Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SELLVNTKSGKVMGTRVPVLSSHISAFLGIPFAEPPVGNMRFRRPEPKKPWSGVWNASTYPNNCQQYVDEQFPGFSGSEM
WNPNREMSEDCLYLNIWVPSPRPKSTTVMVWIYGGGFYSGSSTLDVYNGKYLAYTEEVVLVSLSYRVGAFGFLALHGSQE
APGNVGLLDQRMALQWVHDNIQFFGGDPKTVTIFGESAGGASVGMHILSPGSRDLFRRAILQSGSPNCPWASVSVAEGRR
RAVELGRNLNCNLNSDEELIHCLREKKPQELIDVEWNVLPFDSIFRFSFVPVIDGEFFPTSLESMLNSGNFKKTQILLGV
NKDEGSFFLLYGAPGFSKDSESKISREDFMSGVKLSVPHANDLGLDAVTLQYTDWMDDNNGIKNRDGLDDIVGDHNVICP
LMHFVNKYTKFGNGTYLYFFNHRASNLVWPEWMGVIHGYEIEFVFGLPLVKELNYTAEEEALSRRIMHYWATFAKTGNPN
ESKWPLFTTKEQKFIDLNTEPMKVHQRLRVQMCVFWNQFLPKLLNA

The query sequence (length=526) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5ei5:A 534 531 1.0000 0.9850 0.9906 0.0 1acj:A, 1acl:A, 2ace:A, 2ack:A, 7ais:A, 7ais:B, 7ait:A, 7ait:B, 7aiu:A, 7aiu:B, 7aiv:B, 7aiw:A, 7aiw:B, 7aix:A, 1amn:A, 1ax9:A, 7b38:A, 7b8e:A, 2bag:A, 5bwb:A, 5bwc:A, 2c4h:A, 2c58:A, 2c5f:A, 2c5g:A, 2cek:A, 1cfj:A, 2ckm:A, 2cmf:A, 5dlp:A, 1dx6:A, 5e2i:A, 1e3q:A, 5e4j:A, 5e4t:A, 1e66:A, 5ehx:A, 6euc:A, 1eve:A, 6ewk:A, 6ezg:A, 6ezg:B, 6ezh:A, 6ezh:B, 6fld:A, 6fqn:A, 6g17:A, 6g1u:A, 6g1u:B, 6g1v:A, 6g1v:B, 6g1w:A, 6g1w:B, 6g4m:A, 6g4m:B, 6g4n:A, 6g4n:B, 6g4o:A, 6g4o:B, 6g4p:A, 6g4p:B, 1gpk:A, 1gpn:A, 1gqr:A, 1gqs:A, 6h12:A, 6h12:B, 6h13:A, 6h13:B, 6h14:A, 6h14:B, 1h22:A, 1h23:A, 1hbj:A, 3i6m:A, 3i6z:A, 5ih7:A, 2j3d:A, 2j3q:A, 2j4f:A, 1jjb:A, 5nap:A, 5nau:A, 5nuu:A, 1oce:A, 1odc:A, 1qti:A, 1som:A, 6tt0:A, 4tvk:A, 1u65:A, 1ut6:A, 2v96:A, 2v96:B, 2v97:A, 2v97:B, 2v98:A, 2v98:B, 2vja:A, 2vja:B, 2vjb:A, 2vjb:B, 2vjc:A, 2vjc:B, 2vjd:A, 2vjd:B, 1vot:A, 2vq6:A, 1vxo:A, 1vxr:A, 1w4l:A, 1w6r:A, 2w6c:X, 4w63:A, 1w76:A, 1w76:B, 2wfz:A, 2wg0:A, 2wg1:A, 2wg2:A, 4x3c:A, 2xi4:A, 2xi4:B, 1zgb:A, 1zgc:A, 1zgc:B, 3zv7:A
2 4qww:A 529 526 0.6654 0.6616 0.6654 0.0 4qww:B
