Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SKTINIRNANNFIKACLIRLYTKRGDSVLDLGCGKGGDLLKYERAGIGEYYGVDIAEVSINDARVRARNMKRRFKVFFRA
QDSYGRHMDLGKEFDVISSQFSFHYAFSTSESLDIAQRNIARHLRPGGYFIMTVPSRDVILERYKQGRMSNDFYKIELEK
MEDVPMESVREYRFTLLDSVNNCIEYFVDFTRMVDGFKRLGLSLVERKGFIDFYEDEGRRNPELSKKMGLGCLTREESEV
VGIYEVVVFRKL

The query sequence (length=252) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1ri1:A 252 252 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 2hv9:A, 1ri2:A, 1ri3:A, 1ri4:A, 1z3c:A
2 5e8j:A 310 242 0.3413 0.2774 0.3554 5.08e-35 3bgv:A, 3bgv:B, 3bgv:C, 3bgv:D, 5e8j:B, 5e9j:A, 5e9j:B, 5e9w:A, 5e9w:B, 5e9w:C, 5e9w:D, 3epp:A, 3epp:B, 8q69:A, 8q69:B, 8q8g:A, 8q8g:B, 8q9w:A, 8q9w:B
3 7d8u:A 284 273 0.2500 0.2218 0.2308 1.99e-08 7d8u:B
4 3bus:A 251 141 0.1706 0.1713 0.3050 5.29e-08 3bus:B
5 3bxo:A 236 118 0.1429 0.1525 0.3051 7.46e-07 3bxo:B
6 1wzn:A 244 118 0.1508 0.1557 0.3220 1.29e-05 1wzn:B, 1wzn:C
7 1ve3:B 226 147 0.1944 0.2168 0.3333 2.78e-05 1ve3:A
8 4pne:B 272 167 0.1746 0.1618 0.2635 5.34e-05 4pne:A
9 6f5z:B 228 122 0.1429 0.1579 0.2951 1.37e-04 6f5z:A
10 6mro:A 194 114 0.1270 0.1649 0.2807 1.45e-04 8gdu:A
11 7wzg:B 243 107 0.1429 0.1481 0.3364 2.68e-04 7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
12 5mpt:A 379 154 0.1706 0.1135 0.2792 4.48e-04
13 6uk5:A 240 162 0.1627 0.1708 0.2531 6.64e-04 6uk5:B
14 6ecx:A 283 113 0.1349 0.1201 0.3009 7.65e-04 6ect:A
15 7pd7:B 250 109 0.1429 0.1440 0.3303 8.45e-04 7pd7:A, 7pd7:C, 7pd7:D
16 5je1:A 244 119 0.1429 0.1475 0.3025 0.001 5jdy:A, 5jdy:B, 5jdz:A, 5jdz:B, 5je0:A, 5je0:B, 5je1:B, 5je2:A, 5je2:B, 5je3:A, 5je3:B, 5je4:A, 5je4:B, 5je5:A
17 6uv6:C 264 135 0.1627 0.1553 0.3037 0.001 6uv6:A, 6uv6:B
18 7qos:A 352 188 0.1706 0.1222 0.2287 0.005 7qos:B
19 2zwv:A 373 121 0.1508 0.1019 0.3140 0.006 3dmf:A, 3dmg:A, 3dmh:A, 2zul:A
20 6ecv:A 286 114 0.1270 0.1119 0.2807 0.009 6ecu:A, 6ecu:B, 6ecv:B, 6ecw:A, 6ecw:B
21 4iv8:A 245 125 0.1389 0.1429 0.2800 0.010 4iv8:B
22 5bp7:A 249 189 0.1825 0.1847 0.2434 0.013 5bp7:B, 5bp7:C
