BioLiP

>protein
SILIDKNTKVICQGFTGSQGTFHSEQAIAYGTKMVGGVTPGKGGTTHLGLPVFNTVREAVAATGATASVIYVPAPFCKDS
ILEAIDAGIKLIITITEGIPTLDMLTVKVKLDEAGVRMIGPNCPGVITPGECKIGIQPGHIHKPGKVGIVSRSGTLTYEA
VKQTTDYGFGQSTCVGIGGDPIPGSNFIDILEMFEKDPQTEAIVMIGEIGGSAEEEAAAYIKEHVTKPVVGYIAGVTAPK
GKRMGHAGAIIAGGKGTADEKFAALEAAGVKTVRSLADIGEALKTV

The query sequence (length=286) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1scu:A	288	286	1.0000	0.9931	1.0000	0.0	1cqi:A, 1cqi:D, 1cqj:A, 1cqj:D, 1jkj:A, 1jkj:D, 1jll:A, 1jll:D, 2nu6:A, 2nu6:D, 2nu7:A, 2nu7:D, 2nu8:A, 2nu8:D, 2nu9:A, 2nu9:D, 2nu9:F, 2nu9:H, 2nua:A, 2nua:D, 1scu:D, 2scu:A, 2scu:D
2	6mgg:C	295	286	0.7622	0.7390	0.7622	7.62e-159	6mgg:A, 6pfn:A, 6pfn:C
3	6xru:A	309	284	0.6713	0.6214	0.6761	7.21e-110	5cae:A, 1euc:A, 2fpg:A, 7msr:A, 7mss:A, 7mst:A, 6wcv:A, 4xx0:A
4	6hxq:A	342	280	0.3531	0.2953	0.3607	3.75e-41	6hxq:C
5	8g1e:A	1037	262	0.3287	0.0906	0.3588	7.71e-28	8g1e:B, 8g1e:D, 8g1e:C, 8g1f:A, 8g1f:C, 8g1f:B, 8g1f:D, 8g5c:A, 8g5c:B, 8g5c:C, 8g5c:D, 8g5d:A, 8g5d:B, 8g5d:C, 8g5d:D, 6hxh:A, 6hxh:B, 6hxh:C, 6hxh:D, 6hxh:E, 6hxh:F, 6hxh:G, 6hxh:H, 6hxk:A, 6hxk:B, 6hxk:C, 6hxk:D, 6hxl:A, 6hxl:B, 6hxl:C, 6hxl:D, 6hxl:E, 6hxl:F, 6hxl:G, 6hxl:H, 6hxm:A, 6hxm:B, 7liw:B, 7liw:D, 7lj9:A, 7lj9:B, 7lj9:C, 7lj9:D, 7lla:A, 7lla:C, 7lla:B, 7lla:D, 3mwe:A, 6o0h:A, 6o0h:B, 6o0h:C, 6o0h:D, 3pff:A, 6poe:B, 6poe:D, 6poe:A, 6poe:C, 6qfb:A, 6qfb:B, 6qfb:D, 7rig:A, 7rig:C, 7rig:B, 7rig:D, 7rkz:A, 7rkz:C, 7rkz:B, 7rkz:D, 7rmp:A, 7rmp:C, 7rmp:B, 7rmp:D, 5tde:A, 5tde:B, 5tdf:A, 5tdm:A, 5tdm:B, 5tdz:A, 5te1:A, 5te1:B, 5teq:A, 5teq:B, 5tes:A, 5tet:A, 6ui9:A, 6ui9:C, 6ui9:B, 6ui9:D, 6uia:C, 6uia:A, 6uia:D, 6uia:B, 6uuw:A, 6uuw:C, 6uuw:B, 6uuw:D, 6uuz:A, 6uuz:C, 6uuz:B, 6uuz:D, 6uv5:A, 6uv5:C, 6uv5:B, 6uv5:D, 6z2h:A, 6z2h:C, 6z2h:D
6	6hxi:B	616	312	0.3252	0.1510	0.2981	4.01e-26	6hxi:D, 6znw:B
7	6hxj:D	591	156	0.1993	0.0964	0.3654	1.66e-25	6hxj:B, 6hxj:F, 6hxj:H, 6hxn:A, 6hxn:B, 6hxo:A, 6hxo:B, 6hxo:F, 6hxo:G, 6hxo:H, 6nzy:A, 6nzy:D, 6qcl:B, 6qcl:E, 6qcl:F, 6qcl:G, 6qcl:H
8	6qfb:C	1011	259	0.3112	0.0880	0.3436	7.17e-24
9	7cm9:A	693	102	0.0909	0.0375	0.2549	0.014	7cm9:B, 7cm9:C, 7cm9:D
10	4i4i:A	319	96	0.1014	0.0909	0.3021	0.20	4i4i:B, 4i4i:C, 4i4i:D, 4i7e:A, 4i7e:B, 4i7e:C, 4i7e:D, 1mto:A, 1mto:B, 1mto:C, 1mto:D, 1mto:E, 1mto:F, 1mto:G, 1mto:H, 3pfk:A, 4pfk:A, 6pfk:A, 6pfk:B, 6pfk:C, 6pfk:D
11	4gyj:A	618	76	0.0909	0.0421	0.3421	0.36	3bmx:A, 3bmx:B, 4gyj:B, 4gyk:A, 3nvd:A, 3nvd:B
12	5hbr:A	464	229	0.2063	0.1272	0.2576	0.44	5hbr:C, 4xyl:A, 4xyl:C, 4xym:A, 4xym:C, 4xz3:A, 4xz3:C, 4y8v:A, 4y8v:C, 4yak:A, 4yak:C
13	7kdn:A	622	94	0.1119	0.0514	0.3404	2.9	7kdn:B, 7kdn:C, 7kdn:D, 7kdn:E, 7kdn:F
14	6xyr:A	348	60	0.0839	0.0690	0.4000	3.1
15	3fwx:A	165	68	0.0629	0.1091	0.2647	3.9	3fwx:B
16	6mvu:A	752	34	0.0524	0.0199	0.4412	4.1	6mvs:A, 6mvt:A, 6mvu:B
17	8jhz:A	2615	56	0.0629	0.0069	0.3214	5.0
18	3big:A	321	56	0.0664	0.0592	0.3393	5.6	3d1r:A, 2r8t:A
19	7pr1:A	587	110	0.1014	0.0494	0.2636	6.7	7pr1:B, 7pru:A, 7pru:B
20	1yio:A	198	35	0.0385	0.0556	0.3143	7.0	1zn2:A
21	8x2h:A	2363	53	0.0629	0.0076	0.3396	7.7	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
22	8wb4:3	178	41	0.0420	0.0674	0.2927	9.6	8wb4:9, 8xkl:9, 8xr6:0, 8xr6:4

[Back]