Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKP
GPITLTVAKS

The query sequence (length=90) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6zbq:A 89 90 0.9667 0.9775 0.9667 4.82e-57 6zc4:A
2 1l6o:A 95 89 0.9222 0.8737 0.9326 2.62e-54 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
3 2kaw:A 90 90 0.8667 0.8667 0.8667 5.46e-51 6lcb:A, 2mx6:A
4 2exg:A 101 91 0.4000 0.3564 0.3956 3.96e-11 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
5 8bq8:C 93 65 0.3000 0.2903 0.4154 4.67e-11 8bq8:A, 8bq8:B
6 2m0z:A 97 71 0.3111 0.2887 0.3944 1.14e-09 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
7 7p73:A 420 64 0.3111 0.0667 0.4375 1.45e-09 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 8cn1:H 101 74 0.3000 0.2673 0.3649 1.13e-08 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
9 8bp4:A 93 77 0.3111 0.3011 0.3636 1.92e-08 8bp4:C, 8bp4:B
10 2ka9:A 189 64 0.2778 0.1323 0.3906 1.45e-07 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
11 2ka9:A 189 65 0.2778 0.1323 0.3846 1.66e-06 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
12 2koh:A 111 92 0.3556 0.2883 0.3478 4.30e-07 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
13 8bv7:A 95 48 0.2111 0.2000 0.3958 4.35e-07 8buw:A, 8buw:B
14 1b8q:A 127 74 0.2778 0.1969 0.3378 4.45e-07
15 7pc3:A 405 64 0.2667 0.0593 0.3750 5.75e-07 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
16 3jxt:A 96 58 0.2222 0.2083 0.3448 3.08e-06 3jxt:B
17 5heb:A 119 58 0.2333 0.1765 0.3621 1.02e-05 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
18 6xa7:B 96 64 0.2333 0.2188 0.3281 3.66e-05 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
19 4xh7:A 110 73 0.2667 0.2182 0.3288 4.10e-05
20 3tsz:A 341 68 0.2222 0.0587 0.2941 4.49e-05 3shw:A
21 4wyu:A 201 70 0.2667 0.1194 0.3429 6.31e-05 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
22 8c1t:A 90 64 0.2444 0.2444 0.3438 1.14e-04 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
23 7qct:A 90 73 0.2111 0.2111 0.2603 2.49e-04 7qct:B
24 8b82:A 108 77 0.2778 0.2315 0.3247 4.63e-04 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
25 5zys:A 90 81 0.2889 0.2889 0.3210 0.001
26 7x2e:A 163 59 0.2444 0.1350 0.3729 0.001 2kbs:A
27 2qt5:A 194 80 0.2556 0.1186 0.2875 0.004 2qt5:B
28 2qt5:A 194 71 0.2000 0.0928 0.2535 0.066 2qt5:B
29 7qqm:A 413 75 0.2556 0.0557 0.3067 0.004
30 7p70:A 407 59 0.2444 0.0541 0.3729 0.004 7pc4:A, 7qql:A
31 1n7t:A 103 77 0.2444 0.2136 0.2857 0.006 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
32 2i0i:A 81 46 0.1778 0.1975 0.3478 0.006 2i0i:B, 2i0i:C
33 3cyy:B 81 40 0.1778 0.1975 0.4000 0.006 3cyy:A
34 4xhv:A 94 65 0.2444 0.2340 0.3385 0.008
35 3vqg:A 85 41 0.1444 0.1529 0.3171 0.013
36 2pdz:A 86 70 0.2667 0.2791 0.3429 0.014
37 1n7f:A 86 72 0.2444 0.2558 0.3056 0.018 1n7f:B
38 6nid:B 88 59 0.1889 0.1932 0.2881 0.022 6nid:A, 6nid:C
39 2kpl:A 129 61 0.1889 0.1318 0.2787 0.026
40 3ch8:A 190 67 0.2222 0.1053 0.2985 0.027 2qbw:A
41 6gbe:A 119 54 0.1778 0.1345 0.2963 0.032
42 5n7d:A 423 61 0.1889 0.0402 0.2787 0.034 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
43 2ejy:A 85 56 0.1889 0.2000 0.3036 0.037
44 7qqn:C 414 84 0.2778 0.0604 0.2976 0.041 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
45 2jk8:A 291 39 0.1667 0.0515 0.3846 0.091 5nh2:A
46 6kz1:A 97 61 0.2000 0.1856 0.2951 0.097 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
47 6ar4:B 87 71 0.2111 0.2184 0.2676 0.099 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
48 7pcb:A 415 70 0.2000 0.0434 0.2571 0.12 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
49 5f67:A 98 70 0.2556 0.2347 0.3286 0.13 5f67:B
50 7pc5:A 405 72 0.2778 0.0617 0.3472 0.15
51 8sxg:A 366 76 0.2889 0.0710 0.3421 0.16 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
52 6u0p:C 585 31 0.1444 0.0222 0.4194 0.38 6u0p:A, 6u0p:B, 6u0p:D, 6u0p:E, 6u0p:F, 6u0s:A, 6u0s:B, 6u0s:C, 6u0s:D, 6u0s:E, 6u0s:F
53 6q0m:B 94 79 0.2111 0.2021 0.2405 0.49
54 1ihj:B 95 76 0.2333 0.2211 0.2763 0.50 1ihj:A
55 4wsi:A 372 47 0.1444 0.0349 0.2766 0.56 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
56 7w93:A 307 69 0.1889 0.0554 0.2464 0.65 7vsk:A, 7vte:A, 7vte:B, 7vte:C, 7vte:D, 7vtf:A, 7vtf:B, 7vtf:C, 7vtf:D, 7vtg:A, 7vtg:B, 7vtg:C, 7vtg:D, 7vva:A, 7vva:B, 7vva:C, 7vva:D
57 2r4h:C 98 75 0.2000 0.1837 0.2400 0.91
58 8blu:B 195 52 0.1778 0.0821 0.3077 0.97 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
59 6gua:A 821 31 0.1333 0.0146 0.3871 2.8 6gua:B, 6gua:C, 6gua:D, 6gua:E, 6gua:F, 6gua:G, 6gua:H
60 1zub:A 109 77 0.2111 0.1743 0.2468 3.2
61 6vbg:B 397 36 0.1778 0.0403 0.4444 3.5 6c9w:A, 4oaa:A, 4oaa:B, 6vbg:A, 2y5y:A, 2y5y:B, 4zyr:A, 4zyr:B
62 4od5:A 274 17 0.1222 0.0401 0.6471 5.8 4od5:B, 4od5:C, 4od5:D, 4od5:E
63 7ri3:C 583 62 0.1667 0.0257 0.2419 5.9 7ri3:A, 7ri3:B, 7ri3:D
64 1u38:A 89 55 0.1889 0.1910 0.3091 6.7
65 5ocs:A 369 58 0.2111 0.0515 0.3276 7.0 5ocs:C
66 2m0u:A 117 60 0.1889 0.1453 0.2833 7.2
67 8xud:D 651 55 0.1889 0.0261 0.3091 8.0 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
68 7yiv:A 484 35 0.1444 0.0269 0.3714 9.5 7yiv:D, 7yiv:C, 7yiv:B, 7yiv:G, 7yiv:H, 7yiv:F, 7yiv:E, 7yiw:A, 7yiw:D, 7yiw:C, 7yiw:B, 7yiw:G, 7yiw:H, 7yiw:F, 7yiw:E, 7yix:A, 7yix:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218