Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SEITLGRYLFERLKQVEVQTIFGLPGDFNLSLLDNIYEVPGMRWAGNANELNAAYAADGYARLKGMSCIITTFGVGELSA
LNGIAGSYAEHVGVLHVVGVPSAKQLLLHHTLGNGDFTVFHRMSSNISETTAMITDINTAPAEIDRCIRTTYVSQRPVYL
GLPANLVDLTVPASLLDTPIDLSLKPNDPEAEEEVIENVLQLIKEAKNPVILADACCSRHDAKAETKKLIDLTQFPAFVT
PMGKGSIDEKHPRFGGVYVGTLSSPAVKEAVESADLVLSVGALLSDFNTGSFSYSYKTKNIVEFHSDYTKIRSATFPGVQ
MKFALQKLLTKVADAAKGYKPVPVPSEPEHNEAVADSTPLKQEWVWTQVGEFLREGDVVITETGTSAFGINQTHFPNNTY
GISQVLWGSIGFTTGATLGAAFAAEEIDPKKRVILFIGDGSLQLTVQEISTMIRWGLKPYLFVLNNDGYTIERLIHGETA
QYNCIQNWQHLELLPTFGAKDYEAVRVSTTGEWNKLTTDEKFQDNTRIRLIEVMLPTMDAPSNLVKQAQLTAATN

The query sequence (length=555) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2vjy:A 562 559 1.0000 0.9875 0.9928 0.0 6efg:E, 6efh:A, 6efh:B, 2vjy:B, 2vjy:C, 2vjy:D, 2vk4:A, 2vk4:B, 2vk4:C, 2vk4:D
2 6efg:D 537 554 0.9658 0.9981 0.9675 0.0 6efg:A, 6efg:B
3 2vk1:A 562 559 0.8649 0.8541 0.8587 0.0 1pvd:A, 1pvd:B, 1pyd:A, 1pyd:B, 1qpb:A, 1qpb:B, 2vk1:B, 2vk1:C, 2vk1:D, 2vk8:A, 2vk8:B, 2vk8:C, 2vk8:D, 2w93:A, 2w93:B, 2w93:C, 2w93:D
4 8hp4:A 540 563 0.6631 0.6815 0.6536 0.0 8hp4:B
5 1ovm:A 535 542 0.3946 0.4093 0.4041 4.29e-117 1ovm:B, 1ovm:C, 1ovm:D
6 2vbf:B 546 558 0.3766 0.3828 0.3746 2.07e-116 2vbf:A, 2vbg:A, 2vbg:B
7 6vgs:BBB 543 558 0.3730 0.3812 0.3710 7.19e-115 6vgs:AAA, 6vgs:CCC, 6vgs:DDD
8 5npu:A 547 561 0.3117 0.3163 0.3084 9.47e-80 5npu:B, 5npu:C, 5npu:D
9 2vbi:A 554 561 0.2991 0.2996 0.2959 5.32e-76 2vbi:B, 2vbi:C, 2vbi:D, 2vbi:E, 2vbi:F, 2vbi:G, 2vbi:H
10 4cok:B 549 564 0.3135 0.3169 0.3085 1.36e-67 4cok:A
11 5euj:E 556 561 0.2973 0.2968 0.2941 1.37e-65 5euj:A, 5euj:B, 5euj:C, 5euj:D, 5euj:F, 5euj:G, 5euj:H, 5euj:I, 5euj:J, 5euj:K, 5euj:L, 5euj:M, 5euj:N, 5euj:O, 5euj:P, 5euj:Q, 5euj:R, 5euj:S, 5euj:T, 5euj:U, 5euj:V, 5euj:W, 5euj:X
12 5tma:A 567 574 0.3153 0.3086 0.3049 1.39e-61 3oe1:A, 3oe1:B, 3oe1:C, 3oe1:D, 5tma:B, 2wva:A, 2wva:B, 2wva:E, 2wva:F, 2wva:V, 2wva:Z, 2wva:X, 2wva:Y, 2wvg:A, 2wvg:B, 2wvg:E, 2wvg:F, 1zpd:A, 1zpd:B, 1zpd:E, 1zpd:F, 4zp1:A, 4zp1:B, 4zp1:C, 4zp1:D
