Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SDLIPAPPLSKVPLQQNFQDNQFQGKWYVVGLAGNAILREDKDPQKMYATIYELKEDKSYNVTSVLFRKKKCDYAIATFV
PGSQPGEFTLGNIKSYPGLTSYLVRVVSTNYNQHAMVFFKKVSQNREYFKITLYGRTKELTSELKENFIRFSKSLGLPEN
HIVFPVPIDQCIDG

The query sequence (length=174) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6qmu:A 184 174 0.9598 0.9076 0.9598 2.83e-124 3by0:A, 3by0:B, 3by0:C, 3cbc:A, 3cbc:B, 3cbc:C, 3cmp:A, 3cmp:B, 3cmp:C, 1dfv:A, 1dfv:B, 3fw4:A, 3fw4:C, 3fw5:A, 3fw5:B, 3fw5:C, 3hwe:A, 3hwe:B, 3hwe:C, 3hwf:A, 3hwf:B, 3hwf:C, 3hwg:A, 3hwg:B, 3hwg:C, 3i0a:A, 3i0a:B, 3i0a:C, 4k19:A, 4k19:B, 4k19:C, 3k3l:A, 3k3l:C, 5khp:A, 5khp:B, 5khp:C, 5kic:A, 5kic:B, 5kic:C, 5kid:A, 5kid:B, 5kid:C, 1l6m:A, 1l6m:B, 1l6m:C, 4mvi:A, 4mvk:A, 4mvl:A, 4mvl:B, 4mvl:C, 4mvl:D, 3pec:C, 3ped:A, 3ped:B, 3ped:C, 6qmu:B, 3t1d:A, 3t1d:B, 3t1d:C, 3tf6:A, 3tf6:B, 3tf6:C, 3tzs:A, 3tzs:B, 3tzs:C, 3u0d:A, 3u0d:B, 3u0d:C, 3u0d:D, 8uyn:A, 8uyn:B, 8uyn:C, 8uz9:A, 8uz9:B, 8uz9:C, 1x71:A, 1x71:B, 1x71:C, 1x89:A, 1x89:B, 1x89:C, 1x8u:A, 1x8u:B, 1x8u:C, 4zfx:A, 4zfx:C, 4zhc:A, 4zhc:B, 4zhc:C, 4zhd:A, 4zhd:B, 4zhd:C, 4zhf:A, 4zhf:B, 4zhf:C, 4zhf:D, 4zhf:E, 4zhf:F, 4zhg:A, 4zhg:B, 4zhg:C, 4zhg:D, 4zhg:E, 4zhg:F, 4zhh:A, 4zhh:B, 4zhh:C, 4zhh:D, 4zhh:E, 4zhh:F
2 4iaw:A 180 174 0.8736 0.8444 0.8736 1.61e-111 3dsz:A, 3dsz:B, 4iaw:B, 4iaw:C, 4iax:A
3 6z2c:A 178 174 0.8851 0.8652 0.8851 3.50e-110 6z2c:B, 6z2c:C
4 4qae:B 175 174 0.8563 0.8514 0.8563 5.90e-109 4qae:A, 4qae:C, 4qae:D, 4qae:F, 4qae:E
5 6gr0:A 173 173 0.8563 0.8613 0.8613 3.84e-107 6gr0:B, 6gr0:C
6 5nkn:A 172 172 0.8563 0.8663 0.8663 1.20e-106 6z6z:A
7 2ktd:A 167 161 0.3333 0.3473 0.3602 6.46e-25
8 4imo:A 155 155 0.3103 0.3484 0.3484 1.04e-23
9 8aej:A 160 157 0.2011 0.2188 0.2229 2.30e-09
10 2a2g:A 158 161 0.2126 0.2342 0.2298 2.59e-07 2a2g:B, 2a2g:C, 2a2g:D
11 2kt4:B 157 124 0.2299 0.2548 0.3226 8.04e-07 2lbv:A
12 3sao:A 150 123 0.1954 0.2267 0.2764 4.74e-05 3sao:B
13 3kff:A 152 153 0.1609 0.1842 0.1830 5.25e-05 3kfg:A, 3kfh:A, 3kfi:A
14 1gm6:A 158 164 0.2011 0.2215 0.2134 6.51e-05
15 2dm5:A 157 157 0.1839 0.2038 0.2038 2.37e-04 1i05:A, 1jv4:A, 2nnd:A, 1qy1:A, 1qy2:A, 1yp6:A, 1znd:A, 1zne:A, 1zng:A, 1znh:A, 1znl:A
