BioLiP

>protein
SGISLDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLTREEIVELMRDVSKEDH
SKRSSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLKKITNFFRGDRCRSLTGKPKLFIIQACRGTELDCGIET

The query sequence (length=146) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4pry:A	249	146	1.0000	0.5863	1.0000	2.16e-106	6bdv:A, 6bdv:B, 6bfj:A, 6bfj:B, 6bfk:A, 6bfk:C, 6bfk:B, 6bfk:D, 6bfl:A, 6bfl:B, 6bfo:A, 6bfo:B, 6bg0:A, 6bg0:C, 6bg0:B, 6bg0:D, 6bg1:A, 6bg1:C, 6bg4:A, 6bg4:E, 6bg4:B, 6bg4:F, 6bgk:A, 6bgk:C, 6bgk:B, 6bgk:D, 6bgq:A, 6bgq:B, 6bgq:C, 6bgq:D, 6bgr:A, 6bgr:B, 6bgs:A, 6bgs:C, 6bh9:B, 6bh9:E, 6bh9:A, 6bh9:C, 6bha:A, 6bha:B, 2c1e:A, 2c1e:B, 2c2k:A, 2c2k:B, 2c2m:A, 2c2m:B, 2c2o:A, 2c2o:B, 2cdr:A, 2cdr:B, 2cjx:A, 2cjx:B, 2cjy:A, 2cjy:B, 6ckz:A, 6ckz:B, 6cl0:A, 6cl0:B, 2cnk:A, 2cnk:B, 2cnl:A, 2cnl:B, 2cnn:A, 2cnn:B, 2cno:A, 2cno:B, 1cp3:A, 1cp3:B, 4dcj:A, 4dcj:B, 4dcj:D, 4dcj:E, 4dco:A, 4dco:B, 4dco:D, 4dco:E, 4dcp:A, 4dcp:B, 4dcp:D, 4dcp:E, 3deh:C, 3dei:A, 3dei:C, 3dej:A, 3dej:C, 3dek:A, 2dko:A, 2dko:B, 3edq:A, 3edq:B, 3edq:C, 3edq:D, 4eha:A, 4eha:C, 4ehd:A, 4ehf:A, 4ehh:A, 4ehk:A, 4ehk:C, 4ehl:A, 4ehl:C, 4ehn:A, 1gfw:A, 1gfw:B, 3gjq:A, 3gjq:B, 3gjq:C, 3gjq:D, 3gjr:A, 3gjr:B, 3gjr:C, 3gjr:D, 3gjs:A, 3gjs:B, 3gjs:C, 3gjs:D, 3gjt:A, 3gjt:B, 3gjt:C, 3gjt:D, 3h0e:A, 3h0e:B, 2h5i:A, 2h5i:B, 2h5j:A, 2h5j:B, 2h5j:C, 2h5j:D, 2h65:A, 2h65:B, 2h65:C, 2h65:D, 5i9b:A, 5i9t:C, 5i9t:A, 5iab:C, 5iab:A, 5iae:C, 5iae:A, 5iag:A, 5iaj:A, 5iak:A, 5ian:A, 5iar:A, 5ias:A, 5ibc:A, 5ibp:A, 5ibr:A, 5ibr:C, 5ic4:A, 5ic4:B, 5ic4:C, 5ic4:D, 5ic4:E, 5ic4:F, 5ic4:G, 5ic4:H, 3itn:A, 2j30:A, 2j31:A, 2j32:A, 2j33:A, 4jje:A, 4jr0:A, 4jr0:B, 3kjf:A, 3kjf:B, 1nme:A, 1nme:B, 1nmq:A, 1nmq:B, 1nms:A, 1nms:B, 1pau:A, 1pau:B, 3pcx:A, 3pd0:A, 3pd1:A, 4ps0:A, 4ps0:B, 4qtx:A, 4qty:A, 4qu0:A, 4qu5:A, 4qu8:A, 4qu9:A, 4qua:A, 4qub:A, 4qud:A, 4qud:B, 4que:C, 4que:A, 4qug:A, 4qug:C, 4quh:A, 4quh:C, 4qui:A, 4qui:B, 4quj:A, 4qul:C, 4qul:A, 1re1:A, 1re1:B, 1rhj:A, 1rhj:B, 1rhj:C, 1rhj:D, 1rhk:A, 1rhk:B, 1rhm:A, 1rhm:B, 1rhm:C, 