Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SEITLGRYLFERLKQVEVQTIFGLPGDFNLSLLDNIYEVPGMRWAGNANELNAAYAADGYARLKGMSCIITTFGVGELSA
LNGIAGSYAEHVGVLHVVGVPSVHTLGNGDFTVFHRMSSNISETTAMITDINTAPAEIDRCIRTTYVSQRPVYLGLPANL
VDLTVPASLLDTPIDLSLKPNDPEAEEEVIENVLQLIKEAKNPVILADACCSRHDAKAETKKLIDLTQFPAFVTPMGKGS
IDEKHPRFGGVYVGTLSSPAVKEAVESADLVLSVGALSYKTKNIVEFHSDYTKIRSATFPGVQMKFALQKLLTKVADAAK
GYKPVPVPSEPEHNEAVADSTPLKQEWVWTQVGEFLREGDVVITETGTSAFGINQTHFPNNTYGISQVLWGSIGFTTGAT
LGAAFAAEEIDPKKRVILFIGDGSLQLTVQEISTMIRWGLKPYLFVLNNDGYTIERLIHGETAQYNCIQNWQHLELLPTF
GAKDYEAVRVSTTGEWNKLTTDEKFQDNTRIRLIEVMLPTMDAPSNLVKQAQLTAAT

The query sequence (length=537) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6efg:D 537 537 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 6efg:A, 6efg:B
2 2vjy:A 562 558 1.0000 0.9555 0.9624 0.0 6efg:E, 6efh:A, 6efh:B, 2vjy:B, 2vjy:C, 2vjy:D, 2vk4:A, 2vk4:B, 2vk4:C, 2vk4:D
3 2vk1:A 562 558 0.8585 0.8203 0.8262 0.0 1pvd:A, 1pvd:B, 1pyd:A, 1pyd:B, 1qpb:A, 1qpb:B, 2vk1:B, 2vk1:C, 2vk1:D, 2vk8:A, 2vk8:B, 2vk8:C, 2vk8:D, 2w93:A, 2w93:B, 2w93:C, 2w93:D
4 8hp4:A 540 547 0.6778 0.6741 0.6654 0.0 8hp4:B
5 1ovm:A 535 542 0.3948 0.3963 0.3911 1.54e-108 1ovm:B, 1ovm:C, 1ovm:D
6 2vbf:B 546 551 0.3818 0.3755 0.3721 1.67e-108 2vbf:A, 2vbg:A, 2vbg:B
7 6vgs:BBB 543 552 0.3762 0.3720 0.3659 5.15e-105 6vgs:AAA, 6vgs:CCC, 6vgs:DDD
8 5npu:A 547 519 0.3017 0.2962 0.3121 5.75e-72 5npu:B, 5npu:C, 5npu:D
9 2vbi:A 554 560 0.2998 0.2906 0.2875 2.36e-67 2vbi:B, 2vbi:C, 2vbi:D, 2vbi:E, 2vbi:F, 2vbi:G, 2vbi:H
10 4cok:B 549 562 0.3147 0.3078 0.3007 3.68e-59 4cok:A
11 5euj:E 556 560 0.3035 0.2932 0.2911 3.55e-58 5euj:A, 5euj:B, 5euj:C, 5euj:D, 5euj:F, 5euj:G, 5euj:H, 5euj:I, 5euj:J, 5euj:K, 5euj:L, 5euj:M, 5euj:N, 5euj:O, 5euj:P, 5euj:Q, 5euj:R, 5euj:S, 5euj:T, 5euj:U, 5euj:V, 5euj:W, 5euj:X
