Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SGFSKPLHYPPVRRDETVVDDYFGVKVADPYRWLEDPNSEETKEFVDNQEKLANSVLEECELIDKFKQKIIDFVNFPRCG
VPFRRANKYFHFYNSGLQAQNVFQMQDDLDGKPEVLYDPNLGLSLYSVSEDAKYFAFGIHSGLTEWVTIKILKTEDRSYL
PDTLEWVKFSPAIWTHDNKGFFYCPYPPLKEGEDHMTRSAVNQEARYHFLGTDQSEDILLWRDLENPAHHLKCQITDDGK
YFLLYILDGCDDANKVYCLDLTKLPNGLESFRGREDSAPFMKLIDSFDASYTAIANDGSVFTFQTNKDAPRKKLVRVDLN
NPSVWTDLVPESKKDLLESAHAVNENQLILRYLSDVKHVLEIRDLESGALQHRLPIDIGSVDGITARRRDSVVFFKFTSI
LTPGIVYQCDLKNDPTQLKIFRESVVPDFDRSEFEVKQVFVPSKDGTKIPIFIAARKGISLDGSHPCEMHGYGGFGINMM
PTFSASRIVFLKHLGGVFCLANIRGGGEYGEEWHKAGFRDKKQNVFDDFISAAEYLISSGYTKARRVAIEGGANGGLLVA
ACINQRPDLFGCAEANCGVMDMLRFHKFTLGYLWTGDYGCSDKEEEFKWLIKYSPIHNVRRPWEQPGNEETQYPATMILT
ADHDDRVVPLHSFKLLATMQHVLCTSLEDSPQKNPIIARIQRKATMTQIAEVADRYGFMAKALEAPWID

The query sequence (length=709) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5o3w:B 717 719 0.9944 0.9833 0.9805 0.0 5o3u:A, 5o3u:B, 5o3u:C, 5o3u:D, 5o3v:B, 5o3v:A, 5o3w:A, 5o3w:C, 5o3w:D, 5uw3:A, 5uw3:B, 5uw3:C, 5uw5:A, 5uw5:B, 5uw5:C, 5uw6:A, 5uw6:B, 5uw6:C, 5uzw:A, 5uzw:B, 5uzw:C
2 5uw3:D 698 720 0.9647 0.9799 0.9500 0.0 5uw5:D, 5uw6:D, 5uw7:A, 5uw7:B, 5uzw:D
3 4amy:A 710 720 0.4838 0.4831 0.4764 0.0 4amz:A, 4an0:A, 4an1:A, 4bcb:A, 4bcc:A, 4bcd:A, 3ddu:A, 1e8m:A, 1e8n:A, 3eq7:A, 3eq8:A, 3eq9:A, 1h2y:A, 1h2z:A, 1o6f:A, 1o6g:A, 1qfm:A, 1qfs:A, 1uoo:A, 1uop:A, 1uoq:A, 2xdw:A
4 6jci:A 704 719 0.4922 0.4957 0.4854 0.0
5 3muo:A 684 713 0.3865 0.4006 0.3843 2.43e-146 3iuq:A, 3iur:A, 3ivm:A
6 7vgb:A 681 702 0.3512 0.3656 0.3547 8.92e-144 7vgb:B, 7vgc:A
7 7zaz:AAA 727 738 0.3681 0.3590 0.3537 1.31e-136 7zaz:BBB, 7zaz:DDD, 7zb0:A, 7zb0:B, 7zb0:C, 7zb0:D, 7zb1:A, 7zb1:B, 7zb1:C, 7zb1:D, 7zb2:CCC, 7zb2:FFF
8 7zaz:CCC 690 720 0.3667 0.3768 0.3611 2.40e-136
9 5n4b:A 722 746 0.3639 0.3573 0.3458 1.80e-129 5n4b:B, 5n4d:A, 5n4d:B
10 2bkl:B 677 715 0.3343 0.3501 0.3315 1.00e-117 2bkl:A
11 6can:A 616 700 0.2722 0.3133 0.2757 6.66e-57 6can:B, 5t88:A, 5t88:B
12 7ne7:A 677 461 0.1763 0.1846 0.2711 1.02e-43 7ne4:A, 7ne5:A, 7ob1:A, 7ywp:A
13 4bp9:A 710 510 0.2045 0.2042 0.2843 1.33e-40 4bp9:B, 4bp9:C, 4bp9:D, 4bp9:E, 4bp9:F
14 2xe4:A 721 510 0.1918 0.1886 0.2667 2.28e-39
15 4re6:A 577 194 0.0705 0.0867 0.2577 4.01e-06 2hu5:A, 2hu5:B, 2hu7:A, 2hu7:B, 2hu8:A, 2hu8:B, 4re5:A, 4re5:B, 4re6:C, 1ve7:A, 1ve7:B
