BioLiP

>protein
SKIFDFVKPGVITGDDVQKVFQVAKENNFALPAVNCVGTDSINAVLETAAKVKAPVIVQFSNGGASFIAGKGVKSDVPQG
AAILGAISGAHHVHQMAEHYGVPVILHTDHCAKKLLPWIDGLLDAGEKHFAATGKPLFSSHMIDLSEESLQENIEICSKY
LERMSKIGMTLEIELGCLYTQPEDVDYAYTELSKISPRFTIAASFGNVHGVYKPGNVVLTPTILRDSQEYVSKKHNLPHN
SLNFVFHGGSGSTAQEIKDSVSYGVVKMNIDTDTQWATWEGVLNYYKANEAYLQGQLGNPKGEDQPNKKYYDPRVWLRAG
QTSMIARLEKAFQELNAIDVL

The query sequence (length=341) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1dos:A	358	358	0.9971	0.9497	0.9497	0.0	1b57:A, 1b57:B, 1dos:B, 5vjd:A, 5vjd:B, 5vje:A, 5vje:B, 1zen:A
2	5gk5:C	335	342	0.9795	0.9970	0.9766	0.0	5gk3:A, 5gk3:B, 5gk4:A, 5gk4:B, 5gk5:A, 5gk5:B, 5gk5:D, 5gk5:E, 5gk5:F, 5gk5:G, 5gk5:H, 5gk6:A, 5gk6:B, 5gk7:A, 5gk7:B, 5gk8:A, 5gk8:B, 1gyn:A
3	3qm3:A	350	350	0.6364	0.6200	0.6200	4.64e-158	3qm3:B, 3qm3:C, 3qm3:D, 3qm3:E, 3qm3:F, 3qm3:G, 3qm3:H
4	7rgn:A	340	332	0.5073	0.5088	0.5211	2.12e-119
5	7v6g:B	338	330	0.4956	0.5000	0.5121	8.94e-109	6lnk:A, 6lnk:B, 7v6f:A, 7v6f:B, 7v6g:A, 7yva:A, 7yva:B
6	4del:A	345	335	0.3812	0.3768	0.3881	1.28e-62	4a22:A, 4a22:B, 4def:A, 3ekl:A, 3ekz:A, 3elf:A
7	4lv4:A	320	324	0.3460	0.3688	0.3642	2.02e-51
8	4to8:A	279	323	0.2287	0.2796	0.2415	5.00e-18	4to8:B
9	3q94:A	285	330	0.2405	0.2877	0.2485	2.65e-15	3q94:B
10	6ofu:B	264	253	0.1848	0.2386	0.2490	3.30e-14	6ofu:A, 6ofu:C, 6ofu:D
11	8q59:A	280	316	0.2405	0.2929	0.2595	3.86e-14	8q57:A, 8q57:B, 8q59:B
12	1gvf:B	275	312	0.2229	0.2764	0.2436	6.72e-14	1gvf:A
13	1rv8:B	305	335	0.2375	0.2656	0.2418	5.77e-13	1rv8:A, 1rv8:C, 1rv8:D, 1rvg:A, 1rvg:B, 1rvg:C, 1rvg:D
14	3gay:A	319	350	0.2287	0.2445	0.2229	2.43e-12	3gak:B, 3gay:B, 3gb6:A, 3gb6:B, 2isv:B, 2isw:A, 3ohi:A, 3ohi:B
15	2isv:A	298	325	0.2111	0.2416	0.2215	2.02e-11	3gak:A
16	8q5a:A	276	284	0.2023	0.2500	0.2430	2.10e-11	8q58:A
17	3n9s:A	307	287	0.1935	0.2150	0.2300	1.19e-10	3c4u:A, 3c4u:B, 3c52:A, 3c52:B, 3c56:A, 3c56:B, 3n9r:A, 3n9r:B, 3n9r:K, 3n9r:P, 3n9r:U, 3n9r:Z, 3n9r:e, 3n9r:j, 3n9s:B, 5uck:A, 5uck:B, 5ucn:A, 5ucn:B, 5ucp:A, 5ucp:B, 5ucs:A, 5ucs:B, 5ucz:A, 5ucz:B, 5ud0:B, 5ud2:A, 5ud2:B, 5ud3:A, 5ud3:B, 5ud4:A, 5ud4:B, 5vjf:A, 5vjf:B
18	3pm6:A	287	269	0.1789	0.2125	0.2268	2.89e-09
19	5ud0:A	282	265	0.1818	0.2199	0.2340	4.63e-09	5ud1:A, 5ud1:B
20	3pm6:B	264	252	0.1496	0.1932	0.2024	3.03e-06
21	3c61:A	314	43	0.0440	0.0478	0.3488	0.25	3c61:B, 3c61:C, 3c61:D, 6dgs:A, 6dgs:B, 6dwg:A, 6dwg:B, 6ebs:A, 6ebs:B, 4ef8:A, 4ef8:B, 4ef9:A, 4ef9:B, 3gye:A, 3gye:B, 3gz3:A, 3gz3:B, 3mhu:A, 3mhu:B, 3mjy:A, 3mjy:B, 7mx6:AAA, 7mx6:BBB, 7myd:AAA, 7myd:BBB, 3tjx:A, 3tjx:B, 3tq0:A, 3tq0:B, 3tro:A, 3tro:B
22	6fku:A	511	50	0.0528	0.0352	0.3600	2.1	6fku:B
23	2b4g:B	313	67	0.0616	0.0671	0.3134	3.3	2b4g:A, 2b4g:C, 2b4g:D, 5xfv:A, 5xfv:B, 5xfv:C, 5xfv:D
24	5u89:A	1039	50	0.0411	0.0135	0.2800	3.4
25	4yng:E	470	57	0.0587	0.0426	0.3509	3.5	8eq0:B, 8eq0:A, 4yng:A, 4yng:B, 4yng:C, 4yng:D, 4yng:F, 4yng:G, 4yng:H
26	4wzh:A	304	57	0.0528	0.0592	0.3158	4.4	4wzh:B
27	6q7i:A	770	120	0.0968	0.0429	0.2750	4.7	6q7j:A, 6q7j:B
28	6b2q:B	267	38	0.0411	0.0524	0.3684	7.6	6b2q:A, 6b2q:C, 6b2q:D
29	2eh6:A	375	102	0.0821	0.0747	0.2745	8.2	2eh6:B
30	2d1c:A	495	43	0.0411	0.0283	0.3256	9.4	2d1c:B
31	3aqi:A	359	28	0.0411	0.0390	0.5000	10.0	3aqi:B, 7ct7:A, 7ct7:B, 7ctc:A, 7ctc:D, 4f4d:A, 4f4d:B, 3hcn:A, 3hcn:B, 3hco:A, 3hco:B, 3hcp:A, 3hcp:B, 3hcr:A, 3hcr:B, 1hrk:A, 1hrk:B, 2hrc:A, 2hrc:B, 2hre:A, 2hre:B, 2hre:C, 2hre:D, 4kla:A, 4kla:B, 4klc:A, 4klc:B, 4klr:A, 4klr:B, 4kmm:A, 4kmm:B, 4mk4:A, 4mk4:B, 2pnj:A, 2pnj:B, 2po5:A, 2po5:B, 2po7:A, 2po7:B, 2qd1:A, 2qd1:B, 2qd1:C, 2qd1:D, 2qd2:A, 2qd2:B, 2qd3:A, 2qd3:B, 2qd4:A, 2qd4:B, 2qd5:A, 2qd5:B, 3w1w:A, 3w1w:B

[Back]