BioLiP

>protein
SIFPKISLRPEVENYLKEGFMNKEIVTALGKQEAERKFETLLKHLSHPPSFTTVRVNTHLASVQHVKNLLLDELQKQFNG
LSVPILQHPDLQDVLLIPVIGPRKNIKKQQCEAIVGAQCGNAVLRGAHVYAPGIVSASQFMKAGDVISVYSDIKGKCKKG
AKEFDGTKVFLGNGISELSRKEIFSGLPELKGMGIRMTEPVYLSPSFDSVLPRYLFLQNLPSALVSHVLNPQPGEKILDL
CAAPGGKTTHIAALMHDQGEVIALDKIFNKVEKIKQNALLLGLNSIRAFCFDGTKAVKGEPPFLPESFDRILLDAPCSGM
GQRPNMACTWSVKEVASYQPLQRKLFTAAVQLLKPEGVLVYSTCTITLAENEEQVAWALTKFPCLQLQPQEPQIGGEGMR
GAGLSCEQLKQLQRFDPSAVPLPDTDMDSLREARREDMLRLANKDSIGFFIAKFVKC

The query sequence (length=457) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5wwr:A	461	461	1.0000	0.9913	0.9913	0.0	5wwr:B, 5wws:A, 5wws:B, 5wwt:A, 5wwt:B
2	5zve:B	384	394	0.2735	0.3255	0.3173	1.78e-50	5zve:A, 5zvg:B, 5zvg:A, 5zvh:B, 5zvh:A
3	2yxl:A	443	182	0.1488	0.1535	0.3736	8.23e-31
4	8fkt:SY	378	264	0.1926	0.2328	0.3333	2.56e-27	8fku:SY, 8fkv:SY, 8fkw:SY, 8fkx:SY, 8fky:SY
5	8esq:q	341	264	0.1882	0.2522	0.3258	2.73e-27
6	3a4t:A	258	178	0.1422	0.2519	0.3652	5.36e-26	3a4t:B
7	8v87:q	371	264	0.1860	0.2291	0.3220	3.21e-25	6elz:q, 6em5:q, 7nac:q, 7ohr:q, 7r7a:q, 7r7c:q, 8v83:q, 8v84:q
8	8esr:q	260	261	0.1794	0.3154	0.3142	1.18e-23
9	3m6w:A	460	181	0.1532	0.1522	0.3867	1.60e-22	3m6v:A, 3m6v:B
10	8i9w:CP	356	268	0.1991	0.2556	0.3396	7.08e-22	8i9r:CP, 8i9t:CP, 8i9v:CP, 8i9x:CP, 8i9y:CP, 8i9z:CP, 8ia0:CP
11	1sqf:A	425	182	0.1335	0.1435	0.3352	2.50e-19
12	2b9e:A	275	188	0.1313	0.2182	0.3191	4.44e-15
13	7of5:C	338	180	0.1247	0.1686	0.3167	2.05e-12	7of0:C, 7of3:C, 7of7:C
14	7pd3:x	366	180	0.1247	0.1557	0.3167	2.92e-12	4fp9:A, 4fp9:C, 4fp9:D, 4fp9:F, 4fzv:A, 7o9k:A1, 7o9m:A1, 7odr:x, 7ods:x, 7odt:x, 7oic:x, 8pk0:x, 8qsj:x
15	7r6k:q	177	170	0.1116	0.2881	0.3000	9.12e-10
16	2cww:B	382	140	0.0875	0.1047	0.2857	3.49e-07	2cww:A
17	2bh2:A	418	91	0.0591	0.0646	0.2967	0.005	2bh2:B, 1uwv:A
