Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SLATDKDKLSYSIGADLGKNFKNQGIDVNPEAMAKGMQDAMSGAQLALTEQQMKDVLNKFQKDLMAKRTAEFNKKADENK
VKGEAFLTENKNKPGVVVLPSGLQYKVINSGNGVKPGKSDTVTVEYTGRLIDGTVFDSTEKTGKPATFQVSQVIPGWTEA
LQLMPAGSTWEIYVPSGLAYGPRSVGGPIGPNETLIFKIHLISVKKSS

The query sequence (length=208) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8bjd:A 208 208 1.0000 1.0000 1.0000 2.13e-153 8bje:A, 8bk5:A, 2vcd:A
2 1q6i:A 210 212 0.3558 0.3524 0.3491 4.88e-37 1q6i:B
3 8bk4:A 163 128 0.2933 0.3742 0.4766 7.71e-35 8p3d:A, 8p42:A, 8p42:D
4 8p3c:B 126 111 0.2163 0.3571 0.4054 2.00e-20
5 4giv:A 192 111 0.2115 0.2292 0.3964 1.80e-19 4dz2:A, 4dz2:B, 4dz3:A, 4dz3:B, 4fn2:A, 4fn2:B, 4g50:A, 4g50:B, 4ggq:C, 4ggq:A, 4ggq:B, 4ggq:D, 4giv:B, 5klx:A, 5klx:B, 5klx:D, 5klx:C, 2ko7:A, 2l2s:A, 6o49:A, 6o49:B, 6o4a:A, 6o4a:B, 6o4a:C, 6o4a:D, 3uf8:A, 3uqa:A, 3uqb:A, 5v8t:A, 5v8t:B, 3vaw:A
6 5hw8:B 122 117 0.2260 0.3852 0.4017 5.03e-18 5hw8:A, 5hw8:C, 5hw8:D, 5hw8:E, 5hw8:F, 5hw8:G, 5hw8:H, 6tz6:C, 6tz6:F
7 6tz8:C 111 106 0.1971 0.3694 0.3868 1.92e-15 6tz8:F
8 5hua:A 113 106 0.1923 0.3540 0.3774 6.08e-15 1yat:A
9 7u0s:A 124 107 0.1971 0.3306 0.3832 1.19e-14 5hwc:A, 6tz7:C, 7u0s:B, 7u0u:B, 6vcv:A, 6vcv:B
10 4nnr:A 102 97 0.1635 0.3333 0.3505 2.09e-13 4nnr:B
11 6vrx:A 108 106 0.1875 0.3611 0.3679 6.53e-13 6vct:A, 6vrx:B, 6vrx:C, 6vrx:D
12 8xi9:A 201 107 0.1779 0.1841 0.3458 1.44e-12 1a7x:A, 1a7x:B, 1bkf:A, 1bl4:A, 1bl4:B, 8chi:A, 8chi:B, 8chj:A, 8chj:B, 8chj:C, 8chj:D, 8chk:A, 8chk:B, 8chk:C, 8chl:A, 8chl:B, 8chm:A, 1d7i:A, 1d7i:B, 1d7j:A, 1d7j:B, 2dg3:A, 2dg4:A, 2dg9:A, 4dh0:A, 8er6:A, 8er6:C, 8er6:E, 8er7:A, 8er7:C, 8er7:E, 8era:B, 1f40:A, 1fap:A, 2fap:A, 3fap:A, 4fap:A, 1fkb:A, 1fkd:A, 1fkf:A, 1fkg:A, 1fkh:A, 1fki:A, 1fki:B, 1fkj:A, 1fkl:A, 2fke:A, 1j4h:A, 1j4i:A, 1j4r:A, 1j4r:B, 1j4r:D, 6m4u:A, 6m4u:E, 6m4v:B, 6m4v:D, 6m4w:D, 6m4w:E, 6m4w:F, 1nsg:A, 6oqa:A, 6oqa:B, 6oqa:E, 6oqa:F, 8pdf:A, 8ppz:A, 1qpf:A, 1qpf:D, 1qpl:A, 1qpl:C, 1tco:C, 7u0t:B, 7u8d:A, 7u8d:B, 6vcu:A, 6vcu:C, 6vcu:D, 6vcu:B, 6yf0:A, 6yf1:A, 6yf2:A, 6yf3:A
13 5b8i:C 119 111 0.1971 0.3445 0.3694 1.73e-12
14 6mke:A 117 106 0.1875 0.3333 0.3679 3.57e-12 6mke:B, 6mke:C, 6mke:D
15 1c9h:A 107 107 0.1779 0.3458 0.3458 3.71e-12 5hkg:A
16 5d75:A 120 101 0.1875 0.3250 0.3861 1.79e-11 5gpg:A, 3kz7:A, 1pbk:A