16 6y0f:C 722 168 0.0536 0.0526 0.2262 0.001 6y0f:A, 6y0f:B, 6y0f:D
17 2gbf:A 730 148 0.0451 0.0438 0.2162 0.001 4ffw:A, 4ffw:B, 2gbg:A, 2gbi:A, 2i3z:A, 2oae:A, 5vta:A, 5vta:B, 5vta:C, 5vta:D
18 2dcm:A 662 157 0.0437 0.0468 0.1975 0.010 2eep:A, 2z3z:A
19 7ayq:A 808 120 0.0480 0.0421 0.2833 0.015 7a3i:A
20 7svm:A 852 120 0.0480 0.0399 0.2833 0.016 7a3g:B, 7a3g:A, 7a3i:B, 7a3i:C, 7a3j:C, 7a3j:A, 7a3j:B, 7a3k:C, 7a3k:A, 7a3k:B, 7a3l:A, 7a3l:B, 7a3l:C, 7ayq:B, 7ayr:A, 7ayr:B, 6eop:A, 6eop:B, 6eop:C, 6eot:A, 6eot:B, 6eot:D, 6eot:G, 6eot:I, 6eot:K, 6hp8:A, 6hp8:B, 6hp8:C, 7or4:B, 7or4:A, 7oz7:A, 7oz7:B, 6qzw:A, 6qzw:B, 6qzw:C, 7svm:B, 7svm:C, 7svo:A, 7svo:B, 7svo:C, 6trw:A, 6trw:B, 6trw:C, 6trx:B, 6trx:C, 6trx:A
21 4n8e:B 734 148 0.0437 0.0422 0.2095 0.028 4a5s:A, 4a5s:B, 2ajl:I, 2ajl:J, 6b1e:A, 6b1e:B, 6b1o:A, 6b1o:B, 2bgn:A, 2bgn:B, 2bgn:C, 2bgn:D, 2bgr:A, 2bgr:B, 3bjm:A, 3bjm:B, 2bub:A, 2bub:B, 3c43:A, 3c43:B, 3c45:A, 3c45:B, 3ccb:A, 3ccb:B, 3ccb:C, 3ccb:D, 3ccc:A, 3ccc:B, 3ccc:C, 3ccc:D, 3d4l:A, 3d4l:B, 4dsa:A, 4dsz:A, 4dsz:B, 4dtc:A, 4dtc:B, 3eio:A, 3eio:B, 3f8s:A, 3f8s:B, 2fjp:A, 2fjp:B, 3g0b:A, 3g0b:B, 3g0b:C, 3g0b:D, 3g0c:A, 3g0c:B, 3g0c:C, 3g0c:D, 3g0d:A, 3g0d:B, 3g0d:C, 3g0d:D, 3g0g:A, 3g0g:B, 3g0g:C, 3g0g:D, 4g1f:A, 4g1f:B, 4g1f:C, 4g1f:D, 2g5p:A, 2g5t:A, 2g63:B, 3h0c:A, 3h0c:B, 3hab:A, 3hab:B, 3hac:A, 3hac:B, 2hha:A, 2hha:B, 2i03:B, 2i78:B, 5i7u:A, 5i7u:B, 2iit:A, 2iit:B, 2iiv:A, 2iiv:B, 5ism:A, 5ism:B, 4j3j:A, 4j3j:B, 5j3j:A, 5j3j:B, 4jh0:A, 4jh0:B, 2jid:A, 2jid:B, 5kby:A, 5kby:B, 5kby:C, 5kby:D, 3kwf:A, 3kwf:B, 3kwj:A, 3kwj:B, 4lko:A, 4lko:B, 1n1m:A, 1n1m:B, 4n8d:A, 4n8d:B, 4n8e:A, 3nox:A, 3nox:B, 1nu8:B, 3o95:A, 3o95:B, 3o95:C, 3o95:D, 3o9v:A, 3o9v:B, 3o9v:C, 3o9v:D, 2oag:B, 3oc0:A, 3oc0:B, 2ogz:A, 2ogz:B, 2ole:A, 2ole:B, 2onc:A, 2onc:B, 2onc:C, 2onc:D, 2oph:A, 2oph:B, 3opm:A, 3opm:B, 3opm:C, 3opm:D, 2oqi:B, 2oqv:A, 2p8s:A, 2p8s:B, 4pnz:A, 4pnz:B, 4pv7:A, 4pv7:B, 3q0t:A, 3q0t:B, 3q8w:A, 3q8w:B, 3qbj:A, 3qbj:B, 2qjr:A, 2qjr:B, 2qky:A, 2qky:B, 2qky:C, 2qky:D, 2qoe:A, 2qoe:B, 2qt9:A, 2qt9:B, 2qtb:A, 2qtb:B, 1r9n:A, 1r9n:B, 1r9n:C, 1r9n:D, 2rgu:A, 2rgu:B, 2rip:A, 1rwq:A, 1rwq:B, 3sww:A, 3sww:B, 3sx4:A, 3sx4:B, 5t4b:A, 5t4b:B, 5t4e:A, 5t4e:B, 5t4f:A, 5t4f:B, 5t4h:A, 5t4h:B, 1tkr:A, 1tkr:B, 3vjk:A, 3vjk:B, 3vjl:A, 3vjl:B, 3vjm:A, 3vjm:B, 3w2t:A, 3w2t:B, 1wcy:A, 1wcy:B, 3wqh:A, 3wqh:B, 1x70:A, 1x70:B, 5y7h:A, 5y7h:B, 5y7j:A, 5y7j:B, 5y7j:C, 5y7j:D, 5y7k:A, 5y7k:B, 5y7k:C, 5y7k:D, 5zid:A, 5zid:B
