BioLiP

>protein
SKIFDFVKPGVITGDDVQKVFQVAKENNFALPAVNCVGTDSINAVLETAAKVKAPVIVQFSNGGASFIAGKGVKSDVPQG
AAILGAISGAHHVHQMAEHYGVPVILHTDHCAKKLLPWIDGLLDAGEKHFAATGKPLFSSHMIDLSEESLQENIEICSKY
LERMSKIGMTLEIELGYTQPEDVDYAYTELSKISPRFTIAASFGNVHGVYKPGNVVLTPTILRDSQEYVSKKHNLPHNSL
NFVFHGGSGSTAQEIKDSVSYGVVKMNIDTDTQWATWEGVLNYYKANEAYLQGQLGNPKGEDQPNKKYYDPRVWLRAGQT
SMIARLEKAFQELNAIDVL

The query sequence (length=339) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1dos:A	358	358	0.9971	0.9441	0.9441	0.0	1b57:A, 1b57:B, 1dos:B, 5vjd:A, 5vjd:B, 5vje:A, 5vje:B, 1zen:A
2	5gk5:C	335	342	0.9794	0.9910	0.9708	0.0	5gk3:A, 5gk3:B, 5gk4:A, 5gk4:B, 5gk5:A, 5gk5:B, 5gk5:D, 5gk5:E, 5gk5:F, 5gk5:G, 5gk5:H, 5gk6:A, 5gk6:B, 5gk7:A, 5gk7:B, 5gk8:A, 5gk8:B, 1gyn:A
3	3qm3:A	350	350	0.6342	0.6143	0.6143	1.27e-155	3qm3:B, 3qm3:C, 3qm3:D, 3qm3:E, 3qm3:F, 3qm3:G, 3qm3:H
4	7rgn:A	340	332	0.5074	0.5059	0.5181	1.57e-118
5	7v6g:B	338	330	0.4956	0.4970	0.5091	9.75e-108	6lnk:A, 6lnk:B, 7v6f:A, 7v6f:B, 7v6g:A, 7yva:A, 7yva:B
6	4del:A	345	336	0.3805	0.3739	0.3839	1.04e-61	4a22:A, 4a22:B, 4def:A, 3ekl:A, 3ekz:A, 3elf:A
7	4lv4:A	320	325	0.3451	0.3656	0.3600	1.32e-50
8	4to8:A	279	319	0.2360	0.2867	0.2508	5.76e-18	4to8:B
9	3q94:A	285	330	0.2419	0.2877	0.2485	7.64e-14	3q94:B
10	1gvf:B	275	312	0.2212	0.2727	0.2404	1.88e-13	1gvf:A
11	6ofu:B	264	253	0.1858	0.2386	0.2490	4.28e-13	6ofu:A, 6ofu:C, 6ofu:D
12	2isv:A	298	323	0.2124	0.2416	0.2229	4.31e-13	3gak:A
13	8q59:A	280	316	0.2419	0.2929	0.2595	7.68e-13	8q57:A, 8q57:B, 8q59:B
14	1rv8:B	305	331	0.2360	0.2623	0.2417	4.00e-12	1rv8:A, 1rv8:C, 1rv8:D, 1rvg:A, 1rvg:B, 1rvg:C, 1rvg:D
15	3gay:A	319	350	0.2271	0.2414	0.2200	1.25e-11	3gak:B, 3gay:B, 3gb6:A, 3gb6:B, 2isv:B, 2isw:A, 3ohi:A, 3ohi:B
16	8q5a:A	276	284	0.2035	0.2500	0.2430	2.98e-11	8q58:A
17	5ud0:A	282	269	0.1976	0.2376	0.2491	3.00e-10	5ud1:A, 5ud1:B
18	3n9s:A	307	287	0.1917	0.2117	0.2265	5.60e-09	3c4u:A, 3c4u:B, 3c52:A, 3c52:B, 3c56:A, 3c56:B, 3n9r:A, 3n9r:B, 3n9r:K, 3n9r:P, 3n9r:U, 3n9r:Z, 3n9r:e, 3n9r:j, 3n9s:B, 5uck:A, 5uck:B, 5ucn:A, 5ucn:B, 5ucp:A, 5ucp:B, 5ucs:A, 5ucs:B, 5ucz:A, 5ucz:B, 5ud0:B, 5ud2:A, 5ud2:B, 5ud3:A, 5ud3:B, 5ud4:A, 5ud4:B, 5vjf:A, 5vjf:B
19	3pm6:A	287	269	0.1799	0.2125	0.2268	7.84e-09
20	3pm6:B	264	252	0.1504	0.1932	0.2024	1.85e-04
21	6fku:A	511	50	0.0531	0.0352	0.3600	2.1	6fku:B
22	3c61:A	314	41	0.0413	0.0446	0.3415	3.1	3c61:B, 3c61:C, 3c61:D, 6dgs:A, 6dgs:B, 6dwg:A, 6dwg:B, 6ebs:A, 6ebs:B, 4ef8:A, 4ef8:B, 4ef9:A, 4ef9:B, 3gye:A, 3gye:B, 3gz3:A, 3gz3:B, 3mhu:A, 3mhu:B, 3mjy:A, 3mjy:B, 7mx6:AAA, 7mx6:BBB, 7myd:AAA, 7myd:BBB, 3tjx:A, 3tjx:B, 3tq0:A, 3tq0:B, 3tro:A, 3tro:B
23	5u89:A	1039	50	0.0413	0.0135	0.2800	3.4
24	4yng:E	470	57	0.0590	0.0426	0.3509	3.4	8eq0:B, 8eq0:A, 4yng:A, 4yng:B, 4yng:C, 4yng:D, 4yng:F, 4yng:G, 4yng:H
25	4wzh:A	304	76	0.0678	0.0757	0.3026	4.1	4wzh:B
26	5t5i:A	569	106	0.0855	0.0510	0.2736	5.0	5t5i:I, 5t5m:A, 5t61:A, 5t61:G, 5t61:M, 5t61:S, 5t61:Y, 5t61:e, 5t61:k, 5t61:q
27	6b2q:B	267	38	0.0413	0.0524	0.3684	7.5	6b2q:A, 6b2q:C, 6b2q:D
28	2eh6:A	375	102	0.0826	0.0747	0.2745	9.0	2eh6:B
29	2d1c:A	495	43	0.0413	0.0283	0.3256	9.2	2d1c:B
30	3aqi:A	359	28	0.0413	0.0390	0.5000	9.7	3aqi:B, 7ct7:A, 7ct7:B, 7ctc:A, 7ctc:D, 4f4d:A, 4f4d:B, 3hcn:A, 3hcn:B, 3hco:A, 3hco:B, 3hcp:A, 3hcp:B, 3hcr:A, 3hcr:B, 1hrk:A, 1hrk:B, 2hrc:A, 2hrc:B, 2hre:A, 2hre:B, 2hre:C, 2hre:D, 4kla:A, 4kla:B, 4klc:A, 4klc:B, 4klr:A, 4klr:B, 4kmm:A, 4kmm:B, 4mk4:A, 4mk4:B, 2pnj:A, 2pnj:B, 2po5:A, 2po5:B, 2po7:A, 2po7:B, 2qd1:A, 2qd1:B, 2qd1:C, 2qd1:D, 2qd2:A, 2qd2:B, 2qd3:A, 2qd3:B, 2qd4:A, 2qd4:B, 2qd5:A, 2qd5:B, 3w1w:A, 3w1w:B

[Back]