BioLiP

>protein
SKYSQDVLQLLYKNKPNYISGQSIAESLNISRTAVKKVIDQLKLEGCKIDSVNHKGHLLQQLPDIWYQGIIDQYTKSSAL
FDFSEVYDSIDSTQLAAKKSLVGNQSSFFILSDEQTKGRGRFNRHWSSSKGQGLWMSVVLRPNVAFSMISKFNLFIALGI
RDAIQHFSQDEVKVKWPNDIYIDNGKVCGFLTEMVANNDGIEAIICGIGINLTQQLENFDESIRHRATSIQLHDKNKLDR
YQFLERLLQEIEKRYNQFLTLPFSEIREEYNAASNIWNRTLLFTENDKQFKGQAIDLDYDGYLIVRDEAGESHRLISADI
DF

The query sequence (length=322) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ndl:A	323	322	0.9969	0.9938	0.9969	0.0	6apw:A, 6aqq:A, 4dq2:A, 8eni:A, 4ha8:A, 6oru:A, 3rir:A, 3rkw:A, 3rky:A, 3v7c:A, 3v7r:A, 3v7s:A, 3v8k:A, 3v8l:A
2	2deq:A	235	239	0.2236	0.3064	0.3013	1.00e-26	2deq:B, 2djz:A, 2djz:B, 2dkg:A, 2dkg:B, 2dth:A, 2dth:B, 2dti:A, 2dti:B, 2dto:A, 2dto:B, 2dve:A, 2dve:B, 2dxt:A, 2dxt:B, 2dxu:A, 2dxu:B, 2dz9:A, 2dz9:B, 2e41:A, 2e41:B, 2ejf:A, 2ejf:B, 2ejg:A, 2ejg:B, 2fyk:A, 2fyk:B, 1wnl:A, 1wnl:B, 1wpy:A, 1wpy:B, 1wqw:A, 1wqw:B, 1x01:A, 1x01:B, 2zgw:A, 2zgw:B
3	2ewn:A	318	291	0.2267	0.2296	0.2509	9.00e-23	2ewn:B, 1hxd:A, 1hxd:B, 4wf2:A
4	8fi3:B	308	292	0.2453	0.2565	0.2705	4.71e-22	8fi3:A
5	2ej9:A	237	222	0.2050	0.2785	0.2973	5.79e-20
6	3efr:A	233	162	0.1677	0.2318	0.3333	1.42e-16	3efr:B, 3efs:A, 3efs:B
7	1bib:A	294	292	0.2298	0.2517	0.2534	3.78e-16
8	9j8e:B	296	242	0.2081	0.2264	0.2769	8.91e-14	9j8e:A
9	4xtu:A	266	231	0.1863	0.2256	0.2597	9.04e-14	4op0:A, 4op0:B, 3rux:A, 3rux:B, 4xtu:B, 4xtv:A, 4xtv:B, 4xtw:A, 4xtw:B, 4xtx:A, 4xtx:B, 4xty:A, 4xty:B, 4xtz:A, 4xtz:B, 4xu0:A, 4xu0:B, 4xu1:A, 4xu1:B, 4xu2:A, 4xu2:B, 4xu3:A, 4xu3:B
10	7dbs:A	252	148	0.1304	0.1667	0.2838	5.60e-07	6jhu:A
11	6ck0:B	210	130	0.1056	0.1619	0.2615	6.97e-05	6ck0:A
12	1hiz:A	375	27	0.0373	0.0320	0.4444	0.59	3mmd:A, 4prw:A, 4pud:A, 4pue:A, 1r85:A, 1r86:A, 1r87:A
13	5hmd:A	456	114	0.0870	0.0614	0.2456	0.69	5hmd:B, 5hme:A, 5hme:B, 5hmf:A, 5hmf:B, 4lh8:A, 4lh8:B, 3ls9:A, 3ls9:B, 3lsb:A, 3lsb:B, 3lsc:A, 3lsc:B
14	7xc2:C	858	60	0.0590	0.0221	0.3167	2.1	7xc2:A, 7xc2:E, 7xc2:G, 7xc2:I, 7xe0:A, 7xe0:C, 7xe0:E, 7xe0:G, 7xe0:I, 7xx2:A, 7xx2:C, 7xx2:E, 7xx2:G, 7xx2:I
15	2o2c:A	564	111	0.0776	0.0443	0.2252	2.2	2o2c:B, 2o2c:C
16	1nju:A	230	46	0.0404	0.0565	0.2826	2.3	8j3s:A, 8j3s:B, 8j3s:C, 8j3t:A, 8j3t:B, 1jq7:A, 1jq7:B, 1njt:A, 1njt:B, 1njt:C, 1njt:D, 1nju:B, 1nju:C, 1nju:D, 1nkk:A, 1nkk:B, 1nkk:C, 1nkk:D, 1nkm:A, 7tcz:A, 2wpo:A, 2wpo:B, 2wpo:C, 2wpo:D
17	4nwj:A	504	87	0.0683	0.0437	0.2529	5.4	4my4:A, 4nwx:A, 4qax:A, 7tl8:A
18	6fzw:D	180	82	0.0683	0.1222	0.2683	5.6
19	7aju:UL	779	123	0.0963	0.0398	0.2520	6.9	5wyj:BB, 5wyk:BB, 6zqd:UL, 6zqe:UL, 6zqf:UL
20	5flg:A	253	70	0.0590	0.0751	0.2714	8.3	5flg:B, 5fll:A, 5fll:B, 5fm0:A, 5fm0:B, 5g1f:A, 5g1f:B
21	4v8m:By	189	44	0.0404	0.0688	0.2955	9.0	8ova:By, 8ove:By

[Back]