BioLiP

>protein
SLAIKLIAIDMDGTLLLPDHTISPAVKNAIAAARARGVNVVLTTGRPYAGVHNYLKELHMEQPGDYCITYNGALVQKAAD
GSTVAQTALSYDDYRFLEKLSREVGSHFHALDRTTLYTANRDISYYTVHESFVATIPLVFCEAEKMDPNTQFLKVMMIDE
PAILDQAIARIPQEVKEKYTVLKSAPYFLEILDKRVNKGTGVKSLADVLGIKPEEIMAIGDQENDIAMIEYAGVGVAVDN
AIPSVKEVANFVTKSNLEDGVAFAIEKYVLN

The query sequence (length=271) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1rkq:A	271	271	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	1rkq:B
2	4dwo:A	268	263	0.2841	0.2873	0.2928	3.31e-33	3niw:A
3	1nf2:A	267	276	0.3063	0.3109	0.3007	2.37e-27	1nf2:B, 1nf2:C
4	1nrw:A	285	284	0.3100	0.2947	0.2958	7.07e-23
5	3pgv:A	259	280	0.2952	0.3089	0.2857	2.11e-19	3pgv:B, 3pgv:C, 3pgv:D
6	3r4c:A	268	273	0.2915	0.2948	0.2894	1.17e-17
7	2rar:A	261	271	0.2731	0.2835	0.2731	6.76e-17	2rav:A, 2rb5:A, 2rbk:A, 1ymq:A
8	4zev:A	290	279	0.2620	0.2448	0.2545	1.41e-16	4qjb:A, 4qjb:B, 4zev:B, 4zew:A, 4zew:B, 4zex:A, 4zex:B
9	2b30:A	284	276	0.2620	0.2500	0.2572	6.41e-12	2b30:B, 2b30:C, 2b30:D
10	1rlm:A	269	273	0.2362	0.2379	0.2344	1.01e-10	1rlm:B, 1rlm:C, 1rlm:D, 1rlo:A, 1rlo:B, 1rlo:C, 1rlo:D, 1rlt:A, 1rlt:B, 1rlt:C, 1rlt:D
11	3l7y:A	266	283	0.2509	0.2556	0.2403	1.06e-10
12	3n1u:A	182	77	0.0959	0.1429	0.3377	9.89e-07
13	2b1q:A	244	85	0.0959	0.1066	0.3059	1.65e-06	2b1r:A, 2d2v:A, 1s2o:A, 1tj3:A, 1tj4:A, 1tj5:A, 1u2s:A, 1u2t:A
14	1kyt:A	225	250	0.2030	0.2444	0.2200	1.34e-05	1kyt:B, 1l6r:A, 1l6r:B
15	8a1z:A	396	56	0.0812	0.0556	0.3929	9.68e-05	8a21:A, 5is2:A, 5it0:A, 5it4:A, 5jjb:A, 5jlp:A, 5jlr:A, 5jma:A, 3p96:A, 5t41:A
16	8q4s:A	295	47	0.0738	0.0678	0.4255	4.02e-04	7qpl:A
17	3gyg:D	250	209	0.1771	0.1920	0.2297	0.001
18	3gyg:B	230	75	0.0775	0.0913	0.2800	0.002
19	3gyg:A	285	75	0.0775	0.0737	0.2800	0.002	3gyg:C
20	4hgn:A	165	69	0.0664	0.1091	0.2609	0.007	4hgn:B, 4hgn:C, 4hgn:D
21	2i54:A	242	84	0.0959	0.1074	0.3095	0.010	2i54:B, 2i54:C, 2i55:A, 2i55:B, 2i55:C
