BioLiP

>protein
SCIFCKIIKGEIPSFKLIETAKTYSFLDIQPIAEAHVLIIPKHHGAKLHNIPDDYLSDILPVVKKLTKVLKLDENNTPEG
EGYNVLQNNGRIAHQVVDHVHFHLIPKKDEATGLGVGWPAEATDFDKLGKLHEKLKEELAKVDE

The query sequence (length=144) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6iq1:B	145	143	0.9931	0.9862	1.0000	1.62e-102	6iq1:A, 6iq1:C, 6iq1:D
2	3ksv:A	141	143	0.4375	0.4468	0.4406	1.67e-39
3	1y23:B	141	143	0.3403	0.3475	0.3427	3.58e-24	1y23:A, 1y23:C, 1y23:D, 1y23:E
4	3imi:A	143	125	0.3264	0.3287	0.3760	1.11e-23	3imi:B, 3imi:C, 3imi:D
5	3l7x:A	157	140	0.3056	0.2803	0.3143	2.13e-21
6	3o0m:A	139	109	0.2222	0.2302	0.2936	1.12e-19	3o0m:B
7	3oxk:A	115	111	0.3264	0.4087	0.4234	1.43e-19	3oj7:A, 3omf:A
8	4egu:A	118	110	0.2986	0.3644	0.3909	3.11e-19	4egu:B
9	3r6f:A	130	123	0.2917	0.3231	0.3415	3.79e-18
10	6d6j:B	113	122	0.3125	0.3982	0.3689	2.43e-17	6d6j:A
11	5uvm:A	115	109	0.2847	0.3565	0.3761	1.67e-15	5uvm:B
12	4zgl:F	102	103	0.2500	0.3529	0.3495	4.09e-15	4zgl:B, 4zgl:C, 4zgl:H, 4zgl:I
13	2eo4:A	149	105	0.2500	0.2416	0.3429	1.29e-14
14	6yqm:AAA	117	120	0.2847	0.3504	0.3417	2.32e-11	1av5:B, 6b42:A, 5ed3:B, 5ed6:B, 5emt:A, 5emt:B, 4eqe:B, 4eqg:B, 4eqh:B, 5i2e:A, 5i2e:B, 5i2f:A, 5ipc:A, 5ipd:A, 5ipe:A, 6j53:B, 6j58:B, 6j5s:B, 6j5z:A, 6j5z:D, 6j64:B, 6j65:B, 6j65:E, 5kly:A, 5kly:B, 5klz:B, 5km0:A, 5km0:D, 5km1:A, 5km2:A, 5km3:A, 5km4:A, 5km6:A, 5kma:A, 5kmb:A, 5kmb:B, 5kmc:A, 1kpe:B, 1kpf:A, 6n3v:A, 6n3w:A, 6n3x:A, 6n3y:A, 6n3y:B, 3o1c:A, 3o1x:A, 5o8i:B, 8p8p:A, 8pa6:A, 8pa6:B, 8pa9:A, 8paf:A, 8paf:B, 8pai:A, 8pwk:A, 3qgz:A, 3rhn:A, 4rhn:A, 5rhn:A, 1rzy:A, 3tw2:A, 5wa8:A, 5wa9:A, 4zkl:B, 4zkl:D
15	4ini:B	112	121	0.2361	0.3036	0.2810	1.11e-08	4ini:A, 5km5:B, 5km8:B, 5km9:B, 6yvp:AAA, 6yvp:BBB
16	2fit:A	130	106	0.1667	0.1846	0.2264	6.97e-07	1fhi:A, 2fhi:A, 1fit:A, 3fit:A, 5fit:A, 6fit:A, 7p8p:A, 7p8p:C
17	3n1s:J	119	107	0.2222	0.2689	0.2991	5.93e-06	3n1s:A, 3n1s:B, 3n1s:E, 3n1s:F, 3n1s:I, 3n1s:M, 3n1s:N, 3n1t:A, 3n1t:B, 3n1t:E, 3n1t:F
18	7p8p:B	147	125	0.1875	0.1837	0.2160	6.69e-06	7p8p:D
19	3ano:A	158	85	0.1458	0.1329	0.2471	4.70e-05
20	3ano:B	175	85	0.1458	0.1200	0.2471	5.47e-05
21	5cs2:A	147	92	0.1528	0.1497	0.2391	5.47e-04
22	7p6u:A	772	41	0.1042	0.0194	0.3659	0.64	7p6u:B, 7p6u:C, 7p6u:D, 7p6u:E
23	1gup:A	347	68	0.1319	0.0548	0.2794	0.65	1gup:B, 1gup:C, 1gup:D, 1guq:A, 1guq:B, 1guq:C, 1guq:D, 1hxp:A, 1hxp:B, 1hxq:A, 1hxq:B
24	3ieu:A	293	45	0.1111	0.0546	0.3556	1.6	3ieu:B
25	2h39:B	313	97	0.1389	0.0639	0.2062	3.9	2h39:A, 2q4h:A, 2q4h:B, 2q4l:A, 2q4l:B, 1z84:A, 1z84:B, 1zwj:A, 1zwj:B
26	7te2:A	205	62	0.1181	0.0829	0.2742	4.4
27	2is4:B	632	48	0.1181	0.0269	0.3542	4.4
28	2is6:A	654	48	0.1181	0.0260	0.3542	4.4	2is1:A, 2is1:B, 2is2:A, 2is2:B, 2is4:A, 2is6:B
29	5hzd:A	476	23	0.0764	0.0231	0.4783	5.5	5i49:A, 5ido:A
30	3h0l:A	478	51	0.1181	0.0356	0.3333	9.8	3h0l:D, 3h0l:G, 3h0l:J, 3h0l:M, 3h0l:P, 3h0l:S, 3h0l:V, 3h0m:A, 3h0m:D, 3h0m:G, 3h0m:J, 3h0m:M, 3h0m:P, 3h0m:S, 3h0m:V, 3h0r:A, 3h0r:D, 3h0r:G, 3h0r:J, 3h0r:M, 3h0r:P, 3h0r:S, 3h0r:V

[Back]