Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SEESQAFQRQLTALIGYDVTDVSNVHDDELEFTRRGLVTPRMAEVASRDPKLYAMHPWVTSKPLPEYLWKKIANNCIFIV
IHRSTTSQTIKVSPDDTPGAILQSFDFVLRVCGRDEYLVGETPIKNFQWVRHCLKNGEEIHVVLDTPPDPALDEVRKETV
SLWDCDRKFRVKIRGIDIPVLDLTVFVEANIQHGQQVLCQRRTSPKPFTEEVLWNVWLEFSIKIKDLPKGALLNLQIYCG
KVQLLYYVNLLLIDHRFLLRRGEYVLHMWQISSFNADKLTSATNPDKENSMSISILLDNPIALPKHQVRAEMPNQLRKQL
EAIIATDPLNPLTAEDKELLWHFRYESLKHPKAYPKLFSSVKWGQQEIVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNF
SDENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPYHDSALARFLLKRGLRNKRIGHFLFWFLRSEIAQSRHYQQRFAV
ILEAYLRGCGTAMLHDFTQQVQVIEMLQKVTLDIKSLSAEDVSSQVISQLKQKLENLQNSQLPESFRVPYDPGLKAGALA
IEKCKVMASKKKPLWLEFKCADPTALSNETIGIIFKHGDDLRQDMLILQILRIMESIWETESLDLCLLPYGCISTGDKIG
MIEIVKDATTIAKIQQSTVGNTGAFKDEVLNHWLKEKSPTEEKFQAAVERFVYSCAGYCVATFVLGIGDRHNDNIMITET
GNLFHIDFGHIERVPFVLTPDFLFVMGTSGKKTSPHFQKFQDICVKAYLALRHHTNLLIILFSMMLMTGMPQLTSKEDIE
YIRDALTVGKNEEDAKKYFLDQIEVCRDKGWTVQFNWFL

The query sequence (length=839) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3zw3:A 831 849 0.9726 0.9819 0.9611 0.0 2a4z:A, 4fhj:A, 4fhk:A, 6fh5:A, 6gq7:A, 4hvb:A, 5jha:A, 5jhb:A, 7jwe:A, 4kzc:A, 3lj3:A, 3mjw:A, 3nzu:A, 3p2b:A, 3qk0:A, 3sd5:A, 5t23:A, 6t3b:A, 6t3c:A, 4wwo:A, 4wwp:A, 6xrm:A, 6xrn:A, 3zvv:A
2 1e7u:A 872 865 0.9595 0.9232 0.9306 0.0 4anv:A, 3ibe:A
3 1e8w:A 851 852 0.9523 0.9389 0.9378 0.0 2a5u:A, 4anu:A, 4anw:A, 4anx:A, 4aof:A, 3apc:A, 3apd:A, 3apf:A, 6aud:A, 6c1s:A, 2chw:A, 2chx:A, 2chz:A, 3csf:A, 3cst:A, 3dbs:A, 4dk5:A, 3dpd:A, 1e7v:A, 1e8x:A, 1e8z:A, 1e90:A, 5eds:A, 3ene:A, 4ezj:A, 4ezk:A, 4ezl:A, 4f1s:A, 4fa6:A, 4fad:A, 4fjy:A, 4fjz:A, 4flh:A, 4ful:A, 4g11:A, 5g2n:A, 5g55:A, 4gb9:A, 4hle:A, 4j6i:A, 7jwz:A, 5kae:A, 7kke:A, 4kz0:A, 3l08:A, 3l13:A, 3l16:A, 3l17:A, 3l54:A, 3ml8:A, 3ml9:A, 3nzs:A, 3oaw:A, 5oq4:A, 3pre:A, 3prz:A, 3ps6:A, 4ps3:A, 4ps7:A, 4ps8:A, 3qaq:A, 3qar:A, 3r7q:A, 3r7r:A, 3s2a:A, 8sc8:A, 3t8m:A, 3tjp:A, 3tl5:A, 4urk:A, 2v4l:A, 4wwn:A, 6xrl:A, 4xx5:A, 4xz4:A, 7z61:A
4 8sob:A 1005 903 0.9535 0.7960 0.8859 0.0 8soa:A, 8soc:A
5 7jx0:A 801 841 0.9499 0.9950 0.9477 0.0 3qjz:A
6 8sod:A 941 881 0.8975 0.8002 0.8547 0.0 8soe:A
7 5itd:A 995 910 0.4005 0.3377 0.3692 6.70e-174 5dxh:A, 8ilr:A, 8ils:A, 8ilv:A, 7k6m:A, 7k6o:A, 7r9v:A, 7r9y:A, 8sbc:A, 8sbj:A, 8twy:A, 7tz7:A, 5xgj:A
8 4ykn:A 1205 917 0.3981 0.2772 0.3642 7.89e-169 4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
