Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SIPWNLERITPPQPPDGGSLVEVYLLDTSIQSDHREIEGRVMVTDFENVPEEDGTRFHRQASKCDSHGTHLAGVVSGRDA
GVAKGASMRSLRVLNCQGKGTVSGTLIGLEFIRKSQLVQPVGPLVVLLPLAGGYSRVLNAACQRLARAGVVLVTAAGNFR
DDACLYSPASAPEVITVGATNAQDQPVTLGTLGTNFGRCVDLFAPGEDIIGASSDCSTCFVSQSGTSQAAAHVAGIAAMM
LSAEPELTLAELRQRLIHFSAKDVINEAWFPEDQRVLTPNLVAALPP

The query sequence (length=287) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6u2f:A 582 270 0.9408 0.4639 1.0000 0.0 7kev:A, 7kfa:A, 4ne9:B, 4nmx:B, 5oca:A, 3p5b:A, 3p5c:A, 2qtw:B, 7s5g:B, 7s5h:B, 6u2p:B, 6u36:B, 6u38:B, 6u3i:A, 6u3x:B, 5vla:A, 5vlh:A, 5vlk:A, 5vll:A, 5vlp:A, 2w2m:A, 2w2n:A, 2w2q:A, 6xib:B, 6xic:B, 6xid:B, 6xie:B, 6xif:B, 2xtj:A
2 6u26:B 479 287 0.9547 0.5720 0.9547 0.0 7kev:B, 7kfa:B, 6u2n:B
3 8c4z:B 282 291 0.3659 0.3723 0.3608 2.48e-51
4 5wsl:A 282 275 0.3519 0.3582 0.3673 4.14e-49 5wsl:B, 5wsl:C
5 8c4x:A 276 270 0.3449 0.3587 0.3667 8.41e-48
6 2b6n:A 278 273 0.3136 0.3237 0.3297 5.01e-45
7 4dzt:A 276 264 0.3415 0.3551 0.3712 1.08e-41
8 1s2n:A 281 291 0.3554 0.3630 0.3505 1.21e-41 1s2n:B, 1sh7:A, 1sh7:B
9 7a9f:A 279 250 0.3240 0.3333 0.3720 6.25e-41 7a9k:A, 7a9m:A, 3aj8:A, 3aj9:A, 5avj:A, 5b1d:A, 5b1e:A, 4b5l:A, 1bjr:E, 7c0p:A, 1cnm:A, 5cw1:A, 3d9q:X, 3ddz:X, 3de0:X, 3de1:X, 3de2:X, 3de5:X, 3de6:X, 3de7:X, 2dp4:E, 2dqk:A, 2duj:A, 3dvq:X, 3dvr:X, 3dvs:X, 3dw1:X, 3dw3:X, 3dwe:X, 3dyb:A, 8e52:AAA, 8e53:AAA, 1egq:A, 8f05:A, 8f06:A, 8f07:A, 6fjs:A, 4fon:A, 8fyo:A, 8fyp:A, 8fyq:A, 8fyr:A, 8fys:A, 2g4v:A, 3gt3:A, 3gt4:A, 2hd4:A, 2hpz:A, 1ht3:A, 3i2y:X, 3i30:X, 3i34:X, 3i37:X, 1ic6:A, 2id8:A, 6j43:A, 7jsy:A, 6k2p:A, 6k2r:A, 6k2s:A, 6k2t:A, 6k2v:A, 6k2w:A, 5k7s:A, 6k8m:E, 6kkf:A, 5kxu:A, 5kxv:A, 3l1k:A, 7ln7:A, 7lpt:A, 7lpu:A, 7lpv:A, 7lq8:A, 7lq9:A, 7lqa:A, 7lqb:A, 7lqc:A, 7ltd:A, 7lti:A, 7ltv:A, 7lu0:A, 7lu1:A, 7lu2:A, 7lu3:A, 6mh6:A, 5mjl:A, 6n4u:A, 7nuz:A, 3osz:A, 1oyo:A, 1p7v:A, 1p7w:A, 1pek:E, 1pfg:A, 1pj8:A, 2pq2:A, 6pq0:A, 6pq4:A, 2prk:A, 3prk:E, 1ptk:A, 3ptl:A, 6pu4:A, 6pu5:A, 2pwa:A, 2pwb:A, 2pyz:A, 3q40:A, 3q5g:A, 6qf1:A, 3qmp:A, 6qxv:A, 5rof:A, 5rol:A, 5ron:A, 5rop:A, 5roq:A, 5ror:A, 5row:A, 5rp6:A, 5rp7:A, 5rp9:A, 5rpa:A, 5rpc:A, 5rpd:A, 5rpg:A, 5rph:A, 5rpj:A, 5rpk:A, 5rpm:A, 6rug:A, 6ruh:A, 6ruk:A, 6run:A, 6ruw:A, 6rve:A, 6rvg:A, 6rzp:A, 7s4z:A, 8sdk:A, 7skx:C, 8sog:A, 8sou:A, 8sov:A, 8spl:A, 8sqv:A, 6txg:A, 5uvl:A, 2v8b:A, 6v8r:A, 5whw:A, 5wjg:A, 5wjh:A, 5wrc:A, 4zar:A, 6zet:AAA, 6zeu:AAA, 6zev:AAA
