Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SKLIHVPKEDNSKEVTLDSLLEEGVLDKEIHKAITRMEFPGLTPVQQKTIKPILSSEDHDVIARAKTGTGKTFAFLIPIF
QHLINTKFDSQYMVKAVIVAPTRDLALQIEAEVKKIHDMNYGLKKYACVSLVGGTDFRAAMNKMNKLRPNIVIATPGRLI
DVLEKYSNKFFRFVDYKVLDEADRLLEIGFRDDLETISGILNEKNSKSADNIKTLLFSATLDDKVQKLANNIMNKKECLF
LDTVDKNEPEAHERIDQSVVISEKFANSIFAAVEHIKKQIKERDSNYKAIIFAPTVKFTSFLCSILKNEFKKDLPILEFH
GKITQNKRTSLVKRFKKDESGILVCTDVGARGMDFPNVHEVLQIGVPSELANYIHRIGRTARSGKEGSSVLFICKDELPF
VRELEDAKNIVIAKQEKYEPSEEIKSEVLEAVTEEPEDISDIVISLISSYRSCIKEYRFSERRILPEIASTYGVLLNDPQ
LKIPVSRRFLDKLGLSRSPIGKAMFEIRD

The query sequence (length=509) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3i5x:A 509 509 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 4db2:C, 4db2:A, 4db2:B, 4db2:D, 4db4:A, 3i5y:A, 3i61:A, 3i62:A, 3sqw:A, 3sqx:A, 4tyn:A, 4tyw:A, 4tyy:A, 4tz0:A, 4tz6:A
2 5z3g:Y 438 394 0.2849 0.3311 0.3680 3.96e-65 6c0f:p, 6cb1:p, 8e5t:p, 7nac:D, 7ohr:D, 7ohs:D, 7ohv:D, 7ohw:D, 7ohx:D, 7r6q:D, 7r7a:D, 8v87:D
3 8i9z:CE 465 393 0.2868 0.3140 0.3715 4.90e-65 8i9p:CE, 8i9r:CE, 8i9t:CE, 8i9v:CE, 8i9w:CE, 8i9x:CE, 8i9y:CE, 8ia0:CE
4 8esq:D 427 386 0.2770 0.3302 0.3653 2.76e-62 8esr:D, 8eth:D, 8eup:D, 8euy:D, 8ev3:D
5 8fky:SW 448 481 0.3104 0.3527 0.3285 9.74e-62 8fkp:SW, 8fkq:SW, 8fkr:SW, 8fks:SW, 8fkt:SW, 8fku:SW, 8fkv:SW, 8fkw:SW, 8fkx:SW, 3ly5:A
6 8v83:D 423 393 0.2672 0.3215 0.3461 6.39e-55 6elz:D, 8v84:D
7 8eti:D 391 386 0.2495 0.3248 0.3290 3.51e-54
8 2db3:A 420 354 0.2279 0.2762 0.3277 1.12e-46 2db3:B, 2db3:C, 2db3:D
9 8i9v:Cb 642 400 0.2456 0.1947 0.3125 4.76e-45 8i9t:Cb, 8i9w:Cb, 8i9x:Cb
10 4w7s:B 448 385 0.2358 0.2679 0.3117 1.80e-44
11 7liu:A 442 399 0.2475 0.2851 0.3158 2.83e-43 6cz5:A, 5e7j:A, 5e7m:A, 2i4i:A, 7liu:B, 4px9:A, 4px9:B, 4px9:C, 4pxa:A, 8ssw:A, 8ssw:B
12 4ljy:A 451 371 0.2102 0.2373 0.2884 7.08e-43 7oqb:p, 7oqe:p
13 8v87:3 656 391 0.2436 0.1890 0.3171 2.91e-41 8v84:3
14 6l5n:A 377 367 0.2318 0.3130 0.3215 3.22e-41 6l5m:A, 6l5m:B, 6l5m:C, 6l5m:D, 6l5m:E, 6l5n:B, 6l5o:A