22 4q1v:A 707 93 0.0310 0.0311 0.2366 0.061 4q1v:B
23 6eor:B 805 120 0.0423 0.0373 0.2500 0.067 6qzv:B
24 5yp2:A 724 85 0.0310 0.0304 0.2588 0.079 5yp2:B, 5yp3:A, 5yp3:B, 5yp3:C, 5yp3:D, 5yp4:A, 5yp4:B, 5yp4:C, 5yp4:D
25 7jn7:A 846 120 0.0423 0.0355 0.2500 0.090 6eor:A, 6eor:C, 6eor:D, 7jn7:D, 6qzv:A, 6qzv:C, 6qzv:D, 7svl:A, 7svl:B, 7svl:C, 7svl:D, 7svn:A, 7svn:B, 7svn:C, 7svn:D, 6x6c:A, 6x6c:D, 7zxs:A, 7zxs:B, 7zxs:C, 7zxs:D
26 7qun:A 694 175 0.0578 0.0591 0.2343 0.20 7qun:B, 7qun:C, 7qun:D
27 4ke8:C 249 113 0.0381 0.1084 0.2389 0.61 4ke6:A, 4ke7:A, 4ke7:B, 4ke8:A, 4ke8:B, 4ke8:D, 4ke9:A, 4ke9:B, 4ke9:C, 4ke9:D
28 2aj8:A 728 151 0.0437 0.0426 0.2053 0.69 2aj8:B, 2aj8:C, 2aj8:D, 2ajb:A, 2ajb:B, 2ajb:C, 2ajb:D, 2ajc:A, 2ajc:B, 2ajc:C, 2ajc:D, 2ajd:A, 2ajd:B, 2ajd:C, 2ajd:D, 2bua:A, 2bua:B, 2bua:C, 2bua:D, 2buc:A, 2buc:B, 2buc:C, 2buc:D, 5lls:A, 5lls:B, 5lls:D, 5lls:C, 1orw:A, 1orw:B, 1orw:C, 1orw:D, 7xnm:B, 7xnm:A
29 6cm9:M 415 76 0.0310 0.0530 0.2895 2.7 6cri:M, 6cri:W, 6cri:X, 8d4c:M, 8d4c:J, 8d4d:M, 8d4d:J, 8d4e:M, 8d4f:M, 8d4f:J, 8d4g:M, 8d4g:J, 6d83:M, 6d84:M, 6d84:P, 8d9r:M, 8d9r:j, 8d9r:k, 8d9r:l, 8d9r:m, 8d9r:n, 8d9s:M, 8d9s:j, 8d9s:k, 8d9s:l, 8d9s:m, 8d9s:n, 8d9t:M, 8d9t:i, 8d9t:j, 8d9t:k, 8d9t:l, 8d9t:m, 8d9u:M, 8d9u:i, 8d9u:j, 8d9u:k, 8d9u:l, 8d9u:m, 8d9v:M, 8d9v:J, 6dff:M, 4emz:M, 4emz:A, 4en2:M, 4en2:A, 4p6z:M, 7ux3:M
30 8d9w:a 322 76 0.0310 0.0683 0.2895 3.4 8d9w:M
31 7koe:A 282 54 0.0197 0.0496 0.2593 3.5 7koe:E
32 5ud0:A 282 174 0.0522 0.1312 0.2126 3.8 5ud1:A, 5ud1:B
33 5oqd:C 192 40 0.0183 0.0677 0.3250 5.4 5oqd:B, 5oqd:A, 5oqd:D, 5oqd:E, 5oqd:F
34 6fhq:A 58 38 0.0212 0.2586 0.3947 6.9 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
35 2miq:A 94 45 0.0226 0.1702 0.3556 7.3
36 6st5:A 913 64 0.0240 0.0186 0.2656 8.0
37 1cvm:A 353 147 0.0437 0.0878 0.2109 8.6 3amr:A, 3ams:A, 1h6l:A, 1poo:A, 2poo:A, 1qlg:A
38 6sg9:DG 566 46 0.0197 0.0247 0.3043 8.8 7pua:DG, 6sgb:DG

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218