13 2q5l:A 538 549 0.2559 0.2639 0.2587 4.56e-39 2nxw:A, 2nxw:B, 2q5j:A, 2q5j:B, 2q5l:B, 2q5o:A, 2q5o:B, 2q5q:A, 2q5q:B
14 5k2o:A 585 486 0.2216 0.2103 0.2531 1.21e-19 3e9y:A, 3ea4:A, 8et4:A, 8et5:A, 5k3s:A, 5k6q:A, 5k6r:A, 5k6t:A, 7stq:A, 7tzz:A, 7u1d:A, 7u1u:A, 7u25:A, 6u9h:A, 6u9h:B, 6u9h:H, 6u9h:I, 6u9h:L, 6u9h:M, 6u9h:P, 6u9h:Q, 6vz8:E, 6vz8:I, 6vz8:M, 6vz8:Q, 5wj1:A, 1ybh:A, 1yhy:A, 1yhz:A, 1yi0:A, 1yi1:A, 1z8n:A
15 1t9b:A 583 494 0.2180 0.2075 0.2449 3.74e-19 1t9d:B, 1t9d:C
16 8i01:A 594 482 0.2000 0.1869 0.2303 1.68e-18 8beo:A, 8beo:B, 8beo:C, 8beo:E, 8beo:D, 8beo:F, 8i01:B, 8i01:C, 8i01:E, 8i01:D, 8i01:F, 8i05:A, 8i05:B, 8i05:C, 8i05:E, 8i05:D, 8i05:F, 8i07:A, 8i07:B, 8i07:C, 8i07:E, 8i07:D, 8i07:F, 8i08:A, 8i08:B, 8i08:C, 8i08:E, 8i08:D, 8i08:F, 2pan:A, 2pan:B, 2pan:C, 2pan:D, 2pan:E, 2pan:F
17 6u9d:B 607 506 0.2234 0.2043 0.2451 2.12e-18 6bd3:A, 6bd3:B, 6bd9:A, 6bd9:B, 5fem:A, 5fem:B, 5ims:A, 5ims:B, 1jsc:A, 1jsc:B, 1n0h:A, 1n0h:B, 1t9a:A, 1t9a:B, 1t9b:B, 1t9c:A, 1t9c:B, 1t9d:A, 1t9d:D, 6u9d:A, 6u9d:E, 6u9d:F, 6u9d:I, 6u9d:J, 6u9d:M, 6u9d:N, 6u9d:Q, 6u9d:U, 6u9d:V, 5wkc:A, 5wkc:D, 5wkc:B, 5wkc:E
18 6wo1:A 551 493 0.2000 0.2015 0.2252 4.51e-18
19 6lpi:B 539 494 0.1946 0.2004 0.2186 7.75e-18 6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
20 6deq:A 601 505 0.2162 0.1997 0.2376 8.43e-18 6dek:A, 6del:A, 6dem:A, 6den:A, 6deo:A, 6dep:A, 6der:A, 6des:A
21 8rph:D 608 507 0.1820 0.1661 0.1992 5.49e-15 8rph:A, 8rph:B, 8rph:C, 8rph:E, 8rpi:A, 8rpi:B, 8rpi:C, 8rpi:D, 8rpi:E, 8rpi:F, 8rpj:A, 8rpj:B, 8rpj:C, 8rpj:E, 8rpj:D, 8rpj:F
22 6a50:A 527 484 0.1892 0.1992 0.2169 1.08e-14 6a50:B, 1bfd:A, 5dei:A, 5dei:C, 5dei:D, 5dei:B, 5dgd:A, 5dgt:A, 3f6b:X, 3f6e:X, 2fn3:A, 3fsj:X, 2fwn:A, 3fzn:A, 3fzn:B, 3fzn:D, 3fzn:C, 4gg1:A, 4gm0:A, 4gm1:A, 4gm4:A, 4gp9:A, 4gpe:A, 4jd5:A, 4ju8:A, 4ju9:A, 4jua:A, 4jub:A, 4jub:D, 4jub:B, 4jub:C, 4juc:A, 4juc:C, 4juc:B, 4juc:D, 4jud:X, 4juf:A, 4juf:C, 4juf:B, 4juf:D, 4k9k:A, 4k9l:A, 