BioLiP

>protein
SLRSDLINALYDENQKYDVCGIISAEGKIYPLGSDTKVLSTIFELFSRPIINKIAEKHGYIVEEPKQQNHYPDFTLYKPS
EPNKKIAIDIKTTYTNKENEKIKFTLGGYTSFIRNNTKNIVYPFDQYIAHWIIGYVYTRVATRKSSLKTYNINELNEIPK
PYKGVKVFLQDKWVIAGDLAGSGNTTNIGSIHAHYKDFVEGKGIFDSEDEFLDYWRNYE

The query sequence (length=219) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1b94:A	244	219	1.0000	0.8975	1.0000	1.79e-162	1az0:A, 1az0:B, 2b0d:A, 2b0d:B, 2b0e:A, 2b0e:B, 1b94:B, 1b95:A, 1b95:B, 1b96:A, 1b96:B, 1b97:A, 1b97:B, 1bgb:A, 1bgb:B, 1bss:A, 1bss:B, 1bsu:A, 1bsu:B, 1bua:A, 1bua:B, 1eo3:A, 1eo3:B, 1eo4:A, 1eo4:B, 1eon:A, 1eon:B, 1eoo:A, 1eoo:B, 1eop:A, 1eop:B, 5f8a:A, 5f8a:B, 2ge5:A, 2ge5:B, 5hlk:A, 5hlk:B, 1rv5:A, 1rv5:B, 1rva:A, 1rva:B, 1rvb:A, 1rvb:B, 1rvc:A, 1rvc:B, 2rve:A, 2rve:B, 4rve:A, 4rve:B, 4rve:C, 1stx:A, 1stx:B, 1suz:A, 1suz:B, 1sx5:A, 1sx5:B, 1sx8:A, 1sx8:B
2	8pmj:A	1133	52	0.0822	0.0159	0.3462	0.63	8pmd:A
3	7dv5:U	1189	52	0.0822	0.0151	0.3462	0.63	7e1a:U
4	7xgx:A	607	43	0.0776	0.0280	0.3953	0.97	7xgx:B
5	8gl8:A	2290	54	0.0639	0.0061	0.2593	3.4	8gl6:A, 8glj:A, 8glk:A, 8glm:A, 8gln:A
6	8q66:A	271	58	0.0776	0.0627	0.2931	6.0
7	6eo0:B	275	31	0.0457	0.0364	0.3226	6.5	6enx:A, 6eo0:A, 6eo0:C, 6eo0:D, 6fky:A, 6fky:B, 6fkz:A, 6fkz:B, 6flg:A, 6flg:B, 5ojo:A, 5ojo:B, 4utn:A, 4utn:B, 4utr:A, 4utr:B, 4utv:A, 4utv:B, 4utx:A, 4utx:B, 4utz:A, 4utz:B, 4uu7:A, 4uu7:B, 4uu8:A, 4uu8:B, 4uua:A, 4uua:B, 4uub:A, 4uub:B
8	7veu:A	612	81	0.0959	0.0343	0.2593	7.9	7vev:A, 7vew:A, 7vew:B
9	7suk:SP	2234	152	0.1553	0.0152	0.2237	8.6	6zqb:UT
10	7aju:UT	2313	152	0.1553	0.0147	0.2237	9.7	7ajt:UT, 6zqc:UT, 6zqd:UT, 6zqe:UT
11	2hn1:A	246	86	0.0913	0.0813	0.2326	9.8

[Back]