Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SHMDALRYHIEWNRVAEPGTARPAGRLLAVISPDHAGAPWVTAVLDALGPDTVRFEAKGTDRAAWAAQLAQLREDEGEFH
AVVSLLAAAEALHTDHGSVPLGLAQTLLLAQALGDAGLTAPLWCLTRGGVAAGRGDVLSSPVQGALWGLGRVIGLEHPDR
WGGLIDLPETVDTRAAARLTGLLADAGGEDQLAIRGSGVLARRLAHAAPAVPGSGKRPPVHGSVLVTGGTGGIGGRVARR
LAEQGAAHLVLTSRRGADAPGAAELRAELEQLGVRVTIAACDAADREALAALLAELPEDAPLTAVFHSAGVAHDDAPVAD
LTLGQLDALMRAKLTAARHLHELTADLDLDAFVLFSSGAAVWGSGGQPGYAAANAYLDALAEHRRSLGLTASSVAWGTWG
EVGMATDPEVHDRLVRQGVLAMEPEHALGALDQMLENDDTAAAITLMDWEMFAPAFTANRPSALLSTVPEAVSAL

The query sequence (length=475) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5xwv:A 477 475 1.0000 0.9958 1.0000 0.0 4dif:A, 4dif:B, 3mje:A, 3mje:B, 3mjs:A, 3mjs:B, 3mjt:A, 3mjt:B, 3mjv:A, 3mjv:B, 5xwv:B, 5xww:A, 5xww:B
2 7s6c:C 480 483 0.4737 0.4688 0.4658 3.83e-100 7s6d:C
3 4l4x:A 503 479 0.4379 0.4135 0.4342 9.74e-97
4 4imp:A 520 478 0.4674 0.4269 0.4644 9.32e-93 4imp:B, 4imp:C, 4imp:D
5 7m7f:A 1390 472 0.4442 0.1518 0.4470 1.59e-87 2fr0:A, 2fr1:A, 7m7i:A
6 4hxy:B 430 358 0.3495 0.3860 0.4637 6.83e-55 4hxy:A
7 3slk:A 747 221 0.2442 0.1553 0.5249 6.82e-51 3slk:B
8 3slk:A 747 84 0.0800 0.0509 0.4524 2.60e-06 3slk:B
9 8g7w:B 1059 198 0.2105 0.0944 0.5051 9.54e-41 8g7w:A
10 8g7w:B 1059 114 0.0842 0.0378 0.3509 0.93 8g7w:A
11 4j1q:A 417 226 0.1537 0.1751 0.3230 5.02e-25
12 7cpx:A 2262 220 0.1621 0.0340 0.3500 1.51e-21 7cpx:B, 7cpy:A, 7cpy:B
13 5ktk:A 452 338 0.2084 0.2190 0.2929 3.30e-19
14 5bp4:A 1102 192 0.1474 0.0635 0.3646 9.10e-18 5bp2:A, 5bp4:B, 5bp4:C, 5bp4:D, 5bp4:E, 5bp4:F, 5bp4:G, 5bp4:H, 5bp4:J, 5bp4:K, 5bp4:M, 5bp4:N, 5bp4:P
15 5bp4:L 897 192 0.1474 0.0780 0.3646 1.19e-17 5bp4:I
16 8eyk:F 1070 221 0.1389 0.0617 0.2986 3.98e-16
17 5c37:A 632 221 0.1389 0.1044 0.2986 4.10e-16 5c37:C, 6nna:A, 6nna:B, 4piv:A, 4piv:B
18 8eyi:F 1211 221 0.1389 0.0545 0.2986 4.12e-16 4w9n:A, 4w9n:B, 4w9n:C, 4w9n:D
19 2vz9:B 2086 221 0.1495 0.0340 0.3213 4.39e-16 2vz9:A
20 5d2e:A 485 182 0.1221 0.1196 0.3187 5.09e-16
21 8eyk:E 966 221 0.1432 0.0704 0.3077 1.93e-15 8eyi:E, 8gkc:A, 8gkc:D
22 6ulw:A 1193 222 0.1221 0.0486 0.2613 1.07e-11 6ulw:D, 6ulx:A, 6uly:A, 6uly:B
23 1uzn:A 239 223 0.1432 0.2845 0.3049 1.44e-11