23 4oqd:C 241 118 0.1151 0.1203 0.2458 0.015 6m81:A, 6m81:B, 6m81:C, 6m81:D, 6m82:A, 6m83:A, 4oqd:A, 4oqd:B, 4oqd:D, 4oqe:A, 4oqe:B, 3pfg:A, 3pfh:A, 3pfh:D, 3px2:A, 3px2:D, 3px3:A, 3px3:D
24 5epe:A 248 116 0.1230 0.1250 0.2672 0.017
25 6hp2:A 297 91 0.0913 0.0774 0.2527 0.035
26 3e8s:A 220 90 0.1032 0.1182 0.2889 0.041
27 6cu5:A 314 123 0.1190 0.0955 0.2439 0.044 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
28 6bqc:A 348 131 0.1508 0.1092 0.2901 0.058
29 5dpd:A 511 158 0.1587 0.0783 0.2532 0.064 5dnk:A, 5dnk:B, 5dpd:B
30 1nbh:A 292 199 0.2103 0.1815 0.2663 0.073 1d2h:A, 1d2h:B, 1d2h:C, 1d2h:D, 2idk:B, 2idk:C, 2idk:D, 2idk:A, 1kia:A, 1kia:B, 1kia:C, 1kia:D, 1nbh:B, 1nbh:C, 1nbh:D, 1nbi:A, 1nbi:B, 1nbi:C, 1nbi:D, 3thr:A, 3thr:B, 3thr:C, 3thr:D, 3ths:B, 3ths:C, 3ths:D, 3ths:A, 1xva:A, 1xva:B
31 6rie:O 822 142 0.1429 0.0438 0.2535 0.076 4ckb:A, 4ckb:D, 4ckc:A, 4ckc:D, 4cke:A, 4cke:D, 2vdw:A, 2vdw:C, 2vdw:E, 2vdw:G
32 3uj7:A 259 157 0.1508 0.1467 0.2420 0.087 4fgz:A, 4fgz:B, 4r6w:A, 4r6w:B, 4r6x:A, 4r6x:B, 3uj6:A, 3uj7:B, 3uj8:A, 3uj9:A, 3uja:A, 3ujb:A, 3ujb:B, 3ujc:A, 3ujd:A
33 5f8f:B 361 111 0.1151 0.0803 0.2613 0.096 5f8e:A, 5f8e:B, 5f8f:A, 5f8f:C
34 2ble:A 337 38 0.0595 0.0445 0.3947 0.14 2bwg:A, 2bwg:B, 2bwg:C, 2bwg:D
35 6dcb:A 225 120 0.1468 0.1644 0.3083 0.19 6dcc:A, 5una:C, 5una:A, 5una:B, 5una:D, 5una:E, 5una:F
36 3cjt:A 254 56 0.0794 0.0787 0.3571 0.26 3cjq:A, 3cjq:D, 3cjq:G, 3cjr:A, 3cjt:C, 3cjt:E, 3cjt:G, 3cjt:I, 3cjt:K, 3cjt:M, 3cjt:O, 3egv:A, 2nxe:A, 2nxe:B, 2zbp:A, 2zbq:A, 2zbr:A
37 5wp4:A 485 116 0.1270 0.0660 0.2759 0.26
38 4nec:B 244 53 0.0833 0.0861 0.3962 0.34 4nec:A, 4nec:C, 4nec:D
39 5dpl:A 520 109 0.1151 0.0558 0.2661 0.36 5doo:A, 5dpl:B
40 3eey:A 195 121 0.1032 0.1333 0.2149 0.37 3eey:B, 3eey:C, 3eey:D, 3eey:E, 3eey:F, 3eey:H, 3eey:I, 3eey:J
41 7wzf:A 243 212 0.2063 0.2140 0.2453 0.46
42 1p91:A 268 121 0.1349 0.1269 0.2810 0.51 1p91:B
43 2a14:A 257 68 0.0794 0.0778 0.2941 0.61
44 5dm2:A 258 56 0.0714 0.0698 0.3214 0.95 5dm1:A, 5dm4:A, 4kwc:A
45 3t7s:A 246 140 0.1190 0.1220 0.2143 0.95 3t7s:B, 3t7s:C, 3t7s:D, 3t7t:A, 3t7t:B, 3t7t:C, 3t7t:D
46 5wp5:A 463 121 0.1349 0.0734 0.2810 0.99 5wp5:B