1rhm:D, 1rhq:A, 1rhq:B, 1rhq:D, 1rhq:E, 1rhr:A, 1rhr:B, 1rhu:A, 1rhu:B, 7rn7:A, 7rn7:B, 7rn7:C, 7rn7:D, 7rn8:A, 7rn8:B, 7rn8:C, 7rn8:D, 7rn9:A, 7rn9:B, 7rn9:C, 7rn9:D, 7rna:C, 7rna:D, 7rna:A, 7rna:B, 7rnb:A, 7rnb:B, 7rnb:C, 7rnb:D, 7rnc:A, 7rnc:B, 7rnc:C, 7rnc:D, 7rnd:A, 7rnd:B, 7rnd:C, 7rnd:D, 7rne:A, 7rne:B, 7rne:C, 7rne:D, 7rnf:A, 7rnf:B, 7rnf:C, 7rnf:D, 7rng:A, 7rng:B, 7rng:C, 7rng:D, 7seo:A, 7seo:B, 7seo:C, 7seo:D, 7uso:A, 7uso:B, 7uso:C, 7uso:D, 7usp:A, 7usp:B, 7usp:C, 7usp:D, 7usq:A, 7usq:B, 7usq:C, 7usq:D, 6x8i:A, 6x8i:C, 6x8i:B, 6x8i:D, 6x8k:A, 6x8k:C, 6x8k:B, 6x8k:D, 2xyg:A, 2xyh:A, 2xyp:A, 2xyp:B
2	6pdq:D	142	142	0.5890	0.6056	0.6056	2.63e-64	6pdq:A
3	5jft:A	238	138	0.5685	0.3487	0.6014	2.21e-58	5jft:B, 7jl7:A, 7jl7:C
4	1i4o:A	235	138	0.4932	0.3064	0.5217	1.84e-47	6cl1:A, 6cl1:B, 6cl1:C, 6cl1:D, 6cl2:A, 6cl2:B, 6cl2:C, 6cl2:D, 8dgz:A, 8dgz:B, 8dj3:A, 3edr:A, 3edr:B, 3edr:C, 3edr:D, 1f1j:A, 1f1j:B, 3h1p:A, 3h1p:B, 4hqr:A, 4hqr:B, 1i4o:B, 1i51:A, 1i51:B, 1i51:C, 1i51:D, 3ibc:A, 3ibc:B, 3ibc:C, 3ibc:D, 5ic6:A, 5ic6:B, 5ic6:C, 5ic6:D, 4jj8:A, 4jj8:B, 4jr1:A, 4jr1:B, 4jr2:A, 4jr2:B, 1kmc:A, 1kmc:B, 2ql5:A, 2ql5:B, 2ql5:C, 2ql5:D, 2ql7:A, 2ql7:B, 2ql7:C, 2ql7:D, 2ql9:A, 2ql9:B, 2ql9:C, 2ql9:D, 2qlb:A, 2qlb:B, 2qlb:C, 2qlb:D, 2qlf:A, 2qlf:B, 2qlf:C, 2qlf:D, 2qlj:A, 2qlj:B, 2qlj:C, 2qlj:D, 1shj:A, 5v6u:B, 5v6z:B, 6x8j:A, 6x8j:C, 6x8j:B, 6x8j:D, 6x8l:A, 6x8l:C, 6x8l:B, 6x8l:D, 4zvo:A, 4zvo:B, 4zvo:C, 4zvo:D, 4zvp:A, 4zvp:B, 4zvp:C, 4zvp:D, 4zvq:A, 4zvq:B, 4zvq:C, 4zvq:D, 4zvr:A, 4zvr:B, 4zvr:C, 4zvr:D, 4zvs:A, 4zvs:B, 4zvs:C, 4zvs:D, 4zvt:A, 4zvt:B, 4zvt:C, 4zvt:D, 4zvu:C, 4zvu:D, 4zvu:A, 4zvu:B
5	6ppm:A	151	136	0.4315	0.4172	0.4632	3.37e-45	6ppm:G, 6ppm:J
6	1shj:B	209	139	0.4521	0.3158	0.4748	3.96e-43	4fea:B, 1shl:B, 1shl:A
7	6wi4:B	233	141	0.4110	0.2575	0.4255	1.45e-35	6wi4:A
8	4jj7:A	241	147	0.4110	0.2490	0.4082	3.03e-33	2c2z:A, 2c2z:B, 1f9e:A, 1f9e:B, 1f9e:C, 1f9e:D, 1f9e:E, 1f9e:F, 1f9e:G, 1f9e:H, 1f9e:I, 1f9e:J, 1f9e:K, 1f9e:L, 3h11:B, 3kjn:A, 3kjn:B, 3kjq:A, 3kjq:B, 4prz:A, 4ps1:A, 4ps1:B, 4ps1:C, 4ps1:D, 1qdu:A, 1qdu:B, 1qdu:C, 1qdu:D, 1qdu:E, 1qdu:F, 1qdu:G, 1qdu:H, 1qdu:I, 1qdu:J, 1qdu:K, 1qdu:L, 1qtn:A, 1qtn:B, 6x8h:A, 6x8h:B, 2y1l:C, 2y1l:D, 2y1l:A, 2y1l:B