24 5ovk:A 242 233 0.1474 0.2893 0.3004 8.07e-11 5ovk:B, 5ovk:C, 5ovk:D, 5ovl:A, 5ovl:B, 5ovl:C, 5ovl:D
25 7e24:D 251 168 0.1011 0.1912 0.2857 8.53e-07 7e24:A, 7e24:B, 7e24:C, 7e3x:A, 7e3x:B
26 8i4y:A 1687 345 0.2063 0.0581 0.2841 3.58e-06 8i4y:B, 8i4z:A
27 8jfg:A 248 164 0.0884 0.1694 0.2561 1.18e-05 4iin:A, 4iin:B, 4iin:C, 4iin:D, 8jfa:A, 8jfa:B, 8jfa:C, 8jfa:D, 8jfa:E, 8jfa:F, 8jfg:B, 8jfg:C, 8jfg:D, 8jfg:E, 8jfg:F, 8jfh:A, 8jfh:B, 8jfh:D, 8jfi:D, 8jfi:E, 8jfi:C, 8jfi:A, 8jfi:B, 8jfi:F
28 6k8t:A 662 123 0.0863 0.0619 0.3333 1.78e-05 6k8t:B, 6k8u:A, 6k8u:B
29 4k6f:B 245 187 0.1074 0.2082 0.2727 1.88e-05 4k6f:C, 4k6f:D
30 4nbu:B 244 156 0.0821 0.1598 0.2500 4.90e-05 4nbu:A, 4nbu:C, 4nbu:D
31 1iy8:A 258 221 0.1179 0.2171 0.2534 5.54e-05 1iy8:B, 1iy8:C, 1iy8:D, 1iy8:E, 1iy8:F, 1iy8:G, 1iy8:H
32 3o4r:A 254 85 0.0737 0.1378 0.4118 7.03e-05 3o4r:B, 3o4r:C, 3o4r:D
33 1zem:A 260 150 0.0905 0.1654 0.2867 7.75e-05 1zem:B, 1zem:C, 1zem:D, 1zem:E, 1zem:F, 1zem:G, 1zem:H
34 3vzs:B 249 213 0.1158 0.2209 0.2582 8.64e-05 4n5m:A, 4n5m:B, 4n5n:A, 4n5n:B, 3vzs:A, 3vzs:C, 3vzs:D
35 5ff9:B 257 134 0.0905 0.1673 0.3209 1.02e-04 5feu:A, 5ff9:A, 5ff9:C, 5ff9:D, 5fff:A, 5fff:B
36 3asv:A 248 168 0.0884 0.1694 0.2500 1.52e-04 3asv:B, 3asv:C, 3asv:D, 3asv:E, 3asv:F
37 3pk0:B 262 157 0.1053 0.1908 0.3185 1.54e-04 3pk0:A, 3pk0:C, 3pk0:D
38 8wov:B 341 141 0.0863 0.1202 0.2908 1.66e-04 8wop:A, 8wop:B, 8wov:A, 8wow:A, 8wow:B
39 1vl8:B 252 117 0.0716 0.1349 0.2906 1.88e-04 1vl8:A
40 4b79:A 236 168 0.1011 0.2034 0.2857 2.28e-04 4b79:B
41 5vt6:A 245 182 0.1116 0.2163 0.2912 4.04e-04 5vt6:B, 5vt6:C, 5vt6:D
42 2zat:A 251 83 0.0674 0.1275 0.3855 4.17e-04 2zat:B, 2zat:C, 2zat:D
43 6f9q:C 260 144 0.0905 0.1654 0.2986 4.65e-04 6f9q:A, 6f9q:B, 6f9q:D
44 9cly:B 242 207 0.1032 0.2025 0.2367 4.84e-04 9cly:A
45 4iiu:A 243 159 0.1032 0.2016 0.3082 5.53e-04 4iiu:B, 4iiu:C, 4iiu:D, 4iiv:A, 4iiv:B, 4iiv:C, 4iiv:D
46 7cax:D 238 226 0.1179 0.2353 0.2478 7.85e-04 7cax:B
47 5vml:A 245 223 0.1095 0.2122 0.2332 8.86e-04
48 1ae1:B 258 172 0.1053 0.1938 0.2907 0.001 1ae1:A
49 7quj:A 259 146 0.0884 0.1622 0.2877 0.001 7quj:B, 7quj:C, 7quj:D
50 6zzs:D 261 156 0.0758 0.1379 0.2308 0.002 6zzq:A, 6zzs:A, 6zzs:B, 6zzs:C, 6zzs:E, 6zzs:F