47 5z9o:A 373 54 0.0516 0.0349 0.2407 1.0 5z9o:B
48 5gm2:B 282 67 0.0675 0.0603 0.2537 1.3 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
49 6p3o:A 341 22 0.0476 0.0352 0.5455 1.5 6p3m:A, 6p3n:A
50 5aor:A 1009 42 0.0675 0.0168 0.4048 2.4 5aor:B, 8b9i:A, 8b9j:A
51 1u2z:C 385 68 0.0635 0.0416 0.2353 2.5 7k6p:K, 7k6q:K, 1u2z:A, 1u2z:B
52 8pjb:A 962 42 0.0675 0.0177 0.4048 2.7 8b9g:A, 8b9k:A, 8pjj:A
53 3r0q:G 353 107 0.1151 0.0822 0.2710 2.7 3r0q:C, 3r0q:A, 3r0q:E
54 7v6h:A 267 121 0.1190 0.1124 0.2479 2.8 7v6h:B
55 1tpy:A 285 62 0.0675 0.0596 0.2742 2.9
56 6gkv:A 351 26 0.0516 0.0370 0.5000 3.1 6gkv:B, 6gky:A, 6gky:B, 6gkz:A, 6gkz:B, 6gkz:C, 6gkz:D
57 7lxi:A 279 24 0.0437 0.0394 0.4583 3.4 7mcj:A, 7mcj:B
58 6uld:A 428 81 0.0913 0.0537 0.2840 3.6 6uld:B
59 4f86:A 275 50 0.0556 0.0509 0.2800 3.8 4f84:A, 4f86:B, 4f86:C, 4f86:E, 4f86:F, 4f86:H, 4f86:I, 4f86:J, 4f86:K, 4f86:L
60 3vc1:D 288 46 0.0516 0.0451 0.2826 4.6 4f86:D, 4f86:G, 3vc1:A, 3vc1:B, 3vc1:C, 3vc1:E, 3vc1:F, 3vc1:G, 3vc1:H, 3vc1:I, 3vc1:J, 3vc1:K, 3vc1:L, 3vc2:A, 3vc2:B, 3vc2:C, 3vc2:D, 3vc2:E, 3vc2:F, 3vc2:G, 3vc2:H, 3vc2:I, 3vc2:J, 3vc2:K, 3vc2:L
61 3mb5:A 255 47 0.0476 0.0471 0.2553 4.9 3lga:A, 3lga:B, 3lga:C, 3lga:D, 3lhd:C, 3lhd:A, 3lhd:B, 3lhd:D
62 6dnz:A 317 41 0.0556 0.0442 0.3415 5.0 6dnz:C
63 5jzx:A 364 41 0.0675 0.0467 0.4146 5.1 5jzx:C, 5jzx:D, 5jzx:F
64 4dem:F 346 74 0.0714 0.0520 0.2432 5.7 3b7l:A, 5cg5:A, 5cg6:A, 3cp6:A, 5dgm:F, 5dgn:F, 5dgs:F, 5diq:F, 5djp:F, 5djr:F, 5djv:F, 2f7m:F, 2f89:F, 2f8c:F, 2f8z:F, 2f92:F, 2f94:F, 2f9k:F, 4ga3:A, 4h5c:F, 4h5d:F, 4h5e:F, 5ja0:F, 5juz:F, 4jvj:F, 5jv0:F, 5jv1:F, 5jv2:F, 4kfa:A, 4kpd:A, 4kpj:A, 4kq5:A, 4kqs:A, 4kqu:A, 5ksx:F, 4l2x:F, 4lfv:F, 4lpg:F, 4lph:F, 3n1v:F, 3n1w:F, 4n1z:F, 3n3l:F, 3n45:F, 3n46:F, 3n49:F, 3n5h:F, 3n5j:F, 3n6k:F, 6n7y:F, 6n7z:F, 6n82:F, 6n83:F, 4n9u:A, 4nfi:F, 4nfj:F, 4nfk:F, 4ng6:A, 4nke:A, 4nkf:A, 4nua:A, 6oag:F, 6oah:F, 4ogu:A, 2opm:A, 2opn:A, 4p0v:A, 4p0w:A, 4p0x:A, 4pvx:F, 4pvy:F, 4q23:A, 2qis:A, 4qpf:A, 4qxs:F, 2rah:A, 4rxa:A, 3rye:A, 3s4j:A, 2vf6:A, 5ygi:A, 1yq7:A, 1yv5:A, 1zw5:A
