BioLiP

>protein
SHMATLKVIGVGGGGNNAVNRMIDHGMNNVEFIAINTDGQALNLSKAESKIQIGEKLTRGLGAGANPEIGKKAAEESREQ
IEDAIQGADMVFVTSGMGGGTGTGAAPVVAKIAKEMGALTVGVVTRPFSFEGRKRQTQAAAGVEAMKAAVDTLIVIPNDR
LLDIVDKSTPMMEAFKEADNVLRQGVQGISDLIAVSGEVNLDFADVKTIMSNQGSALMGIGVSSGENRAVEAAKKAISSP
LLETSIVGAQGVLMNITGGESLSLFEAQEAADIVQDAADEDVNMIFGTVINPELQDEIVVTVIATGF

The query sequence (length=307) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4m8i:A	311	305	0.9805	0.9678	0.9869	0.0	4dxd:A, 5h5g:A, 5h5g:B, 5h5h:A, 5h5i:A, 8htb:A, 6kvp:A, 6kvq:A, 5mn4:A, 5mn5:A, 5mn5:B, 5mn6:A, 5mn6:B, 5mn7:A, 5mn7:B, 5mn8:B, 5mn8:A, 7ohh:A, 7ohk:A, 7ohl:A, 7ohn:A, 7oi2:A, 7oja:A, 7ojb:A, 7ojc:A, 7ojd:A, 7ojz:A, 7on2:A, 7on3:A, 7on4:A, 6rvm:A, 6rvm:B, 6rvm:C, 6rvn:A, 6rvp:A, 6rvq:A, 6si9:A, 3vo8:A, 3vo8:B, 3voa:A, 3vob:A, 3wgj:A, 3wgj:B, 3wgk:A, 3wgk:B, 3wgl:A, 3wgl:B, 3wgm:A, 3wgm:B, 3wgn:A, 3wgn:B, 5xdt:A, 5xdu:A, 5xdv:A, 5xdw:A, 6yd1:A, 6yd5:A, 6yd6:A
2	2rhl:B	315	304	0.7980	0.7778	0.8059	5.96e-156	2rhl:A, 2rho:A, 2rho:B, 4u39:B, 4u39:E, 4u39:F, 4u39:G
3	4u39:D	280	291	0.7134	0.7821	0.7526	5.38e-133	4u39:H, 4u39:I
4	7yop:B	304	305	0.5896	0.5954	0.5934	5.08e-121	8grw:A, 8grw:B, 7yop:A, 7ysz:A, 7ysz:B
5	5zue:A	309	291	0.5961	0.5922	0.6289	5.73e-118	4kwe:A, 4kwe:B, 4kwe:C, 2q1y:A, 1rlu:A, 1rq7:A, 5v68:B, 5v68:E, 6y1u:A, 6y1u:B, 6y1v:A, 6y1v:B, 6ym1:A, 6ym9:A
6	2vaw:A	315	292	0.5114	0.4984	0.5377	6.48e-95	1ofu:A, 1ofu:B
7	1w5f:A	315	305	0.5016	0.4889	0.5049	8.27e-91	1w5f:B
8	8h1o:A	314	291	0.4919	0.4809	0.5189	4.18e-90	8gzv:A, 8gzw:A, 8gzw:C, 8gzw:E, 8gzx:A, 8gzy:A, 8gzy:C, 8gzy:E, 8ibn:A, 8ibn:B, 8ibn:C, 8ibn:D, 6ll5:A, 6ll6:A, 6umk:A, 6unx:A
9	1w58:1	337	303	0.4919	0.4481	0.4983	1.90e-81	1fsz:A, 2vap:A, 1w5a:A, 1w5a:B, 1w5b:A, 1w5b:B, 1w5e:A, 1w5e:B, 1w5e:C, 1w5e:D, 1w5e:E, 1w5e:F, 1w5e:G, 1w5e:H, 1w5e:I
10	2r6r:1	323	293	0.4267	0.4056	0.4471	1.65e-74	2r75:1
11	3zid:A	360	266	0.2280	0.1944	0.2632	1.73e-09	3zid:B
12	4b46:A	330	169	0.1759	0.1636	0.3195	1.78e-04
13	4b45:A	334	202	0.1726	0.1587	0.2624	0.006
14	4xcq:A	303	120	0.1140	0.1155	0.2917	0.037
15	5ycd:B	193	83	0.0782	0.1244	0.2892	1.2	5x6k:A, 5x6k:B, 5x6l:A, 5x6l:B, 5xru:A, 5xru:B, 5xz2:A, 5xz2:B, 5ycb:A, 5ycb:B, 5ycc:A, 5ycc:B, 5ycd:A, 5ycf:B, 5ycf:A
16	5ysc:A	255	20	0.0326	0.0392	0.5000	2.0
17	6kbn:C	504	75	0.0749	0.0456	0.3067	2.3	6kbm:A, 6kbn:A
18	4rnh:A	423	93	0.0879	0.0638	0.2903	2.5
19	5jiz:A	151	53	0.0489	0.0993	0.2830	3.4	6bq8:A, 5bv6:A, 5jix:A
20	5l22:B	540	53	0.0619	0.0352	0.3585	5.3	5l22:A
21	6gos:1	284	47	0.0456	0.0493	0.2979	5.6	6gos:2, 6grg:1, 6grg:2, 6grh:1, 6grh:2, 6gri:1, 6gri:2
22	8e73:FD	122	44	0.0423	0.1066	0.2955	6.6
23	3jz4:A	481	55	0.0717	0.0457	0.4000	7.2	3jz4:B, 3jz4:C, 3jz4:D
24	4ga6:A	493	100	0.0717	0.0446	0.2200	9.4	4ga4:A, 4ga4:B, 4ga6:B

[Back]