9 5dxh:D 981 886 0.3886 0.3323 0.3679 9.44e-169 8gua:A, 6oac:A
10 5ubr:A 887 908 0.3909 0.3698 0.3612 5.81e-168 5dxt:A, 7k6n:A
11 5swp:A 1060 944 0.4017 0.3179 0.3570 1.07e-167 6gvh:A, 5swt:A, 8v8u:A, 8v8u:C
12 7k71:A 843 872 0.3850 0.3832 0.3704 3.21e-164 8gud:A
13 4bfr:A 855 878 0.3754 0.3684 0.3588 6.33e-163 4bfr:B
14 2y3a:A 976 895 0.3766 0.3238 0.3531 4.30e-162
15 2wxl:A 823 759 0.3385 0.3451 0.3742 8.32e-155 6gy0:A, 5i4u:A, 5i6u:A, 6mul:A, 6mul:B, 6mum:B, 5ngb:A, 7r26:A, 5t27:A, 5t28:A, 5t2b:A, 5t2d:A, 5t2g:A, 5t2i:A, 5t2m:A, 5t7f:A, 5t7f:B, 5t8i:A, 2wxf:A, 2wxh:A, 2wxi:A, 2wxj:A, 2wxm:A, 2wxn:A, 2wxo:A, 2wxp:A, 2wxq:A, 2x38:A, 4xe0:A
16 6pyu:A 930 864 0.3647 0.3290 0.3542 9.79e-151 8bcy:A, 5dxu:A, 6ftn:A, 7jis:A, 5m6u:A, 6mum:A, 5ncy:A, 5ncz:A, 6ocu:A, 7oi4:AAA, 7oij:AAA, 7oil:AAA, 7ois:AAA, 8s3r:A, 5t2l:A, 5t8f:A, 5ubt:A, 2wxg:A, 2wxk:A
17 7lq1:A 950 872 0.3623 0.3200 0.3486 5.16e-150 5ae8:A, 5ae9:A, 6eyz:A, 6ez6:A, 6g6w:A, 6hi1:A, 6hi2:A, 6hi9:A, 5l72:A, 7lm2:A, 6oco:A, 7pop:A, 7por:A, 7pos:A, 7pot:A, 6pyr:A, 6q6y:A, 6q73:A, 6q74:A, 6tnr:A, 6tns:A, 5vlr:A, 6zaa:A, 6zac:A, 6zad:A
18 5o83:A 794 753 0.3313 0.3501 0.3692 6.10e-146 4ajw:B, 6dgt:A, 5is5:A, 7r2b:A, 4v0i:B
19 4ajw:A 765 750 0.3194 0.3503 0.3573 1.63e-137 4v0i:A
20 7bi6:A 829 758 0.3063 0.3100 0.3391 8.06e-119 8a9i:A, 7bi9:A, 7z74:A, 7z75:A
21 7bi2:A 1021 646 0.2765 0.2272 0.3591 2.82e-113
22 6ykg:AAA 559 544 0.1967 0.2952 0.3033 4.35e-67 5anl:A, 5enn:A, 5enn:B, 6i3u:A, 3ls8:A, 3ls8:B, 4oys:A, 4ph4:B, 7rsj:A, 7rsp:A, 7rsp:B, 7rsv:A, 7rsv:B, 8rxr:A, 8rxr:B, 4uwf:A, 4uwg:A, 4uwh:A, 4uwk:A, 4uwl:A
23 2x6k:A 550 548 0.1931 0.2945 0.2956 1.57e-57 2x6f:A, 2x6f:B, 2x6i:A, 2x6i:B, 2x6j:A, 2x6j:B, 2x6k:B
24 6bq1:E 1510 425 0.1359 0.0755 0.2682 1.97e-34 6bq1:A
25 4d0l:E 479 315 0.1097 0.1921 0.2921 1.62e-28 5c4g:E, 4d0l:A, 4d0l:C, 4d0m:A, 4d0m:C, 4d0m:G, 4d0m:I, 4d0m:M, 4d0m:O, 4d0m:Q, 4d0m:S, 4d0m:W, 4d0m:Y, 4d0m:c, 4d0m:g, 5euq:E, 5fbl:A, 5fbq:A, 5fbr:A, 5fbv:A, 5fbw:A, 6gl3:A, 8q6f:A, 8q6g:A, 8q6h:A, 8vof:A, 4wae:A, 4wag:A
26 7nfe:A 3585 244 0.0739 0.0173 0.2541 9.77e-12
27 7nfc:A 3562 246 0.0739 0.0174 0.2520 1.48e-11 8bh3:S, 8bh3:A, 8bhv:A, 8bhv:F, 8bhy:A, 8bhy:S, 8bot:F, 8bot:S, 7nfc:F
28 5y3r:C 3636 253 0.0739 0.0171 0.2451 8.99e-11
29 7k1k:A 3604 253 0.0739 0.0172 0.2451 9.37e-11 7k1b:A
30 7sgl:A 3852 253 0.0739 0.0161 0.2451 9.75e-11
31 7k0y:A 3669 253 0.0739 0.0169 0.2451 1.00e-10