10 3f7o:A 284 273 0.3171 0.3204 0.3333 1.50e-33 3f7o:B
11 5z6o:A 282 219 0.2683 0.2730 0.3516 1.90e-32
12 8gkp:C 282 274 0.2822 0.2872 0.2956 1.54e-28 8gkp:D, 8gkq:C, 8u45:C
13 1bh6:A 274 248 0.2648 0.2774 0.3065 4.15e-23
14 3whi:A 355 270 0.2753 0.2225 0.2926 1.31e-22 4dww:A, 5gl8:B, 1mee:A, 6o44:A, 6o44:B, 6pak:A, 6pak:B, 1scj:A, 3vyv:A, 3vyv:B, 3whi:B
15 3afg:B 507 249 0.2718 0.1538 0.3133 1.12e-19 3afg:A
16 3wiv:C 397 309 0.2857 0.2065 0.2654 2.40e-17 3a3n:A, 3a3n:B, 3a3o:A, 3a3o:B, 3a3p:A, 3a3p:B, 2e1p:A, 4jp8:A, 3vhq:A, 3vv2:A, 3vv2:B, 3wiu:A, 3wiu:B, 3wiu:C, 3wiv:A, 3wiv:B, 2z2x:A, 2z2y:A, 2z2y:B, 2z2y:C, 2z2y:D, 2z2z:A, 2z30:A, 2z30:B, 2z56:A, 2z56:B, 2z57:A, 2z57:B, 2z58:A, 2z58:B, 2zrq:A, 2zwo:A, 2zwo:B, 2zwo:C, 2zwp:A, 2zwp:B
17 1tec:E 279 253 0.2683 0.2760 0.3043 1.25e-16 2tec:E, 3tec:E, 1thm:A
18 5aqe:A 269 264 0.2753 0.2937 0.2992 8.66e-16 5arb:A, 5arc:A, 5ard:A, 3bx1:A, 3bx1:B, 1c9j:A, 1c9m:A, 1c9n:A, 4cfy:A, 4cfz:A, 4cg0:A, 1gci:A, 1iav:A, 1jea:A, 1mpt:A, 1ndq:A, 1ndu:A, 1q5p:A, 1st3:A, 1svn:A, 1tk2:A, 1wsd:A, 6y5s:A, 6y5t:A
19 1dbi:A 271 247 0.2439 0.2583 0.2834 1.65e-15
20 3lpa:A 340 219 0.2404 0.2029 0.3151 7.79e-15 3lpc:A, 3lpd:A
21 7y6m:C 290 257 0.2439 0.2414 0.2724 1.94e-14 7y6m:D
22 6uai:S 266 251 0.2544 0.2744 0.2908 3.17e-14 6uao:S, 6ube:S
23 7w2a:A 354 215 0.2369 0.1921 0.3163 5.56e-14 7w2a:B
24 3ti9:A 341 291 0.2753 0.2317 0.2715 2.87e-13 3ti7:A
25 1r6v:A 671 300 0.2822 0.1207 0.2700 4.45e-13
26 1af4:A 274 248 0.2474 0.2591 0.2863 6.54e-12 1be6:A, 1be8:A, 1bfk:A, 1bfu:A, 1c3l:A, 4c3u:A, 4c3v:A, 1cse:E, 6dwq:A, 4hx2:A, 4hx2:C, 1oyv:A, 1oyv:B, 1r0r:E, 1sbc:A, 1sca:A, 1scb:A, 1scd:A, 1scn:E, 1sel:A, 1sel:B, 2sec:E, 3unx:A, 2wuv:A, 2wuw:E, 1yu6:A, 1yu6:B
27 5ffn:A 311 282 0.2648 0.2444 0.2695 7.19e-11
28 2xrm:A 301 233 0.2334 0.2226 0.2876 2.11e-10
29 8h7o:A 281 276 0.2857 0.2918 0.2971 3.45e-10 1a2q:A, 1ak9:A, 7am6:C, 7am7:C, 7am8:A, 1aqn:A, 1au9:A, 3bgo:S, 3cnq:S, 1dui:A, 8h7p:A, 1lw6:E, 5ox2:A, 1s01:A, 1s02:A, 1sbh:A, 1sbi:A, 1sbn:E, 1sib:E, 2sic:E, 3sic:E, 5sic:E, 2sni:E, 1st2:A, 2st1:A, 1sua:A, 1sub:A, 1sud:A, 1sue:A, 1sup:A, 1tm1:E, 1tm3:E, 1tm4:E, 1tm5:E, 1tm7:E, 1tmg:E, 1to1:E, 1to2:E, 1ubn:A, 1v5i:A, 1y1k:E, 1y33:E, 1y34:E, 1y3b:E, 1y3c:E, 1y3d:E, 1y3f:E, 1y48:E, 1y4a:E, 1y4d:E, 1yja:A, 1yjb:A, 1yjc:A
30 3d43:B 310 281 0.2334 0.2161 0.2384 5.51e-10 3d43:A, 1ea7:A, 2ixt:A, 2ixt:B
31 3vv3:A 329 254 0.2160 0.1884 0.2441 8.61e-09 3vv3:B
