Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SGKPVLHYFNARGRMECIRFLLAAAGVEFDEKFIQSPEDLEKLKKDGNLMFDQVPMVEIDGMKLAQTRAILNYIATKYDL
YGKDMKERALIDMYSEGILDLTEMIMQLVICPPDQKEAKTALAKDRTKNRYLPAFEKVLKSHGQDYLVGNKLTRVDIHLL
ELLLYVEEFDASLLTSFPLLKAFKSRISSLPNVKKFLQPGSQRKLPM

The query sequence (length=207) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1f3b:A 222 207 0.9517 0.8874 0.9517 8.30e-147 1ev4:A, 1ev4:C, 1ev4:D, 1ev9:A, 1ev9:C, 1ev9:D, 1f3a:A, 1f3a:B, 1f3b:B, 5lcz:A, 5lcz:B, 1ml6:A, 1ml6:B
2 6ato:A 221 205 0.7681 0.7195 0.7756 8.20e-117 4acs:A, 4acs:B, 4acs:C, 4acs:D, 6ato:B, 6atr:A, 6atr:B, 7bib:A, 7bib:B, 1gse:A, 1gse:B, 1gsf:A, 1gsf:B, 1gsf:C, 1gsf:D, 1guh:A, 1guh:B, 1guh:C, 1guh:D, 4hj2:A, 4hj2:B, 3i69:A, 3i69:B, 3i69:C, 3i69:D, 3i6a:A, 3i6a:B, 3i6a:C, 3i6a:D, 3i6a:E, 3i6a:F, 3i6a:G, 3i6a:H, 3ik9:A, 3ik9:B, 3ik9:C, 3ik9:D, 3ik9:E, 3ik9:F, 3ik9:G, 3ik9:H, 5jcu:A, 5jcu:B, 5jcu:C, 5jcu:D, 1k3l:A, 1k3l:B, 1k3y:A, 1k3y:B, 3ktl:A, 3ktl:B, 3l0h:A, 3l0h:B, 1pkw:A, 1pkw:B, 1pl1:A, 1pl1:B, 1pl2:A, 1pl2:B, 2r3x:A, 2r3x:B, 2r6k:A, 2r6k:B, 1tdi:A, 1tdi:B, 1usb:A, 1usb:B, 2vct:A, 2vct:B, 2vct:C, 2vct:D, 2vcv:A, 2vcv:B, 2vcv:C, 2vcv:D, 2vcv:E, 2vcv:F, 2vcv:G, 2vcv:H, 2vcv:I, 2vcv:J, 2vcv:K, 2vcv:L, 2vcv:M, 2vcv:N, 2vcv:O, 2vcv:P, 2wju:A, 2wju:B, 2wju:C, 2wju:D, 2wju:E, 2wju:F, 2wju:G, 2wju:H, 6yaw:A, 6yaw:B, 1ydk:A, 1ydk:B
3 6zj9:A 220 204 0.7391 0.6955 0.7500 4.60e-112 6zjc:B, 6zjc:A, 6zjc:D, 6zjc:C
4 1b48:A 221 206 0.5990 0.5611 0.6019 1.33e-88 1b48:B
5 1vf1:A 226 203 0.6039 0.5531 0.6158 1.68e-87 1vf2:A, 1vf2:B, 1vf3:A, 1vf3:B
6 3ik7:A 221 206 0.4976 0.4661 0.5000 4.32e-75 1gul:A, 1gul:B, 1gul:C, 1gul:D, 1gul:E, 1gul:F, 1gul:G, 1gul:H, 3ik7:B, 3ik7:C, 3ik7:D
7 2gsr:A 207 195 0.3140 0.3140 0.3333 3.26e-26 2gsr:B
8 2aaw:C 211 203 0.3237 0.3175 0.3300 5.41e-26 2aaw:A, 3fr3:A, 3fr3:B, 3fr9:A, 3fr9:B, 3frc:A, 3frc:B, 1q4j:A, 1q4j:B
9 8c5d:A 209 192 0.2947 0.2919 0.3177 2.97e-24 8c5d:B, 1glp:A, 1glp:B, 1glq:A, 1glq:B, 2glr:A, 2glr:B, 1gsy:A, 1gsy:B, 1gti:A, 1gti:B, 1gti:C, 1gti:D, 1gti:E, 1gti:F, 3o76:A, 3o76:B, 2oa7:A, 2oa7:B, 2oac:A, 2oac:B, 2oad:A, 2oad:B