3 4bc0:A 542 536 0.5970 0.5793 0.5858 0.0 4a16:A, 4a16:B, 4a16:C, 4a16:D, 4a23:A, 4a23:B, 4ara:A, 4ara:B, 4arb:A, 4arb:B, 4b7z:A, 4b7z:B, 4b80:A, 4b80:B, 4b81:A, 4b81:B, 4b82:A, 4b82:B, 4b83:A, 4b83:B, 4b84:A, 4b84:B, 4b85:A, 4b85:B, 4bc0:B, 4bc0:C, 4bc0:D, 4bc1:A, 4bc1:B, 4bc1:C, 4bc1:D, 4btl:A, 4btl:B, 2c0p:A, 2c0p:B, 2c0q:A, 2c0q:B, 5dtj:A, 5dtj:B, 5ehn:A, 5ehn:B, 5ehq:A, 5ehq:B, 5ehz:A, 5ehz:B, 5eia:A, 5eia:B, 5eie:A, 5eie:B, 5eih:A, 5eih:B, 5fkj:A, 5fkj:D, 5fkj:B, 5fkj:C, 5foq:A, 5foq:B, 5fpp:A, 5fpp:B, 6fsd:A, 6fsd:B, 6fse:A, 6fse:B, 5fum:A, 5fum:B, 2gyu:A, 2gyu:B, 2gyv:A, 2gyv:B, 2gyw:A, 2gyw:B, 2h9y:A, 2h9y:B, 2ha0:A, 2ha0:B, 2ha2:A, 2ha2:B, 2ha3:A, 2ha3:B, 2ha4:A, 2ha4:B, 2ha5:A, 2ha5:B, 2ha6:A, 2ha6:B, 2ha7:A, 2ha7:B, 1j06:A, 1j06:B, 1j07:A, 1j07:B, 2jey:A, 2jey:B, 2jez:A, 2jez:B, 2jf0:A, 2jf0:B, 1maa:A, 1maa:B, 1maa:C, 1maa:D, 1n5m:A, 1n5m:B, 1n5r:A, 8orc:A, 8orc:B, 5ov9:A, 5ov9:B, 1q83:A, 1q83:B, 1q84:A, 1q84:B, 7qak:A, 7qak:B, 7qb4:A, 7qb4:B, 7qyn:A, 7qyn:B, 7r02:A, 7r02:B, 7r0a:A, 7r0a:B, 7r2f:A, 7r2f:B, 7r3c:A, 7r3c:B, 7r4e:A, 7r4e:B, 6td2:A, 6td2:B, 2whp:A, 2whp:B, 2whq:A, 2whq:B, 2whr:A, 2whr:B, 2wls:A, 2wls:B, 2wu3:A, 2wu3:B, 2wu4:A, 2wu4:B, 2xud:A, 2xuf:A, 2xuf:B, 2xug:A, 2xug:B, 2xuh:A, 2xuh:B, 2xui:A, 2xui:B, 2xuj:A, 2xuj:B, 2xuk:A, 2xuk:B, 2xuo:A, 2xuo:B, 2xup:A, 2xup:B, 2xuq:A, 2xuq:B, 3zlu:B, 3zlv:A, 3zlv:B
4 4bdt:A 563 537 0.5875 0.5488 0.5754 0.0 8aen:B, 8aen:A, 8aev:A, 8aev:B, 6cqt:A, 6cqt:B, 6cqu:A, 6cqu:B, 6cqv:A, 6cqv:B, 6cqw:A, 6cqw:B, 6cqx:A, 6cqx:B, 6cqy:A, 6cqy:B, 6cqz:A, 6cqz:B, 7d9o:A, 7d9o:B, 7d9p:A, 7d9p:B, 7d9q:A, 7d9q:B, 8dt4:A, 8dt4:B, 8dt5:A, 8dt5:B, 8dt7:A, 8dt7:B, 7e3h:A, 7e3h:B, 4ey5:A, 4ey5:B, 4ey6:A, 4ey6:B, 4ey7:A, 4ey7:B, 6f25:A, 6f25:B, 5hf6:B, 5hf6:A, 5hf8:A, 5hf8:B, 5hf9:A, 5hf9:B, 5hfa:A, 5hfa:B, 5hq3:A, 5hq3:B, 