BioLiP

>protein
SISISYSTTYSGWTVADYLADWSAYFGDVNHRPGQVVDGSNTGGFNPGPFDGSQYALKSTASDAAFIAGGDLHYTLFSNP
SHTLWGKLDSIALGDTLTGGASSGGYALDSQEVSFSNLGLDSPIAQGRDGTVHKVVYGLMSGDSSALQGQIDALLKAVDP
SLSINSTFDQLAAAGVAHATP

The query sequence (length=181) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7emo:A	186	181	1.0000	0.9731	1.0000	1.09e-128	3ell:A, 3ell:B, 7emo:B, 7emo:C, 7emp:A, 7emp:B, 7emp:C, 7emq:A, 7emq:B, 7emq:C, 7emr:A, 7emr:B, 7emr:C, 7ems:A, 7ems:B, 7ems:C, 7emt:A, 7emu:A, 7emv:A, 7emw:A, 5iqx:A, 6jlg:A, 6jlg:E, 6jlg:B, 6jlg:C, 6jlg:D, 6jlg:F, 6jlg:G, 6jlg:H, 3mol:A, 3mol:B, 3mom:A, 3mom:B, 4o6q:A, 4o6s:A, 4o6t:A, 4o6u:A, 6u87:A, 6urb:A, 6urb:B, 7vf7:A, 7vf7:B, 7vf7:C, 7vf8:A, 7vf8:B, 7vm1:A, 7vm1:B, 7vm1:C, 7vm1:D, 3w8m:A, 3w8o:A, 3w8o:B, 3wah:A, 3wah:B, 5xa4:A, 5xa4:B, 5xhl:A, 5xhl:B, 5xib:A, 5xib:B, 5xic:A, 5xic:B, 5xic:C, 5xic:D, 5xie:A, 5xie:B, 5xkb:A, 5xkb:B
2	8ki1:A	181	181	0.7901	0.7901	0.7901	1.48e-100	8ki0:A, 8ki0:B, 8ki1:B
3	2uyd:X	174	175	0.4972	0.5172	0.5143	2.13e-52	1b2v:A, 5c58:B, 2cn4:A, 2cn4:B, 3ddr:C, 3ddr:D, 1dk0:A, 1dk0:B, 1dkh:A
4	4jet:A	179	184	0.2983	0.3017	0.2935	8.10e-20	4jet:B, 4jet:C, 4jet:D, 4jet:E, 4jet:F, 4jet:G, 4jet:H, 4jet:I, 4jet:J, 4xzd:A, 4xzd:D, 4y1q:A, 4y1q:B, 4y1q:D, 4y1q:G, 4y1q:I, 4y1q:K, 4y1q:M, 4y1q:O
5	4y4s:A	155	178	0.2818	0.3290	0.2865	7.41e-13
6	3m6i:A	358	107	0.1436	0.0726	0.2430	0.44	3m6i:B
7	7yyp:A	597	59	0.1160	0.0352	0.3559	1.1	7yzn:A, 7zag:7, 7zah:7, 7zki:7
8	7jux:A	278	27	0.0608	0.0396	0.4074	3.2	9axh:C, 9axh:D, 7juw:B, 7juy:B, 7juz:A, 7jv0:A, 7jv1:D
9	3ws1:A	360	40	0.0829	0.0417	0.3750	3.7	3wrz:A, 3wrz:B, 3ws0:A, 3ws0:B, 3ws0:C, 3ws1:B, 3ws1:C, 3ws2:A, 3ws2:B, 3ws2:C, 3ws5:B