10 6llx:B 215 202 0.2995 0.2884 0.3069 6.13e-24 10gs:A, 10gs:B, 20gs:A, 20gs:B, 11gs:A, 11gs:B, 12gs:A, 12gs:B, 13gs:A, 13gs:B, 17gs:A, 17gs:B, 18gs:A, 18gs:B, 19gs:A, 19gs:B, 2a2r:A, 2a2r:B, 2a2s:A, 2a2s:B, 6ap9:A, 6ap9:B, 1aqv:A, 1aqv:B, 1aqw:A, 1aqw:B, 1aqw:C, 1aqw:D, 1aqx:A, 1aqx:B, 1aqx:C, 1aqx:D, 7bia:A, 7bia:B, 3csh:A, 3csh:B, 3csi:A, 3csi:B, 3csi:C, 3csi:D, 3csj:B, 5dal:A, 5dal:B, 5dcg:B, 3dd3:A, 3dd3:B, 5ddl:A, 5ddl:B, 3dgq:A, 3dgq:B, 5djl:A, 5djl:B, 1gss:A, 1gss:B, 2gss:A, 2gss:B, 3gss:A, 3gss:B, 4gss:A, 4gss:B, 5gss:A, 5gss:B, 6gss:A, 6gss:B, 7gss:A, 7gss:B, 8gss:A, 8gss:B, 8gss:C, 9gss:A, 9gss:B, 3gus:A, 3gus:B, 3hjm:A, 3hjm:B, 3hjm:C, 3hjm:D, 3hjo:A, 3hjo:B, 3hkr:A, 3hkr:B, 3ie3:A, 3ie3:B, 5j41:A, 5j41:B, 2j9h:A, 2j9h:B, 5jcw:A, 5jcw:B, 1kbn:A, 1kbn:B, 3km6:A, 3km6:B, 3kmn:A, 3kmn:B, 3kmo:A, 3kmo:B, 5l6x:A, 5l6x:B, 1lbk:A, 1lbk:B, 6llx:A, 1md3:A, 1md3:B, 1md4:A, 1md4:B, 3n9j:A, 3n9j:B, 1pgt:A, 1pgt:B, 2pgt:A, 2pgt:B, 3pgt:A, 3pgt:B, 4pgt:A, 4pgt:B, 1px6:A, 1px6:B, 1px7:A, 1px7:B, 5x79:A, 5x79:B, 7xba:A, 7xba:B, 6y1e:A, 6y1e:B, 6y1e:C, 6y1e:D, 1zgn:A, 1zgn:B
11 1zl9:A 207 209 0.3092 0.3092 0.3062 9.02e-23 1zl9:B
12 1gsq:A 202 198 0.2802 0.2871 0.2929 3.23e-22 2gsq:A
13 5d73:A 207 216 0.3237 0.3237 0.3102 3.91e-22 5d73:B
14 5b7c:A 206 204 0.2850 0.2864 0.2892 1.90e-21
15 4q5f:D 206 196 0.2802 0.2816 0.2959 1.18e-20 4q5f:A
16 3w8s:A 205 207 0.3043 0.3073 0.3043 3.83e-20
17 4ofm:B 206 201 0.2947 0.2961 0.3035 4.03e-20 4ofm:A, 4ofm:C, 4ofm:D, 4ofn:A, 4ofn:B
18 1tu7:A 208 208 0.2947 0.2933 0.2933 4.81e-20 1tu7:B, 1tu8:A, 1tu8:B, 1tu8:C, 1tu8:D
19 2on5:A 206 208 0.2899 0.2913 0.2885 9.40e-18 2on5:B, 2on5:C, 2on5:D, 2on5:E, 2on5:F, 2on5:G, 2on5:H
20 4ec0:B 200 203 0.2609 0.2700 0.2660 2.69e-17 5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
21 2fhe:A 216 206 0.2899 0.2778 0.2913 3.83e-17 2fhe:B
22 3iso:A 218 212 0.3092 0.2936 0.3019 5.47e-17 3iso:B, 4l5l:A, 4l5l:B, 4l5o:A, 4l5o:C, 4l5o:B
23 4q5r:A 202 194 0.2850 0.2921 0.3041 5.78e-17 4q5r:C, 4q5r:D, 4q5r:B, 4q5r:F, 4q5r:E
24 2hnl:A 202 201 0.2657 0.2723 0.2736 6.00e-16 2hnl:B
25 2vcz:C 177 200 0.2512 0.2938 0.2600 8.95e-16
26 6n69:B 199 206 0.2609 0.2714 0.2621 1.47e-15 6n69:A, 1pd2:1, 1pd2:2, 5y9z:A, 5y9z:B
27 5an1:A 219 204 0.2947 0.2785 0.2990 1.80e-15 5an1:B, 5an1:C, 5an1:D, 5an1:E, 5an1:F, 5an1:G, 5an1:H, 7so8:A, 7so8:C, 7so8:E, 7so8:G, 7so8:H, 7so8:F, 7so8:B, 7so8:D
28 5h5l:B 199 208 0.2609 0.2714 0.2596 1.89e-15 5h5l:A
29 4q5q:A 218 210 0.3043 0.2890 0.3000 6.58e-15 4q5q:B
30 1b4p:A 217 211 0.2947 0.2811 0.2891 1.33e-14
31 2ab6:A 217 217 0.3237 0.3088 0.3088 1.48e-14 2ab6:B, 2ab6:C, 2ab6:D, 2c4j:A, 2c4j:B, 2c4j:C, 2c4j:D, 3gur:A, 3gur:B, 3gur:C, 3gur:D, 1hna:A, 1hnb:A, 1hnb:B, 1hnc:A, 1hnc:B, 1hnc:C, 1hnc:D, 5hwl:A, 5hwl:B, 1xw5:A, 1xw5:B, 1ykc:A, 1ykc:B
