Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SLLPVPYTEAASLSTGSTVTIKGRPLVCFLNEPYLQVDFHTEMKEESDIVFHFQVCFGRRVVMNSREYGAWKQQVESKNM
PFQDGQEFELSISVLPDKYQVMVNGQSSYTFDHRIKPEAVKMVQVWRDISLTKFNVSYLKR

The query sequence (length=141) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6l6a:A 142 141 1.0000 0.9930 1.0000 1.55e-105 6a1t:A, 1g86:A, 6gku:A, 1hdk:A, 6l64:A, 6l67:A, 6l68:A, 6l6b:A, 6l6c:A, 1qkq:A, 6qrn:A, 5xrg:A, 5xri:A, 5xrk:A, 5xrl:A, 5xrm:A, 5xrn:A, 5xro:A, 5xrp:A, 5yt4:A
2 7xxy:A 137 136 0.7872 0.8102 0.8162 3.92e-81 7xxv:A
3 7cya:A 139 136 0.5532 0.5612 0.5735 6.92e-51
4 6a62:A 138 137 0.5390 0.5507 0.5547 1.20e-47 6a63:A, 6a64:A, 5xg8:A
5 6ljq:A 140 131 0.5106 0.5143 0.5496 1.58e-46 6ljr:A
6 6k2z:A 138 137 0.4823 0.4928 0.4964 1.03e-44 6k2z:B
7 6n3r:C 136 130 0.3830 0.3971 0.4154 1.42e-23 6n3r:B, 6n3r:D, 6n3r:F, 6n3r:H
8 3i8t:A 140 134 0.3333 0.3357 0.3507 6.69e-21
9 4xzp:A 148 134 0.3121 0.2973 0.3284 9.29e-16 5duu:A, 5duu:B, 5duu:C, 5duu:D, 5duv:A, 5duv:B, 5duv:C, 5duv:D, 5duw:A, 5duw:B, 5duw:C, 5duw:D, 5dux:B, 5dux:D, 5dux:A, 5dux:C
10 4han:A 293 141 0.2766 0.1331 0.2766 1.93e-13 7aen:A, 7aen:B, 7als:A, 7als:B, 3ap4:A, 3ap4:B, 3ap4:C, 3ap4:D, 3ap6:A, 3ap6:B, 3ap6:C, 3ap6:D, 3ap7:A, 3ap9:A, 4bmb:A, 4bme:A, 4bme:B, 8cm8:A, 8cm8:B, 4fqz:A, 4gxl:A, 5gzc:A, 5gzd:A, 5gze:A, 5gzf:A, 5gzg:A, 4han:B, 7p11:A, 7p11:B, 7p1m:A, 7p1m:B, 5t7i:A, 5t7s:A, 5t7t:A, 5t7u:A, 3vkl:A, 3vkl:B, 3vkm:A, 3vkm:B, 3vko:A, 3vko:B, 5vwg:A, 6w4z:A, 6w4z:B, 2yxs:A, 6z6y:A
11 4han:A 293 134 0.2553 0.1229 0.2687 0.005 7aen:A, 7aen:B, 7als:A, 7als:B, 3ap4:A, 3ap4:B, 3ap4:C, 3ap4:D, 3ap6:A, 3ap6:B, 3ap6:C, 3ap6:D, 3ap7:A, 3ap9:A, 4bmb:A, 4bme:A, 4bme:B, 8cm8:A, 8cm8:B, 4fqz:A, 4gxl:A, 5gzc:A, 5gzd:A, 5gze:A, 5gzf:A, 5gzg:A, 4han:B, 7p11:A, 7p11:B, 7p1m:A, 7p1m:B, 5t7i:A, 5t7s:A, 5t7t:A, 5t7u:A, 3vkl:A, 3vkl:B, 3vkm:A, 3vkm:B, 3vko:A, 3vko:B, 5vwg:A, 6w4z:A, 6w4z:B, 2yxs:A, 6z6y:A