12 5tma:A 567 572 0.3184 0.3016 0.2990 5.18e-57 3oe1:A, 3oe1:B, 3oe1:C, 3oe1:D, 5tma:B, 2wva:A, 2wva:B, 2wva:E, 2wva:F, 2wva:V, 2wva:Z, 2wva:X, 2wva:Y, 2wvg:A, 2wvg:B, 2wvg:E, 2wvg:F, 1zpd:A, 1zpd:B, 1zpd:E, 1zpd:F, 4zp1:A, 4zp1:B, 4zp1:C, 4zp1:D
13 2q5l:A 538 548 0.2626 0.2621 0.2573 2.08e-35 2nxw:A, 2nxw:B, 2q5j:A, 2q5j:B, 2q5l:B, 2q5o:A, 2q5o:B, 2q5q:A, 2q5q:B
14 6wo1:A 551 484 0.2086 0.2033 0.2314 2.04e-18
15 6deq:A 601 489 0.2160 0.1930 0.2372 2.47e-18 6dek:A, 6del:A, 6dem:A, 6den:A, 6deo:A, 6dep:A, 6der:A, 6des:A
16 1t9b:A 583 490 0.2160 0.1990 0.2367 3.18e-18 1t9d:B, 1t9d:C
17 5k2o:A 585 480 0.2235 0.2051 0.2500 1.09e-17 3e9y:A, 3ea4:A, 8et4:A, 8et5:A, 5k3s:A, 5k6q:A, 5k6r:A, 5k6t:A, 7stq:A, 7tzz:A, 7u1d:A, 7u1u:A, 7u25:A, 6u9h:A, 6u9h:B, 6u9h:H, 6u9h:I, 6u9h:L, 6u9h:M, 6u9h:P, 6u9h:Q, 6vz8:E, 6vz8:I, 6vz8:M, 6vz8:Q, 5wj1:A, 1ybh:A, 1yhy:A, 1yhz:A, 1yi0:A, 1yi1:A, 1z8n:A
18 6u9d:B 607 502 0.2216 0.1960 0.2371 2.33e-17 6bd3:A, 6bd3:B, 6bd9:A, 6bd9:B, 5fem:A, 5fem:B, 5ims:A, 5ims:B, 1jsc:A, 1jsc:B, 1n0h:A, 1n0h:B, 1t9a:A, 1t9a:B, 1t9b:B, 1t9c:A, 1t9c:B, 1t9d:A, 1t9d:D, 6u9d:A, 6u9d:E, 6u9d:F, 6u9d:I, 6u9d:J, 6u9d:M, 6u9d:N, 6u9d:Q, 6u9d:U, 6u9d:V, 5wkc:A, 5wkc:D, 5wkc:B, 5wkc:E
19 8i01:A 594 475 0.2030 0.1835 0.2295 6.25e-16 8beo:A, 8beo:B, 8beo:C, 8beo:E, 8beo:D, 8beo:F, 8i01:B, 8i01:C, 8i01:E, 8i01:D, 8i01:F, 8i05:A, 8i05:B, 8i05:C, 8i05:E, 8i05:D, 8i05:F, 8i07:A, 8i07:B, 8i07:C, 8i07:E, 8i07:D, 8i07:F, 8i08:A, 8i08:B, 8i08:C, 8i08:E, 8i08:D, 8i08:F, 2pan:A, 2pan:B, 2pan:C, 2pan:D, 2pan:E, 2pan:F
20 6lpi:B 539 487 0.1974 0.1967 0.2177 1.01e-15 6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
21 6a50:A 527 475 0.1955 0.1992 0.2211 3.57e-15 6a50:B, 1bfd:A, 5dei:A, 5dei:C, 5dei:D, 5dei:B, 5dgd:A, 5dgt:A, 3f6b:X, 3f6e:X, 2fn3:A, 3fsj:X, 2fwn:A, 3fzn:A, 3fzn:B, 3fzn:D, 3fzn:C, 4gg1:A, 4gm0:A, 4gm1:A, 4gm4:A, 4gp9:A, 4gpe:A, 4jd5:A, 4ju8:A, 4ju9:A, 4jua:A, 4jub:A, 4jub:D, 