Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIV
HKPGPITLTVAKS

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1l6o:A 95 89 0.9247 0.9053 0.9663 7.04e-59 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
2 6zbq:A 89 93 0.9355 0.9775 0.9355 2.15e-56 6zc4:A
3 2kaw:A 90 90 0.8602 0.8889 0.8889 5.48e-55 6lcb:A, 2mx6:A
4 8bq8:C 93 65 0.2903 0.2903 0.4154 1.06e-10 8bq8:A, 8bq8:B
5 2exg:A 101 91 0.3871 0.3564 0.3956 1.62e-10 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
6 2m0z:A 97 71 0.3011 0.2887 0.3944 2.76e-09 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
7 2ka9:A 189 64 0.2903 0.1429 0.4219 4.85e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
8 2ka9:A 189 65 0.2688 0.1323 0.3846 2.95e-06 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
9 7p73:A 420 64 0.2796 0.0619 0.4062 5.41e-09 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
10 7pc3:A 405 64 0.2796 0.0642 0.4062 1.92e-08 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
11 8bp4:A 93 78 0.3011 0.3011 0.3590 2.17e-08 8bp4:C, 8bp4:B
12 8cn1:H 101 65 0.2688 0.2475 0.3846 2.81e-08 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
13 2koh:A 111 92 0.3441 0.2883 0.3478 1.83e-07 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
14 8bv7:A 95 48 0.2043 0.2000 0.3958 4.82e-07 8buw:A, 8buw:B
15 1b8q:A 127 78 0.2903 0.2126 0.3462 2.07e-05
16 6xa7:B 96 64 0.2366 0.2292 0.3438 2.67e-05 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
17 4wyu:A 201 70 0.2581 0.1194 0.3429 5.08e-05 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
18 3jxt:A 96 61 0.2366 0.2292 0.3607 1.14e-04 3jxt:B
19 4xh7:A 110 71 0.2473 0.2091 0.3239 1.63e-04
20 5heb:A 119 61 0.2473 0.1933 0.3770 3.22e-04 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
21 8c1t:A 90 64 0.2258 0.2333 0.3281 5.27e-04 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
22 5zys:A 90 83 0.3011 0.3111 0.3373 6.73e-04
23 1n7t:A 103 77 0.2581 0.2330 0.3117 0.002 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
24 7x2e:A 163 46 0.1828 0.1043 0.3696 0.002 2kbs:A
25 3tsz:A 341 47 0.1720 0.0469 0.3404 0.002 3shw:A
26 4xhv:A 94 65 0.2366 0.2340 0.3385 0.005
27 8b82:A 108 77 0.2796 0.2407 0.3377 0.005 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
28 7pc5:A 405 72 0.2688 0.0617 0.3472 0.005
29 3cyy:B 81 40 0.1720 0.1975 0.4000 0.006 3cyy:A
30 3ch8:A 190 67 0.2366 0.1158 0.3284 0.007 2qbw:A
31 7qct:A 90 76 0.2151 0.2222 0.2632 0.008 7qct:B
32 7qqm:A 413 60 0.2151 0.0484 0.3333 0.009
33 5f67:A 98 71 0.2688 0.2551 0.3521 0.012 5f67:B
34 1n7f:A 86 74 0.2473 0.2674 0.3108 0.013 1n7f:B
35 2qt5:A 194 79 0.2258 0.1082 0.2658 0.015 2qt5:B
36 2qt5:A 194 73 0.1935 0.0928 0.2466 0.11 2qt5:B
37 2kpl:A 129 63 0.1828 0.1318 0.2698 0.023
38 6nid:B 88 59 0.1828 0.1932 0.2881 0.024 6nid:A, 6nid:C
39 6kz1:A 97 62 0.2043 0.1959 0.3065 0.031 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
40 6gbe:A 119 65 0.2151 0.1681 0.3077 0.035
41 5n7d:A 423 63 0.1828 0.0402 0.2698 0.037 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
42 2ejy:A 85 56 0.1828 0.2000 0.3036 0.042
43 7p70:A 407 61 0.2258 0.0516 0.3443 0.051 7pc4:A, 7qql:A
44 2l4t:A 124 52 0.1720 0.1290 0.3077 0.054 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
45 7weg:B 96 72 0.2473 0.2396 0.3194 0.058 7weg:A
46 2jk8:A 291 39 0.1613 0.0515 0.3846 0.11 5nh2:A
47 7qqn:C 414 86 0.2688 0.0604 0.2907 0.14 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
48 6q0m:B 94 79 0.2258 0.2234 0.2658 0.17
49 7pcb:A 415 70 0.2151 0.0482 0.2857 0.19 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
50 2i0i:A 81 49 0.1935 0.2222 0.3673 0.19 2i0i:B, 2i0i:C
51 1zub:A 109 77 0.2043 0.1743 0.2468 0.22
52 6ar4:B 87 73 0.2043 0.2184 0.2603 0.24 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
53 2pdz:A 86 72 0.2473 0.2674 0.3194 0.27
54 3vqg:A 85 44 0.1505 0.1647 0.3182 0.50
55 3r0h:D 199 91 0.2581 0.1206 0.2637 0.67 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
56 4wsi:A 372 47 0.1398 0.0349 0.2766 0.68 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
57 2r4h:C 98 77 0.2043 0.1939 0.2468 1.4
58 8sxg:A 366 49 0.1935 0.0492 0.3673 1.5 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
59 8blu:B 195 49 0.1613 0.0769 0.3061 1.6 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
60 1ihj:B 95 76 0.2151 0.2105 0.2632 1.7 1ihj:A
61 6gua:A 821 31 0.1290 0.0146 0.3871 3.1 6gua:B, 6gua:C, 6gua:D, 6gua:E, 6gua:F, 6gua:G, 6gua:H
62 1u38:A 89 58 0.1935 0.2022 0.3103 4.0
63 7ri3:C 583 62 0.1613 0.0257 0.2419 6.3 7ri3:A, 7ri3:B, 7ri3:D
64 3fhq:A 601 64 0.1720 0.0266 0.2500 9.1 3fha:A, 3fha:B, 3fha:C, 3fha:D, 3fhq:B, 3fhq:D, 3fhq:F
65 5ocs:A 369 58 0.2043 0.0515 0.3276 9.1 5ocs:C
66 6vbg:B 397 39 0.1720 0.0403 0.4103 9.6 6c9w:A, 4oaa:A, 4oaa:B, 6vbg:A, 2y5y:A, 2y5y:B, 4zyr:A, 4zyr:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218