12 4wvv:A 145 101 0.2340 0.2276 0.3267 9.61e-12 4wvw:A
13 7xbl:B 136 126 0.2411 0.2500 0.2698 1.41e-11 2gal:A, 2gal:B, 3gal:A, 3gal:B, 4gal:B, 5gal:B, 5h9q:B, 5h9s:B, 7n57:A, 7n57:B, 7n8d:A, 7n8d:B, 7rdg:C, 7rdg:B, 7rdg:A, 7rdg:D, 7tkx:A, 7tkx:B, 7tkz:B, 7tkz:A, 7tro:B, 4uw3:A, 4uw4:B, 4uw5:A, 4uw5:D, 4uw5:F, 4uw6:B, 6vto:A, 6vto:B, 6vtq:A, 6vtq:B, 6vts:A, 6vts:B, 7xac:A, 7xac:B, 4xbq:A, 4xbq:B, 7xbl:A, 4y26:A, 4y26:B, 3zxe:A, 3zxe:B
14 3wv6:A 284 139 0.2908 0.1444 0.2950 2.28e-11 2eak:A, 2eak:C, 2eal:A, 2eal:B, 3lse:A, 3nv2:A, 3nv3:A, 3nv4:A, 3wlu:A, 3wlu:B, 3wlu:C, 3wlu:D, 3wv6:B, 2yy1:A, 2zhk:A, 2zhk:B, 2zhl:A, 2zhl:B, 2zhl:C, 2zhl:D, 2zhm:A, 2zhm:B, 2zhm:C, 2zhm:D, 2zhn:A
15 3wv6:A 284 98 0.2057 0.1021 0.2959 4.57e-05 2eak:A, 2eak:C, 2eal:A, 2eal:B, 3lse:A, 3nv2:A, 3nv3:A, 3nv4:A, 3wlu:A, 3wlu:B, 3wlu:C, 3wlu:D, 3wv6:B, 2yy1:A, 2zhk:A, 2zhk:B, 2zhl:A, 2zhl:B, 2zhl:C, 2zhl:D, 2zhm:A, 2zhm:B, 2zhm:C, 2zhm:D, 2zhn:A
16 2d6n:B 153 135 0.2837 0.2614 0.2963 1.49e-09 2d6m:A, 2d6m:B, 2d6n:A, 2d6o:X, 2d6p:A, 2d6p:B
17 4ylz:C 140 134 0.2695 0.2714 0.2836 8.18e-09 5cbl:A, 5cbl:B, 5cbl:C, 5cbl:D, 6wab:A, 6wab:B, 4ylz:A, 4ylz:B, 4ylz:D, 4ym0:D, 4ym0:A, 4ym0:B, 4ym0:C, 4ym1:A, 4ym1:B, 4ym1:C, 4ym2:A, 4ym2:B, 4ym2:C, 4ym2:D, 4ym3:A, 4ym3:B, 4ym3:C, 4ym3:D
18 7df6:A 139 99 0.1844 0.1871 0.2626 9.50e-09 7cxb:A, 7cxc:A, 7cxc:B, 7cxd:A, 7cxd:B, 7cxd:D, 7cxd:E, 7df6:B, 8ilu:A, 8ilu:B, 8iu1:A
19 5glt:A 278 131 0.2482 0.1259 0.2672 1.46e-08 5glt:B, 5glu:A, 5glu:B, 5glw:A, 5glz:A, 5glz:B, 5glz:C, 5gm0:A, 5gm0:B
20 5glt:A 278 134 0.2340 0.1187 0.2463 6.25e-06 5glt:B, 5glu:A, 5glu:B, 5glw:A, 5glz:A, 5glz:B, 5glz:C, 5gm0:A, 5gm0:B
