BioLiP

>protein
SFRFGQCLIKPSVVFLKTELSFALVNRKPVVPGHVLVCPLRPVERFHDLRPDEVADLFQTTQRVGTVVEKHFHGTSLTFS
MQDGPEAGQTVKHVNVHVLPRKAGDFHRNDSIYEELQKHSWRSEEEMAAEAAALRVYFQ

The query sequence (length=139) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7p8p:B	147	146	1.0000	0.9456	0.9521	2.13e-99	7p8p:D
2	2fit:A	130	139	0.8993	0.9615	0.8993	1.92e-85	1fhi:A, 2fhi:A, 1fit:A, 3fit:A, 5fit:A, 6fit:A, 7p8p:A, 7p8p:C
3	5cs2:A	147	138	0.3237	0.3061	0.3261	5.81e-25
4	3ano:A	158	95	0.2230	0.1962	0.3263	1.76e-10
5	3ano:B	175	95	0.2230	0.1771	0.3263	2.85e-10
6	3o0m:A	139	96	0.2086	0.2086	0.3021	6.03e-10	3o0m:B
7	2eo4:A	149	84	0.1727	0.1611	0.2857	1.40e-08
8	1y23:B	141	127	0.2302	0.2270	0.2520	2.36e-07	1y23:A, 1y23:C, 1y23:D, 1y23:E
9	3imi:A	143	105	0.1871	0.1818	0.2476	6.88e-07	3imi:B, 3imi:C, 3imi:D
10	3l7x:A	157	120	0.2302	0.2038	0.2667	1.17e-06
11	6iq1:B	145	125	0.1942	0.1862	0.2160	3.22e-06	6iq1:A, 6iq1:C, 6iq1:D
12	3oxk:A	115	93	0.1799	0.2174	0.2688	5.17e-06	3oj7:A, 3omf:A
13	4egu:A	118	94	0.2014	0.2373	0.2979	1.88e-05	4egu:B
14	3r6f:A	130	96	0.2014	0.2154	0.2917	3.63e-05
15	3ksv:A	141	91	0.1583	0.1560	0.2418	8.75e-04
16	4zgl:F	102	90	0.2086	0.2843	0.3222	0.003	4zgl:B, 4zgl:C, 4zgl:H, 4zgl:I
17	5uvm:A	115	92	0.1727	0.2087	0.2609	0.010	5uvm:B
18	6yqm:AAA	117	100	0.1871	0.2222	0.2600	0.043	1av5:B, 6b42:A, 5ed3:B, 5ed6:B, 5emt:A, 5emt:B, 4eqe:B, 4eqg:B, 4eqh:B, 5i2e:A, 5i2e:B, 5i2f:A, 5ipc:A, 5ipd:A, 5ipe:A, 6j53:B, 6j58:B, 6j5s:B, 6j5z:A, 6j5z:D, 6j64:B, 6j65:B, 6j65:E, 5kly:A, 5kly:B, 5klz:B, 5km0:A, 5km0:D, 5km1:A, 5km2:A, 5km3:A, 5km4:A, 5km6:A, 5kma:A, 5kmb:A, 5kmb:B, 5kmc:A, 1kpe:B, 1kpf:A, 6n3v:A, 6n3w:A, 6n3x:A, 6n3y:A, 6n3y:B, 3o1c:A, 3o1x:A, 5o8i:B, 8p8p:A, 8pa6:A, 8pa6:B, 8pa9:A, 8paf:A, 8paf:B, 8pai:A, 8pwk:A, 3qgz:A, 3rhn:A, 4rhn:A, 5rhn:A, 1rzy:A, 3tw2:A, 5wa8:A, 5wa9:A, 4zkl:B, 4zkl:D
19	4ini:B	112	89	0.1367	0.1696	0.2135	0.061	4ini:A, 5km5:B, 5km8:B, 5km9:B, 6yvp:AAA, 6yvp:BBB
20	2oik:C	141	89	0.1799	0.1773	0.2809	0.080	2oik:A, 2oik:B, 2oik:D
21	2y1d:A	359	111	0.2086	0.0808	0.2613	0.36
22	4s17:A	452	35	0.1007	0.0310	0.4000	0.41	4s17:B, 4s17:C, 4s17:D, 4s17:E, 4s17:F
23	4aic:A	379	72	0.1727	0.0633	0.3333	0.46	4a03:A, 4a03:B, 4aic:B, 2c82:A, 2c82:B, 2jcv:A, 2jcv:B, 2jcx:A, 2jcx:B, 2jd0:A, 2jd1:A, 2jd1:B, 2jd2:A, 2jd2:B, 4ooe:A, 4ooe:B, 4ooe:C, 4ooe:D, 4oof:A, 4oof:B, 3ras:A, 3ras:B, 4rcv:A, 4rcv:B, 2y1c:A, 2y1c:B, 2y1d:B, 2y1e:A, 2y1e:B, 2y1f:A, 2y1f:B, 2y1g:A, 2y1g:B, 3zhx:A, 3zhx:B, 3zhy:A, 3zhy:B, 3zhz:A, 3zi0:A, 3zi0:B
24	8e73:V2	222	46	0.0935	0.0586	0.2826	1.3	6x89:V2
25	1c0a:A	585	53	0.1151	0.0274	0.3019	3.8	1il2:A, 1il2:B
26	3frk:A	365	71	0.1151	0.0438	0.2254	4.1	3frk:B
27	5yzg:D	1908	98	0.1727	0.0126	0.2449	7.1	6ahd:D, 8bc8:B, 8bc9:B, 8bca:B, 8bcb:B, 8bcc:B, 8bcd:B, 8bce:B, 8bcf:B, 8bcg:B, 8bch:B, 7bdi:B, 7bdj:B, 7bdk:B, 7bdl:B, 4f92:B, 4f93:B, 6ff7:r, 8h6k:5D, 8h6l:5D, 4kit:B, 5o9z:C, 7os1:B, 8qo9:B, 8qzs:B, 5urj:A, 5urk:A, 5urm:A, 5urm:B, 5xjc:D
28	8p14:A	331	79	0.1727	0.0725	0.3038	8.7	8hje:A, 7tuo:A
29	5j67:C	563	28	0.0791	0.0195	0.3929	9.3	5j67:A, 5j68:A

[Back]