Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYT
SKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPVSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKS
IGVSNFNHRLLEMILNKPGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPVLC
ALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLNRNVRYLTLDIFAGPPNYPF

The query sequence (length=317) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4l1w:A 325 317 1.0000 0.9754 1.0000 0.0 6a7a:A, 3c3u:A, 3gug:A, 2hdj:A, 2hdj:B, 1ihi:A, 1ihi:B, 6ijx:A, 2ipj:A, 2ipj:B, 1j96:A, 1j96:B, 8jp2:A, 4jq1:A, 4jq1:B, 4jq2:A, 4jq2:B, 4jq3:A, 4jq3:B, 4jq4:A, 4jq4:B, 4jqa:A, 4jqa:B, 4jtq:A, 4jtq:B, 4jtr:A, 4jtr:B, 4l1w:B, 4l1x:A, 4l1x:B, 1mrq:A, 3nty:A, 1xjb:A, 1xjb:B, 4xo6:A, 4xo6:B, 4xo7:A, 4xo7:B, 4yvp:A, 4yvp:B
2 4zfc:B 320 317 0.8675 0.8594 0.8675 0.0 6a7b:A, 6a7b:B, 8bbs:B, 8bbs:A, 7c7f:A, 7c7f:B, 7c7g:A, 7c7g:B, 7c7h:A, 7c7h:B, 4dbs:A, 4dbs:B, 4dbu:A, 4dbu:B, 4dbw:A, 4dbw:B, 4dz5:A, 6f2u:A, 6f2u:B, 2f38:A, 6f78:A, 6f78:B, 4fa3:A, 4fal:A, 4fam:A, 4fam:B, 9ffd:A, 9ffd:B, 2fgb:A, 6gxk:A, 6gxk:B, 4h7c:A, 4hmn:A, 5hnt:A, 5hnt:C, 5hnu:A, 5hnu:C, 8i0c:A, 8i0c:B, 8jp1:A, 8jp1:B, 3r43:A, 3r58:A, 3r6i:A, 3r7m:A, 3r8g:A, 3r8h:A, 3r94:A, 8rb6:A, 8rb6:B, 1ry0:A, 1ry0:B, 1ry8:A, 1ry8:B, 1s1p:A, 1s1r:A, 1s2a:A, 1s2c:A, 3ufy:A, 3ug8:A, 3ugr:A, 3uwe:A, 4wdt:A, 4wdu:A, 4wdw:A, 4wdw:B, 4wdx:A, 4wdx:B, 7wqm:A, 7wqm:B, 7wqr:A, 7wqr:B, 7wqs:A, 7wqs:B, 4wrh:A, 7x3l:A, 7x3l:B, 7x3m:A, 7x3m:B, 7x3o:A, 7x3o:B, 1xf0:A, 4xvd:A, 4xvd:B, 4xve:A, 4yvv:A, 4yvv:B, 4yvx:A, 4yvx:B, 4zfc:A, 1zq5:A
3 2fvl:A 323 316 0.8139 0.7988 0.8165 0.0 2fvl:B, 2fvl:C
4 1q13:A 322 316 0.7855 0.7733 0.7880 0.0 1q13:B, 1q5m:A, 1q5m:B
5 3cv6:A 323 317 0.7382 0.7245 0.7382 3.71e-178 3cv6:B, 2he5:A, 2he5:B, 2he5:C, 2he5:D, 2hej:A, 2hej:B, 2ipf:A, 2ipf:B, 2ipg:A, 2ipg:B, 2p5n:A, 2p5n:B
6 1afs:A 319 312 0.6814 0.6771 0.6923 3.92e-166 1afs:B, 1lwi:A, 1lwi:B
7 3ln3:A 319 314 0.6593 0.6552 0.6656 1.06e-159 6m7k:A, 5uxf:A