51 6pnl:A 336 144 0.0842 0.1190 0.2778 0.004 6pmh:A
52 7k66:A 1265 100 0.0716 0.0269 0.3400 0.006 1d7p:M, 3hnb:M, 7kbt:A, 6mf0:A, 6mf0:B, 4xzu:M
53 5mln:B 238 168 0.1074 0.2143 0.3036 0.007 5mln:A
54 6y4d:A 257 136 0.0821 0.1518 0.2868 0.007 6y4d:B
55 3oid:B 251 97 0.0611 0.1155 0.2990 0.008 3oid:A, 3oid:C, 3oid:D
56 6j7u:A 247 122 0.0779 0.1498 0.3033 0.009 6j7u:B, 6j7u:C, 6j7u:D
57 8cxa:A 251 69 0.0505 0.0956 0.3478 0.009 8cxa:B
58 1i3k:A 347 145 0.0926 0.1268 0.3034 0.010 1ek5:A, 1ek6:A, 1ek6:B, 1hzj:A, 1hzj:B, 1i3k:B, 1i3l:A, 1i3l:B, 1i3m:A, 1i3m:B, 1i3n:A, 1i3n:B
59 4bo4:C 255 186 0.1137 0.2118 0.2903 0.010 4ag3:A, 4ag3:B, 4ag3:C, 4bnt:B, 4bnt:C, 4bnt:D, 4bnu:A, 4bnu:B, 4bnu:C, 4bnu:D, 4bnv:A, 4bnv:B, 4bnv:C, 4bnv:D, 4bnx:A, 4bnx:B, 4bnx:C, 4bnx:D, 4bny:A, 4bny:B, 4bny:C, 4bny:D, 4bnz:A, 4bnz:B, 4bnz:C, 4bnz:D, 4bo0:A, 4bo0:B, 4bo0:C, 4bo0:D, 4bo1:A, 4bo1:B, 4bo1:C, 4bo1:D, 4bo2:A, 4bo2:B, 4bo2:C, 4bo2:D, 4bo3:A, 4bo3:B, 4bo3:C, 4bo3:D, 4bo4:A, 4bo4:B, 4bo4:D, 4bo5:A, 4bo5:B, 4bo5:C, 4bo5:D, 4bo6:A, 4bo6:B, 4bo6:C, 4bo6:D, 4bo7:A, 4bo7:B, 4bo7:C, 4bo7:D, 4bo8:A, 4bo8:B, 4bo8:C, 4bo8:D, 4bo9:A, 4bo9:B, 4bo9:C, 4bo9:D
60 8jat:A 204 62 0.0484 0.1127 0.3710 0.011
61 7tzp:G 247 157 0.0905 0.1741 0.2739 0.011 6t6n:A, 6t6n:B, 6t6n:C, 6t6n:D, 6t6n:E, 6t6n:F, 6t6n:G, 6t6n:H, 7tzp:A, 7tzp:C, 7tzp:E
62 3op4:A 247 183 0.1032 0.1984 0.2678 0.013 4i08:A, 4i08:B, 3op4:B, 3rsh:A, 3rsh:B, 4wk6:A, 4wk6:B, 4wk6:C, 4wk6:D
63 4qec:A 248 132 0.0526 0.1008 0.1894 0.014 4qec:B, 4qed:A, 4qed:B
64 1z45:A 674 150 0.0821 0.0579 0.2600 0.018
65 7kn1:A 336 87 0.0632 0.0893 0.3448 0.019 7kn1:B
66 2ae2:A 259 125 0.0800 0.1467 0.3040 0.019 2ae2:B, 1ipe:A, 1ipe:B, 1ipf:A, 1ipf:B
67 6zyz:A 259 125 0.0674 0.1236 0.2560 0.019 6zyz:B, 6zyz:C, 6zyz:D, 6zzt:C
68 8i70:A 658 104 0.0695 0.0502 0.3173 0.019 8a30:A, 8a7s:A, 8a8t:A, 8aer:A, 8j2a:A, 8j2b:A, 8j2d:A, 8j2e:A
69 7xwi:B 224 102 0.0547 0.1161 0.2549 0.021 7xwh:A, 7xwh:B, 7xwh:C, 7xwh:D, 7xwi:A, 7xwi:C, 7xwi:D, 7xwj:A, 7xwj:B, 7xwj:C, 7xwj:D, 7xwk:A, 7xwk:B, 7xwk:C, 7xwk:D, 7xwl:A, 7xwl:B, 7xwl:C, 7xwl:D, 7xwm:A, 7xwm:B, 7xwm:C, 7xwm:D, 7xwn:A, 7xwn:B, 7xwn:C, 7xwn:D