32 7opy:F 217 213 0.2899 0.2765 0.2817 3.54e-13 7opy:A, 7opy:B, 7opy:C, 7opz:C, 7opz:A, 7opz:B, 7opz:D
33 2f3m:A 218 217 0.2995 0.2844 0.2857 1.17e-12 2f3m:B, 2f3m:C, 2f3m:D, 2f3m:E, 2f3m:F, 1xw6:A, 1xw6:B, 1xw6:C, 1xw6:D, 1xwk:A, 1xwk:B, 1xwk:C, 1yj6:A, 1yj6:B, 1yj6:C
34 2wb9:A 210 201 0.2802 0.2762 0.2886 1.29e-12 2wb9:B, 2wdu:A, 2wdu:B
35 1fhe:A 214 205 0.2850 0.2757 0.2878 7.62e-12
36 5fwg:A 217 213 0.2705 0.2581 0.2629 4.05e-11 5fwg:B, 3fyg:A, 3fyg:B, 2gst:A, 2gst:B, 3gst:A, 3gst:B, 4gst:A, 4gst:B, 5gst:A, 5gst:B, 6gst:A, 6gst:B, 6gsu:A, 6gsu:B, 6gsv:A, 6gsv:B, 6gsw:A, 6gsw:B, 6gsx:A, 6gsx:B, 6gsy:A, 6gsy:B, 1mtc:A, 1mtc:B
37 4ai6:A 2650 209 0.2995 0.0234 0.2967 7.35e-11 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
38 4q5n:A 220 202 0.2415 0.2273 0.2475 8.59e-11 4q5n:B
39 1c72:A 217 215 0.2754 0.2627 0.2651 2.18e-10 1c72:B, 1c72:C, 1c72:D, 1gsu:A, 1gsu:B
40 2cz2:A 212 203 0.2464 0.2406 0.2512 4.08e-10
41 1fw1:A 208 199 0.2512 0.2500 0.2613 4.18e-10
42 8agq:A 213 162 0.2415 0.2347 0.3086 7.94e-10 5f07:A
43 3vpq:A 203 204 0.2560 0.2611 0.2598 7.97e-10 3vur:A
44 4png:B 223 202 0.2754 0.2556 0.2822 1.06e-09 4png:A
45 4pnf:B 221 171 0.2367 0.2217 0.2865 1.36e-09 4pnf:A, 4pnf:C, 4pnf:D, 4pnf:E, 4pnf:F, 4pnf:G, 4pnf:H, 4yh2:A, 4yh2:B, 4yh2:C, 4yh2:D
46 2c80:A 208 198 0.2512 0.2500 0.2626 2.14e-09 2c80:B, 2ca8:A, 2caq:A, 2f8f:A, 2f8f:B, 1oe7:A, 1oe7:B, 1oe8:A, 1oe8:B
47 1u3i:A 208 201 0.2464 0.2452 0.2537 5.81e-09
48 4hi7:A 220 211 0.2657 0.2500 0.2607 8.27e-09 4hi7:B
49 1m0u:A 203 195 0.2271 0.2315 0.2410 8.41e-09
50 5f06:A 213 159 0.2126 0.2066 0.2767 3.52e-08 5f06:B
51 6zb6:C 227 181 0.2319 0.2115 0.2652 1.16e-07 7obo:AAA, 7odm:AAA, 6riv:B, 6riv:A, 6tk8:AAA, 6zb6:A, 6zb6:E, 6zb6:B, 6zb6:F, 6zb6:D
52 1r5a:A 214 187 0.2512 0.2430 0.2781 1.22e-06
53 3lsz:A 223 159 0.2077 0.1928 0.2704 2.78e-06 3lsz:B, 3lsz:C, 3lsz:D
54 4nhw:D 217 152 0.1981 0.1889 0.2697 1.23e-05 4nhw:A, 4nhw:B, 4nhw:C
55 7rhp:A 215 204 0.2222 0.2140 0.2255 2.72e-05
56 1bye:A 213 160 0.2174 0.2113 0.2812 4.43e-05 1axd:A, 1axd:B, 1bye:B, 1bye:C, 1bye:D
57 6to3:AAA 190 152 0.1836 0.2000 0.2500 4.66e-05
58 4ivf:F 227 150 0.2029 0.1850 0.2800 6.28e-05 4ivf:A, 4ivf:B, 4ivf:C, 4ivf:D, 4ivf:E, 4ivf:G, 4ivf:H
59 1f2e:A 201 160 0.2126 0.2189 0.2750 8.53e-05 1f2e:B, 1f2e:C, 1f2e:D