22	1f5s:A	210	63	0.0849	0.1095	0.3651	0.014	1f5s:B, 1j97:A, 1j97:B, 1l7m:A, 1l7m:B, 1l7n:A, 1l7n:B, 1l7o:A, 1l7o:B, 1l7p:A, 1l7p:B
23	3mmz:D	174	75	0.0812	0.1264	0.2933	0.028	3mmz:A, 3mmz:B, 3mmz:C
24	1wzc:B	244	72	0.0849	0.0943	0.3194	0.043	1wzc:A
25	4um7:A	175	80	0.0738	0.1143	0.2500	0.074	4um5:A, 4um5:B, 4um5:C, 4um5:D, 4um7:B, 4um7:C, 4um7:D, 4ume:A, 4umf:A, 4umf:B, 4umf:C, 4umf:D
26	3nrj:I	177	58	0.0664	0.1017	0.3103	0.082	3nrj:A, 3nrj:B, 3nrj:C, 3nrj:D, 3nrj:E, 3nrj:F, 3nrj:G, 3nrj:H, 3nrj:J, 3nrj:K, 3nrj:L
27	3hyc:A	181	58	0.0738	0.1105	0.3448	0.11	3hyc:B, 3hyc:C, 3hyc:D, 3hyc:E, 3hyc:F, 3hyc:G, 3hyc:H, 3i6b:A, 3i6b:B, 3i6b:C, 3i6b:D, 2r8e:A, 2r8e:B, 2r8e:C, 2r8e:D, 2r8e:E, 2r8e:F, 2r8e:G, 2r8e:H, 2r8y:A, 2r8y:B, 2r8y:C, 2r8y:D, 2r8y:E, 2r8y:F, 2r8y:G, 2r8y:H, 2r8y:I, 2r8y:J, 2r8y:K, 2r8y:L, 2r8y:M, 2r8y:N, 2r8y:O, 2r8y:P, 2r8z:A, 2r8z:B, 2r8z:C, 2r8z:D, 2r8z:E, 2r8z:F, 2r8z:G, 2r8z:H, 2r8z:I, 2r8z:J, 2r8z:K, 2r8z:L, 2r8z:M, 2r8z:N, 2r8z:O, 2r8z:P
28	4ovy:A	305	72	0.0812	0.0721	0.3056	0.19
29	6iuy:A	585	29	0.0590	0.0274	0.5517	0.44	6iuy:B
30	7kya:A	1174	22	0.0480	0.0111	0.5909	0.64	7ky5:A, 7ky7:A, 7ky8:A, 7ky9:A
31	7kyc:A	1178	22	0.0443	0.0102	0.5455	0.98	7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
32	4ap9:A	200	63	0.0738	0.1000	0.3175	1.0	4ap9:B, 4ap9:C, 4ap9:D
33	6roh:A	1112	23	0.0443	0.0108	0.5217	1.5	7oh4:A, 7oh5:A, 7oh6:A, 7oh7:A, 7pem:A, 6roi:A, 6roj:A
34	6k7l:A	992	23	0.0443	0.0121	0.5217	1.9	6k7i:A, 6k7j:A, 6k7k:A, 6k7m:A, 6k7n:A
35	6lcp:A	1140	22	0.0443	0.0105	0.5455	2.5	6lcr:A
36	2ydx:A	312	55	0.0627	0.0545	0.3091	2.9	2ydx:C, 2ydx:B, 2ydx:D, 2ydx:E
37	2cfc:A	250	34	0.0480	0.0520	0.3824	3.1	2cfc:B, 2cfc:C, 2cfc:D
38	8b5v:A	244	74	0.0849	0.0943	0.3108	3.3	8b5v:B
39	3m1y:C	208	43	0.0443	0.0577	0.2791	3.4	3m1y:A, 3m1y:B, 3m1y:D
40	7rd6:A	929	25	0.0406	0.0118	0.4400	3.7	7rd7:A, 7rd8:A
41	3n07:A	179	45	0.0590	0.0894	0.3556	3.9	3n07:B, 3n07:C, 3n07:D