4m0e:A, 4m0e:B, 4m0f:A, 4m0f:B, 6nea:A, 6nea:B, 6ntg:A, 6ntg:B, 6nth:A, 6nth:B, 6ntk:A, 6ntk:B, 6ntl:A, 6ntl:B, 6ntm:A, 6ntm:B, 6ntn:A, 6ntn:B, 6nto:A, 6nto:B, 6o4w:A, 6o4w:B, 6o4x:A, 6o4x:B, 6o50:A, 6o50:B, 6o52:A, 6o52:B, 6o5r:A, 6o5r:B, 6o5s:A, 6o5s:B, 6o5v:A, 6o5v:B, 6o66:A, 6o66:B, 7p1n:aa, 7p1n:A, 7p1n:bb, 7p1p:aa, 7p1p:A, 7p1p:bb, 7rb5:A, 7rb6:A, 7rb6:B, 7rb7:A, 7rb7:B, 6u34:A, 6u34:B, 6u37:A, 6u37:B, 6u3p:A, 6wuv:A, 6wuv:B, 6wuy:A, 6wuy:B, 6wuz:A, 6wuz:B, 6wv1:A, 6wv1:B, 6wvc:A, 6wvc:B, 6wvo:A, 6wvo:B, 6wvp:A, 6wvp:B, 6wvq:A, 6wvq:B, 7xn1:A, 7xn1:B, 6zwe:A
5 6i2t:B 562 527 0.5380 0.5036 0.5370 0.0 7aiy:A, 8ai7:F, 7amz:A, 8am1:A, 8am2:A, 4aqd:A, 4aqd:B, 7awg:A, 7awh:A, 7awi:A, 4axb:A, 4b0o:A, 4b0p:A, 4bbz:A, 4bds:A, 7bgc:A, 7bo3:A, 7bo4:A, 8cgo:A, 3djy:A, 3dkk:A, 5dyt:A, 5dyt:B, 5dyw:A, 5dyw:B, 5dyy:A, 5dyy:B, 6ep4:A, 6eqp:A, 6eqq:A, 6esj:A, 6esj:B, 6esy:B, 6esy:A, 6eyf:A, 6f7q:A, 6f7q:B, 6i0b:A, 6i0c:A, 6i2t:A, 6i2t:C, 6i2t:D, 2j4c:A, 5k5e:A, 5k5e:B, 5lkr:A, 5lkr:B, 5nn0:A, 3o9m:A, 3o9m:B, 1p0i:A, 1p0m:A, 1p0p:A, 1p0q:A, 7q1m:A, 7q1n:A, 7q1o:A, 7q1p:A, 6qaa:A, 6qab:A, 6qac:A, 6qad:A, 6qae:A, 7qbq:A, 7qbr:A, 7qhd:A, 7qhe:A, 6r6v:A, 6r6w:A, 6rua:A, 6rua:B, 6sam:A, 6t9p:A, 6t9s:A, 4tpk:A, 4tpk:B, 2wid:A, 2wif:A, 2wig:A, 2wij:A, 2wik:A, 2wil:B, 2wil:A, 2wsl:A, 4xii:A, 4xii:B, 1xlu:A, 1xlv:A, 1xlw:A, 2xmb:A, 2xmc:A, 2xmd:A, 2xmg:A, 2xqf:A, 2xqg:A, 2xqi:A, 2xqj:A, 2xqk:A, 6xta:A, 2y1k:A, 7zpb:A, 6zwi:A
6 5ydj:B 538 535 0.4753 0.4647 0.4673 4.13e-176 6ary:A, 6ary:B
7 6xyu:A 537 541 0.3992 0.3911 0.3882 1.97e-137 6xys:A, 6xyy:A
8 8axc:B 532 541 0.3612 0.3571 0.3512 3.61e-88 8axc:A, 8axc:C, 8axc:D
9 1aql:A 532 541 0.3251 0.3214 0.3161 1.96e-83 1aql:B