70 3ay6:B 267 115 0.0611 0.1086 0.2522 0.023 3aut:B, 3auu:A, 3auu:B, 3ay6:A, 3ay6:C, 3ay6:D
71 5b4t:A 260 118 0.0737 0.1346 0.2966 0.037 5b4u:A, 5b4v:A, 3vdq:A, 3vdq:B, 3vdq:C, 3vdq:D, 3vdr:A, 3vdr:B, 3vdr:C, 3vdr:D, 3w8d:A, 3w8e:A, 3w8f:A
72 7krg:F 270 120 0.0695 0.1222 0.2750 0.038 3gdf:A, 3gdf:B, 7krg:A, 7krg:B, 7krg:C, 7krg:D, 7krg:E, 7krg:G, 7krg:H
73 7v1q:A 251 220 0.1347 0.2550 0.2909 0.047 7v1q:B, 7v1q:C, 7v1q:D, 7v1q:E, 7v1q:F, 7v1q:G, 7v1q:H, 7v1r:A, 7v1r:B, 7v1r:C, 7v1r:D, 7v1r:E, 7v1r:F, 7v1r:G, 7v1r:H
74 3osu:A 246 191 0.1053 0.2033 0.2618 0.048 3sj7:A, 3sj7:B
75 3ai2:A 263 69 0.0547 0.0989 0.3768 0.048 3ai2:B, 3ai2:H, 3ai2:D, 3ai2:E, 3ai2:C, 3ai2:F, 3ai2:G, 3ai3:A, 3ai3:C, 3ai3:E, 3ai3:G
76 5l4s:A 310 71 0.0568 0.0871 0.3803 0.049 5lcx:A, 5ldg:A
77 1x1t:A 236 117 0.0800 0.1610 0.3248 0.058 2ztu:A
78 4bms:F 249 168 0.0947 0.1807 0.2679 0.062 4bms:A, 4bms:B, 4bms:C, 4bms:E, 4bms:K, 4i5e:A, 4i5e:B, 4i5e:C, 4i5e:D, 4i5e:E, 4i5e:F, 4i5e:G, 4i5e:H, 6ihh:A, 6ihh:B, 6ihi:A, 6ihi:B, 6ihi:C
79 2rh4:B 268 87 0.0632 0.1119 0.3448 0.063 3csd:B, 3csd:A, 4dbz:A, 4dbz:B, 4dc0:A, 4dc0:B, 4dc1:A, 4dc1:B, 3qrw:A, 3qrw:B, 2rh4:A, 2rhc:B, 2rhc:A, 2rhr:B, 2rhr:A, 3ri3:B, 3ri3:A, 1w4z:A, 1w4z:B, 1x7g:A, 1x7g:B, 1x7h:A, 1x7h:B, 1xr3:A, 1xr3:B
80 2q2q:D 255 118 0.0779 0.1451 0.3136 0.066 2q2q:C, 2q2q:E, 2q2q:F, 2q2q:G, 2q2q:H, 2q2v:B, 2q2v:C, 2q2v:D
81 1h5q:A 260 184 0.0926 0.1692 0.2391 0.076 1h5q:B, 1h5q:C, 1h5q:D, 1h5q:E, 1h5q:F, 1h5q:G, 1h5q:H, 1h5q:I, 1h5q:J, 1h5q:K, 1h5q:L
82 1wmb:A 260 117 0.0800 0.1462 0.3248 0.078 1wmb:B, 2ztl:A, 2ztl:B, 2ztl:C, 2ztl:D, 2ztm:A, 2ztm:C, 2ztm:D, 2ztu:C, 2ztu:D, 2ztv:A, 2ztv:B, 2ztv:C, 2ztv:D
83 3ijr:F 290 119 0.0568 0.0931 0.2269 0.084 3i3o:A, 3i3o:B, 3i3o:C, 3i3o:D, 3i3o:E, 3i3o:F, 3i3o:H, 3ijr:A, 3ijr:B, 3ijr:C, 3ijr:D, 3ijr:E, 3ijr:G, 3ijr:H
84 4bmv:C 258 92 0.0695 0.1279 0.3587 0.085 4bmv:A, 4bmv:B, 4bmv:D, 4bmv:E, 4bmv:F, 4bmv:G, 4bmv:H, 4bmv:I, 4bmv:J
85 4iqg:D 248 166 0.1011 0.1935 0.2892 0.088 4iqg:C, 4iqg:A, 4iqg:B
86 5vp5:A 411 204 0.1179 0.1363 0.2745 0.088
87 7w61:A 249 192 0.0884 0.1687 0.2188 0.092
88 4eso:B 251 162 0.1011 0.1912 0.2963 0.100 4eso:A, 4eso:C, 4eso:D
89 5o98:B 283 73 0.0547 0.0919 0.3562 0.12 5o98:A