4k9m:A, 4k9n:A, 4k9n:C, 4k9n:B, 4k9n:D, 4k9o:A, 4k9o:C, 4k9o:B, 4k9o:D, 4k9p:A, 4k9p:C, 4k9p:B, 4k9p:D, 6m2y:A, 6m2z:A, 1mcz:A, 1mcz:B, 1mcz:C, 1mcz:D, 1mcz:E, 1mcz:F, 1mcz:G, 1mcz:H, 1mcz:I, 1mcz:J, 1mcz:K, 1mcz:L, 1mcz:M, 1mcz:N, 1mcz:O, 1mcz:P, 4mpj:A, 4mpp:A, 4mpr:A, 4mq5:A, 4mzx:A, 1pi3:A, 1po7:A, 1q6z:A, 4qel:A, 2v3w:A, 2v3w:C, 2v3w:B, 2v3w:D, 1yno:A
23 6vz8:D 531 482 0.2180 0.2279 0.2510 1.61e-13 6vz8:H, 6vz8:L, 6vz8:P
24 6xn8:A 540 503 0.2126 0.2185 0.2346 4.87e-13 6xn8:B
25 4q9d:B 519 488 0.1982 0.2119 0.2254 1.10e-11 4q9d:A
26 7egv:A 590 519 0.2126 0.2000 0.2274 1.30e-11 7egv:B, 7ehe:A, 7ehe:B
27 2ji6:A 559 263 0.1333 0.1324 0.2814 1.46e-11 2c31:A, 2c31:B, 2ji6:B, 2ji7:A, 2ji7:B, 2ji8:A, 2ji8:B, 2ji9:A, 2ji9:B, 2jib:A, 2jib:B
28 2ji6:A 559 100 0.0432 0.0429 0.2400 0.38 2c31:A, 2c31:B, 2ji6:B, 2ji7:A, 2ji7:B, 2ji8:A, 2ji8:B, 2ji9:A, 2ji9:B, 2jib:A, 2jib:B
29 4fee:A 586 506 0.1946 0.1843 0.2134 1.11e-10 2ez4:A, 2ez4:B, 2ez8:A, 2ez8:B, 2ez9:A, 2ez9:B, 2ezt:A, 2ezt:B, 2ezu:A, 2ezu:B, 4fee:B, 4feg:A, 4feg:B, 6haf:A, 6haf:B, 4kgd:A, 4kgd:B, 1pow:A, 1pow:B, 1pox:A, 1pox:B, 1y9d:B
30 4d5e:B 587 334 0.1441 0.1363 0.2395 1.12e-10 4d5e:A, 4d5g:A, 4d5g:B, 2pgn:A, 2pgn:B, 2pgo:A, 2pgo:B
31 7orx:CCC 531 481 0.1802 0.1883 0.2079 3.06e-10 7orx:AAA, 7orx:BBB, 7orx:DDD
32 7pt4:B 584 503 0.1910 0.1815 0.2107 3.85e-10 7pt1:A, 7pt1:B, 7pt2:A, 7pt2:B, 7pt3:A, 7pt3:B, 7pt4:A
33 6qsi:A 525 487 0.1874 0.1981 0.2136 4.53e-10 6qsi:B
34 5ahk:A 555 496 0.1820 0.1820 0.2036 1.38e-09 5ahk:B
35 1y9d:D 560 498 0.1892 0.1875 0.2108 2.93e-09 1y9d:A, 1y9d:C
36 5dx6:B 557 490 0.1964 0.1957 0.2224 3.60e-09 5d6r:B, 5d6r:M, 5dx6:A, 1ozf:A, 1ozf:B, 1ozg:A, 1ozg:B, 1ozh:A, 1ozh:B, 1ozh:C, 1ozh:D, 5wdg:A, 5wdg:B
37 2q28:A 550 493 0.2036 0.2055 0.2292 8.51e-09 2q27:A, 2q27:B, 2q28:B, 2q29:A, 2q29:B
38 3ey9:A 571 498 0.1892 0.1839 0.2108 9.51e-09 3ey9:B, 3eya:A, 3eya:B, 3eya:C, 3eya:D, 3eya:E, 3eya:F, 3eya:G, 3eya:H, 3eya:I, 3eya:J, 3eya:K, 3eya:L
39 6u9d:R 416 303 0.1351 0.1803 0.2475 4.82e-08