15 6o5f:A 417 390 0.2456 0.2998 0.3205 1.03e-40 6o5f:B
16 3ex7:C 392 403 0.2259 0.2934 0.2854 1.14e-40 8c6j:7, 3ex7:H, 9fmd:7, 2hyi:C, 2hyi:I, 8i0w:u, 6icz:u, 2j0q:A, 2j0q:B, 2j0s:A, 2j0u:A, 6qdv:7, 2xb2:A, 2xb2:X, 5xjc:u, 5yzg:u, 7znj:A, 7znj:a, 7znj:F, 7znj:f, 7znj:K, 7znj:k
17 8y6o:I 597 394 0.2495 0.2127 0.3223 1.42e-40 8qp8:G, 6qw6:5X, 6qx9:5X, 8r08:G
18 5dtu:A 404 410 0.2220 0.2797 0.2756 1.47e-40
19 4d26:A 430 370 0.2377 0.2814 0.3270 2.05e-40 4d25:A
20 8fkv:NI 647 407 0.2299 0.1808 0.2875 2.23e-40 8fkt:NI, 8fku:NI, 8fkw:NI, 8fkx:NI, 8fky:NI
21 8arp:C 445 348 0.2122 0.2427 0.3103 2.33e-40 8arp:A, 8arp:B, 8arp:D, 8arp:E, 8arp:F
22 7pmq:C 458 356 0.2043 0.2271 0.2921 1.55e-39 7pli:A, 7pli:B, 7pli:J, 7pli:E, 7pli:F, 7pli:I, 7pmm:A, 7pmm:B, 7pmq:D, 7pmq:A, 7pmq:B
23 6uv1:A 438 367 0.2200 0.2557 0.3052 1.65e-36 6uv1:B, 6uv2:A, 6uv3:A, 6uv4:A
24 4kbf:A 365 351 0.2083 0.2904 0.3020 3.05e-36 2gxq:A, 2gxs:A, 2gxs:B, 2gxu:A, 3mwk:B, 3mwl:B, 3nbf:A, 3nbf:B, 3nbf:C, 3nbf:D
25 4ct4:B 378 392 0.2318 0.3122 0.3010 5.46e-36 5anr:B, 4ct4:D, 1vec:A, 2wax:C, 2way:A
26 7nac:x 539 397 0.2259 0.2134 0.2897 5.48e-36 7nad:x, 7r72:x, 7r7a:x
27 6xki:A 378 389 0.2279 0.3069 0.2982 1.03e-35 5zbz:A, 5zc9:A
28 8ia0:CW 540 374 0.2161 0.2037 0.2941 4.95e-34 8i9z:CW
29 2vso:A 366 382 0.2200 0.3060 0.2932 1.18e-32 1fuk:A, 2vso:B, 2vsx:A, 2vsx:B
30 8tbx:A 458 421 0.2515 0.2795 0.3040 1.37e-31
31 4bru:A 375 381 0.2004 0.2720 0.2677 2.71e-29
32 6b4i:F 426 383 0.2122 0.2535 0.2820 4.69e-28 6b4i:E, 6b4j:E, 6b4j:F, 6b4k:A, 6b4k:B, 3ews:A, 3ews:B, 3fht:A, 3fht:B, 3fmo:B, 3fmp:B, 3fmp:D, 3g0h:A
33 5sup:B 383 377 0.2043 0.2715 0.2759 6.93e-27 5sup:A, 5sup:C, 5suq:A, 5suq:C
34 5elx:A 391 386 0.2043 0.2660 0.2694 2.51e-26 3peu:A, 3pev:A, 3pew:A, 3pey:A, 3rrm:A, 3rrn:A
35 8enk:B 381 372 0.1827 0.2441 0.2500 3.99e-25 8enk:A, 1xtj:A, 7znk:P, 7znk:p
36 2pl3:A 232 219 0.1395 0.3060 0.3242 1.12e-24
37 3ber:A 220 175 0.1277 0.2955 0.3714 2.70e-24