42	3ig4:A	419	82	0.0849	0.0549	0.2805	4.2	3ig4:B, 3ig4:C, 3ig4:D, 3ig4:E, 3ig4:F
43	3tw6:B	1129	136	0.1181	0.0283	0.2353	4.8	4jx4:A, 4jx4:B, 4jx4:C, 4jx4:D, 4jx5:A, 4jx5:B, 4jx5:C, 4jx5:D, 4jx6:A, 4jx6:B, 4jx6:C, 4jx6:D, 4loc:A, 4loc:B, 4loc:C, 4loc:D, 4m6v:A, 4m6v:B, 4m6v:C, 4m6v:D, 4mfd:A, 4mfd:B, 4mfd:C, 4mfd:D, 4mfe:A, 4mfe:B, 4mfe:C, 4mfe:D, 4mim:A, 4mim:B, 4mim:C, 4mim:D, 3tw6:C, 3tw6:D
44	8gwe:A	931	33	0.0517	0.0150	0.4242	5.3	7aap:A, 7b3b:A, 7b3c:A, 7b3d:A, 7btf:A, 7bv1:A, 7bv2:A, 7bw4:A, 7bzf:A, 7c2k:A, 7ctt:A, 7cxm:A, 7cxn:A, 7cyq:A, 7d4f:A, 7dfg:A, 7dfh:A, 7doi:A, 7dok:A, 7dte:A, 7ed5:A, 7egq:A, 7egq:N, 7eiz:A, 8gw1:A, 8gwb:A, 8gwf:A, 8gwg:A, 8gwi:A, 8gwk:A, 8gwm:A, 8gwn:A, 8gwo:A, 8gy6:A, 7krn:A, 7kro:A, 7krp:A, 7l1f:A, 6nur:A, 7oyg:A, 7oyg:D, 7ozu:A, 7ozv:A, 7rdx:A, 7rdy:A, 7rdz:A, 7re0:A, 7re1:A, 7re2:A, 7re3:A, 7re3:G, 8sq9:A, 8sqj:A, 8sqk:A, 7uo4:A, 7uo7:A, 7uo9:A, 7uob:A, 7uoe:A, 6xez:A, 6xqb:A, 6yyt:A
45	2qf7:A	1076	136	0.1181	0.0297	0.2353	5.4	3tw6:A
46	7thm:A	860	33	0.0517	0.0163	0.4242	5.6
47	4gik:A	307	22	0.0406	0.0358	0.5000	5.8	4gij:A, 4gik:B, 4gik:C, 4gil:A, 4gil:B, 4gil:C, 4gim:A, 4gim:B, 4gim:C
48	2i22:B	178	71	0.0775	0.1180	0.2958	6.7	2i22:C
49	8dgc:A	2028	60	0.0590	0.0079	0.2667	7.3	8dgc:B, 8dgc:C, 8dgc:D
50	6nus:A	715	29	0.0443	0.0168	0.4138	7.7
51	3e81:A	164	39	0.0480	0.0793	0.3333	8.1	3e81:B, 3e81:D, 3e81:C, 3e84:A, 3e84:B, 3e84:C, 3e84:D, 3e8m:A, 3e8m:B, 3e8m:C, 3e8m:D, 4hgo:A, 4hgo:B, 4hgo:C, 4hgo:D, 4hgq:A, 4hgq:B, 4hgq:C, 4hgq:D, 4hgq:E, 4hgq:F, 4hgq:G, 4hgq:H, 4hgr:A, 4hgr:B, 4hgr:C, 4hgr:D, 4hgr:E, 4hgr:F, 4hgr:G, 4hgr:H
52	7vgh:B	1183	22	0.0406	0.0093	0.5000	8.7	7vgi:B
53	8ox8:A	1125	22	0.0406	0.0098	0.5000	8.8	8ox7:A, 8ox9:A, 7py4:A, 7vgj:A
54	8oxa:A	1035	22	0.0406	0.0106	0.5000	9.3	8ox5:A, 8oxb:A, 8oxc:A
55	8ox6:A	575	23	0.0406	0.0191	0.4783	9.4
56	8ox4:A	870	22	0.0406	0.0126	0.5000	9.6

[Back]