10 1mx9:D 533 550 0.3669 0.3621 0.3509 4.51e-83 2dqy:A, 2dqy:B, 2dqy:C, 2dqz:A, 2dqz:B, 2dqz:C, 2dr0:A, 2dr0:B, 2dr0:C, 2h7c:A, 2h7c:F, 2h7c:B, 2h7c:D, 2h7c:C, 2h7c:E, 2hrq:A, 2hrq:B, 2hrq:C, 2hrq:D, 2hrq:E, 2hrq:F, 2hrr:A, 2hrr:B, 2hrr:C, 1mx1:A, 1mx1:B, 1mx1:C, 1mx1:D, 1mx1:E, 1mx1:F, 1mx5:A, 1mx5:B, 1mx5:C, 1mx5:D, 1mx5:E, 1mx5:F, 1mx9:A, 1mx9:B, 1mx9:C, 1mx9:E, 1mx9:F, 1mx9:G, 1mx9:H, 1mx9:I, 1mx9:J, 1mx9:K, 1mx9:L, 1ya4:A, 1ya4:B, 1ya4:C, 1ya8:A, 1ya8:B, 1ya8:C, 1yah:A, 1yah:B, 1yah:C, 1yaj:A, 1yaj:B, 1yaj:D, 1yaj:E, 1yaj:F, 1yaj:G, 1yaj:H, 1yaj:I, 1yaj:J, 1yaj:K, 1yaj:L
11 3k9b:B 499 536 0.3593 0.3788 0.3526 3.20e-79 3k9b:A
12 1k4y:A 501 538 0.3422 0.3593 0.3346 6.17e-79
13 3k9b:C 453 527 0.3403 0.3951 0.3397 1.12e-74
14 6h18:A 523 541 0.3175 0.3193 0.3087 1.25e-70 6h0t:A, 6h0v:A, 6h19:A, 6h1a:A
15 1c7i:A 483 506 0.3023 0.3292 0.3142 7.17e-69 1qe3:A
16 7w1i:A 497 509 0.3080 0.3260 0.3183 1.28e-62 7w1j:A, 7w1l:A
17 4fnm:A 569 502 0.2890 0.2671 0.3028 2.01e-60 5ch5:A, 5ivi:A, 5ivk:A, 4qwm:A, 5tyj:A, 5tyk:A, 5tyl:A, 5tym:A, 5tyn:A, 5tyo:A, 5typ:A, 4ubi:A, 4ubj:A, 4ubk:A, 4ubl:A, 4ubm:A, 4ubn:A, 4ubo:A, 4w1p:A, 4w1q:A, 4w1r:A, 4w1s:A
18 7n4y:B 2455 546 0.2928 0.0627 0.2821 2.66e-57 7n4y:A
19 1lpm:A 534 509 0.3156 0.3109 0.3261 1.43e-52 1lpn:A, 1lpo:A, 1lpp:A, 1lps:A, 3rar:A
20 7mp4:A 534 517 0.2871 0.2828 0.2921 2.58e-52 7mp4:B, 7mp4:C, 7mp4:D, 7mp4:E, 7mp4:F, 7mp4:G, 7mp4:H
21 1cle:A 534 512 0.3004 0.2959 0.3086 1.13e-47 1cle:B, 1llf:A, 1llf:B
22 5thm:A 520 312 0.2053 0.2077 0.3462 1.50e-42
23 2fj0:A 530 337 0.1996 0.1981 0.3116 2.82e-39
24 4be9:A 538 559 0.2928 0.2862 0.2755 1.04e-37 4be9:B, 4upd:A, 4upd:B
25 5aob:A 278 114 0.0608 0.1151 0.2807 3.20e-04 5aoc:A, 7bfr:A
26 6i8d:A 315 94 0.0475 0.0794 0.2660 0.001 6i8d:B, 6rb0:A, 6rb0:B, 6rky:A, 6rky:B, 6rky:C, 6rky:D
27 6iey:A 307 111 0.0627 0.1075 0.2973 0.002
28 7auy:B 245 104 0.0513 0.1102 0.2596 0.002