38 6aic:A 202 218 0.1316 0.3317 0.3073 5.70e-23
39 5gju:A 199 213 0.1277 0.3266 0.3052 9.50e-21
40 5h1y:B 245 237 0.1356 0.2816 0.2911 1.14e-20 5h1y:A
41 3iuy:A 213 202 0.1297 0.3099 0.3267 7.23e-19 3iuy:B
42 7oi6:x 374 364 0.1965 0.2674 0.2747 1.37e-18
43 3fe2:A 234 201 0.1238 0.2692 0.3134 6.71e-17 3fe2:B
44 3dkp:A 240 240 0.1415 0.3000 0.3000 4.06e-15
45 7am2:BW 447 391 0.1788 0.2036 0.2327 7.62e-14
46 3b7g:A 205 182 0.1100 0.2732 0.3077 2.95e-13 3b7g:B, 2oxc:A, 2oxc:B
47 2rb4:A 164 127 0.0766 0.2378 0.3071 7.63e-10
48 7a8r:A 531 367 0.1631 0.1563 0.2262 4.63e-08 7a8r:B, 6jtz:A, 6jtz:B, 4u7d:A, 4u7d:B, 4u7d:D, 4u7d:C, 2v1x:A, 2v1x:B, 2wwy:B, 2wwy:A, 8yrs:B, 8yrs:A
49 7tra:A 572 369 0.1827 0.1626 0.2520 1.74e-07
50 6s8r:A 167 78 0.0491 0.1497 0.3205 2.23e-07
51 6yhr:A 541 174 0.0727 0.0684 0.2126 5.88e-07 3aaf:A, 3aaf:B, 7gqs:A, 7gqt:A, 7gqu:A, 8pfl:A, 8pfo:A, 8pfp:A, 8yle:A
52 5lst:A 617 421 0.1513 0.1248 0.1829 6.97e-07
53 1oyw:A 516 97 0.0472 0.0465 0.2474 4.99e-06 1oyy:A
54 6yxy:EB 663 187 0.0864 0.0664 0.2353 7.81e-06 7aoi:XB, 6yxx:EB
55 6yxy:EB 663 69 0.0472 0.0362 0.3478 4.75e-05 7aoi:XB, 6yxx:EB
56 6crm:A 512 90 0.0452 0.0449 0.2556 8.81e-06 4tmu:A
57 7aud:A 522 250 0.1139 0.1111 0.2320 2.18e-05 7aud:E, 7aud:B, 7aud:C, 7aud:D, 7aud:F
58 4q47:A 513 466 0.1729 0.1715 0.1888 3.48e-05 4q47:B, 4q48:A, 4q48:B
59 4cgz:A 629 250 0.1139 0.0922 0.2320 4.24e-05 4cdg:A, 4cdg:B, 4o3m:A
60 5v9x:A 772 391 0.1709 0.1127 0.2225 6.11e-05
61 7auc:A 493 92 0.0393 0.0406 0.2174 5.48e-04
62 6l8n:A 810 147 0.0786 0.0494 0.2721 8.97e-04
63 6znq:B 711 389 0.1493 0.1069 0.1954 0.001 6znp:B
64 7zpq:CA 1742 358 0.1631 0.0476 0.2318 0.001 7zrs:CA, 7zuw:CA
65 6znp:A 748 391 0.1513 0.1029 0.1969 0.005 6znq:A
66 7yym:A 1281 86 0.0452 0.0180 0.2674 0.011 4ngb:A, 4ngc:A, 4ngg:A, 4nh3:A, 4nh5:A, 4nh6:A, 7yyn:A, 7zpi:A, 7zpj:A, 7zpk:A
67 5zal:A 1314 53 0.0275 0.0107 0.2642 0.014 2eb1:A, 2eb1:B, 2eb1:C, 4ngd:A, 5zam:A