8 3bur:A 325 313 0.5741 0.5600 0.5815 1.77e-138 3bur:B, 3buv:B, 3buv:A, 3bv7:A, 3bv7:B, 3caq:A, 3caq:B, 3cas:A, 3cas:B, 3cav:A, 3cav:B, 3cmf:A, 3cmf:B, 3cot:A, 3cot:B, 3dop:A, 3dop:B, 3g1r:A, 3g1r:B, 3uzw:A, 3uzw:B, 3uzx:A, 3uzx:B, 3uzy:A, 3uzy:B, 3uzz:A, 3uzz:B
9 4gq0:A 318 312 0.4795 0.4780 0.4872 4.10e-104 4ga8:A, 4gab:A, 4gqg:A, 4i5x:A, 4icc:X, 4jih:A, 4jii:X, 5lik:X, 5liu:X, 5liw:X, 5lix:X, 5liy:X, 5m2f:X, 4wev:X, 4xzl:X, 4xzm:X, 4xzn:X, 5y7n:A, 1zua:X
10 8b34:A 318 312 0.4826 0.4811 0.4904 6.36e-100 8a4n:A, 1abn:A, 2acq:A, 2acr:A, 2acs:A, 2acu:A, 1ads:A, 8ae9:A, 2agt:A, 8aqg:A, 8aqp:A, 8auu:A, 1az1:A, 1az2:A, 8b3n:A, 8b3r:A, 8b66:A, 3bcj:A, 8bjl:A, 8cnf:A, 8cnp:A, 3dn5:A, 2dux:A, 2duz:A, 2dv0:A, 1ef3:A, 1ef3:B, 1el3:A, 2f2k:A, 6f7r:A, 6f81:A, 6f82:A, 6f84:A, 6f8o:A, 8fh5:A, 8fh6:A, 8fh7:A, 8fh8:A, 8fh9:A, 2fz8:A, 2fz9:A, 2fzb:A, 2fzd:A, 3g5e:A, 4gca:A, 3ghr:A, 3ghs:A, 3ght:A, 3ghu:A, 5ha7:A, 5ha7:B, 2hv5:A, 2hvn:A, 2hvo:A, 2i16:A, 2i17:A, 1iei:A, 4igs:A, 2ikg:A, 2ikh:A, 2iki:A, 2ikj:A, 2ine:A, 2inz:A, 2ipw:A, 2iq0:A, 2iqd:A, 2is7:A, 2isf:A, 2j8t:A, 4jir:A, 4lau:A, 4laz:A, 3lbo:A, 4lb3:A, 4lb4:A, 4lbr:A, 4lbs:A, 3ld5:A, 3len:A, 3lep:A, 3lqg:A, 3lql:A, 3lz3:A, 3lz5:A, 3m0i:A, 3m4h:A, 3m64:A, 1mar:A, 3mb9:A, 3mc5:A, 4nkc:A, 2nvc:A, 2nvd:A, 3onb:A, 3onc:A, 5ou0:A, 5ouj:A, 5ouk:A, 8oz2:A, 3p2v:A, 8p2r:A, 2pd5:A, 2pd9:A, 2pdb:A, 2pdc:A, 2pdf:A, 2pdg:A, 2pdh:A, 2pdi:A, 2pdj:A, 2pdk:A, 2pdl:A, 2pdm:A, 2pdn:A, 2pdp:A, 2pdq:A, 2pdu:A, 2pdw:A, 2pdx:A, 2pdy:A, 2pev:A, 2pf8:A, 2pfh:A, 4pr4:A, 4prr:A, 4prt:A, 4puu:A, 4puw:A, 1pwl:A, 1pwm:A, 2pzn:A, 3q65:A, 3q65:B, 3q67:A, 3q67:B, 4q7b:A, 4qbx:A, 4qr6:A, 2qxw:A, 4qx4:A, 4qxi:A, 2r24:A, 4rpq:A, 3rx2:A, 3rx3:A, 3rx4:A, 3s3g:A, 6syw:A, 6t27:A, 6t3p:A, 1t40:A, 1t41:A, 3t42:A, 6t5g:A, 6t7q:A, 6td8:A, 6tuc:A, 6tuf:A, 6txp:A, 3u2c:A, 1us0:A, 3v35:A, 3v36:A, 1x96:A, 1x97:A, 1x98:A, 6xum:A, 4xzh:A, 4xzh:B, 4xzi:A, 6y03:A, 6y1p:A, 4ys1:A, 4yu1:A, 1z3n:A, 1z89:A, 1z8a:A