29 7at3:A 295 104 0.0513 0.0915 0.2596 0.002 7at3:B, 7at4:A, 7atd:B, 7atf:A, 7atf:B, 7atq:A, 7auy:A, 7av5:AAA, 7av5:BBB, 7nb5:A
30 5hc2:A 343 124 0.0646 0.0991 0.2742 0.003 5hc0:A, 5hc2:B, 5hc2:C, 5hc2:D, 5hc3:B, 5hc3:D, 5hc4:A
31 1qz3:A 309 143 0.0665 0.1133 0.2448 0.037
32 4n5i:X 311 145 0.0684 0.1158 0.2483 0.073 4ouk:X, 4po3:X
33 6sxy:B 340 124 0.0608 0.0941 0.2581 0.17 8pc7:A, 8pc7:B, 8pc7:C, 8pc7:D, 6sxy:A, 6sya:A, 6sya:B, 6syl:A, 6syl:B
34 8idy:u 554 52 0.0228 0.0217 0.2308 0.70 8inf:f, 8ink:N, 8ipy:N
35 7v2b:D 376 54 0.0323 0.0452 0.3148 1.1 7v2b:A, 7v3w:A, 7v3w:D
36 6xyc:A 285 109 0.0456 0.0842 0.2202 2.5
37 7aor:g 184 56 0.0304 0.0870 0.2857 2.8
38 3tr9:A 277 49 0.0266 0.0505 0.2857 3.2 3tr9:B, 3tr9:C, 3tr9:D
39 1ay0:A 678 55 0.0361 0.0280 0.3455 3.3 1ay0:B, 1gpu:A, 1gpu:B, 1ngs:A, 1ngs:B, 1tka:A, 1tka:B, 1tkb:A, 1tkb:B, 1tkc:A, 1tkc:B, 1trk:A, 1trk:B
40 6u1d:B 326 55 0.0342 0.0552 0.3273 3.6 6u1d:A, 6u1e:A, 6u1e:B, 6u1f:A, 6u1f:B, 6u1g:A, 6u1g:B, 6u1h:A, 6u1h:B, 6u1h:C, 6u1i:C, 6u1j:A, 6u1j:C, 6u1k:A, 6u1k:B, 6u1k:C, 6u1k:D, 2yzm:A, 2yzm:B, 2yzm:C, 2yzn:A, 2yzn:B, 2yzn:C, 2zdg:A, 2zdg:B, 2zdg:C, 2zdg:D, 2zdh:A, 2zdh:B, 2zdh:C, 2zdh:D, 2zdq:A, 2zdq:B
41 7cih:C 311 95 0.0475 0.0804 0.2632 3.7 7ci0:A, 7ci0:B, 7ci0:C, 7ci0:D, 7cih:A, 7cih:B, 7cih:D, 7cip:A, 7cip:B, 7cip:C, 7cip:D, 6keu:A, 6keu:B, 6keu:C, 6keu:D, 6kf1:A, 6kf1:B, 6kf1:C, 6kf1:D, 6kf5:A, 6kf5:B, 6kf5:C, 6kf5:D, 6kf7:A, 6kf7:B, 6kf7:C, 6kf7:D, 7w8n:A, 7w8n:B, 7w8n:C, 7w8n:D
42 6u1h:D 305 55 0.0342 0.0590 0.3273 3.8 6u1i:A
43 1g60:A 238 54 0.0342 0.0756 0.3333 5.9 1g60:B
44 6gzv:C 238 102 0.0513 0.1134 0.2647 6.2 6zcl:C
45 2f1w:A 144 70 0.0380 0.1389 0.2857 7.0 2foj:A, 2foo:A, 2fop:A, 4jjq:A, 4kg9:A, 3mqr:A, 3mqs:C, 2xxn:A, 4ysi:A, 1yy6:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218