18	7pnx:b	326	103	0.0656	0.0920	0.2913	0.009	8ipk:A, 8ipl:A, 8ipm:D, 7pny:b, 7pnz:b, 8qrl:8
19	4dmg:A	385	138	0.0853	0.1013	0.2826	0.057	4dmg:B
20	1eiz:A	180	34	0.0284	0.0722	0.3824	0.14	1ej0:A
21	2b3t:A	276	141	0.0788	0.1304	0.2553	0.15	1t43:A
22	6rjb:B	622	99	0.0569	0.0418	0.2626	0.34	6ha3:A, 6had:A, 4kxu:A, 4kxv:A, 4kxw:A, 4kxx:A, 4kxy:A, 4kxy:B, 3mos:A, 3ooy:A, 3ooy:B, 6rjb:A, 8wa8:A, 8wa9:A, 8wa9:B, 8waa:A, 8waa:B
23	1jg1:A	215	93	0.0525	0.1116	0.2581	0.44	1jg2:A, 1jg3:A, 1jg3:B, 1jg4:A
24	7pnv:b	323	103	0.0656	0.0929	0.2913	0.53
25	4o29:A	207	82	0.0416	0.0918	0.2317	1.7
26	5oql:S	237	34	0.0284	0.0549	0.3824	4.1	6rxt:CB, 6rxu:CB, 6rxv:CB, 6rxx:CB, 6rxy:CB, 6rxz:CB
27	1dl5:A	317	108	0.0547	0.0789	0.2315	4.6	1dl5:B
28	3c46:A	1095	172	0.1028	0.0429	0.2733	6.8	3c2p:A, 3c2p:B, 3c3l:A, 3c3l:B, 3c46:B, 4ff1:A, 4ff1:B, 4ff2:A, 4ff2:B, 4ff3:A, 4ff3:B, 4ff4:A, 4ff4:B, 3q0a:A, 3q0a:B, 3q22:A, 3q22:B, 3q23:A, 3q23:B, 3q24:A, 3q24:B
29	7uu5:A	379	48	0.0372	0.0449	0.3542	6.9	8e40:A, 8edj:A, 5k81:A, 5k81:B, 5k81:C, 5k81:D, 5k81:E, 5k81:F, 5k82:A, 5k82:B, 5k82:C, 5k82:D, 5k83:C, 5k83:E, 5k83:A, 5k83:D, 5k83:F, 5k83:B, 6p3x:A, 6p3x:B, 6p3y:A, 6p3y:B, 6p3z:A, 6p3z:B, 6p40:A, 6p40:B, 7uu3:A, 7uu3:B, 7uu4:A, 7uu5:B
30	4bju:A	548	112	0.0591	0.0493	0.2411	8.7	4bju:B, 5o9x:A, 5oaw:A, 5oaw:B
31	2j28:9	430	58	0.0372	0.0395	0.2931	9.3	5aka:5
32	6b3t:A	396	89	0.0503	0.0581	0.2584	9.6	6b0u:A, 6b0u:B, 6b0u:C, 8d1r:A, 8d23:A, 8d25:A, 5ebv:A, 5ec4:A, 8f4a:A, 8f4t:A, 8f4u:A, 8f4w:A, 8f4z:A, 8f51:A, 8f55:A, 8f57:A, 8f58:A, 5iv0:A, 4jd6:A, 4jd6:B, 4jd6:C, 4jd6:D, 4jd6:E, 4jd6:F, 6p3t:A, 6p3u:A, 6p3v:A, 3r1k:A, 3ryo:A, 3ryo:B, 3ryo:C, 3ryo:D, 3ryo:E, 3ryo:F, 3ryo:G, 3ryo:H, 3ryo:I, 3ryo:J, 3ryo:K, 3ryo:L, 5tvj:A, 6vur:A, 6vus:A, 6vut:A, 6vuu:A, 6vuw:A, 6vux:A, 6vuy:A, 6vuz:A, 6vv0:A, 6vv1:A, 6vv2:A, 6vv3:A, 6x10:A, 6x6g:AAA, 6x6i:AAA, 6x6y:AAA, 6x7a:AAA

[Back]