11 1ah0:A 315 310 0.4858 0.4889 0.4968 2.18e-97 1ah3:A, 1ah4:A, 1eko:A
12 1c9w:A 315 312 0.4763 0.4794 0.4840 1.34e-96 1frb:A
13 3o3r:A 315 312 0.4700 0.4730 0.4776 3.49e-94 3o3r:B, 3qkz:A, 3qkz:B
14 3fx4:A 325 323 0.4448 0.4338 0.4365 3.17e-90 1ae4:A, 3cv7:A, 1cwn:A, 3h4g:A, 1hqt:A
15 3wcz:A 307 318 0.4164 0.4300 0.4151 1.57e-80
16 5ket:A 328 327 0.4006 0.3872 0.3884 1.07e-71 5ket:B
17 3h7r:A 307 280 0.3754 0.3876 0.4250 6.75e-71
18 3h7u:A 312 280 0.3912 0.3974 0.4429 2.14e-70
19 7f7k:B 310 279 0.4038 0.4129 0.4588 2.93e-67 7f7k:A, 7f7l:A, 7f7l:B, 7f7m:A, 7f7m:B, 7w1w:A, 7w1w:B, 7w1x:A, 7w1x:B
20 1k8c:B 319 310 0.3880 0.3856 0.3968 3.77e-67 1k8c:A, 1k8c:C, 1k8c:D, 1mi3:A, 1mi3:B, 1mi3:C, 1mi3:D, 1r38:A, 1r38:B, 1r38:C, 1r38:D, 1sm9:A, 1sm9:B, 1sm9:C, 1sm9:D, 1ye4:A, 1ye4:B, 1ye4:C, 1ye4:D, 1ye6:A, 1ye6:B, 1ye6:C, 1ye6:D, 1z9a:A, 1z9a:B, 1z9a:C, 1z9a:D
21 4gie:A 288 314 0.3912 0.4306 0.3949 2.17e-66 4fzi:A, 4fzi:B
22 1vbj:A 281 300 0.3754 0.4235 0.3967 4.18e-65 1vbj:B
23 5z6t:A 317 312 0.3912 0.3912 0.3974 7.48e-65 5z6t:B
24 5zcm:A 329 314 0.3565 0.3435 0.3599 1.44e-64
25 7s5f:B 309 316 0.3849 0.3948 0.3861 6.94e-64 7s5f:A, 7s5f:C, 7s5f:D
26 5jh2:A 257 281 0.3628 0.4475 0.4093 1.66e-63
27 2bgs:A 308 312 0.3596 0.3701 0.3654 9.68e-61 2vdg:A
28 3krb:A 307 312 0.3596 0.3713 0.3654 1.33e-60 3krb:B
29 4g5d:A 283 299 0.3502 0.3922 0.3712 1.63e-58 4g5d:B
30 5az1:A 327 318 0.3438 0.3333 0.3428 5.79e-58 5az0:A
31 2wzm:A 274 300 0.3502 0.4051 0.3700 1.92e-56 2wzm:B
32 1vp5:A 284 294 0.3186 0.3556 0.3435 5.72e-56 1vp5:B
33 1zgd:A 308 289 0.3628 0.3734 0.3979 5.76e-55 1zgd:B
34 3d3f:A 275 298 0.3659 0.4218 0.3893 1.82e-52 3d3f:B
35 3wbw:A 271 295 0.3186 0.3727 0.3424 3.57e-52 3wbw:B, 3wby:A, 3wby:B
36 1a80:A 277 294 0.3344 0.3827 0.3605 9.53e-52 1m9h:A
37 3b3d:A 280 310 0.3596 0.4071 0.3677 1.34e-51 3b3d:B, 3b3d:C
38 5jgw:A 314 312 0.3565 0.3599 0.3622 1.55e-51 5jgw:B, 5jgw:C, 5jgw:D, 5jgy:A, 5jgy:B