32 4m1z:A 317 307 0.2962 0.2681 0.2769 3.72e-08 4m1z:B
33 5yl7:A 339 224 0.2125 0.1799 0.2723 3.88e-08
34 8pol:B 479 266 0.2125 0.1273 0.2293 4.75e-07 4lvn:A, 4lvo:A, 8pol:A
35 4akt:A 330 109 0.1220 0.1061 0.3211 3.13e-06
36 4tr2:B 474 283 0.2230 0.1350 0.2261 3.82e-06 8coy:A, 8coy:B, 8coz:A, 8coz:B, 8cp0:A, 8qke:A, 8qke:B, 8qkg:A, 8qkg:B, 8qkj:A, 8qkj:B, 4tr2:A
37 4hvl:A 369 306 0.2857 0.2222 0.2680 7.47e-06
38 1v6c:B 436 194 0.1742 0.1147 0.2577 1.70e-05 1v6c:A, 1wvm:A, 1wvm:B, 1y9z:A, 1y9z:B
39 1v6c:B 436 33 0.0453 0.0298 0.3939 0.59 1v6c:A, 1wvm:A, 1wvm:B, 1y9z:A, 1y9z:B
40 8uw8:A 738 263 0.2334 0.0908 0.2548 5.97e-04
41 6vjb:A 1346 159 0.1498 0.0319 0.2704 0.001
42 6vjb:A 1346 86 0.0801 0.0171 0.2674 1.8
43 8ehe:A 353 300 0.2334 0.1898 0.2233 0.002
44 7edd:A 1394 160 0.1463 0.0301 0.2625 0.002 5xyr:A
45 7edd:A 1394 86 0.0836 0.0172 0.2791 0.79 5xyr:A
46 2gko:A 309 282 0.2265 0.2104 0.2305 0.003
47 5xya:A 1358 167 0.1498 0.0317 0.2575 0.003 5xxz:A
48 5xya:A 1358 86 0.0836 0.0177 0.2791 0.74 5xxz:A
49 1r64:A 481 209 0.1812 0.1081 0.2488 0.006 2id4:A, 2id4:B, 1ot5:A, 1ot5:B, 1r64:B
50 8e7f:A 614 150 0.1359 0.0635 0.2600 0.020
51 3t41:A 423 334 0.2578 0.1749 0.2216 0.056 3t41:B
52 7bj3:A 936 85 0.0906 0.0278 0.3059 0.38 8bty:A, 3eif:A, 1xf1:A, 1xf1:B, 7yzx:A
53 5xxz:B 1310 151 0.1359 0.0298 0.2583 0.38
54 8b4x:A 473 268 0.2160 0.1311 0.2313 0.58 8b4v:A, 8b4w:A, 6eqv:A, 6eqw:A, 6eqx:A, 6hlb:A, 6hld:A, 6hle:A, 6hza:A, 6hzb:A, 6hzc:A, 6hzd:A, 5jmo:A, 5jmo:B, 5jxg:A, 5jxh:A, 5jxi:A, 5jxj:A, 7lcu:A, 5mim:A, 7o1u:A, 7o1w:A, 7o1y:A, 7o20:A, 7o22:A, 4omc:A, 4omc:B, 4omc:C, 4omc:D, 4omc:E, 4omc:F, 4omd:A, 4omd:B, 4omd:C, 4omd:D, 4omd:E, 4omd:F, 8oyh:A, 1p8j:A, 1p8j:D, 1p8j:B, 1p8j:C, 1p8j:E, 1p8j:F, 1p8j:G, 1p8j:H, 7qxy:A, 7qxz:A, 7qy0:A, 7qy1:A, 7qy2:A, 4ryd:A, 4ryd:B, 4ryd:C, 4ryd:D, 4ryd:E, 4ryd:F, 6yd2:A, 6yd3:A, 6yd4:A, 6yd7:A, 4z2a:A
55 6k8w:A 545 22 0.0314 0.0165 0.4091 2.1 6k8w:B
56 3opy:B 884 51 0.0557 0.0181 0.3137 2.9 3opy:D, 3opy:F, 3opy:H
57 4yn3:A 596 65 0.0627 0.0302 0.2769 3.0 3vta:A, 3vta:B
58 4ub9:A 467 69 0.0627 0.0385 0.2609 4.3 4ub9:B, 4ub9:C, 4ub9:D, 4ub9:E, 4ub9:F, 4ub9:G, 4wgx:A
59 5kvu:A 738 61 0.0627 0.0244 0.2951 6.6 5kvu:B, 5kvu:C, 5kvu:D
60 8i6y:A 844 80 0.0627 0.0213 0.2250 6.9 8i6y:B
61 3wqb:A 597 33 0.0418 0.0201 0.3636 7.9 3hjr:A
62 3i6t:B 364 50 0.0592 0.0467 0.3400 9.9 3i6t:A, 3i6t:C, 3i6t:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218