21 6fof:A 153 96 0.1844 0.1699 0.2708 1.76e-08 1a3k:A, 3aya:A, 3aya:B, 3ayc:B, 3ayd:A, 3aye:A, 3aye:B, 6b8k:A, 4bli:A, 4blj:A, 4bm8:A, 8bz3:A, 7cxa:A, 7cxa:B, 7df5:A, 5e88:A, 5e89:A, 5e8a:A, 6eog:A, 6eol:A, 5exo:A, 6exy:A, 6eym:A, 6f6y:A, 6fk2:A, 6fof:C, 6fof:D, 6fof:E, 6fof:G, 6fof:B, 6fof:F, 6fof:H, 6fof:I, 6fof:J, 6fof:K, 6fof:L, 6g0v:A, 6h64:A, 6h64:F, 6h64:B, 6h64:E, 6h64:C, 6h64:D, 5h9p:A, 5h9r:A, 6i74:A, 6i75:A, 6i76:A, 6i77:A, 6i78:A, 8itx:A, 8itx:B, 8itz:A, 5iuq:A, 4jc1:A, 4jck:A, 1kjl:A, 1kjr:A, 6kxa:A, 6kxb:A, 4lbj:A, 4lbk:A, 4lbl:A, 4lbm:A, 4lbn:A, 4lbo:A, 5nf7:A, 5nf9:A, 5nfa:A, 5nfb:A, 2nmn:A, 2nmo:A, 2nn8:A, 5oax:A, 5ody:A, 8oji:A, 8ojk:A, 8ojm:A, 8ojo:A, 8pbf:A, 8pf9:A, 8pff:A, 8ppn:A, 6q0q:A, 6q17:A, 6qge:A, 6qgf:A, 6qln:A, 6qlo:A, 6qlp:A, 6qlq:B, 6qlr:A, 6qls:A, 6qlt:A, 6qlu:A, 4r9a:A, 4r9b:A, 4r9c:A, 4r9d:A, 7rdo:A, 7rdp:A, 7rgx:A, 7rgy:A, 7rgz:A, 6rhl:A, 6rhm:A, 7rh0:A, 7rh1:A, 7rh3:A, 7rh4:A, 4rl7:A, 6rzf:A, 6rzg:A, 6rzh:A, 6rzi:A, 6rzj:A, 6rzk:A, 6rzl:A, 6rzm:A, 3t1l:A, 3t1m:A, 6tf6:A, 6tf7:A, 4xbn:A, 7xfa:A, 2xg3:A, 6y4c:A, 6y78:A, 7zqx:A, 3zsj:A, 3zsk:A
22 2wt0:A 300 123 0.2553 0.1200 0.2927 5.29e-07 2wsv:A, 2wt1:A, 2wt2:A, 2wt2:B
23 2wt0:A 300 142 0.2482 0.1167 0.2465 8.46e-06 2wsv:A, 2wt1:A, 2wt2:A, 2wt2:B
24 3ajy:A 133 72 0.1560 0.1654 0.3056 8.79e-07 3ajy:C
25 3vv1:A 141 101 0.1915 0.1915 0.2673 7.29e-06 3vv1:B
26 3ajz:A 132 72 0.1489 0.1591 0.2917 1.24e-05 3ak0:A, 3ak0:B
27 1sla:A 134 101 0.1844 0.1940 0.2574 1.25e-05 1slb:A, 1slb:C, 1slc:A, 1slc:B, 1slt:A, 1slt:B
28 5jpg:A 144 99 0.2128 0.2083 0.3030 2.05e-05 5jpg:B
29 5nld:B 138 128 0.1986 0.2029 0.2188 4.79e-05 5nle:A, 5nle:B, 5nle:C, 5nle:D, 5nlh:A, 5nm1:A, 5nm1:B, 5nm1:C, 5nm1:D, 5nmj:A, 7p8h:C, 7p8h:A
30 6m5y:A 270 101 0.1844 0.0963 0.2574 3.41e-04 8b0w:A, 8b0w:B, 8b0z:A, 8b0z:B, 6b94:A, 6b94:B, 6f83:A, 6f83:B, 1gzw:A, 1gzw:B, 7lta:A, 5mwt:A, 5mwt:B, 5mwx:A, 5mwx:B, 7nml:B, 8ojp:A, 8ojp:B, 3oy8:A, 3oy8:B, 3oyw:A, 3oyw:B, 4q1p:A, 4q1p:B, 4q1r:A, 4q1r:B, 4q26:A, 4q26:B, 4q26:G, 4q26:H, 4q27:A, 4q27:B, 4q2f:A, 4q2f:B, 8r74:A, 8r74:B, 3t2t:A, 4xbl:A, 4xbl:B, 4y1u:B, 4y1u:A, 4y1v:A, 4y1v:B, 4y1x:A, 4y1x:B, 4y1y:A, 4y1y:B, 4y1z:A, 4y1z:B, 4y20:A, 4y20:B, 4y22:B, 4y24:A, 4y24:B