90 2ewm:B 247 60 0.0463 0.0891 0.3667 0.12 2ewm:A
91 3s55:D 275 81 0.0589 0.1018 0.3457 0.12 3s55:A, 3s55:B, 3s55:C, 3s55:E, 3s55:F, 3s55:G, 3s55:H
92 7dn1:B 280 107 0.0611 0.1036 0.2710 0.15 7dll:A, 7dll:B, 7dmg:A, 7dmg:B
93 1zbq:A 302 170 0.0926 0.1457 0.2588 0.16 1gz6:A, 1gz6:C, 1gz6:D, 1zbq:B, 1zbq:C, 1zbq:D, 1zbq:E, 1zbq:F
94 3rkr:A 221 113 0.0716 0.1538 0.3009 0.17 3rkr:B
95 1ahi:A 255 68 0.0505 0.0941 0.3529 0.18 1ahh:A, 1ahh:B, 1ahi:B, 1fmc:A, 1fmc:B
96 3sxp:D 314 152 0.0737 0.1115 0.2303 0.20 3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
97 6t62:A 244 182 0.0926 0.1803 0.2418 0.20 6t62:B, 6wpr:A, 6wpr:B
98 1xg5:C 257 108 0.0653 0.1206 0.2870 0.21 1xg5:A, 1xg5:B, 1xg5:D
99 8g84:A 297 100 0.0632 0.1010 0.3000 0.21 8g84:B, 8g89:A, 8g89:B, 8g93:A, 8g93:B
100 4lis:A 364 143 0.0842 0.1099 0.2797 0.22 4lis:B, 4lis:C
101 8g9v:E 293 100 0.0611 0.0990 0.2900 0.22 8g9v:A, 8g9v:B, 8g9v:C, 8g9v:D, 8g9v:F, 8g9v:G, 8g9v:H
102 6qhe:A 261 88 0.0589 0.1073 0.3182 0.23 6qhe:B, 6qhe:C, 6qhe:D, 6qhe:F
103 7emg:B 243 222 0.1158 0.2263 0.2477 0.28 7emg:A
104 1edo:A 244 158 0.0842 0.1639 0.2532 0.29
105 7nm8:AAA 251 215 0.1179 0.2231 0.2605 0.36
106 5u2w:A 246 127 0.0863 0.1667 0.3228 0.38 5u2w:B, 5u2w:C, 5u2w:D
107 7n09:A 259 258 0.1368 0.2510 0.2519 0.40 7n09:B
108 4e5y:C 290 49 0.0337 0.0552 0.3265 0.41
109 7dlm:A 280 97 0.0589 0.1000 0.2887 0.42 7dlm:B, 7dn1:A, 7vyq:A, 7vyq:B, 7vyq:F, 7vyq:G
110 8ijg:C 250 34 0.0400 0.0760 0.5588 0.45 8ij6:A, 8ij6:B, 8ij6:C, 8ij6:D, 8ijg:A, 8ijg:B, 8ijg:D
111 6jha:A 242 31 0.0295 0.0579 0.4516 0.50 6jhb:A
112 7ejh:A 253 118 0.0758 0.1423 0.3051 0.50 7ejh:B, 7ejh:C, 7ejh:D, 7eji:A, 7eji:B, 7eji:C, 7eji:D, 7ejj:A, 7ejj:B, 7ejj:C, 7ejj:D, 4rf2:A, 4rf2:B, 7vdo:D, 7vdo:A, 7vdo:B, 7ve7:A, 7ve7:B, 7ve7:C, 7ve7:D
113 5ilg:A 265 125 0.0653 0.1170 0.2480 0.54 5ilg:B, 5ilo:A, 5ilo:B
114 8r2j:B 275 41 0.0421 0.0727 0.4878 0.56 8r2j:A
115 2hrb:A 273 193 0.1116 0.1941 0.2746 0.56
116 6jhb:B 264 31 0.0295 0.0530 0.4516 0.61 6jha:B
117 1gz6:B 278 164 0.0884 0.1511 0.2561 0.62
118 3rku:A 268 81 0.0484 0.0858 0.2840 0.66 3rku:B, 3rku:C, 3rku:D
119 3p19:A 239 31 0.0295 0.0586 0.4516 0.73 3p19:B, 3p19:C, 3p19:D
