Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SLASLYVRPPVTCYTDACEAPVAMWNGAIPLKEYVTKLYSHPLEASPTRLSFNDINSMYCVGNDELMQFFPEGLGGKVMQ
LMPPGHPRGFLYRKEAHLLNLFIDKIQHWQAKRNVLSSLTNNRPGFIIDGPKGCGKSALMCQVVHYARSRNLLTLYVPNA
KEWTHGEWCWPSTILPGFFDAPDAARFFLRYFAKANRSTLLSWRLKCTPNDLPVEQGERQPQNLYELCEWGHQVVAPASI
DRQSVCVKFLMDELSAEKKLPIVIVVDGWNLFSHDTHFRYPHPDFLRTLASLNDDSTDIDLYPQELPRIPASRLGFVRGL
NKMILSKDEPNKFFFTCTTRDFKPFDGISGFPDVETDRFTNSLDEYAPYDAEKDSLFHPIQLGNFDEYEFRAFTRFLVNS
GELAGLGWGPLWHFSSDFERKLYKIGFLSNRNPQGVIDHYHQELVWRYEYQRTRQKQYLLHRNME

The query sequence (length=465) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7aor:r 465 465 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 7pua:Cg 487 476 0.8516 0.8131 0.8319 0.0 6hiv:Cg, 6hiw:Cg, 6hiz:Cg, 7pub:Cg, 6sg9:Cg, 6sgb:Cg
3 6xyw:Bw 337 263 0.1570 0.2166 0.2776 6.15e-17
4 6gaw:Ag 353 316 0.1634 0.2153 0.2405 1.22e-06 5aj3:g, 5aj4:Ag, 6gaz:Ag, 3jd5:g, 6neq:g, 6nf8:g, 7nqh:Ag, 7nql:Ag, 7nsi:Ag, 7nsj:Ag, 8oin:AX, 8oip:AX, 6ydp:Ag, 6ydw:Ag
5 8a22:Bw 349 154 0.0925 0.1232 0.2792 1.61e-05 8apn:Bw, 8apo:Bw
6 7pnt:X 357 324 0.1677 0.2185 0.2407 8.54e-05 7pnu:X, 7pnv:X, 7pnw:X
7 7l08:AX 353 156 0.0882 0.1161 0.2628 5.92e-04 8any:AX, 8csp:X, 8csq:X, 8csr:X, 8css:X, 8cst:X, 8csu:X, 8k2a:Se, 7og4:AX, 8oir:AX, 8ois:AX, 7p2e:X, 7pnx:X, 7pny:X, 7pnz:X, 7po0:X, 7po1:X, 7po2:X, 7po3:X, 7qi4:AX, 7qi5:AX, 7qi6:AX, 8qrk:X, 8qrl:X, 8qrm:X, 8qrn:X, 6rw4:X, 6rw5:X, 6vlz:AX, 6vmi:AX, 8xt0:Se, 8xt2:Se, 6zm5:AX, 6zm6:AX, 6zs9:AX, 6zsa:AX, 6zsb:AX, 6zsc:AX, 6zsd:AX, 6zse:AX, 6zsg:AX
8 6z1p:Bw 662 89 0.0516 0.0363 0.2697 5.92e-04
9 7pkq:x 368 49 0.0344 0.0435 0.3265 0.003
10 7a5f:X6 316 71 0.0452 0.0665 0.2958 0.004 7a5g:X6, 7a5i:X6, 7a5k:X6, 3j9m:AX, 6nu2:AX, 6nu3:AX
11 8om2:W 402 154 0.0774 0.0896 0.2338 0.038 8d8k:W, 8d8l:W, 5mrc:WW, 5mre:WW, 5mrf:WW, 8om3:W, 8om4:W
12 6yw5:XX 408 88 0.0473 0.0539 0.2500 0.24 6ywe:XX, 6ywx:XX, 6ywy:XX
13 6hyp:A 2272 61 0.0387 0.0079 0.2951 0.64
14 6ke6:RP 2052 94 0.0581 0.0132 0.2872 0.85
15 5fl3:A 354 52 0.0387 0.0508 0.3462 1.00
16 8oup:B 151 103 0.0538 0.1656 0.2427 1.2 8oup:A, 8oup:C, 8oup:D
17 6h25:J 868 75 0.0473 0.0253 0.2933 1.7 6d6q:K, 6d6r:K
18 6pdy:A 262 58 0.0344 0.0611 0.2759 1.8 6pe0:A
19 5jcs:s 2003 41 0.0344 0.0080 0.3902 4.1
20 6sc2:B 3930 89 0.0430 0.0051 0.2247 4.7 6rla:A, 6rla:B, 6sc2:A
21 4rh7:A 3005 89 0.0430 0.0067 0.2247 5.2
22 4ai6:A 2650 38 0.0301 0.0053 0.3684 5.2 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
23 8dzz:A 2363 38 0.0301 0.0059 0.3684 5.5 8dzz:D, 8e00:A
24 4w8f:B 2609 38 0.0301 0.0054 0.3684 5.6 220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
25 7mgm:A 2274 38 0.0301 0.0062 0.3684 5.6
26 6p25:B 690 80 0.0452 0.0304 0.2625 5.7 6p2r:B
27 3jb9:X 1195 30 0.0237 0.0092 0.3667 8.5
28 2iw3:B 980 45 0.0366 0.0173 0.3778 8.6 7b7d:EF, 2iw3:A, 2iwh:A, 2iwh:B
29 5juy:B 1234 65 0.0452 0.0170 0.3231 9.1 1cy5:A, 3j2t:A, 3j2t:B, 3j2t:C, 3j2t:D, 3j2t:E, 3j2t:F, 3j2t:G, 3jbt:A, 3jbt:C, 3jbt:E, 3jbt:G, 3jbt:I, 3jbt:K, 3jbt:M, 5juy:A, 5juy:C, 5juy:D, 5juy:E, 5juy:F, 5juy:G, 2p1h:A, 5wve:A, 5wve:C, 5wve:E, 5wve:G, 5wve:I, 5wve:K, 5wve:M, 1z6t:A, 1z6t:B, 1z6t:C, 1z6t:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218