31 6m5y:A 270 101 0.1844 0.0963 0.2574 3.41e-04 8b0w:A, 8b0w:B, 8b0z:A, 8b0z:B, 6b94:A, 6b94:B, 6f83:A, 6f83:B, 1gzw:A, 1gzw:B, 7lta:A, 5mwt:A, 5mwt:B, 5mwx:A, 5mwx:B, 7nml:B, 8ojp:A, 8ojp:B, 3oy8:A, 3oy8:B, 3oyw:A, 3oyw:B, 4q1p:A, 4q1p:B, 4q1r:A, 4q1r:B, 4q26:A, 4q26:B, 4q26:G, 4q26:H, 4q27:A, 4q27:B, 4q2f:A, 4q2f:B, 8r74:A, 8r74:B, 3t2t:A, 4xbl:A, 4xbl:B, 4y1u:B, 4y1u:A, 4y1v:A, 4y1v:B, 4y1x:A, 4y1x:B, 4y1y:A, 4y1y:B, 4y1z:A, 4y1z:B, 4y20:A, 4y20:B, 4y22:B, 4y24:A, 4y24:B
32 1w6m:A 134 101 0.1773 0.1866 0.2475 7.30e-04 1w6m:B, 1w6o:A, 1w6o:B, 1w6p:A, 1w6p:B, 2zkn:A
33 1is3:A 134 73 0.1348 0.1418 0.2603 0.002 1is4:A, 1wld:A, 1wlw:A
34 4ga9:A 134 93 0.1418 0.1493 0.2151 0.005 4ga9:B, 3m2m:A, 3m2m:C, 3m2m:D, 3m2m:E, 3m2m:H, 4no4:A, 4no4:B, 4no4:C, 4no4:D, 4no4:E, 4no4:F
35 6e20:B 133 114 0.2128 0.2256 0.2632 0.010 6e20:A
36 2ymz:B 130 123 0.2057 0.2231 0.2358 0.011 2ymz:D
37 3wud:A 132 87 0.1348 0.1439 0.2184 0.012
38 5dg2:B 131 89 0.1348 0.1450 0.2135 0.016 5dg1:C, 5dg1:H, 5dg1:D, 5dg1:I, 5ews:C, 5ews:D, 5ews:A, 5ews:G, 5ews:H, 5ews:I, 5ews:J, 5ews:K, 5ews:M, 5ews:N, 1hlc:A, 1hlc:B
39 1c1l:A 135 74 0.1418 0.1481 0.2703 0.044
40 1a78:A 134 83 0.1773 0.1866 0.3012 0.061 1a78:B, 1gan:A, 1gan:B
41 7x4n:E 332 21 0.0780 0.0331 0.5238 0.85
42 4j1q:A 417 110 0.1631 0.0552 0.2091 1.1
43 3wuc:B 137 48 0.1064 0.1095 0.3125 2.0 3wuc:A
44 3ldg:A 377 37 0.0851 0.0318 0.3243 2.8
45 8a22:Ad 193 32 0.0922 0.0674 0.4062 3.4 8apn:Ad, 8apo:Ad
46 5ck3:B 270 39 0.0851 0.0444 0.3077 3.7
47 7ofx:B 665 89 0.1348 0.0286 0.2135 6.9 7ofx:A, 7ofx:C, 7ofx:D, 5ohs:A, 5ohs:B, 5ohs:C, 5ohs:D, 5ohs:E, 5ohs:F, 5ohs:G, 5ohs:H, 5ohy:A, 5ohy:B, 5ohy:C, 5ohy:D
48 7nyc:C 809 54 0.1277 0.0222 0.3333 7.0 7nyd:C
49 7c3k:B 389 47 0.0922 0.0334 0.2766 8.5 7c3k:A, 8jqz:A, 8jqz:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218