120 3o03:A 254 113 0.0568 0.1063 0.2389 0.73
121 8hi5:A 647 71 0.0547 0.0402 0.3662 0.74
122 3vvb:A 270 90 0.0421 0.0741 0.2222 0.76
123 3dwf:B 275 32 0.0337 0.0582 0.5000 0.76 3dwf:A, 3dwf:C, 3dwf:D, 3g49:A, 3g49:B, 3g49:C, 3g49:D, 3lz6:A, 3lz6:B, 3lz6:C, 3lz6:D, 1xse:A, 1xse:B
124 7xpo:A 344 89 0.0526 0.0727 0.2809 0.85 7xpo:B, 7xpp:B, 7xpp:A, 7xpq:A, 7xpq:B
125 1n5d:A 288 106 0.0695 0.1146 0.3113 0.85
126 3w1v:A 347 90 0.0421 0.0576 0.2222 0.94 4g5h:A, 3vvc:A, 3w1v:B
127 2hun:A 329 97 0.0568 0.0821 0.2784 0.94 2hun:B
128 4k26:A 265 32 0.0337 0.0604 0.5000 1.0 3gmd:A, 3gmd:B, 3gmd:C, 3gmd:D, 3gmd:E, 3gmd:F, 3gmd:G, 3gmd:H, 4k26:B, 4nmh:A, 4nmh:B, 4nmh:C, 4nmh:D, 5pgz:A, 5pgz:B, 5qij:A, 5qij:B, 1y5m:A, 1y5m:B, 1y5r:A, 1y5r:B
129 6ixj:A 251 171 0.0968 0.1833 0.2690 1.0 6ixj:B, 6ixj:C, 6ixj:D, 6ixj:E, 6ixj:F, 6ixj:G, 6ixj:H, 6ixj:I, 6ixj:J, 6ixj:K, 6ixj:L
130 6tq5:A 240 204 0.1032 0.2042 0.2402 1.1 6tq5:B, 6tq5:C, 6tq5:D
131 3tvl:A 204 117 0.0863 0.2010 0.3504 1.3 3tvl:B
132 7v0h:G 253 37 0.0379 0.0711 0.4865 1.3 7v0h:A, 7v0h:B, 7v0h:C, 7v0h:D, 7v0h:E, 7v0h:F, 7v0h:H
133 1yxm:B 283 71 0.0505 0.0848 0.3380 1.4
134 2exx:A 305 45 0.0400 0.0623 0.4222 1.5 2exx:B, 2wm3:A, 2wmd:A
135 4iju:B 282 32 0.0337 0.0567 0.5000 1.5 4bb5:A, 4bb5:B, 4bb5:C, 4bb5:D, 4bb6:A, 4bb6:B, 2bel:A, 2bel:B, 2bel:C, 2bel:D, 3byz:A, 3byz:B, 3byz:C, 3byz:D, 3bzu:A, 3bzu:B, 3bzu:C, 3bzu:D, 4c7j:A, 4c7j:B, 4c7j:C, 4c7j:D, 4c7k:A, 4c7k:B, 4c7k:C, 4c7k:D, 3ch6:A, 3ch6:B, 3ch6:D, 3ch6:E, 3czr:A, 3czr:B, 3d3e:A, 3d3e:B, 3d3e:C, 3d3e:D, 3d4n:A, 3d4n:B, 3d4n:C, 3d4n:D, 3d5q:A, 3d5q:B, 3d5q:C, 3d5q:D, 3ey4:A, 3ey4:B, 3ey4:C, 3ey4:D, 3fco:A, 3fco:B, 3frj:A, 3frj:B, 3h6k:A, 3h6k:B, 3h6k:C, 3h6k:D, 3hfg:A, 3hfg:B, 3hfg:C, 3hfg:D, 4hfr:A, 4hfr:B, 4hx5:A, 4hx5:B, 4hx5:C, 4hx5:D, 4iju:A, 4iju:D, 4iju:E, 4ijv:A, 4ijv:B, 4ijv:D, 4ijv:E, 4ijw:A, 4ijw:B, 4ijw:D, 4ijw:E, 2ilt:A, 2irw:A, 2irw:B, 2irw:C, 2irw:D, 2irw:E, 2irw:F, 2irw:G, 2irw:H, 4k1l:A, 4k1l:B, 4k1l:C, 4k1l:D, 6nj7:A, 6nj7:B, 6nj7:C, 6nj7:D, 3oq1:A, 3oq1:B, 3oq1:C, 3oq1:D, 4p38:A, 4p38:B, 3pdj:A, 3pdj:B, 5pgu:A, 5pgu:B, 5pgu:D, 5pgu:E, 5pgv:A, 5pgv:B, 5pgv:D, 5pgv:E, 5pgw:A, 5pgw:B, 5pgw:D, 5pgw:E, 5pgx:A, 5pgx:B, 5pgx:D, 5pgx:E, 5pgy:A, 5pgy:B, 5pgy:D, 5pgy:E, 5qii:A, 5qii:B, 5qii:D, 5qii:E, 3qqp:A, 3qqp:B, 3qqp:C, 3qqp:D, 2rbe:A, 2rbe:B, 2rbe:C, 2rbe:D, 3tfq:A, 3tfq:B, 3tfq:D, 3tfq:E, 1xu7:A, 1xu7:B, 1xu7:C, 1xu7:D, 1xu9:A, 1xu9:B, 1xu9:C, 1xu9:D, 4yyz:A, 4yyz:B