39 4ijr:A 328 314 0.3565 0.3445 0.3599 2.86e-47 4ijr:C
40 3wg6:A 299 302 0.3028 0.3211 0.3179 4.33e-40 3wg6:B, 3wg6:C, 3wg6:D
41 4h8n:A 303 296 0.3123 0.3267 0.3345 2.36e-37 4h8n:B
42 6kik:A 275 301 0.3186 0.3673 0.3355 5.25e-35 5dan:A, 6kiy:A, 6ky6:A, 6ky6:B
43 5c7h:A 281 303 0.2934 0.3310 0.3069 1.02e-24 4pmj:A
44 6cia:A 284 305 0.2334 0.2606 0.2426 4.20e-14 4wgh:A
45 1pz1:A 333 224 0.1893 0.1802 0.2679 1.17e-12 1pz1:B
46 1pz0:A 311 183 0.1767 0.1801 0.3060 8.62e-12
47 8hnq:A 286 216 0.1703 0.1888 0.2500 4.86e-11
48 3v0s:A 287 292 0.2334 0.2578 0.2534 6.31e-11 3v0t:A
49 1ynp:B 298 177 0.1420 0.1510 0.2542 1.74e-08 1ynp:A, 1ynq:A, 1ynq:B
50 8hw0:A 329 173 0.1451 0.1398 0.2659 6.94e-07
51 1gve:A 324 124 0.1104 0.1080 0.2823 3.57e-06
52 2clp:A 323 143 0.1325 0.1300 0.2937 5.29e-06 2clp:B, 2clp:C, 2clp:D, 2clp:E, 2clp:F, 2clp:G, 2clp:H, 2clp:I, 2clp:J, 2clp:K
53 6ow0:A 323 308 0.2145 0.2105 0.2208 8.07e-06
54 1lqa:A 346 175 0.1640 0.1503 0.2971 1.05e-05 1lqa:B
55 8jwm:B 331 333 0.2429 0.2326 0.2312 1.23e-05 8jwk:D, 8jwk:J, 8jwk:L, 8jwk:N, 8jwk:P, 8jwl:C, 8jwl:H, 8jwm:A, 8jwm:C, 8jwm:D, 8jwm:E, 8jwm:F, 8jwm:G, 8jwm:H, 8jwn:A, 8jwn:B, 8jwn:C, 8jwn:D, 8jwn:E, 8jwn:F, 8jwn:G, 8jwn:H, 8jwo:B, 8jwo:F, 8jwo:H, 8jwo:J, 8jwo:N, 8jwo:P, 8xr4:A, 8xr4:B, 8xr4:C, 8xr4:D, 8xr4:E, 8xr4:F, 8xr4:G, 8xr4:H
56 6ow0:B 301 300 0.2240 0.2359 0.2367 1.76e-05 6ovx:A, 6ovx:B
57 7svq:A 315 284 0.2145 0.2159 0.2394 5.36e-05 7svq:B
58 8jwo:L 311 167 0.1262 0.1286 0.2395 5.65e-05 8jwk:H, 8jwo:A, 8jwo:C, 8jwo:D, 8jwo:E, 8jwo:G, 8jwo:I, 8jwo:K, 8jwo:M, 8jwo:O
59 2c91:A 325 136 0.1262 0.1231 0.2941 5.65e-05 2bp1:A, 2bp1:B, 2bp1:C, 2bp1:D, 2c91:B, 2c91:C, 2c91:D, 2c91:E, 2c91:F, 2c91:G, 2c91:H, 2c91:I, 2c91:J
60 4aub:B 335 329 0.2240 0.2119 0.2158 1.15e-04 4aub:A, 4aub:C, 4aub:G, 3n6q:D
61 6hg6:A 313 320 0.2145 0.2173 0.2125 1.36e-04
62 8usu:A 316 309 0.2240 0.2247 0.2298 1.37e-04 8usu:B
63 7bc1:A 295 131 0.1136 0.1220 0.2748 1.64e-04