10	5a4f:L	581	56	0.0994	0.0310	0.3214	4.8	5a4f:M, 5a4i:L, 5a4i:M, 5a4m:L, 5a4m:M, 5adu:L, 5adu:M, 6fpi:L, 6fpi:M, 6fpo:L, 6fpo:M, 6fpw:L, 6fpw:M, 6g7r:L, 6g7r:M, 6g94:L, 6g94:M, 6g94:J, 6g94:K, 6gal:L, 6gal:M, 4gd3:L, 4gd3:M, 4gd3:J, 4gd3:K, 5jrd:L, 5jrd:M, 5lmm:L, 5lmm:M, 5lry:L, 5lry:M, 6rp2:L, 6rp2:M, 4ue3:LLL, 4ue3:MMM, 3uqy:L, 3uqy:M, 3usc:L, 3usc:M, 3use:L, 3use:M
11	7t7u:D	168	55	0.1160	0.1250	0.3818	5.2	4lms:B, 4lms:D, 7t7u:B
12	5brn:B	194	34	0.0608	0.0567	0.3235	5.6	5bsk:A, 5bsk:B, 5bsk:C, 5bsk:D, 4kn6:A, 8tpy:A, 8tpy:B, 8tpy:C, 8tpy:D
13	6m8n:A	367	50	0.0884	0.0436	0.3200	5.7
14	1bzy:A	214	34	0.0608	0.0514	0.3235	5.9	6bnj:A, 6bnj:B, 6bnj:C, 6bnj:D, 5brn:A, 5brn:C, 5brn:D, 1bzy:B, 1bzy:C, 1bzy:D, 1d6n:A, 1d6n:B, 3gep:A, 3gep:B, 3ggc:A, 3ggc:B, 3ggj:A, 3ggj:B, 5hia:A, 5hia:B, 5hia:C, 5hia:D, 1hmp:A, 1hmp:B, 4ijq:A, 4ijq:B, 4ijq:C, 4ijq:D, 4rab:A, 4rab:B, 4rab:C, 4rab:D, 4rac:A, 4rac:B, 4rac:C, 4rac:D, 4rad:A, 4rad:B, 4rad:C, 4rad:D, 4rad:E, 4rad:F, 4rad:G, 4rad:H, 4ran:A, 4ran:B, 4ran:C, 4ran:D, 4rao:A, 4rao:B, 4rao:C, 4rao:D, 4raq:A, 4raq:B, 4raq:C, 4raq:D, 7san:A, 7san:B, 7san:C, 7san:D, 8tpv:A, 8tpv:B, 8tpv:C, 8tpv:D, 5w8v:A, 5w8v:B, 5w8v:C, 5w8v:D
15	6s1s:A	367	34	0.0608	0.0300	0.3235	6.3	4hef:A, 6i30:A, 4nk3:A, 4ooy:A, 3s1y:A, 3s22:A, 8sdr:A, 8sds:A, 8sdt:A, 8sdv:A, 6uqs:A, 6uqt:A, 6uqu:A, 6ur3:A, 4wyy:A, 2wzx:A, 2wzz:A, 4wz4:A, 4x68:A, 4x68:B
16	2d6f:D	522	12	0.0552	0.0192	0.8333	7.1	2d6f:C
17	1k6x:A	324	58	0.0884	0.0494	0.2759	8.4	1ti7:A, 2vut:A, 2vut:B, 2vut:C, 2vut:D, 2vut:E, 2vut:F, 2vut:G, 2vut:H, 2vuu:A, 2vuu:B, 2vuu:C, 2vuu:D, 2vuu:E, 2vuu:F, 2vuu:G, 2vuu:H
18	5a0y:E	442	95	0.1271	0.0520	0.2421	9.4	5a0y:B, 5a8k:B, 5a8k:E, 7b2h:B, 7b2h:E, 5g0r:E, 5g0r:B, 1hbm:B, 1hbm:E, 1hbn:B, 1hbn:E, 1hbo:B, 1hbo:E, 1hbu:B, 1hbu:E, 3m1v:E, 3m1v:B, 3m2r:E, 3m2r:B, 3m2u:E, 3m2u:B, 3m2v:E, 3m2v:B, 3m30:E, 3m30:B, 3m32:B, 3m32:E, 1mro:E, 1mro:B, 3pot:E, 3pot:B, 7suc:b, 7suc:B, 7sxm:E, 7sxm:B

[Back]