16 2qos:C 173 161 0.1897 0.1908 0.2050 0.001 2ovd:A
17 1epb:B 164 150 0.1954 0.2073 0.2267 0.004 1epb:A
18 1iiu:A 174 124 0.1609 0.1609 0.2258 0.088
19 1qab:E 180 127 0.1494 0.1444 0.2047 0.12 1qab:F
20 1fem:A 176 126 0.1437 0.1420 0.1984 0.71 1aqb:A, 1brp:A, 3bsz:E, 3bsz:F, 1erb:A, 1fel:A, 1fen:A, 3fmz:A, 3fmz:B, 1hbp:A, 1kt3:A, 1kt4:A, 1kt5:A, 1kt6:A, 1kt7:A, 5nu7:A, 5nua:A, 5nub:A, 4o9s:A, 4o9s:B, 4psq:B, 4psq:A, 6qba:A, 1rbp:A, 1rlb:E, 1rlb:F, 2wr6:A
21 7kcv:A 362 81 0.1322 0.0635 0.2840 0.99 6c39:A, 6dz8:A, 6dz8:B, 3hum:A, 3hum:B, 3hun:A, 3hun:B, 7kcw:A, 7kcx:A, 7kcy:A, 5tw4:A, 5tw4:B, 5tw8:A, 5tw8:B, 5tx9:A, 5tx9:B, 5txi:A, 5txi:B, 5ty2:A, 5ty2:B, 5ty7:A, 5ty7:B
22 7byv:A 428 40 0.0862 0.0350 0.3750 2.1 7bys:A, 7bys:B, 7byt:A, 7byx:A, 7byx:B, 7byx:C, 7byx:D
23 8cff:A 823 46 0.0805 0.0170 0.3043 4.8 8cff:C, 8cff:E, 8cff:G, 8cgs:A, 8cgs:C, 8cgs:E, 8cgs:G, 8ch9:A, 8ch9:C, 8ch9:E, 8ch9:G, 1g8j:A, 1g8j:C, 1g8k:A, 1g8k:C, 1g8k:E, 1g8k:G
24 1bso:A 162 136 0.1552 0.1667 0.1985 5.5 1b0o:A, 7bf7:AAA, 7bf8:BBB, 7bf9:AAA, 4dq3:A, 4dq4:A, 7er3:A, 7er3:B, 7er3:C, 7er3:D, 6ge7:A, 6gf9:A, 6gfs:A, 6ghh:A, 2gj5:A, 4gny:A, 1gx8:A, 1gx9:A, 1gxa:A, 4ib6:A, 4ib7:A, 4ib8:A, 4ib9:A, 4iba:A, 4kii:A, 7kot:A, 7kp5:AA1, 7kp5:BA1, 5lke:A, 5lkf:A, 4lzu:A, 4lzv:A, 6nkq:B, 3nq9:A, 5nuj:A, 5nuk:A, 5num:A, 5nun:A, 4omw:C, 4omw:D, 4omx:A, 7q19:AAA, 7q2n:AAA, 7q2n:BBB, 7q2o:AAA, 7q2o:BBB, 7q2p:AAA, 7q2p:BBB, 6t42:AAA, 6t44:AAA, 6t44:BBB, 3uew:A, 7wql:A, 7wql:B, 4y0p:A, 4y0q:A, 4y0r:A, 4y0s:A, 5y5c:A, 5y5c:B, 7z9z:AAA, 7za0:AAA, 7zcd:AAA
25 2hzq:A 166 18 0.0460 0.0482 0.4444 5.6
26 8i9t:CO 62 55 0.0805 0.2258 0.2545 5.8 8i9v:CO, 8i9w:CO, 8i9x:CO, 8i9y:CO, 8i9z:CO, 8ia0:CO, 8pv1:CO, 8pv2:CO, 8pv3:CO, 8pv4:CO, 8pv5:CO, 8pv6:CO, 8pv7:CO, 8pv8:CO, 8pvk:CO, 8pvl:CO
27 6d6j:B 113 32 0.0690 0.1062 0.3750 6.5 6d6j:A
28 4dq5:A 164 37 0.0575 0.0610 0.2703 6.6 4dq5:B, 4dqj:A
29 4dn1:A 389 77 0.1149 0.0514 0.2597 7.1 4dn1:B
30 2ra6:C 143 60 0.0862 0.1049 0.2500 8.7 2r74:A, 2r74:B, 2ra6:A, 2ra6:B, 2ra6:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218