4jub:B, 4jub:C, 4juc:A, 4juc:C, 4juc:B, 4juc:D, 4jud:X, 4juf:A, 4juf:C, 4juf:B, 4juf:D, 4k9k:A, 4k9l:A, 4k9m:A, 4k9n:A, 4k9n:C, 4k9n:B, 4k9n:D, 4k9o:A, 4k9o:C, 4k9o:B, 4k9o:D, 4k9p:A, 4k9p:C, 4k9p:B, 4k9p:D, 6m2y:A, 6m2z:A, 1mcz:A, 1mcz:B, 1mcz:C, 1mcz:D, 1mcz:E, 1mcz:F, 1mcz:G, 1mcz:H, 1mcz:I, 1mcz:J, 1mcz:K, 1mcz:L, 1mcz:M, 1mcz:N, 1mcz:O, 1mcz:P, 4mpj:A, 4mpp:A, 4mpr:A, 4mq5:A, 4mzx:A, 1pi3:A, 1po7:A, 1q6z:A, 4qel:A, 2v3w:A, 2v3w:C, 2v3w:B, 2v3w:D, 1yno:A
22 6vz8:D 531 465 0.2160 0.2185 0.2495 1.06e-14 6vz8:H, 6vz8:L, 6vz8:P
23 8rph:D 608 509 0.1844 0.1628 0.1945 7.83e-14 8rph:A, 8rph:B, 8rph:C, 8rph:E, 8rpi:A, 8rpi:B, 8rpi:C, 8rpi:D, 8rpi:E, 8rpi:F, 8rpj:A, 8rpj:B, 8rpj:C, 8rpj:E, 8rpj:D, 8rpj:F
24 6xn8:A 540 492 0.2142 0.2130 0.2337 8.30e-14 6xn8:B
25 2ji6:A 559 259 0.1359 0.1306 0.2819 7.56e-12 2c31:A, 2c31:B, 2ji6:B, 2ji7:A, 2ji7:B, 2ji8:A, 2ji8:B, 2ji9:A, 2ji9:B, 2jib:A, 2jib:B
26 2ji6:A 559 100 0.0447 0.0429 0.2400 0.39 2c31:A, 2c31:B, 2ji6:B, 2ji7:A, 2ji7:B, 2ji8:A, 2ji8:B, 2ji9:A, 2ji9:B, 2jib:A, 2jib:B
27 7orx:CCC 531 483 0.1937 0.1959 0.2153 2.70e-11 7orx:AAA, 7orx:BBB, 7orx:DDD
28 1y9d:D 560 483 0.1937 0.1857 0.2153 6.95e-11 1y9d:A, 1y9d:C
29 4fee:A 586 497 0.2030 0.1860 0.2193 1.99e-10 2ez4:A, 2ez4:B, 2ez8:A, 2ez8:B, 2ez9:A, 2ez9:B, 2ezt:A, 2ezt:B, 2ezu:A, 2ezu:B, 4fee:B, 4feg:A, 4feg:B, 6haf:A, 6haf:B, 4kgd:A, 4kgd:B, 1pow:A, 1pow:B, 1pox:A, 1pox:B, 1y9d:B
30 4q9d:B 519 482 0.2048 0.2119 0.2282 1.11e-09 4q9d:A
31 7egv:A 590 488 0.2011 0.1831 0.2213 2.06e-09 7egv:B, 7ehe:A, 7ehe:B
32 6qsi:A 525 486 0.2048 0.2095 0.2263 3.85e-09 6qsi:B
33 5dx6:B 557 479 0.2011 0.1939 0.2255 5.83e-09 5d6r:B, 5d6r:M, 5dx6:A, 1ozf:A, 1ozf:B, 1ozg:A, 1ozg:B, 1ozh:A, 1ozh:B, 1ozh:C, 1ozh:D, 5wdg:A, 5wdg:B
34 2q28:A 550 488 0.2067 0.2018 0.2275 1.49e-08 2q27:A, 2q27:B, 2q28:B, 2q29:A, 2q29:B