68 1gm5:A 729 109 0.0609 0.0425 0.2844 0.026
69 5jb2:A 670 271 0.1100 0.0836 0.2066 0.042 5jaj:A, 5jbg:A
70 7zmq:A 443 93 0.0452 0.0519 0.2473 0.052 5lb3:B, 5lb3:E, 5lb5:A, 5lb5:B, 5lb5:C, 5lb5:D, 5lb8:A, 5lb8:D, 5lba:B, 5lba:A, 5lba:C, 5lba:D, 7zml:A, 7zml:B, 7zml:C, 7zml:D, 7zmm:B, 7zmm:A, 7zmm:C, 7zmm:D, 7zmn:A, 7zmn:B, 7zmo:A, 7zmo:B, 7zmp:A, 7zmp:B, 7zmq:B, 7zmr:A, 7zmr:B, 7zms:A, 7zmt:A, 7zmt:B, 7zmv:A, 7zmv:B, 7zmv:C, 7zmv:D
71 8dga:A 1629 204 0.0845 0.0264 0.2108 0.15
72 5yzg:D 1908 130 0.0668 0.0178 0.2615 0.16 6ahd:D, 8bc8:B, 8bc9:B, 8bca:B, 8bcb:B, 8bcc:B, 8bcd:B, 8bce:B, 8bcf:B, 8bcg:B, 8bch:B, 7bdi:B, 7bdj:B, 7bdk:B, 7bdl:B, 4f92:B, 4f93:B, 6ff7:r, 8h6k:5D, 8h6l:5D, 4kit:B, 5o9z:C, 7os1:B, 8qo9:B, 8qzs:B, 5urj:A, 5urk:A, 5urm:A, 5urm:B, 5xjc:D
73 4q5o:A 282 69 0.0452 0.0816 0.3333 0.19 4mhu:A, 4mhu:B, 4q5o:B
74 6zns:A 635 160 0.0707 0.0567 0.2250 0.32
75 8dfv:A 1664 71 0.0334 0.0102 0.2394 0.32
76 8dg5:A 1635 71 0.0334 0.0104 0.2394 0.34 8dg7:A
77 6p4f:C 436 69 0.0295 0.0344 0.2174 0.50 6p4f:A, 6p4w:A
78 5jbj:A 627 69 0.0393 0.0319 0.2899 0.55
79 8fak:H 643 96 0.0511 0.0404 0.2708 0.62 2d7g:A, 2d7g:B, 2d7g:C, 2d7g:D, 2d7h:A, 6dcr:A, 2dwl:A, 2dwl:B, 2dwl:C, 2dwl:D, 2dwm:A, 2dwm:C, 2dwm:D, 2dwn:A, 2dwn:C
80 7z8s:E 1514 78 0.0354 0.0119 0.2308 0.78 7zb5:E, 7zb5:H
81 8sp4:A 859 69 0.0334 0.0198 0.2464 0.82 8spg:A
82 7zke:E 1623 78 0.0354 0.0111 0.2308 0.83
83 8w0a:C 636 146 0.0609 0.0487 0.2123 0.90 8w0a:A
84 7eld:A 1137 139 0.0530 0.0237 0.1942 0.94 7ele:A
85 4ff7:A 247 92 0.0530 0.1093 0.2935 1.2 4ff7:B, 7tim:A, 7tim:B, 2ypi:A, 2ypi:B, 3ypi:A, 3ypi:B
86 4j1q:A 417 183 0.0845 0.1031 0.2350 2.3
87 3din:A 816 133 0.0609 0.0380 0.2331 2.7 3din:B, 3jux:A, 4ys0:A
88 6dgd:A 704 81 0.0432 0.0312 0.2716 2.7 6dgd:B, 4nl4:H
89 6o8h:A 571 120 0.0550 0.0490 0.2333 2.8 6o8g:B, 6o8g:C
90 3go4:A 262 67 0.0334 0.0649 0.2537 2.9
91 7jl0:A 662 71 0.0295 0.0227 0.2113 3.1 7jl2:A, 7jl2:C, 7jl2:E
92 6acx:A 1175 70 0.0393 0.0170 0.2857 3.1 6acx:B
