BioLiP

>protein
SELLLQRRLATTALKQPKELGYYSTNVGGELKVMDESNLSYYYLPDADIEKHIDLSAGARKFQDEQAEAEDDTGSLHGLL
QTLMEYERRKSKKVNADIIAFRGQVKRLIHCAFGGHATDVDMYVMSFDGQLFIRAARKKLEFPTSPRESWAYLAYYSGYK
FERMALLDRPVAETPREVLESRGKQVVRNGPQYKTVVRTGVGEHKLVLGAEVDGIFDFREPTGDNLKHYVELKVAKKVQT
LKDATNFEQKLFSVWLQCFLVGINRVIIGFRDEKFVLKSVEEFSTSEIPLLLKSTRNACVDAIKWYGALTKWLCELPRGP
EDDFKLYRLSCSRGALHLRQLHDEDLANGDDIIPGWFREWRRSLS

The query sequence (length=365) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5bte:B	368	365	1.0000	0.9918	1.0000	0.0	5bte:A
2	8k5p:O	346	361	0.4685	0.4942	0.4737	2.57e-111
3	5bud:A	391	391	0.4219	0.3939	0.3939	7.95e-83	5bud:B
4	5ulj:B	386	398	0.4082	0.3860	0.3744	7.08e-73	5ulj:A
5	3fqd:B	332	283	0.2384	0.2620	0.3074	2.34e-29	3fqg:A, 6wui:A
6	6wug:A	312	283	0.2356	0.2756	0.3039	5.45e-25
7	6aix:A	358	295	0.2082	0.2123	0.2576	2.50e-14	6aiy:A, 3fqi:A, 3fqj:A, 4j7l:A, 4j7m:A, 4j7n:A, 5uli:A, 6wre:A, 6wuf:A, 6wuk:A
8	1xxp:A	287	98	0.0712	0.0906	0.2653	0.13	3blt:A, 3blu:A, 3bm8:A, 6drb:A, 3f9a:A, 3f9b:A, 2i42:A, 1pa9:A, 1qz0:A, 1qz0:B, 3u96:A, 3u96:B, 1xxp:B, 1xxv:A, 1xxv:B, 2y2f:A, 2ydu:A, 1ytn:A, 1yts:A, 1ytw:A, 4z6b:A, 4zi4:A, 4zn5:A
9	3zby:B	404	85	0.0603	0.0545	0.2588	1.4	4tri:A, 4tri:B, 4uax:A, 2yoo:A, 2yoo:B, 2yoo:C, 2yoo:D, 3zby:A, 3zby:C, 3zby:D, 3zby:E, 3zby:F
10	6gka:A	178	53	0.0411	0.0843	0.2830	7.0	6gkb:A, 6gkc:A, 7pfb:A, 7pfg:A, 7pfh:A, 7pfi:A, 7pfj:A, 7pfk:A, 6son:A, 6soo:A, 6soq:A, 6sor:A
11	1llw:A	1475	114	0.0932	0.0231	0.2982	9.0	1llz:A, 1lm1:A
12	4a37:B	376	56	0.0521	0.0505	0.3393	10.0	4a37:A, 4a38:A, 4a38:B, 4a39:A, 4a39:B

[Back]