35 4d5e:B 587 496 0.2086 0.1908 0.2258 2.05e-08 4d5e:A, 4d5g:A, 4d5g:B, 2pgn:A, 2pgn:B, 2pgo:A, 2pgo:B
36 6u9d:R 416 237 0.1117 0.1442 0.2532 2.24e-08
37 5ahk:A 555 491 0.1844 0.1784 0.2016 3.49e-08 5ahk:B
38 3ey9:A 571 491 0.1881 0.1769 0.2057 4.37e-08 3ey9:B, 3eya:A, 3eya:B, 3eya:C, 3eya:D, 3eya:E, 3eya:F, 3eya:G, 3eya:H, 3eya:I, 3eya:J, 3eya:K, 3eya:L
39 8rph:F 520 101 0.0559 0.0577 0.2970 8.63e-08
40 4qq8:C 569 535 0.2179 0.2056 0.2187 9.06e-07 2ag0:A, 2ag0:B, 2ag0:C, 2ag0:D, 2ag1:A, 2ag1:B, 2ag1:C, 2ag1:D, 3d7k:A, 3d7k:B, 3iae:A, 3iae:B, 3iaf:A, 3iaf:B, 3iaf:C, 3iaf:D, 4qpz:A, 4qpz:B, 4qpz:C, 4qpz:D, 4qpz:E, 4qpz:F, 4qpz:G, 4qpz:H, 4qq8:A, 4qq8:B, 4qq8:D, 2uz1:A, 2uz1:B, 2uz1:C, 2uz1:D
41 7b2e:A 548 497 0.2123 0.2080 0.2294 6.69e-05 7ayg:A, 7ayg:B, 7ayg:C, 7ayg:D, 7ayg:E, 7ayg:F, 7ayg:G, 7ayg:H, 7b2e:B, 7b2e:C, 7b2e:D, 7b2e:E, 7b2e:F, 7b2e:G, 7b2e:H
42 7pt4:B 584 109 0.0540 0.0497 0.2661 1.42e-04 7pt1:A, 7pt1:B, 7pt2:A, 7pt2:B, 7pt3:A, 7pt3:B, 7pt4:A
43 2ihv:A 563 536 0.2272 0.2167 0.2276 1.45e-04 2iht:A, 2iht:B, 2iht:C, 2iht:D, 2ihu:A, 2ihu:B, 2ihu:C, 2ihu:D, 2ihv:B, 2ihv:C, 2ihv:D, 1upa:A, 1upa:B, 1upa:C, 1upa:D, 1upb:A, 1upb:B, 1upb:C, 1upb:D, 1upc:A, 1upc:B, 1upc:C, 1upc:D, 1upc:E, 1upc:F
44 4rji:C 555 495 0.1918 0.1856 0.2081 2.57e-04 4rji:A, 4rji:B, 4rji:D, 4rjj:A, 4rjj:B, 4rjj:C, 4rjj:D, 4rjj:E, 4rjj:F, 4rjj:G, 4rjj:H, 4rjk:A, 4rjk:B, 4rjk:C, 4rjk:D, 4rjk:E, 4rjk:F, 4rjk:G, 4rjk:H
45 2dji:A 590 482 0.1732 0.1576 0.1929 0.15 1v5e:A, 1v5f:A, 1v5g:A
46 351c:A 82 79 0.0391 0.2561 0.2658 1.7 451c:A, 1dvv:A, 2exv:A, 2exv:C, 2pac:A, 3x39:A, 3x39:B
47 7z4g:B 1188 65 0.0354 0.0160 0.2923 3.7 7zo1:B
48 3nzg:D 380 41 0.0261 0.0368 0.3415 4.2 3nzg:A, 3nzg:B, 3nzg:C
49 7x21:B 277 45 0.0223 0.0433 0.2667 5.9 8ijl:B, 8ijm:B, 7x22:B, 7x24:B
50 7epr:B 310 137 0.0596 0.1032 0.2336 6.1 7epr:A, 7epr:C, 7epr:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218