93 2fc0:A 196 56 0.0354 0.0918 0.3214 3.5 2fbv:A, 2fbx:A
94 6uwr:A 660 55 0.0334 0.0258 0.3091 3.7 6uwi:A, 6uwi:h, 6uwi:G, 6uwi:n, 6uwi:F, 6uwi:m, 6uwi:E, 6uwi:l, 6uwi:D, 6uwi:k, 6uwi:C, 6uwi:j, 6uwi:B, 6uwi:i, 6uwi:H, 6uwi:a, 6uwi:I, 6uwi:b, 6uwi:J, 6uwi:c, 6uwi:K, 6uwi:d, 6uwi:L, 6uwi:e, 6uwi:M, 6uwi:f, 6uwi:N, 6uwi:g, 6uwr:B, 6uwr:C, 6uwr:D, 6uwr:E, 6uwr:F, 6uwr:G, 6uwr:H, 6uwr:I, 6uwr:J, 6uwr:K, 6uwr:L, 6uwr:M, 6uwr:N, 6uwt:H, 6uwt:I, 6uwt:J, 6uwt:K, 6uwt:L, 6uwt:M, 6uwt:N, 6uwt:A, 6uwt:B, 6uwt:C, 6uwt:D, 6uwt:E, 6uwt:F, 6uwt:G
95 7r5j:D4 1312 82 0.0491 0.0191 0.3049 4.2 7r5j:D0, 7r5j:D1, 7r5j:D2, 7r5j:D3, 7r5j:D5, 7r5k:D4, 7r5k:D0, 7r5k:D1, 7r5k:D2, 7r5k:D3, 7r5k:D5
96 8hf0:A 1561 120 0.0570 0.0186 0.2417 4.2 8hf0:D, 8hf1:A, 8hf1:D, 8hf1:G, 7w0a:A, 7w0a:E, 7w0c:A, 7w0d:A, 7w0e:A, 7w0f:A
97 7vnn:D 641 54 0.0334 0.0265 0.3148 4.2 8ekm:A, 8ekm:B, 8ekm:C, 8ekm:D, 8ekm:E, 8ekm:F, 8ekm:G, 7vnj:A, 7vnj:B, 7vnj:C, 7vnj:D, 7vnj:E, 7vnj:F, 7vnj:G, 7vnn:A, 7vnn:B, 7vnn:C, 7vnn:E, 7vnn:F, 7vnn:G, 7yvq:A, 7yvq:B, 7yvq:C, 7yvq:D, 7yvq:E, 7yvq:F, 7yvq:G, 7yvs:A, 7yvs:B, 7yvs:C, 7yvs:D, 7yvs:E, 7yvs:F, 7yvs:G
98 7w0b:A 1586 120 0.0570 0.0183 0.2417 4.4 7w0d:F
99 7bkp:A 689 71 0.0295 0.0218 0.2113 5.0 6g19:A, 6gjz:A, 6gkh:A, 6gkm:A, 6h66:A, 7nic:A, 7niq:B
100 5gan:B 1781 107 0.0609 0.0174 0.2897 5.9 4bgd:A, 5gao:B, 5gap:B, 5nrl:B, 5zwm:D, 5zwo:D
101 7r21:T 304 61 0.0413 0.0691 0.3443 7.2 7tr6:O, 7tr8:O, 7tr9:O, 7tra:N
102 7bkq:A 640 46 0.0216 0.0172 0.2391 7.3
103 5jc7:A 641 50 0.0275 0.0218 0.2800 7.3
104 5jc3:A 668 50 0.0275 0.0210 0.2800 7.5 5jc3:B, 5jc7:B, 5jcf:A, 5jcf:B, 5jch:A, 5jch:B
105 7djs:D 251 33 0.0216 0.0438 0.3333 8.9 7djs:A, 7djs:B, 7djs:C
106 5i10:A 192 42 0.0334 0.0885 0.4048 8.9
107 8t5s:A 693 56 0.0314 0.0231 0.2857 9.0
108 6xeo:A 1118 74 0.0314 0.0143 0.2162 9.5
109 6x2f:A 1144 74 0.0314 0.0140 0.2162 9.8 7ssg:A, 6x26:A, 6x2n:A, 6x43:A, 6x4w:A, 6x4y:A, 6x50:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218