40 4qq8:C 569 535 0.2162 0.2109 0.2243 1.06e-07 2ag0:A, 2ag0:B, 2ag0:C, 2ag0:D, 2ag1:A, 2ag1:B, 2ag1:C, 2ag1:D, 3d7k:A, 3d7k:B, 3iae:A, 3iae:B, 3iaf:A, 3iaf:B, 3iaf:C, 3iaf:D, 4qpz:A, 4qpz:B, 4qpz:C, 4qpz:D, 4qpz:E, 4qpz:F, 4qpz:G, 4qpz:H, 4qq8:A, 4qq8:B, 4qq8:D, 2uz1:A, 2uz1:B, 2uz1:C, 2uz1:D
41 8rph:F 520 101 0.0541 0.0577 0.2970 1.18e-07
42 7b2e:A 548 501 0.2072 0.2099 0.2295 1.37e-05 7ayg:A, 7ayg:B, 7ayg:C, 7ayg:D, 7ayg:E, 7ayg:F, 7ayg:G, 7ayg:H, 7b2e:B, 7b2e:C, 7b2e:D, 7b2e:E, 7b2e:F, 7b2e:G, 7b2e:H
43 4rji:C 555 504 0.1946 0.1946 0.2143 1.51e-04 4rji:A, 4rji:B, 4rji:D, 4rjj:A, 4rjj:B, 4rjj:C, 4rjj:D, 4rjj:E, 4rjj:F, 4rjj:G, 4rjj:H, 4rjk:A, 4rjk:B, 4rjk:C, 4rjk:D, 4rjk:E, 4rjk:F, 4rjk:G, 4rjk:H
44 2ihv:A 563 547 0.2234 0.2202 0.2267 0.005 2iht:A, 2iht:B, 2iht:C, 2iht:D, 2ihu:A, 2ihu:B, 2ihu:C, 2ihu:D, 2ihv:B, 2ihv:C, 2ihv:D, 1upa:A, 1upa:B, 1upa:C, 1upa:D, 1upb:A, 1upb:B, 1upb:C, 1upb:D, 1upc:A, 1upc:B, 1upc:C, 1upc:D, 1upc:E, 1upc:F
45 2dji:A 590 492 0.1730 0.1627 0.1951 0.075 1v5e:A, 1v5f:A, 1v5g:A
46 351c:A 82 79 0.0378 0.2561 0.2658 1.5 451c:A, 1dvv:A, 2exv:A, 2exv:C, 2pac:A, 3x39:A, 3x39:B
47 8u8b:A 1712 28 0.0252 0.0082 0.5000 2.3 8u7l:B, 8u7l:A, 8u8a:B, 8u8a:C, 8u8b:B, 2zej:A
48 8fo9:F 2289 28 0.0252 0.0061 0.5000 2.4 9c61:A, 9c61:B, 8fo2:E, 8fo7:C, 8fo8:C, 8fo8:E, 8fo9:E, 7lht:A, 7lht:B, 7lhw:A, 7li3:A, 7li4:A, 6oje:A, 6oje:B, 6ojf:A, 6ojf:B, 7thy:A, 7thz:A, 6xaf:A, 6xaf:B, 2zej:B
49 8tzh:A 1485 27 0.0234 0.0088 0.4815 3.7 3d6t:B
50 3nzg:D 380 41 0.0252 0.0368 0.3415 4.1 3nzg:A, 3nzg:B, 3nzg:C
51 7z4g:B 1188 65 0.0342 0.0160 0.2923 4.6 7zo1:B
52 7x21:B 277 45 0.0216 0.0433 0.2667 5.9 8ijl:B, 8ijm:B, 7x22:B, 7x24:B
53 4rei:A 146 61 0.0342 0.1301 0.3115 7.3
54 5vvj:F 95 46 0.0288 0.1684 0.3478 8.7 5dlj:F, 5dlj:E, 5dqt:F, 5dqt:E, 5dqt:N, 5dqt:M, 5dqu:F, 5dqu:E, 5dqz:F, 5dqz:E, 5ds4:F, 5ds4:E, 5ds5:E, 5ds5:F, 5ds6:E, 5ds6:F, 5vvj:E, 5vvk:E, 5vvk:F, 5vvl:E, 5vvl:F, 5wfe:E, 5wfe:F

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218