BioLiP

>protein
SAWPEEKNYHQPAILNSSALRQIAEGTSISEMWQNDLQPLLIERYPGSPGSYAARQHIMQRIQRLQADWVLEIDTFLSQT
PEGERSFSNIISTLNPTAKRHLVLACHYDSKYFSHWNNRVFVGATDSAVPCAMMLELARALDKKLLSLKTDSKPDLSLQL
IFFDGEEAFLHWSPQDSLYGSRHLAAKMASTPHPPGARGTSQLHGMDLLVLLDLIGAPNPTFPNFFPNSARWFERLQAIE
HELHELGLLKDHSLEGRYFQNYSYGGVIQDDHIPFLRRGVPVLHLIPSPFPEVWHTMDDNEENLDESTIDNLNKILQVFV
LEYLHL

The query sequence (length=326) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6yi1:A	329	327	0.9908	0.9818	0.9878	0.0	2afm:A, 2afm:B, 2afo:A, 2afo:B, 2afs:A, 2afs:B, 2afu:A, 2afu:B, 2afw:A, 2afw:B, 2afx:A, 2afx:B, 2afz:A, 2afz:B, 7cm0:A, 7cm0:B, 7cm0:C, 7cm0:D, 7coz:A, 7coz:B, 7coz:C, 7cp0:A, 7cp0:B, 7cp0:C, 7d8e:A, 7d8e:B, 7d8e:C, 9fxh:A, 9fxh:B, 9fxh:C, 9fxi:A, 9fxi:B, 9fxi:C, 9fxj:A, 9fxj:B, 9fxj:C, 6gbx:A, 6gbx:B, 6gbx:C, 8hy3:A, 3pbb:A, 3pbb:B, 3pbe:A, 3pbe:B, 3si0:A, 8xgb:B, 8xgt:B, 8xgt:A, 8xgt:C, 8xgt:D, 8xgt:E, 8xgt:F, 8xgt:G, 8xgt:H, 8xgt:I, 8xgt:J, 8xgt:K, 8xgt:L, 8xgy:B, 8xgy:E, 8xgy:A, 8xgy:D, 8xgy:C, 8xgy:K, 8xgy:F, 8xgy:I, 8xgy:G, 8xgy:H, 8xgy:J, 8xgy:L, 6yi1:B, 6yjy:A, 6yjy:B, 4yu9:A, 4yu9:B, 4yu9:C, 4ywy:A, 4ywy:B, 4ywy:C, 2zed:A, 2zed:B, 2zee:A, 2zee:B, 2zef:A, 2zef:B, 2zeg:A, 2zeg:B, 2zeh:A, 2zeh:B, 2zel:A, 2zel:B, 2zem:A, 2zem:B, 2zen:A, 2zen:B, 2zeo:A, 2zeo:B, 2zep:A, 2zep:B
2	3si1:A	323	325	0.8436	0.8514	0.8462	0.0	3si2:A
3	3pb6:X	313	312	0.4969	0.5176	0.5192	1.84e-101	3pb4:X, 3pb7:X, 3pb8:X, 3pb9:X, 8xfv:X, 8xfv:A, 8xfv:B, 8xfv:C, 8xfv:D, 8xfv:E, 8xfv:F, 8xfv:G, 8xfv:H, 8xfv:I, 8xfv:J, 8xga:A, 8xga:B, 8xga:C, 8xga:D, 8xga:E, 8xga:F, 8xga:G, 8xga:H, 8xga:I, 8xga:J, 8xga:K
4	4fai:B	305	290	0.4448	0.4754	0.5000	3.75e-87	4fai:A, 4fbe:A, 4fbe:B
5	7d21:A	328	300	0.4540	0.4512	0.4933	5.59e-86	7d1h:A, 7d1n:A, 7d1y:A, 7d2d:A, 7d2i:A, 7d2j:A, 4mhn:A, 4mhy:A, 4mhz:A
6	4f9v:A	307	305	0.3957	0.4202	0.4230	1.49e-71	4f9u:B, 4f9u:A, 4f9v:B, 4fwu:A
7	7d17:A	321	302	0.3742	0.3801	0.4040	3.41e-57
8	7d18:A	293	273	0.2546	0.2833	0.3040	2.74e-25
9	3tc8:A	293	303	0.2239	0.2491	0.2409	8.09e-16	3tc8:B
10	6qro:A	291	258	0.2270	0.2543	0.2868	1.02e-14	6qro:B, 6qro:C, 6qro:D
11	7cje:C	289	249	0.1810	0.2042	0.2369	9.45e-14	7cje:A, 7cjg:A, 7cjg:B, 6qql:A, 6qql:B
12	7d1d:A	294	260	0.1933	0.2143	0.2423	2.71e-09	7d1e:A, 4fuu:A
13	7d1b:A	302	289	0.1902	0.2053	0.2145	5.78e-07
14	2ek8:A	412	239	0.1718	0.1359	0.2343	1.01e-06	2ek9:A, 5ib9:A
15	6hc6:C	408	105	0.0951	0.0760	0.2952	0.022	6hc6:A, 6hc6:B, 6hc7:A, 6hc7:B, 6hc7:C
16	6m13:b	688	61	0.0675	0.0320	0.3607	0.27	7dsy:a, 7dsy:b, 7dts:a, 7dts:b, 7elw:a, 7elw:b, 6m11:a, 6m11:b, 6m12:a, 6m12:b, 6m13:a, 4o1o:A, 4o1o:B, 4o1o:C, 4o1o:D, 4o1p:A, 4o1p:B, 4o1p:C, 4o1p:D
17	4fn5:A	670	64	0.0552	0.0269	0.2812	0.66
18	3d46:A	405	53	0.0521	0.0420	0.3208	1.0	3box:A, 3box:B, 3cxo:A, 3cxo:B, 3d46:B, 3d46:C, 3d46:D, 3d46:E, 3d46:F, 3d46:G, 3d46:H, 3d47:A, 3d47:B, 3d47:C, 3d47:D, 3d47:E, 3d47:F, 3d47:G, 3d47:H, 2gsh:A, 2gsh:B
19	9eut:A	728	84	0.0798	0.0357	0.3095	1.3	3c2w:A, 3c2w:B, 3c2w:C, 3c2w:D, 3c2w:E, 3c2w:F, 3c2w:G, 3c2w:H, 9eut:B, 9euy:A, 9euy:B, 3g6o:A, 3g6o:B, 3ibr:A, 3ibr:B, 3nhq:A, 3nhq:B, 3nhq:C, 3nhq:D, 3nhq:E, 3nhq:F, 3nhq:G, 3nhq:H, 3nop:C, 3not:C, 3nou:C
20	1f2o:A	277	297	0.1840	0.2166	0.2020	2.4	1cp7:A, 1f2p:A, 1qq9:A, 1tf8:A, 1tf9:A, 1tkf:A, 1tkh:A, 1tkj:A, 1xbu:A, 1xjo:A
21	3pmd:A	153	47	0.0429	0.0915	0.2979	5.6
22	3a2k:A	462	45	0.0460	0.0325	0.3333	6.5	3a2k:B
23	6xtv:B	290	90	0.0736	0.0828	0.2667	9.7

[Back]