64 7twz:A 298 127 0.1167 0.1242 0.2913 3.69e-04 7twz:B, 7twz:C, 7twz:D, 7twz:E, 7twz:F
65 4aub:F 298 312 0.2145 0.2282 0.2179 3.79e-04 4aub:E, 4aub:H
66 1og6:C 298 224 0.1577 0.1678 0.2232 0.001 1og6:A, 1og6:B
67 7wf3:C 328 206 0.1420 0.1372 0.2184 0.001 2a79:A, 3eau:A, 3eb3:A, 3eb4:A, 6ebk:A, 6ebk:C, 6ebk:E, 6ebk:G, 6ebl:A, 6ebl:C, 6ebl:E, 6ebl:G, 7ej1:A, 7ej1:C, 7ej1:E, 7ej1:G, 7ej2:A, 7ej2:C, 7ej2:E, 7ej2:G, 1exb:A, 4jta:A, 4jta:P, 4jtc:A, 4jtc:G, 4jtd:A, 4jtd:G, 3lnm:A, 3lnm:C, 3lut:A, 1qrq:A, 1qrq:B, 1qrq:C, 1qrq:D, 2r9r:A, 2r9r:G, 7sit:A, 7sit:C, 7siz:A, 7siz:C, 7wf3:G, 7wf3:I, 7wf3:M, 7wf4:G, 7wf4:I, 7wf4:M, 7wf4:o, 5wie:A, 5wie:G, 1zsx:A
68 7ezi:A 323 224 0.1672 0.1641 0.2366 0.001 7ezl:A
69 4exa:F 259 107 0.1009 0.1236 0.2991 0.004 4exa:A, 4exa:B, 4exa:C, 4exa:D, 4exa:E
70 4v4n:AM 194 58 0.0473 0.0773 0.2586 0.82 6skf:BP, 6skg:BP, 6th6:BP, 4v6u:BM
71 8qp8:A 1918 69 0.0631 0.0104 0.2899 1.0
72 6jkh:A 212 38 0.0473 0.0708 0.3947 2.9 6jkh:B
73 5t79:A 315 227 0.1577 0.1587 0.2203 3.4 3erp:A, 3erp:B
74 6pnx:B 294 104 0.1073 0.1156 0.3269 4.4 9cd7:B, 9cd7:C, 7dhl:A, 4k33:A, 6lvm:A, 6pnx:A, 8udt:A, 8udt:B, 8udt:C, 8udu:A, 8udu:B, 8udv:A, 8udv:B
75 4kf9:A 318 34 0.0347 0.0346 0.3235 5.3
76 2rcy:A 262 44 0.0410 0.0496 0.2955 5.9 2rcy:E, 2rcy:B, 2rcy:C, 2rcy:D
77 6zq4:F 512 159 0.1167 0.0723 0.2327 6.0 6zq4:A, 6zq4:B, 6zq4:C, 6zq4:D, 6zq4:E, 6zq4:G, 6zq4:H, 6zq6:A, 6zq6:B, 6zq6:C, 6zq6:D, 6zq7:A
78 6gej:Y 447 51 0.0505 0.0358 0.3137 6.5 8ets:W, 8ets:U, 8ets:Y, 8etu:W, 8etu:U, 8etu:Y, 8etw:W, 8etw:U, 8etw:Y, 8eu9:W, 8eu9:U, 8eu9:Y, 8euf:W, 8euf:U, 8euf:Y, 6gej:U, 6gej:W, 6gen:U, 6gen:W, 6gen:Y
79 5ecu:A 350 38 0.0473 0.0429 0.3947 6.8
80 8d4i:A 462 53 0.0473 0.0325 0.2830 7.0 8d2y:A, 8d4i:C, 8d5d:A, 8d5d:B, 8d5r:A, 8d5r:B, 8d88:A, 8d88:B
81 5ztb:B 311 85 0.0694 0.0707 0.2588 7.8 5b4e:A, 5b4f:A, 5gha:A, 5gha:D, 5gha:B, 5gha:C, 5ztb:A, 5ztb:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218