Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SFIKALQTAQQNFVVTDPSLPDNPIVYASQGFLNLTGYSLDQILGRNCRFLQGPETDPKAVERIRKAIEQGNDMSVCLLN
YRVDGTTFWNQFFIAALRDAGGNVTNFVGVQCKVSDQYAATVTKQQEEEEE

The query sequence (length=131) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6t74:B 141 131 0.9924 0.9220 0.9924 3.62e-95 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
2 6i21:A 135 130 0.7099 0.6889 0.7154 1.63e-71 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
3 3ue6:E 138 129 0.7176 0.6812 0.7287 4.61e-69 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
4 4hhd:A 152 108 0.4427 0.3816 0.5370 2.66e-40 4hhd:B
5 8qi8:A 110 108 0.4427 0.5273 0.5370 4.01e-39 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
6 2z6c:A 121 113 0.4275 0.4628 0.4956 1.38e-38 2z6c:B
7 2z6d:A 118 111 0.4351 0.4831 0.5135 7.49e-38 2z6d:B
8 2wkp:A 320 106 0.4427 0.1812 0.5472 8.83e-38 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
9 7tbq:A 375 108 0.4427 0.1547 0.5370 2.40e-37 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
10 7qf2:AAA 117 103 0.4122 0.4615 0.5243 1.79e-36 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
11 5hzh:A 320 106 0.4351 0.1781 0.5377 2.71e-36
12 4eeu:A 109 107 0.4122 0.4954 0.5047 9.55e-36 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
13 7tcd:A 436 106 0.4351 0.1307 0.5377 1.08e-35 4wf0:A, 4wf0:B
14 1g28:A 104 101 0.4046 0.5096 0.5248 1.44e-35 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
15 5hzi:A 476 106 0.4351 0.1197 0.5377 1.59e-35 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
16 6gb3:A 120 106 0.3893 0.4250 0.4811 7.34e-33 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
17 2mwg:A 261 114 0.4046 0.2031 0.4649 4.80e-32 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
18 4gcz:B 378 128 0.4275 0.1481 0.4375 3.94e-31 4gcz:A
19 8pm1:A 109 106 0.3893 0.4679 0.4811 5.76e-31 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
20 8j68:A 129 111 0.3817 0.3876 0.4505 3.54e-30 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
21 6ph4:B 460 128 0.3817 0.1087 0.3906 1.58e-29 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
22 6hmj:A 359 129 0.3740 0.1365 0.3798 9.84e-29 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
23 4r3a:A 318 118 0.3588 0.1478 0.3983 1.42e-26 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
24 8a5r:AAA 206 103 0.3282 0.2087 0.4175 5.43e-25 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
25 7oo9:A 106 104 0.3969 0.4906 0.5000 6.61e-25 7oo9:B
26 8c05:A 305 122 0.3282 0.1410 0.3525 4.80e-24
27 4r3a:B 278 103 0.3206 0.1511 0.4078 1.73e-23
28 7r5n:B 151 117 0.3359 0.2914 0.3761 8.91e-23 7r5n:A
29 7yx0:A 166 118 0.3511 0.2771 0.3898 2.23e-22 7yx0:C
30 5svu:B 135 115 0.3359 0.3259 0.3826 1.57e-21 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
31 7r56:A 137 105 0.3206 0.3066 0.4000 2.24e-21 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
32 7wa4:B 107 100 0.3053 0.3738 0.4000 7.79e-21
33 4wuj:C 145 92 0.3282 0.2966 0.4674 1.73e-20 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
34 7a6p:A 149 115 0.2977 0.2617 0.3391 3.93e-20 7a6p:B
35 3hjk:A 150 112 0.3130 0.2733 0.3661 2.14e-19 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
36 8a6x:B 368 126 0.3130 0.1114 0.3254 2.09e-18 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
37 4hj6:B 178 103 0.2901 0.2135 0.3689 2.27e-16 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
38 7yid:A 660 126 0.2519 0.0500 0.2619 4.98e-10 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
39 2gj3:A 119 94 0.1756 0.1933 0.2447 1.95e-06 2gj3:B
40 3ewk:A 227 96 0.1679 0.0969 0.2292 3.48e-05
41 3ewk:A 227 114 0.1832 0.1057 0.2105 7.84e-04
42 1s66:L 119 71 0.1527 0.1681 0.2817 0.16 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
43 6pl0:B 608 78 0.1298 0.0280 0.2179 0.41 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
44 8pty:C 440 115 0.2443 0.0727 0.2783 0.87 8avg:C
45 8ptx:C 538 115 0.2443 0.0595 0.2783 0.89 8ptz:C, 8pu0:C
46 3bwx:A 285 30 0.0840 0.0386 0.3667 3.3
47 6vsu:E 318 25 0.1069 0.0440 0.5600 5.2 6vsu:A, 6vsu:B, 6vsu:C, 6vsu:D, 6vsu:F, 6vsu:G, 6vsu:I, 6vsu:H, 6vsu:J, 6vsu:K, 6vsu:L, 6vsu:M, 6vsu:N, 6vsu:O, 6vsu:P, 6vsu:Q, 6vsu:R, 6vsu:S, 6vsu:T, 6vsu:U, 6vsu:V, 6vsu:W, 6vsu:X
48 1e6y:A 568 39 0.0992 0.0229 0.3333 5.5 1e6y:D, 8gf5:A, 8gf5:B
49 8iav:C 460 39 0.1145 0.0326 0.3846 5.6 8iav:D
50 4bwr:A 467 65 0.1679 0.0471 0.3385 6.1
51 1d06:A 130 98 0.1756 0.1769 0.2347 6.7 1ew0:A
52 4koa:A 333 38 0.0840 0.0330 0.2895 7.1
53 6mfb:D 386 46 0.0992 0.0337 0.2826 7.4 6mfb:A, 6mfb:B, 6mfb:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218