65 5kok:A 348 19 0.0437 0.0316 0.5789 5.7 5koc:A, 5koc:B, 5kok:B, 5kpc:A, 5kpc:B, 5kpg:A, 5kpg:B
66 2a7r:A 338 48 0.0595 0.0444 0.3125 5.7 2a7r:B, 2a7r:C, 2bzn:A, 2bzn:B, 2bzn:C, 2bzn:D, 2bzn:E, 2bzn:F, 2bzn:G, 2bzn:H, 2c6q:A, 2c6q:B, 2c6q:D, 2c6q:C, 2c6q:E, 2c6q:F, 2c6q:H, 2c6q:G
67 6sga:F2 915 83 0.0913 0.0251 0.2771 6.3 7pua:F2, 6sgb:F2
68 1cr6:B 541 35 0.0556 0.0259 0.4000 6.3 1cr6:A, 1ek1:A, 1ek1:B, 1ek2:A, 1ek2:B
69 4krh:A 430 153 0.1468 0.0860 0.2418 6.9 4krh:B, 4kri:A, 4kri:B, 4kri:C
70 2aj4:A 509 47 0.0595 0.0295 0.3191 7.0 2aj4:B
71 4cjn:A 642 178 0.1706 0.0670 0.2416 7.8 4bl3:A, 4bl3:B, 4cjn:B, 4cpk:A, 4cpk:B, 4dki:A, 4dki:B, 6h5o:B, 5m18:A, 5m18:B, 5m19:A, 5m19:B, 5m1a:A, 5m1a:B, 1mwt:A, 1mwt:B, 1mwu:A, 1mwu:B, 6q9n:A, 3zfz:A, 3zfz:B, 3zg0:A, 3zg0:B, 3zg5:A, 3zg5:B
72 9fce:B 209 110 0.1429 0.1722 0.3273 7.9 9fce:A
73 6cx6:B 333 43 0.0675 0.0511 0.3953 7.9 6cx6:A, 5eg5:A, 4fr0:A, 4fsd:A, 4kw7:A, 4rsr:A
74 7xpl:E 231 156 0.1270 0.1385 0.2051 8.5 5gin:E, 5gin:F, 5gin:M, 5gio:E, 5gio:F, 5gio:M, 5gip:E, 5gip:F, 5gip:O, 5gip:P, 3id5:B, 3id5:F, 3id6:C, 3pla:E, 3pla:F, 3pla:M, 7xpl:F
75 7yhp:A 374 25 0.0437 0.0294 0.4400 8.6 7yho:A
76 7qrd:C 364 108 0.0992 0.0687 0.2315 9.2 6arj:A, 6arj:B, 6arj:C, 6arj:D, 6arv:A, 6arv:B, 6arv:C, 6arv:D, 3b3f:A, 3b3f:B, 3b3f:C, 3b3f:D, 6d2l:A, 6d2l:B, 6d2l:C, 6d2l:D, 6d2l:E, 6d2l:F, 6dvr:A, 6dvr:B, 5dwq:B, 5dwq:D, 5dwq:A, 5dwq:C, 5dx0:A, 5dx0:B, 5dx0:C, 5dx0:D, 5dx1:A, 5dx1:B, 5dx1:C, 5dx1:D, 5dx8:A, 5dx8:B, 5dx8:C, 5dx8:D, 5dxa:A, 5dxa:B, 5dxa:D, 5dxa:C, 5dxj:A, 5dxj:B, 5dxj:C, 5dxj:D, 7fai:A, 7fai:B, 7fai:C, 7fai:D, 7faj:A, 7faj:B, 7faj:C, 7faj:D, 8g2h:A, 8g2i:A, 5ih3:A, 5ih3:B, 5ih3:C, 5ih3:D, 4ikp:A, 4ikp:B, 4ikp:C, 4ikp:D, 5is6:A, 5is6:B, 5is6:C, 5is6:D, 5is7:A, 5is7:B, 5is7:C, 5is7:D, 5is8:A, 5is8:B, 5is8:D, 5is8:C, 5is9:A, 5is9:B, 5is9:C, 5is9:D, 5isa:C, 5isa:D, 5isa:A, 5isa:B, 5isb:A, 5isb:B, 5isb:C, 5isb:D, 5isc:A, 5isc:B, 5isc:C, 5isc:D, 5isd:A, 5isd:B, 5isd:C, 5isd:D, 5ise:A, 5ise:B, 5ise:C, 5ise:D, 5isf:A, 5isf:B, 5isf:C, 5isf:D, 5isg:A, 5isg:B, 5isg:C, 5isg:D, 5ish:A, 5ish:B, 5ish:C, 5ish:D, 5isi:A, 5isi:B, 5isi:C, 5isi:D, 6izq:A, 5k8v:A, 5k8v:B, 