17 3pa7:A 124 94 0.1635 0.2742 0.3617 1.56e-10 3ihz:A, 3ihz:B, 4itz:A, 4itz:B, 4j4o:A, 4mgv:A
18 7f2j:A 117 116 0.1923 0.3419 0.3448 8.20e-10 7f2j:B, 6j2m:A
19 4lax:A 237 106 0.1971 0.1730 0.3868 2.41e-09 4drj:A, 4lay:A, 6rcy:A, 4tw8:A, 4tw8:B
20 4qt3:A 125 94 0.1538 0.2560 0.3404 3.96e-09 4j4n:A, 4j4n:B, 4j4n:C, 4qt2:A, 2vn1:A, 2vn1:B
21 4msp:A 189 91 0.1538 0.1693 0.3516 1.46e-08 4msp:B
22 8z38:B 113 98 0.1683 0.3097 0.3571 1.98e-08 8z38:A
23 5njx:A 413 102 0.1635 0.0823 0.3333 1.04e-07 7a6w:AAA, 7a6w:BBB, 7a6x:AAA, 7aot:A, 7aou:A, 7apq:A, 7aps:A, 7aps:B, 7apt:A, 7apw:A, 7awf:A, 7awx:A, 7awx:B, 7b9y:A, 7b9z:A, 7ba0:A, 8ba6:A, 8baj:A, 5bxj:A, 8cca:A, 8ccb:A, 8ccc:A, 8ccd:A, 8cce:A, 8ccf:A, 8ccg:A, 8cch:A, 8chn:A, 8chp:A, 8chq:A, 8chr:A, 5dit:A, 5diu:A, 5div:A, 4drh:A, 4drh:D, 4dri:A, 4drk:A, 4drk:B, 4drm:A, 4drn:A, 4dro:A, 4drp:A, 4drq:A, 7ett:A, 7etu:A, 7etv:A, 9eu6:A, 9eu7:A, 9eu7:B, 9eu8:A, 9eu8:B, 9eu9:A, 9eu9:B, 9eua:A, 9eua:B, 9eub:A, 9eub:B, 9euc:A, 9euc:B, 9eud:A, 9eud:B, 9eue:A, 9eue:B, 9ey3:A, 9ey4:A, 4jfi:A, 4jfj:A, 4jfk:A, 4jfl:A, 4jfm:A, 3o5f:A, 3o5r:A, 5obk:A, 8pc2:G, 8pc2:H, 8pj8:A, 8pja:A, 7r0l:A, 8r5k:A, 6saf:A, 4tw6:A, 4tw7:A, 4tx0:A, 6tx4:A, 6tx5:A, 6tx6:A, 6tx7:A, 6tx9:A, 6txx:A, 4w9o:A, 4w9o:E, 4w9p:A, 4w9p:E, 4w9q:A
24 4odq:A 106 95 0.1394 0.2736 0.3053 4.97e-06 4odp:A, 4odr:A, 4odr:B, 7oxg:A, 7oxg:B
25 7oxj:A 156 74 0.1154 0.1538 0.3243 0.003 3luo:A, 4odk:A, 4odl:B, 4odl:A, 4odm:A, 4odm:B, 4odm:C, 4odm:D, 4odn:A, 4odo:A, 4odo:C, 4odo:B, 7oxh:A, 7oxi:A, 7oxk:A
26 1zgl:H 168 57 0.0913 0.1131 0.3333 0.003
27 8cmb:B 194 62 0.1010 0.1082 0.3387 0.015 8cmh:B, 4fqx:B, 2fse:B, 2fse:D, 1fv1:B, 1fv1:E, 4gbx:B, 1h15:B, 1h15:E, 8pje:E, 4x5w:B, 7yx9:B, 1zgl:B, 1zgl:E
28 5nig:B 197 62 0.0962 0.1015 0.3226 0.055 4aen:B, 1aqd:B, 1aqd:E, 1aqd:H, 1aqd:K, 6atf:B, 6atf:E, 6ati:B, 6ati:E, 6atz:B, 6atz:D, 6bij:B, 6bil:B, 6bin:B, 6bir:B, 6biv:A, 6bix:B, 6biy:B, 6biz:B, 1bx2:B, 1bx2:E, 4c56:E, 4c56:K, 8cmc:B, 8cmd:B, 8cmd:E, 8cmd:H, 8cme:B, 8cme:E, 8cme:H, 8cmf:B, 8cmf:E, 8cmg:B, 8cmi:B, 8cmi:E, 8cmi:H, 6cpl:B, 6cpn:B, 6cpo:B, 6cpo:E, 6cqj:B, 6cqj:E, 6cqj:H, 6cql:B, 6cqn:B, 6cqq:B, 6cqq:G, 6cqr:B, 6cqr:G, 1d5m:B, 1d5x:B, 1d5z:B, 1d6e:B, 1dlh:B, 1dlh:E, 4e41:B, 4e41:G, 1fyt:B, 2g9h:B, 4h25:B, 4h26:B, 4h26:E, 6hby:B, 6hby:E, 1hqr:B, 1hxy:B, 4i5b:B, 4i5b:E, 2iam:B, 2ian:B, 2ian:G, 2ian:L, 