60 3vwx:C 220 181 0.2126 0.2000 0.2431 3.93e-04 3vwx:A, 3vwx:B, 3vwx:D
61 1pn9:A 209 205 0.2464 0.2440 0.2488 0.002 1pn9:B
62 7rka:A 211 136 0.1546 0.1517 0.2353 0.003
63 4ri6:A 214 52 0.0966 0.0935 0.3846 0.003 4ri6:B, 4ri7:A, 4ri7:B
64 3gh6:A 209 88 0.1353 0.1340 0.3182 0.004
65 3mak:A 208 160 0.2367 0.2356 0.3063 0.008 3ein:A
66 5ft3:B 221 146 0.1594 0.1493 0.2260 0.010 5ft3:A
67 5a4u:A 211 161 0.1836 0.1801 0.2360 0.013 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B
68 4g0k:A 327 67 0.1256 0.0795 0.3881 0.019 4g0k:B, 4g0l:A, 4g0l:B, 3r3e:A, 3r3e:B
69 2x64:B 207 193 0.2319 0.2319 0.2487 0.019 2x64:A, 2x64:C, 2x64:D, 2x64:E, 2x64:F
70 8ai8:A 183 116 0.1449 0.1639 0.2586 0.020 8ai8:B, 8ai9:A, 8ai9:B, 8aib:A, 8aib:B, 7pka:A, 7pka:B
71 3wyw:B 214 93 0.1498 0.1449 0.3333 0.021 3wyw:A
72 6ezy:B 212 82 0.1304 0.1274 0.3293 0.026 6f01:B, 6f05:A, 6f05:B, 6f05:C, 6f05:D, 6f05:E, 6f05:F, 6f05:G, 6f05:H, 6f05:I, 6f05:J
73 1jlv:A 207 192 0.2367 0.2367 0.2552 0.035 1jlv:B, 1jlv:C, 1jlv:D, 1jlv:E, 1jlv:F
74 4iel:B 206 153 0.1498 0.1505 0.2026 0.045 4iel:A
75 2gdr:A 202 152 0.1787 0.1832 0.2434 0.046 2dsa:A, 2dsa:B, 2dsa:C, 2dsa:D, 2gdr:B, 2gdr:C, 2gdr:D, 2gdr:E, 2gdr:F
76 4i97:A 207 171 0.2222 0.2222 0.2690 0.047 4i97:B
77 3ppu:A 314 121 0.1401 0.0924 0.2397 0.059
78 4zba:A 222 153 0.1787 0.1667 0.2418 0.072 4zb9:A, 4zb9:C, 4zb9:D, 4zba:B, 4zba:C, 4zba:D, 4zbb:A, 4zbb:C, 4zbb:B, 4zbb:D
79 9f7k:A 222 71 0.1111 0.1036 0.3239 0.074 9f7k:B
80 6gcb:A 293 104 0.1449 0.1024 0.2885 0.17 6gcb:B, 6gcc:A, 6gcc:B
81 3zmk:B 222 144 0.1594 0.1486 0.2292 0.70 4gsn:A, 4gsn:C, 4gsn:D, 2imi:A, 2imi:B, 2imk:A, 2imk:B, 3zmk:D, 3zml:A, 3zml:B
82 6r84:A 446 73 0.1014 0.0471 0.2877 1.3
83 5lol:A 207 118 0.1401 0.1401 0.2458 1.5
84 5f05:C 211 160 0.1932 0.1896 0.2500 1.6 5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
85 7qep:O9 50 33 0.0628 0.2600 0.3939 1.8
86 3bby:A 191 44 0.0628 0.0681 0.2955 1.9
87 5wtz:A 420 67 0.0918 0.0452 0.2836 2.1 5h04:A, 5wu0:A
88 3f63:A 218 33 0.0628 0.0596 0.3939 2.2 3f63:B, 3f6d:A, 3f6d:B, 3g7i:B, 3g7j:A, 3g7j:B
89 7tm3:6 224 23 0.0531 0.0491 0.4783 4.2 7tut:6, 6w6l:4
90 8ix7:B 221 200 0.2319 0.2172 0.2400 4.9 8ix7:A
91 4gsn:B 220 53 0.0725 0.0682 0.2830 5.2
92 4jbb:A 208 43 0.0580 0.0577 0.2791 6.1
93 5elg:A 212 69 0.0966 0.0943 0.2899 7.3

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218