136 5yss:B 255 123 0.0716 0.1333 0.2764 1.7 5yss:D
137 6o7y:A 183 85 0.0568 0.1475 0.3176 1.7 6o7z:A, 6o80:A
138 5ts3:A 265 85 0.0611 0.1094 0.3412 1.8 5ts3:B
139 6t77:A 244 233 0.1411 0.2746 0.2876 2.0 1q7b:A, 1q7b:D, 1q7b:B, 1q7b:C, 1q7c:A, 1q7c:B, 6t5x:A, 6t5x:B, 6t77:B
140 6ujk:A 246 89 0.0568 0.1098 0.3034 2.0 6ujk:B
141 3pxx:A 282 98 0.0695 0.1170 0.3367 2.2 3pxx:B, 3pxx:C, 3pxx:D, 3pxx:E, 3pxx:F
142 4zrn:A 309 144 0.0695 0.1068 0.2292 2.2 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
143 7pcs:B 247 74 0.0463 0.0891 0.2973 2.2 7pcs:D
144 6jyg:D 307 72 0.0421 0.0651 0.2778 2.3 6jyg:A, 6jyg:B, 6jyg:C, 6jyg:E, 6jyg:F
145 4u7w:B 394 60 0.0358 0.0431 0.2833 2.4 4u7w:A
146 2c20:A 329 147 0.0716 0.1033 0.2313 2.5 2c20:B, 2c20:C, 2c20:D, 2c20:E, 2c20:F
147 1g6k:A 261 117 0.0568 0.1034 0.2308 2.6 1g6k:B, 1g6k:E, 1g6k:F, 1gco:A, 1gco:B, 1gco:E, 1gco:F, 1gee:A, 1gee:B, 1gee:E, 1gee:F, 1rwb:A, 1rwb:B, 1rwb:E, 1rwb:F
148 5t2u:A 241 76 0.0611 0.1203 0.3816 2.7 5t2u:B, 5t2u:C, 5t2u:D
149 5jc8:D 262 168 0.0989 0.1794 0.2798 2.7
150 5l53:A 294 73 0.0547 0.0884 0.3562 2.8
151 4jro:C 247 93 0.0611 0.1174 0.3118 2.9 4jro:B, 4jro:D
152 6bxk:A 340 126 0.0737 0.1029 0.2778 2.9 6bxk:B, 6bxl:A, 6bxl:B, 3lzd:A, 3lzd:B
153 1e3w:D 255 89 0.0547 0.1020 0.2921 2.9 1e3s:A, 1e3s:B, 1e3s:C, 1e3s:D, 1e3w:A, 1e3w:B, 1e3w:C, 1e6w:A, 1e6w:B, 1e6w:C, 1e6w:D
154 5wjs:A 258 174 0.1095 0.2016 0.2989 3.0 5wjs:B
155 4yai:A 273 68 0.0505 0.0879 0.3529 3.0 4yag:A, 4yag:B, 4yai:B
156 5wuw:A 245 72 0.0526 0.1020 0.3472 3.0
157 4osp:A 252 188 0.1137 0.2143 0.2872 3.2
158 7uf8:A 341 72 0.0484 0.0674 0.3194 3.2 7uf8:B, 7uf8:C, 7uf8:D
159 7x5j:C 256 198 0.0968 0.1797 0.2323 3.3 7x5j:D, 7x5j:A, 7x5j:E, 7x5j:B, 7x5j:F
160 7b81:A 256 75 0.0526 0.0977 0.3333 3.6 7b81:B, 7do6:A, 7do6:B, 7do6:C, 7do6:D, 7do6:E, 7do6:F, 7do6:G, 7do6:H, 7do7:A, 7do7:B
161 6vft:C 420 64 0.0505 0.0571 0.3750 4.1 6vft:A, 6vft:B, 6vft:D
162 4nbt:A 239 155 0.0779 0.1548 0.2387 4.2 4nbt:B, 4nbt:C, 4nbt:D