9	1jxq:A	242	149	0.4110	0.2479	0.4027	3.61e-33	1jxq:C
10	4nbl:A	258	136	0.3767	0.2132	0.4044	1.48e-32	8eg5:A, 8eg5:B, 8eg5:C, 8eg5:D, 8eg5:E, 8eg5:F, 8eg5:G, 8eg5:H, 8eg6:A, 8eg6:B, 8eg6:C, 8eg6:D, 8eg6:E, 8eg6:F, 8eg6:G, 8eg6:H, 4ejf:A, 4ejf:C, 4ejf:B, 4ejf:D, 8f78:A, 8f78:B, 8f78:C, 8f78:D, 8f96:A, 8f96:B, 8f96:C, 8f96:D, 8f97:A, 8f97:C, 8f97:D, 8f98:A, 8f98:B, 8f98:D, 8f99:A, 8f99:B, 8f99:C, 8f99:D, 8f9a:B, 8f9a:C, 8f9a:D, 8f9b:A, 8f9b:B, 8f9b:C, 8f9b:D, 8f9c:A, 8f9c:B, 8f9c:C, 8f9c:D, 8f9d:A, 8f9d:B, 8f9d:C, 8f9d:D, 8fbv:A, 8fbv:B, 8fbv:D, 4hva:A, 4hva:B, 4n5d:A, 4n5d:B, 4n6g:A, 4n6g:B, 4n7j:A, 4n7j:B, 4n7m:A, 4n7m:B, 4nbk:A, 4nbk:B, 4nbl:B, 4nbn:A, 4nbn:B, 3od5:A, 3od5:B, 3p4u:A, 3p4u:B, 3p4u:C, 3p4u:D, 3qnw:B, 3qnw:D, 3qnw:H, 3s70:A, 3s70:C
11	6px9:B	207	139	0.3904	0.2754	0.4101	2.10e-32
12	4fxo:B	227	130	0.3562	0.2291	0.4000	1.28e-29	4fxo:A, 4fxo:C, 4fxo:D
13	1m72:C	252	136	0.3288	0.1905	0.3529	2.19e-26	1m72:A, 1m72:B
14	1pyo:C	161	140	0.3425	0.3106	0.3571	4.42e-24	1pyo:A, 3r5j:C, 3r5j:A, 3r6g:C, 3r6g:A, 3r6l:C, 3r6l:A, 3r7b:C, 3r7n:C, 3r7n:A, 3rjm:A, 3rjm:C
15	4fea:A	170	128	0.3356	0.2882	0.3828	4.64e-23
16	6f6r:A	180	127	0.2945	0.2389	0.3386	1.39e-11	1bmq:A, 6bz9:A, 3d6f:A, 3d6h:A, 3d6m:A, 2h48:A, 2h4w:A, 2h4y:A, 2h51:A, 2h54:A, 2hbq:A, 2hbr:A, 2hby:A, 2hbz:A, 1ibc:A, 1ice:A, 5mmv:A, 5mtk:A, 3ns7:A, 6pzp:A, 1rwk:A, 1rwm:A, 1rwn:A, 1rwo:A, 1rwp:A, 1rwv:A, 1rww:A, 1rwx:A, 1sc3:A
17	7wr6:A	247	131	0.2945	0.1741	0.3282	1.97e-09
18	2rkn:A	77	39	0.0753	0.1429	0.2821	1.5
19	8hwp:A	328	43	0.1027	0.0457	0.3488	1.8	5xtu:A
20	7tcm:A	373	65	0.1096	0.0429	0.2462	1.8	7tcm:B
21	1f7u:A	606	37	0.0959	0.0231	0.3784	3.8	1bs2:A, 1f7v:A
22	4uxh:A	173	18	0.0753	0.0636	0.6111	4.6	4uxh:B, 4uxi:A, 4uxi:B, 4uxj:A, 4uxj:B, 4uxj:C, 4uxj:D, 4uxj:E, 4uxj:F, 4uxj:G, 4uxj:H
23	7vua:A	785	29	0.0890	0.0166	0.4483	6.5	7vua:B

[Back]