BioLiP

>protein
SLRRGIYHIENAGVPSAIDLKDGSSSDGTPIVGWQFTPDTINWHQLWLAEPIPNVADTFTLANLFSGTYMDLYNGSSEAG
TAVNGWQGTAFTTNPHQLWTIKKSSDGTSYKIQNYGSKTFVDLVNGDSSDGAKIAGWTGTWDEGNPHQKWYFNRMSVSSA
EAQAAIARNPHIHGTYRGYILDGEYLVLPNATFTQIWKDSGLPGSKWREQIYDCDDFAIAMKAAVGKWGADSWKANGFAI
FCGVMLGVNKAGDAAHAYNFTLTKDHADIVFFEPQNGGYLNDIGYDSYMAFY

The query sequence (length=292) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5d61:A	292	292	0.9966	0.9966	0.9966	0.0	5d62:A, 5d63:A, 3ef2:A, 3ef2:B, 3ef2:C, 3ef2:D, 2iho:A, 5mu9:A, 6tsl:AAA, 6tsm:AAA, 6tsn:AAA, 6tso:AAA, 6tsp:AAA, 6tsq:AAA, 6tsr:AAA, 6yh0:AAA
2	3phz:A	278	292	0.3733	0.3921	0.3733	6.84e-53	5mua:A, 5mua:B, 3phz:B
3	3vsz:C	482	147	0.1301	0.0788	0.2585	0.051	3vsz:A, 3vsz:B, 3vsz:E, 3vsz:F, 3vt0:A, 3vt0:B, 3vt0:C, 3vt0:E, 3vt0:F, 3vt1:B, 3vt1:C, 3vt1:E, 3vt1:F, 3vt1:A, 3vt2:A, 3vt2:B, 3vt2:C, 3vt2:D, 3vt2:E, 3vt2:F
4	3vsz:C	482	47	0.0582	0.0353	0.3617	0.16	3vsz:A, 3vsz:B, 3vsz:E, 3vsz:F, 3vt0:A, 3vt0:B, 3vt0:C, 3vt0:E, 3vt0:F, 3vt1:B, 3vt1:C, 3vt1:E, 3vt1:F, 3vt1:A, 3vt2:A, 3vt2:B, 3vt2:C, 3vt2:D, 3vt2:E, 3vt2:F
5	5bp5:A	286	59	0.0685	0.0699	0.3390	0.054	5bp5:B, 5bqu:B, 5bqu:A, 4lo1:A, 4lo1:B, 4lo2:A, 4lo2:B, 4lo3:A, 4lo3:B
6	2a21:A	263	49	0.0582	0.0646	0.3469	0.29	2a21:B, 2a2i:A, 2a2i:B, 3e0i:A, 3e0i:B, 3e12:A, 3e12:B, 2ef9:A, 2ef9:B, 1fwn:A, 1fwn:B, 1fws:A, 1fws:B, 1fwt:A, 1fwt:B, 1fww:A, 1fww:B, 1fx6:A, 1fx6:B, 1fxp:A, 1fxp:B, 1fxq:A, 1fxq:B, 1fy6:A, 1fy6:B, 1jcx:A, 1jcx:B, 1jcy:A, 1jcy:B, 1lrn:A, 1lrn:B, 1lro:A, 1lro:B, 1lrq:A, 1lrq:B, 2nwr:A, 2nwr:B, 2nws:A, 2nws:B, 2nx1:A, 2nx1:B, 2nx3:A, 2nx3:B, 2nx3:C, 2nx3:D, 2nx3:E, 2nx3:F, 2nx3:G, 2nx3:H, 2nx3:I, 2nx3:J, 2nx3:K, 2nx3:L, 2nxg:A, 2nxg:B, 2nxh:A, 2nxh:B, 2nxh:C, 2nxh:D, 2nxh:E, 2nxh:F, 2nxh:G, 2nxh:H, 2nxh:I, 2nxh:J, 2nxh:K, 2nxh:L, 2nxi:A, 2nxi:B, 2nxi:C, 2nxi:D, 2nxi:E, 2nxi:F, 2nxi:G, 2nxi:H, 2nxi:I, 2nxi:J, 2nxi:K, 2nxi:L, 1pck:A, 1pck:B, 1pcw:A, 1pcw:B, 1pe1:A, 1pe1:B, 1t8x:A, 1t8x:B, 1t96:A, 1t96:B, 1zha:A, 1zha:B, 1zji:A, 1zji:B
7	3fhq:A	601	52	0.0685	0.0333	0.3846	0.56	3fha:A, 3fha:B, 3fha:C, 3fha:D, 3fhq:B, 3fhq:D, 3fhq:F
8	8jvi:B	604	21	0.0411	0.0199	0.5714	3.0	8fca:A, 8fca:B, 8fca:C, 8fca:D, 8j1b:A, 8j1b:B, 8j1b:C, 8j1b:D, 8j1f:A, 8j1f:B, 8j1f:C, 8j1f:D, 8j1h:C, 8j1h:D, 8j1h:B, 8j1h:A, 8jvi:C, 8jvi:D, 8jvi:A
9	8t1b:A	644	21	0.0411	0.0186	0.5714	3.5	4dx2:A, 8fc7:A, 8fc7:B, 8fc7:C, 8fc7:D, 8fc8:A, 8fc8:B, 8fc8:D, 8fc8:C, 8fcb:A, 8fcb:B, 8fcb:D, 8fcb:C, 8ju5:D, 8ju5:B, 8ju6:A, 8ju6:B, 8ju6:D, 8ju6:C, 8jvj:A, 8jvj:B, 8jvj:C, 8jvj:D, 8t1b:B, 8t1b:D, 8t1b:C, 8t1d:A, 8t1d:B, 8t1d:C, 8t1d:D, 8t1e:A, 8t1e:B, 8t1e:C, 8t1e:D, 8t1f:A, 8t1f:B, 8t1f:C, 8t1f:D
10	1hwm:B	264	69	0.0685	0.0758	0.2899	5.3	1hwn:B, 1hwo:B, 1hwp:B
11	8pos:A	168	51	0.0514	0.0893	0.2941	6.3	8por:A, 8pos:B
12	3ca1:A	257	70	0.0616	0.0700	0.2571	7.6	3ca4:A, 3ca5:A, 3cah:A
13	3qcp:A	410	41	0.0445	0.0317	0.3171	8.1	3qd9:A, 3qd9:B, 3qd9:C, 3qd9:D

[Back]