163 4y9d:A 235 118 0.0695 0.1404 0.2797 4.2
164 4z3d:A 276 110 0.0695 0.1196 0.3000 4.2 3bhi:A, 3bhj:A, 3bhm:A, 2pfg:A, 1wma:A, 4z3d:B, 4z3d:C, 4z3d:D
165 7jk9:A 316 43 0.0337 0.0506 0.3721 4.4 7jk9:B, 7jk9:C, 7jk9:D, 7jk9:E, 7jk9:F, 7jk9:G, 7jk9:H, 7jk9:I, 7jk9:J, 7jk9:K, 7jk9:L, 7jk9:M, 7jk9:N, 7jk9:O, 7jk9:P, 7jk9:Q, 7jk9:R, 7jk9:S, 7jk9:T, 7jk9:V, 7jk9:W, 7jk9:X, 7jk9:Y, 7jk9:Z, 7jk9:AA, 7jk9:BA, 7jk9:CA, 7jk9:DA, 7jk9:EA, 7jk9:FA, 7jk9:GA, 7jk9:HA, 7jk9:IA, 7jk9:JA, 7jk9:KA, 7jk9:LA, 7jk9:MA, 7jk9:NA, 7jk9:OA
166 6y0s:AAA 251 89 0.0505 0.0956 0.2697 4.4 6y0s:BBB, 6y0z:A, 6y10:A, 1zjy:A, 1zjz:A, 1zk0:A, 1zk1:A, 1zk4:A
167 5bju:A 340 91 0.0442 0.0618 0.2308 4.6 5bju:B, 5bjv:A, 5bjv:B, 5bjw:A, 5bjw:B, 5bjx:A, 5bjx:B, 5bjy:A, 5bjy:B
168 4j2o:C 316 55 0.0316 0.0475 0.2727 5.3 4j2o:A, 4j2o:B, 4j2o:D, 4j2o:E, 4j2o:F
169 2bd0:A 240 118 0.0779 0.1542 0.3136 5.6 2bd0:B, 2bd0:C, 2bd0:D
170 3pgj:A 272 98 0.0589 0.1029 0.2857 5.8 3pgj:B, 3pgj:C, 3pgj:D, 3sef:A, 3sef:B
171 3enk:A 340 96 0.0632 0.0882 0.3125 5.9 3enk:B
172 1a6e:A 503 127 0.0800 0.0755 0.2992 6.1
173 3e9q:B 256 157 0.0779 0.1445 0.2357 6.2 3f1k:A, 3gy0:A, 3gz4:A, 3gz4:B
174 1a9y:A 338 89 0.0526 0.0740 0.2809 6.7 1a9z:A, 5gy7:A, 5gy7:B, 1kvq:A, 1kvr:A, 1kvs:A, 1kvt:A, 1kvu:A, 1lrj:A, 1lrk:A, 1lrl:A, 1nah:A, 1nai:A, 1uda:A, 1udb:A, 1udc:A, 2udp:A, 2udp:B, 1xel:A
175 6nkk:A 257 182 0.0989 0.1829 0.2582 6.9 6nkk:B, 6nkk:C, 6nkk:D, 6nkk:E, 6nkk:F, 6nkm:A, 6nkm:B, 6nkm:C, 6nkm:D, 6nkm:E, 6nkm:F
176 4hbg:A 257 31 0.0232 0.0428 0.3548 6.9 4fda:A
177 5ha5:D 244 90 0.0674 0.1311 0.3556 7.2 5ha5:B, 5ha5:C
178 4fw8:A 427 191 0.1116 0.1241 0.2775 7.2 4fw8:B, 4fw8:C, 4fw8:D, 3q6i:A, 3q6i:B, 3q6i:C, 3q6i:D, 3v1u:A
179 4is3:C 250 159 0.0758 0.1440 0.2264 7.3 4is3:A, 4is3:B, 4is3:D
180 1bxk:B 344 102 0.0547 0.0756 0.2549 7.6 1bxk:A
181 2f1k:A 279 51 0.0400 0.0681 0.3725 7.9 2f1k:B, 2f1k:C, 2f1k:D
182 3cdz:A 630 122 0.0695 0.0524 0.2705 8.8 3j2q:A
183 4kwh:B 257 206 0.1242 0.2296 0.2864 9.0 4kwh:A, 4kwi:A, 4kwi:B, 4oso:A, 4oso:B
184 3bb0:A 576 70 0.0400 0.0330 0.2714 10.0 1vnc:A, 1vne:A, 1vnf:A, 1vng:A, 1vnh:A, 1vni:A, 1vns:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218