BioLiP

>protein
SHSWRHIRAEGLDSSYTVLFGKAEADEIFQELEKEVEYFTGALARVQVFGKWHSVPRKQATYGDAGLTYTFSGLTLSPKP
WIPVLERIRDHVSGVTGQTFNFVLINRYKDGSDHICEHRDDERELAPGSPIASVSFGASRDFVFRHKAVVRLPLAHGSLL
MMNHPTNTHWYHSLPVRKKVLAPRVNLTFRKILL

The query sequence (length=194) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3h8o:A	206	205	0.9897	0.9320	0.9366	3.91e-139	3btx:A, 3bty:A, 3btz:A, 3bu0:A, 3buc:A, 3h8r:A, 3h8x:A, 4mg2:A, 4mgt:A, 3rzg:A, 3rzh:A, 3rzj:A, 3rzk:A, 3rzl:A, 3rzl:D, 3rzm:A, 3s57:A, 3s5a:A
2	8jnr:A	211	182	0.3557	0.3270	0.3791	1.46e-32	2iuw:A, 8jnk:A, 8jnk:C, 8jnk:E, 8jnk:G, 8jnr:E, 8jnr:D
3	8jnr:C	184	144	0.3144	0.3315	0.4236	1.34e-27
4	5ylb:A	187	84	0.1340	0.1390	0.3095	0.001	5yl6:A
5	3tht:B	312	79	0.1289	0.0801	0.3165	0.55	3thp:A, 3tht:A, 3tht:C, 3tht:D
6	4ie6:A	447	93	0.1340	0.0582	0.2796	0.75	6aej:A, 6ak4:A, 6akw:A, 7ckk:A, 4cxw:A, 4cxx:A, 4cxy:A, 5dab:A, 7e8z:A, 5f8p:A, 4ie0:A, 4ie4:A, 4ie5:A, 4ie7:A, 8it9:A, 3lfm:A, 4qho:A, 4qkn:A, 7wcv:A, 4zs2:A, 4zs3:A
7	5zmd:G	403	93	0.1340	0.0645	0.2796	0.78	5zmd:A, 5zmd:C, 5zmd:E
8	7xya:F	302	41	0.0773	0.0497	0.3659	1.1
9	5zve:B	384	83	0.1237	0.0625	0.2892	1.7	5zve:A, 5zvg:B, 5zvg:A, 5zvh:B, 5zvh:A
10	7pmv:B	1141	72	0.1237	0.0210	0.3333	2.2	7kwo:V, 6n29:A, 6n29:B, 7pmv:A, 7pmv:D, 7pmv:E, 7pnf:B, 7pnf:D, 7wn3:F, 7wn3:H, 7wn3:C, 7wn3:D, 7wn4:F, 7wn4:H, 7wn6:F, 7wn6:H, 7wn6:C, 7wn6:D, 7wpp:F, 7wpp:H, 7wpq:C, 7wpq:D, 7wpq:F, 7wpq:H, 7wpr:a, 7wpr:b, 7wpr:C, 7wpr:c, 7wpr:D, 7wpr:d, 7wpr:e, 7wpr:f, 7wpr:S, 7wpr:T, 7wpr:U, 7wpr:V, 7wpr:W, 7wpr:X, 7wpr:Y, 7wpr:Z, 7wps:Z, 7wps:b, 7wps:C, 7wps:D, 7wps:F, 7wps:H, 7wps:J, 7wps:L, 7wps:N, 7wps:P, 7wps:R, 7wps:T, 7wps:V, 7wps:X, 7wqt:a, 7wqt:b, 7wqt:C, 7wqt:c, 7wqt:D, 7wqt:d, 7wqt:e, 7wqt:f, 7wqt:S, 7wqt:T, 7wqt:U, 7wqt:V, 7wqt:W, 7wqt:X, 7wqt:Y, 7wqt:Z, 7zwh:D, 7zwh:E
11	8d3d:A	1314	72	0.1237	0.0183	0.3333	2.3	8d3c:A, 8d3c:B, 8d3c:C, 8d3c:D, 8d3c:E, 8d3c:F, 8d3c:G, 8d3c:H, 8d3c:I, 8d3c:J, 8d3c:K, 8d3c:L, 8d3c:M, 8d3c:N, 8d3c:O, 8d3c:P, 8d3d:B, 8d3d:C, 8d3d:D, 8d3d:E, 8d3d:F, 8d3d:G, 8d3d:H, 8d3d:I, 8d3d:J, 8d3d:K, 8d3d:L, 8d3d:M, 8d3d:N, 8d3d:O, 8d3d:P, 7f49:A, 3hxo:A, 3hxq:A, 7wn3:A, 7wn3:B, 7wn3:E, 7wn3:G, 7wn4:E, 7wn4:G, 7wn6:A, 7wn6:B, 7wn6:E, 7wn6:G, 7wpp:E, 7wpp:G, 7wpq:A, 7wpq:B, 7wpq:E, 7wpq:G, 7wpr:A, 7wpr:B, 7wpr:E, 7wpr:F, 7wpr:G, 7wpr:H, 7wpr:I, 7wpr:J, 7wpr:K, 7wpr:L, 7wpr:M, 7wpr:N, 7wpr:O, 7wpr:P, 7wpr:Q, 7wpr:R, 7wps:A, 7wps:B, 7wps:E, 7wps:G, 7wps:I, 7wps:K, 7wps:M, 7wps:O, 7wps:Q, 7wps:S, 7wps:U, 7wps:W, 7wps:Y, 7wps:a, 7wqt:A, 7wqt:B, 7wqt:E, 7wqt:F, 7wqt:G, 7wqt:H, 7wqt:I, 7wqt:J, 7wqt:K, 7wqt:L, 7wqt:M, 7wqt:N, 7wqt:O, 7wqt:P, 7wqt:Q, 7wqt:R
12	2c7j:A	162	33	0.0825	0.0988	0.4848	9.5	2c7k:A, 2c7l:A, 2j96:A, 2j96:B
13	6bt2:B	271	35	0.0773	0.0554	0.4286	9.7
14	6nf0:A	298	35	0.0773	0.0503	0.4286	9.8	6bt2:A

[Back]