BioLiP

>protein
SGSKFRGHQKSKGNSYDVEVVLQHVDTGNSYLCGYLKIKTEEYPTLTTFFEGEIISKKHPFLTRKWDADEDVDRKHWGKF
LAFYQYADFDYEELKNGDYVFMRWKEQFLVPDHTGASFAGFYYICFQKSAASIEGYYYHRSSEWYQSLNLTHV

The query sequence (length=153) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7q50:A	170	166	1.0000	0.9000	0.9217	2.78e-107	6cct:A, 6ccu:A, 6cd8:A, 6cd8:B, 6cd9:A, 6cdc:A, 6cdg:A, 7s12:A, 7slz:A, 7u3e:A, 7u3e:B, 7u3f:A, 7u3g:A, 7u3h:A, 7u3i:A, 7u3i:B, 7u3j:A, 7u3k:A, 7u3l:A, 8v1p:A, 6wzx:A, 6wzx:B, 6wzz:A
2	7ns3:4	199	175	0.3791	0.2915	0.3314	1.02e-22
3	7qqy:A	216	193	0.3856	0.2731	0.3057	3.69e-20	7q51:A
4	6g21:A	504	87	0.1503	0.0456	0.2644	0.068	6g21:B
5	8sm5:I	138	77	0.1176	0.1304	0.2338	0.44
6	3bxu:A	71	42	0.0915	0.1972	0.3333	0.57	3bxu:B
7	3zjh:B	193	96	0.1765	0.1399	0.2812	2.8	3qzx:A, 3qzz:A, 3r0g:A, 3r0g:B, 2veb:A, 2vee:A, 2vee:B, 2vee:C, 2vee:D, 2vee:E, 2vee:F, 2vee:G, 2vee:H, 3zh0:A, 3zh0:B, 3zh0:C, 3zh0:D, 3zjh:A, 3zji:A, 3zji:B, 3zjj:A, 3zjj:B, 3zjj:C, 3zjl:A, 3zjl:B, 3zjm:A, 3zjm:B, 3zjm:C, 3zjn:A, 3zjn:B, 3zjo:A, 3zjo:B, 3zjp:A, 3zjq:A, 3zjq:B, 3zjr:A, 3zjs:A, 3zjs:B, 3zol:A, 3zol:B, 3zom:A, 3zom:B
8	5imt:A	460	52	0.1046	0.0348	0.3077	5.2
9	2wh6:A	157	67	0.0915	0.0892	0.2090	5.4	7p33:B, 7p33:D, 7p33:A, 7p33:E, 7p9w:A, 8sm5:A, 8sm5:C, 8sm5:G, 8sm5:E, 2v6q:A, 2xpx:A
10	6j15:D	106	35	0.0654	0.0943	0.2857	7.5
11	6jjp:F	118	35	0.0654	0.0847	0.2857	8.3	8as0:A, 8as0:F, 8as0:I, 8as0:L, 8as0:O, 8as0:R, 8as0:X, 8as0:Y, 7cu5:Q, 6j15:C, 6jbt:F, 6jjp:C, 6umt:A, 5wt9:G
12	8c8j:A	698	39	0.0784	0.0172	0.3077	9.2

[Back]