5k8v:C, 5k8v:D, 5k8w:A, 5k8w:B, 5k8w:C, 5k8w:D, 5k8x:A, 5k8x:B, 5k8x:C, 5k8x:D, 5lgp:A, 5lgp:B, 5lgp:C, 5lgp:D, 5lgq:B, 5lgq:A, 5lgq:C, 5lgq:D, 5lgr:A, 5lgr:B, 5lgr:C, 5lgr:D, 5lgs:A, 5lgs:B, 5lgs:C, 5lgs:D, 5lkj:A, 5lkj:B, 5lkj:C, 5lkj:D, 5lv2:A, 5lv2:B, 5lv2:C, 5lv2:D, 5lv2:E, 5lv2:F, 5lv2:G, 5lv2:H, 5lv3:A, 5lv3:B, 5lv3:C, 5lv3:D, 5ntc:A, 5ntc:B, 5ntc:C, 5ntc:D, 7okp:A, 7okp:B, 7okp:C, 7okp:D, 7os4:A, 7os4:B, 7os4:C, 7os4:D, 7ppq:A, 7ppq:B, 7ppq:C, 7ppq:D, 7ppy:A, 7ppy:B, 7ppy:C, 7ppy:D, 7pu8:A, 7pu8:B, 7pu8:C, 7pu8:D, 7puc:A, 7puc:B, 7puc:C, 7puc:D, 7puq:A, 7puq:B, 7puq:C, 7puq:D, 7pv6:A, 7pv6:B, 7pv6:C, 7pv6:D, 7qph:A, 7qph:D, 7qph:C, 7qph:B, 7qrd:A, 7qrd:B, 7qrd:D, 6s70:A, 6s70:B, 6s70:C, 6s70:D, 6s71:A, 6s71:B, 6s71:C, 6s71:D, 6s74:A, 6s74:B, 6s74:C, 6s74:D, 6s77:A, 6s77:B, 6s77:C, 6s77:D, 6s79:A, 6s79:B, 6s79:C, 6s79:D, 6s7a:A, 6s7a:B, 6s7a:C, 6s7a:D, 6s7b:A, 6s7b:B, 6s7b:C, 6s7b:D, 6s7c:A, 6s7c:B, 6s7c:C, 6s7c:D, 8sig:A, 8sih:A, 5tbh:A, 5tbh:B, 5tbh:C, 5tbh:D, 5tbi:A, 5tbi:B, 5tbi:C, 5tbi:D, 5tbj:A, 5tbj:B, 5tbj:C, 5tbj:D, 5u4x:A, 5u4x:B, 5u4x:C, 5u4x:D, 7u9i:A, 7u9i:B, 2v74:B, 2v74:D, 2v74:F, 2v74:H, 2y1w:A, 2y1w:B, 2y1w:C, 2y1w:D, 2y1x:A, 2y1x:D, 2y1x:B, 2y1x:C
77 6h5o:A 598 178 0.1706 0.0719 0.2416 9.2
78 4qnu:A 323 43 0.0516 0.0402 0.3023 9.5 4qnu:B, 4qnu:C, 4qnu:D, 4qnu:E, 4qnu:F, 4qnu:G, 4qnu:H, 4qnv:A, 4qnv:B
79 6tb9:E3 84 29 0.0397 0.1190 0.3448 9.6 6tb9:D3, 6tb9:C3, 6tb9:B3, 6tb9:E2, 6tb9:D2, 6tb9:C2, 6tb9:B2, 6tba:E3, 6tba:D3, 6tba:C3, 6tba:B3, 6tba:E2, 6tba:D2, 6tba:C2, 6tba:B2, 6tba:EN, 6tba:DN, 6tba:CN, 6tba:BN, 6tba:EM, 6tba:DM, 6tba:CM, 6tba:BM, 6tba:EI, 6tba:DI, 6tba:CI, 6tba:BI, 6tba:EH, 6tba:DH, 6tba:CH, 6tba:BH, 6tba:ED, 6tba:DD, 6tba:CD, 6tba:BD, 6tba:EC, 6tba:DC, 6tba:CC, 6tba:BC, 6tba:E8, 6tba:D8, 6tba:C8, 6tba:B8, 6tba:E7, 6tba:D7, 6tba:C7, 6tba:B7, 6tsu:D2, 6tsu:A2, 6tsu:C2, 6tsu:B2, 6tsu:E2, 6tsu:E3, 6tsu:B3, 6tsu:D3, 6tsu:C3, 6tsu:A3, 6tui:D2, 6tui:A2, 6tui:C2, 6tui:B2, 6tui:E2, 6tui:E3, 6tui:B3, 6tui:D3, 6tui:C3, 6tui:A3
80 7yhq:A 393 25 0.0437 0.0280 0.4400 9.7

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218