[Back]