32 7z87:A 3689 253 0.0739 0.0168 0.2451 1.00e-10
33 7su3:A 3802 253 0.0739 0.0163 0.2451 1.01e-10
34 8eza:L 3720 253 0.0739 0.0167 0.2451 1.02e-10 8eza:C, 7lt3:C, 7lt3:L
35 8bot:A 3528 244 0.0739 0.0176 0.2541 1.05e-10
36 7k1n:A 3634 253 0.0739 0.0171 0.2451 1.06e-10 7z88:A
37 7otm:A 3656 253 0.0739 0.0170 0.2451 1.08e-10 7otp:A, 7otv:A, 7otw:A, 7oty:A
38 7sud:A 3740 253 0.0739 0.0166 0.2451 1.09e-10
39 7k1j:A 3584 253 0.0739 0.0173 0.2451 1.10e-10 7k19:A
40 8ez9:L 3662 253 0.0739 0.0169 0.2451 1.11e-10 8ez9:C
41 7k17:B 3645 253 0.0739 0.0170 0.2451 1.12e-10 7k17:A
42 6zha:A 3707 253 0.0739 0.0167 0.2451 1.13e-10 6zh8:A
43 6zhe:A 3768 253 0.0739 0.0165 0.2451 1.14e-10
44 8ezb:C 3724 253 0.0739 0.0166 0.2451 1.15e-10 8ezb:L
45 6zhe:F 3731 253 0.0739 0.0166 0.2451 1.15e-10
46 6s8f:F 2571 219 0.0691 0.0226 0.2648 3.47e-09 7mq8:NR, 7mq9:NR, 7mqa:NR, 6s8f:H
47 6z2w:E 2325 244 0.0727 0.0262 0.2500 3.70e-08 6z2w:F, 6z2x:E, 6z2x:F, 6z3a:F, 6z3a:E
48 7sic:A 2773 247 0.0727 0.0220 0.2470 3.73e-07 8oxo:A, 8oxo:B, 8oxp:A, 8oxp:B, 7sic:B, 7sid:A, 7sid:C
49 7ni5:A 2791 247 0.0727 0.0219 0.2470 4.07e-07 7ni4:A, 7ni4:B, 7ni5:B, 7ni6:A, 7ni6:B, 8oxq:A, 8oxq:B
50 8oxm:A 2748 247 0.0727 0.0222 0.2470 4.24e-07 8oxm:B
51 3jbz:A 960 322 0.0858 0.0750 0.2236 8.22e-06
52 8rch:A 2036 254 0.0691 0.0285 0.2283 8.97e-06 8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
53 6zwm:B 2185 254 0.0691 0.0265 0.2283 9.27e-06 6zwm:A
54 6bcu:A 2204 254 0.0691 0.0263 0.2283 9.59e-06 6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
55 6skz:A 2638 217 0.0596 0.0190 0.2304 2.76e-05 6sl0:A, 6sl0:B
56 6sl1:A 2652 217 0.0596 0.0189 0.2304 2.81e-05 6sky:A, 6sky:B
57 7pw9:A 1952 251 0.0656 0.0282 0.2191 6.70e-05 7pw4:A, 7pw5:A, 7pw6:A, 7pw7:A, 7pw8:A, 6z3r:A
58 6syt:A 1896 82 0.0262 0.0116 0.2683 0.002
59 1g8x:A 1009 114 0.0322 0.0268 0.2368 2.4 1g8x:B
60 7ljn:A 342 74 0.0238 0.0585 0.2703 2.6 7ljn:B, 7ljn:C, 7ljn:D
61 7u5e:A 501 52 0.0203 0.0339 0.3269 6.2
62 7w1m:D 967 75 0.0274 0.0238 0.3067 6.6 5qsm:A, 5qso:A, 5qsp:A, 5qsq:A, 5qsr:A, 5qss:A, 5qst:C, 5qsu:C, 5qsv:D, 5qsw:C, 5qsw:D, 5qsx:C, 5qsx:D, 5qsz:A, 6rrc:C, 6rrc:A
63 7u5d:A 630 52 0.0203 0.0270 0.3269 6.9
64 4ej6:A 343 70 0.0215 0.0525 0.2571 7.0 4ejm:A
65 6wg3:D 932 75 0.0274 0.0247 0.3067 7.1 5qsn:B, 5qsq:B, 5qsr:B, 5qsy:B, 6rrk:A, 6rrk:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218