BioLiP

>protein
SKNVVIYADGVYDMLHLGHMKQLEQAKKLFENTTLIVGVTSDNETKLFKGQVVQTLEERTETLKHIRWVDEIISPCPWVV
TPEFLEKYKIDYVAHDIYAWLKRAGKFKATQRTEGVSTTDLIVRILKNYEDY

The query sequence (length=132) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4zcs:A	141	141	0.9848	0.9220	0.9220	1.76e-91	7pui:A, 7pve:A, 7pvf:A, 7pvg:A, 7py9:A, 7pya:A, 7pyb:A, 7pyc:A, 7q2i:A, 7q2k:A, 7q2l:A, 7q2m:A, 7q2v:A, 7q3m:A, 7q3w:A, 7q9v:A, 7q9w:A, 7qa7:A, 7qad:A, 7qd3:A, 7qvn:A, 7qvo:A, 7z9v:A, 4zcp:A, 4zcq:A, 4zcr:A, 4zcs:C, 4zcs:E, 4zcs:B, 4zcs:D, 4zcs:F
2	4mvd:B	253	142	0.5152	0.2688	0.4789	1.49e-44	3hl4:A, 3hl4:B, 4mvc:A, 4mvc:B, 4mvd:A, 4mvd:D, 4mvd:C, 4mvd:F, 4mvd:E, 4mvd:H, 4mvd:G
3	4xsv:A	306	136	0.4318	0.1863	0.4191	5.81e-30	3elb:A
4	4xsv:A	306	139	0.3712	0.1601	0.3525	2.43e-18	3elb:A
5	1coz:A	126	132	0.3182	0.3333	0.3182	1.28e-10	1coz:B, 1n1d:A, 1n1d:B, 1n1d:C, 1n1d:D
6	3glv:B	122	44	0.1288	0.1393	0.3864	0.003
7	5x3d:A	126	91	0.1667	0.1746	0.2418	0.036
8	1s4m:A	277	87	0.2045	0.0975	0.3103	0.50	1s4m:B, 1t6x:A, 1t6x:B, 1t6y:A, 1t6y:B, 1t6z:A, 1t6z:B
9	5ts2:A	165	67	0.1364	0.1091	0.2687	0.86	4ruk:A, 4ruk:F, 4ruk:B, 4ruk:E, 4ruk:C, 4ruk:D, 5ts2:B, 5ts2:C, 5ts2:D, 5ts2:E, 5ts2:F, 3x1j:A, 3x1j:C, 3x1j:B, 3x1k:A, 3x1k:B, 3x1k:C, 3x1k:D, 3x1k:E, 3x1k:F, 3x1m:A, 3x1m:C, 3x1m:B
10	3iu7:A	284	54	0.1894	0.0880	0.4630	1.9	4iec:A, 4if7:A, 3iu8:A, 3iu9:A, 4ook:A, 3pka:A, 3pkb:A, 3pkc:A, 3pkd:A, 3pke:A, 3ror:A, 1yj3:A, 5yoh:A, 5yoi:A, 5ypd:A, 5ypj:A, 5yxf:A
11	1od6:A	155	33	0.0985	0.0839	0.3939	2.4
12	2pbj:A	274	86	0.1970	0.0949	0.3023	2.9	2pbj:B, 2pbj:C, 2pbj:D, 1z9h:A, 1z9h:B, 1z9h:C, 1z9h:D
13	7x0b:B	301	44	0.0833	0.0365	0.2500	3.1	7wzv:A, 7wzv:B, 7wzx:A, 7x0b:A
14	2rvn:A	83	44	0.1136	0.1807	0.3409	3.1
15	8w2h:A	761	48	0.1212	0.0210	0.3333	4.3	7lw1:A, 7lw1:D, 7lw1:E, 7lw1:F, 8w2g:A, 8w2g:B, 8w2g:D, 8w2g:C, 8w2h:B, 8w2h:C, 8w2h:D, 8w2j:E, 8w2j:F, 8w2j:G, 8w2j:H, 8w2j:A, 8w2j:B, 8w2j:C, 8w2j:D
16	6gyf:B	366	64	0.1515	0.0546	0.3125	4.7	6gye:A, 6gye:B, 6gyf:A, 6gzo:A, 6gzo:B
17	3nd6:A	152	60	0.1136	0.0987	0.2500	4.7	3nd6:B, 3nd6:C, 3nd6:D, 3nd6:E, 3nd6:F, 3nd7:A, 3nd7:B, 3nd7:C, 3nd7:D, 3nd7:E, 3nd7:F
18	4bkm:A	304	66	0.1288	0.0559	0.2576	7.6	4bkm:B, 4bkm:C, 4bkm:D

[Back]