BioLiP

>protein
SKYSQDVLQLLYKNKPNYISGQSIAESLNISRTAVKKVIDQLKLEGCKIDSVNHKGHLLQQLPDIWYQGIIDQYTKSSAL
FDFSEVYDSIDSTQLAAKKSLVGNQSSFFILSDEQTKGRGRFNRHWSSKGQGLWMSVVLRPNVAFSMISKFNLFIALGIR
DAIQHFSQDEVKVKWPNDIYIDNGKVCGFLTEMVANNDGIEAIICGIGINLTQQLENFDESIRHRATSIQLHDKNKLDRY
QFLERLLQEIEKRYNQFLTLPFSEIREEYIAASNIWNRTLLFTENDKQFKGQAIDLDYDGYLIVRDEAGESHRLISADID
F

The query sequence (length=321) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ndl:A	323	322	1.0000	0.9938	0.9969	0.0	6apw:A, 6aqq:A, 4dq2:A, 8eni:A, 4ha8:A, 6oru:A, 3rir:A, 3rkw:A, 3rky:A, 3v7c:A, 3v7r:A, 3v7s:A, 3v8k:A, 3v8l:A
2	2deq:A	235	238	0.2212	0.3021	0.2983	1.67e-27	2deq:B, 2djz:A, 2djz:B, 2dkg:A, 2dkg:B, 2dth:A, 2dth:B, 2dti:A, 2dti:B, 2dto:A, 2dto:B, 2dve:A, 2dve:B, 2dxt:A, 2dxt:B, 2dxu:A, 2dxu:B, 2dz9:A, 2dz9:B, 2e41:A, 2e41:B, 2ejf:A, 2ejf:B, 2ejg:A, 2ejg:B, 2fyk:A, 2fyk:B, 1wnl:A, 1wnl:B, 1wpy:A, 1wpy:B, 1wqw:A, 1wqw:B, 1x01:A, 1x01:B, 2zgw:A, 2zgw:B
3	2ewn:A	318	291	0.2274	0.2296	0.2509	3.72e-21	2ewn:B, 1hxd:A, 1hxd:B, 4wf2:A
4	8fi3:B	308	292	0.2461	0.2565	0.2705	3.09e-20	8fi3:A
5	2ej9:A	237	221	0.2025	0.2743	0.2941	1.12e-19
6	3efr:A	233	161	0.1651	0.2275	0.3292	7.32e-17	3efr:B, 3efs:A, 3efs:B
7	1bib:A	294	291	0.2305	0.2517	0.2543	8.26e-16
8	9j8e:B	296	230	0.1963	0.2128	0.2739	2.89e-13	9j8e:A
9	4xtu:A	266	231	0.1869	0.2256	0.2597	5.47e-13	4op0:A, 4op0:B, 3rux:A, 3rux:B, 4xtu:B, 4xtv:A, 4xtv:B, 4xtw:A, 4xtw:B, 4xtx:A, 4xtx:B, 4xty:A, 4xty:B, 4xtz:A, 4xtz:B, 4xu0:A, 4xu0:B, 4xu1:A, 4xu1:B, 4xu2:A, 4xu2:B, 4xu3:A, 4xu3:B
10	7dbs:A	252	147	0.1246	0.1587	0.2721	1.98e-06	6jhu:A
11	6ck0:B	210	129	0.1028	0.1571	0.2558	2.69e-05	6ck0:A
12	1hiz:A	375	27	0.0374	0.0320	0.4444	0.62	3mmd:A, 4prw:A, 4pud:A, 4pue:A, 1r85:A, 1r86:A, 1r87:A
13	4nwj:A	504	87	0.0685	0.0437	0.2529	0.89	4my4:A, 4nwx:A, 4qax:A, 7tl8:A
14	5hmd:A	456	114	0.0872	0.0614	0.2456	1.7	5hmd:B, 5hme:A, 5hme:B, 5hmf:A, 5hmf:B, 4lh8:A, 4lh8:B, 3ls9:A, 3ls9:B, 3lsb:A, 3lsb:B, 3lsc:A, 3lsc:B
15	7xc2:C	858	60	0.0592	0.0221	0.3167	2.0	7xc2:A, 7xc2:E, 7xc2:G, 7xc2:I, 7xe0:A, 7xe0:C, 7xe0:E, 7xe0:G, 7xe0:I, 7xx2:A, 7xx2:C, 7xx2:E, 7xx2:G, 7xx2:I
16	2o2c:A	564	111	0.0779	0.0443	0.2252	2.3	2o2c:B, 2o2c:C
17	1nju:A	230	46	0.0405	0.0565	0.2826	2.3	8j3s:A, 8j3s:B, 8j3s:C, 8j3t:A, 8j3t:B, 1jq7:A, 1jq7:B, 1njt:A, 1njt:B, 1njt:C, 1njt:D, 1nju:B, 1nju:C, 1nju:D, 1nkk:A, 1nkk:B, 1nkk:C, 1nkk:D, 1nkm:A, 7tcz:A, 2wpo:A, 2wpo:B, 2wpo:C, 2wpo:D
18	3l4u:A	864	99	0.0779	0.0289	0.2525	6.0	3ctt:A, 3l4t:A, 3l4v:A, 3l4w:A, 3l4x:A, 3l4y:A, 3l4z:A, 2qmj:A
19	1k1x:A	636	95	0.0810	0.0409	0.2737	7.0	1k1w:A, 1k1x:B, 1k1y:A, 1k1y:B
20	5flg:A	253	70	0.0592	0.0751	0.2714	8.2	5flg:B, 5fll:A, 5fll:B, 5fm0:A, 5fm0:B, 5g1f:A, 5g1f:B
21	4v8m:By	189	44	0.0405	0.0688	0.2955	9.4	8ova:By, 8ove:By

[Back]