BioLiP

>protein
SIKELAVDEELAAADGLIPRQKSKLCKHGDRGMCEYCSPLPPWDKEYHEKNKIKHISFHSYLKKLNENANKKENGSSYIS
PLSEPDFRINKRCHNGHEPWPRGICSKCQPSAITLQQQEFRMVDHVEFQKSEIINEFIQAWRYTGMQRFGYMYGSYSKYD
NTPLGIKAVVEAIYEPPQHDEQDGLTMDVEQVKNEMLQIDRQAQEMGLSRIGLIFTDLSDAGAGDGSVFCKRHKDSFFLS
SLEVIMAARHQTRHPNVSKYSEQGFFSSKFVTCVISGNLEGEIDISSYQVSTEAEALVTADMISGSTFPSMAYINDTTDE
RYVPEIFYMKSNEYGITVKENAKPAFPVDYLLVTLTHGFPNTTNSKFVSSTGFPWSNRQAMGQSQDYQELKKYLFNVASS
GDFNLLHEKISNFHLLLYINSLQILSPDEWKLLIESAVKNEWEESLLKLVSSAGWQTLVMILQESG

The query sequence (length=466) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8dau:G	475	468	0.9914	0.9726	0.9872	0.0	8dar:G, 8das:G, 8dat:G, 8dav:G, 8daw:G, 6jwh:A, 6jwi:A, 6jwi:E, 6jwj:A, 6oa9:G
2	6chs:A	460	465	0.5021	0.5087	0.5032	1.35e-171	6cdd:A, 6cdd:B
3	7wwp:A	420	470	0.3412	0.3786	0.3383	2.99e-86	7wwq:A
4	7sa3:A	303	89	0.0644	0.0990	0.3371	0.39
5	2pom:A	355	75	0.0494	0.0648	0.3067	1.1
6	6kpm:A	295	38	0.0300	0.0475	0.3684	1.2	6kpn:A, 6kpo:A
7	2atx:A	186	49	0.0343	0.0860	0.3265	1.6	2atx:B
8	8jng:A	147	29	0.0258	0.0816	0.4138	2.0
9	6en3:A	934	79	0.0472	0.0236	0.2785	2.5	8a49:C, 4nuy:A, 4nuz:A
10	6e93:A	112	74	0.0408	0.1696	0.2568	3.2	6e94:A
11	6yoz:AAA	400	97	0.0536	0.0625	0.2577	4.2	1ojj:A, 1ojj:B, 1ojk:A, 1ojk:B, 6yoz:BBB
12	4v3p:ST	82	44	0.0258	0.1463	0.2727	5.3
13	2g49:A	970	84	0.0494	0.0237	0.2738	6.3	6b3q:A, 6b3q:B, 6b70:A, 6b70:B, 6bfc:A, 6bfc:B, 6byz:A, 6byz:B, 5cjo:A, 3cww:B, 3cww:A, 4dtt:A, 4dtt:B, 4dwk:A, 4dwk:B, 3e4a:A, 3e4a:B, 3e4z:A, 3e4z:B, 3e50:A, 3e50:B, 6eds:A, 6eds:B, 2g47:A, 2g47:B, 2g48:A, 2g48:B, 2g49:B, 2g54:A, 2g54:B, 2g56:A, 2g56:B, 4gs8:A, 4gs8:B, 4gsc:A, 4gsc:B, 4gsf:A, 4gsf:B, 3h44:A, 3h44:B, 3hgz:A, 3hgz:B, 4ifh:A, 4ifh:B, 2jbu:A, 2jbu:B, 2jg4:A, 2jg4:B, 7k1d:A, 7k1d:B, 7k1e:A, 7k1e:B, 7k1f:A, 7k1f:B, 4lte:A, 4lte:B, 4m1c:A, 4m1c:B, 6mq3:A, 6mq3:B, 3n56:A, 3n56:B, 3n57:A, 3n57:B, 4nxo:A, 4nxo:B, 3ofi:A, 3ofi:B, 3p7l:A, 3p7o:A, 4pes:A, 4pes:B, 4pf7:A, 4pf7:B, 4pf9:A, 4pf9:B, 4pfc:A, 4pfc:B, 4qia:A, 4qia:B, 3qz2:A, 3qz2:B, 4ral:A, 4ral:B, 4re9:A, 4re9:B, 7rze:A, 7rzf:A, 7rzi:A, 7rzi:B, 3tuv:A, 2wby:A, 2wby:B, 2wc0:A, 2wc0:B, 2wk3:A, 2wk3:B, 5wob:A, 5wob:B, 5wob:C, 5wob:D, 5wob:E, 5wob:F, 5wob:G, 5wob:H, 2ypu:A, 2ypu:B

[Back]