BioLiP

>protein
SETGEMGILWEFDPIINKWIRLSMKLKVERKPFAEGALREAYHTVSLGVGTDENYPLGTTTKLFPPIEMISPISKNNEAM
TQLKNGTKFVLKLYKKASRELYFEDVKMQMVCRDWGNKFNQKKPPKKIEFLMSWVVELIDRSPSSNGQPILCSIEPLLVG
EFKKNNSNYGAVLTNRSTPQAFSHFTYELSNKQMIVVDIQGVDDLYTDPQIHTPDGKGFGLGNLGKAGINKFITTHKCNA
VCALLDLDVK

The query sequence (length=250) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4zme:A	262	252	1.0000	0.9542	0.9921	0.0	5dyj:A, 5dyj:B, 5e4h:A, 5e4h:B, 5e4h:C, 5e4h:D, 5e4h:E, 5e4h:F, 5e4h:G, 5e4h:H, 5e9e:A, 5e9e:B, 3lkm:A, 3lla:A, 3lla:B, 3lmh:A, 3lmh:B, 3lmi:A, 3lmi:B, 3lmi:C, 3lmi:D, 3pdt:A, 4zme:B, 4zmf:A, 4zmf:B, 4zs4:A, 4zs4:B
2	8gm4:A	462	238	0.3640	0.1970	0.3824	1.04e-48
3	8fny:A	497	239	0.3600	0.1811	0.3766	9.39e-48	8fny:C, 8fo6:A, 8gm5:A, 7shq:A
4	4kuj:B	268	271	0.2640	0.2463	0.2435	2.19e-16	4kuj:A, 4nl0:A, 4nl0:B
5	1ia9:B	280	160	0.2080	0.1857	0.3250	1.59e-15	1ia9:A, 1iah:A, 1iah:B, 1iaj:B
6	1iaj:A	253	155	0.1840	0.1818	0.2968	4.22e-11
7	4amc:A	1019	51	0.0640	0.0157	0.3137	0.18
8	6h6c:A	151	90	0.1000	0.1656	0.2778	0.33	5eet:A, 5eoh:A, 5eqm:A, 5eu2:A, 5ev5:A, 5eyj:A, 5eys:A, 6eye:A, 5f0b:A, 5f2a:A, 3gk9:A, 3gkt:A, 3gln:A, 8grz:A, 6h5z:A, 6h6i:A, 6h6j:A, 6i3t:A, 6i40:A, 5mjc:A, 5mjd:A, 4mpm:A, 4mpm:B, 4mu5:A, 5nvi:A, 5nw6:A, 4nzi:A, 4o1t:A, 5o17:A, 5o18:A, 5o1k:A, 4o2g:A, 5o27:A, 4o35:A, 4o4t:A, 4o4z:A, 7ohd:A, 1oj6:A, 1oj6:B, 1oj6:C, 1oj6:D, 1q1f:A, 6r1q:A, 6ra6:A, 7vqg:A, 2vry:A, 1w92:A
9	3gon:A	329	52	0.0680	0.0517	0.3269	1.0
10	3fvb:A	161	103	0.1160	0.1801	0.2816	3.0	3fvb:B, 8sqo:A, 8sqp:A, 8sqq:A, 8sqr:A, 8sqt:A
11	7d6v:C	264	32	0.0520	0.0492	0.4062	6.4	7d6x:C
12	4lqf:A	78	30	0.0280	0.0897	0.2333	8.1

[Back]