2ian:Q, 2icw:B, 2icw:E, 2ipk:B, 4is6:B, 1j8h:B, 5jlz:B, 5jlz:D, 1jwm:B, 1jws:B, 1jwu:B, 1kg0:B, 1klg:B, 1klu:B, 3l6f:B, 5lax:B, 5lax:D, 1lo5:B, 4mcy:B, 4mcz:B, 4md0:B, 4md4:B, 4md5:B, 4mdi:B, 4mdj:B, 5ni9:B, 6nix:B, 7nze:DDD, 7nze:BBB, 7nzf:BBB, 7nzh:BBB, 7nzh:DDD, 7o00:BBB, 2oje:B, 2oje:F, 4ov5:B, 4ov5:E, 4ov5:H, 4ov5:K, 4ov5:N, 4ov5:Q, 3pdo:B, 3pgc:B, 3pgc:E, 3pgd:B, 3pgd:E, 8pje:B, 8pjf:B, 8pjg:B, 1pyw:B, 3qxa:B, 3qxa:E, 3qxd:E, 3qxd:B, 6qza:BBB, 6qza:EEE, 6qzc:BBB, 6qzd:BBB, 6qzd:EEE, 6r0e:BBB, 1r5i:B, 1r5i:F, 3s4s:B, 3s4s:E, 3s5l:B, 3s5l:E, 1seb:B, 1seb:F, 2seb:B, 1sje:B, 1sjh:B, 1t5w:B, 1t5w:E, 1t5x:B, 8tbp:B, 8tbp:D, 8trl:B, 8trl:E, 8trq:B, 8trr:B, 8trr:G, 6v0y:B, 6v13:B, 6v15:B, 6v18:B, 6v19:B, 6v1a:B, 2xn9:E, 4y19:B, 4y1a:B, 1ymm:B, 7yx9:D, 7yxb:B, 7yxb:D, 1zgl:K
29 2q6w:B 188 62 0.0865 0.0957 0.2903 0.51 1a6a:B, 3c5j:B, 4h1l:B, 4h1l:E, 4h25:E, 7n19:B, 7n19:E, 7n19:H, 7n19:K, 2q6w:E
30 7z0q:D 176 57 0.0769 0.0909 0.2807 0.58
31 6bni:A 502 40 0.0865 0.0359 0.4500 1.6 6bni:B, 6c86:A, 6c86:B, 5eln:A, 5eln:B, 5eln:C, 5eln:D, 5elo:A, 5elo:B, 5elo:C, 5elo:D, 6hcw:A, 6hcw:B, 7zog:A, 7zog:B, 7zog:C, 7zog:D
32 7ae4:a 67 25 0.0481 0.1493 0.4000 1.9 7ae4:b, 7ae4:c, 7ae4:d, 7ae4:e, 7ae4:f, 7ae5:b, 7ae5:c, 7ae5:d, 7ae5:e, 7ae5:f, 7ae5:a, 7ae7:a, 7ae7:c, 7ae7:d, 7ae7:e, 7ae7:f
33 7ev9:A 382 92 0.1154 0.0628 0.2609 2.6 7ev9:E, 7ev9:I, 8oyi:A, 8oyi:E, 8oyi:I, 3rgb:A, 3rgb:E, 3rgb:I, 7s4h:A, 7s4h:E, 7s4h:I, 7s4i:A, 7s4i:E, 7s4i:I, 7s4j:A, 7s4j:E, 7s4j:I, 7s4k:A, 7s4k:E, 7s4k:I, 8sqw:A, 8sqw:E, 8sqw:I, 8sr1:A, 8sr1:E, 8sr1:I, 8sr2:A, 8sr2:E, 8sr2:I, 8sr4:A, 8sr4:E, 8sr4:I, 8sr5:A, 8sr5:E, 8sr5:I, 7t4o:A, 7t4o:E, 7t4o:I, 7t4p:A, 7t4p:E, 7t4p:I, 1yew:A, 1yew:E, 1yew:I
34 5mgx:G 266 87 0.1154 0.0902 0.2759 2.6 5mgx:F, 5mgx:E, 5mgx:H
35 1a65:A 504 65 0.1010 0.0417 0.3231 3.7 1hfu:A
36 7zbw:C 709 50 0.0673 0.0197 0.2800 6.0 8cdj:C
37 7oi6:y 331 42 0.0769 0.0483 0.3810 6.1 8pk0:t
38 8bad:B 351 61 0.0865 0.0513 0.2951 6.3 8bad:A
39 1wu5:A 376 52 0.0721 0.0399 0.2885 6.8 1wu6:A
40 1e3d:B 537 55 0.0769 0.0298 0.2909 7.1 1e3d:D
41 6ged:A 295 55 0.1058 0.0746 0.4000 7.5
42 2vvf:A 269 34 0.0721 0.0558 0.4412 9.4 2vvf:B, 2vvf:C, 2vvf:D, 2vvf:E, 2vvf:F, 2w0c:A, 2w0c:B, 2w0c:C, 2w0c:D, 2w0c:E, 2w0c:F, 2w0c:G, 2w0c:H, 2w0c:I, 2w0c:J

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218