BioLiP

>protein
SAVMNVMVQAAMKAGRSLVRDYGEVQNLQVSLKGPADYVSQADRKAEKIIFNELSKARPKFGFLMEESEEIIGEDSQHRF
IVDPLDGTTNFLHGIPFFAVSIALESQGKIVAGVIYNPINDELFTAERGSGAFFNDRRCRVSARRRLEDCVIATGMPHLP
GHGTYLIELRNVMAEVSGIRRFGTAALDLAYVAAGRTDGFWEDNLQIWDMAAGILMVREAGGFVTDKEGGNDIFRKKNII
AGNEHIRIKLERALKKGI

The query sequence (length=258) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3lv0:A	258	258	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3luz:A, 3lv0:B
2	3luz:B	234	256	0.8992	0.9915	0.9062	1.68e-163
3	8wdq:A	273	247	0.4264	0.4029	0.4453	5.12e-68	8wdq:B
4	6ib8:B	270	246	0.4186	0.4000	0.4390	1.61e-67	6ib7:A, 6ib8:A, 2qfl:A, 6tqn:T, 6tqn:S, 6tqo:T, 6tqo:S
5	2p3n:A	256	240	0.3527	0.3555	0.3792	2.63e-45	2p3n:B, 2p3n:C, 2p3n:D
6	2bji:A	274	262	0.3295	0.3102	0.3244	2.11e-41	2bji:B
7	6giu:A	275	263	0.3527	0.3309	0.3460	3.32e-41	4as4:A, 4as4:B, 1awb:A, 1awb:B, 6giu:B, 6gj0:A, 6gj0:B, 2hhm:A, 2hhm:B, 1ima:A, 1ima:B, 1imb:A, 1imb:B, 1imc:A, 1imc:B, 1imd:A, 1imd:B, 1ime:A, 1ime:B, 6zk0:AAA, 6zk0:BBB
8	4as5:A	274	265	0.3411	0.3212	0.3321	3.43e-39	4as5:B, 4as5:C, 4as5:D
9	2czi:A	259	253	0.3101	0.3089	0.3162	2.08e-38	2czh:B
10	5dw8:A	260	189	0.2248	0.2231	0.3069	3.64e-21	5dw8:B, 5j16:A, 5j16:B, 5j16:C, 5j16:D
11	1dk4:A	252	166	0.1977	0.2024	0.3072	1.52e-19	1dk4:B, 1g0h:A, 1g0h:B, 1g0i:A, 1g0i:B
12	5zon:A	256	214	0.2713	0.2734	0.3271	1.42e-17	5yht:A, 5yht:B, 5zon:B, 5zon:C, 5zon:D
13	6b5z:A	252	227	0.2713	0.2778	0.3084	2.20e-16	6b5z:B, 6b60:A, 6b60:B, 6b61:A, 6b61:B, 6b62:A, 6b62:B, 6b63:A, 6b63:B, 6b64:A, 6b64:B, 6b65:A, 6b65:B, 6b66:A, 6b66:B, 1lbx:A, 1lbx:B, 1lby:A, 1lby:B, 1lbz:A, 1lbz:B
14	5eq9:B	260	228	0.2326	0.2308	0.2632	1.89e-13	5eq8:A, 5eq9:A, 5eq9:C, 5eq9:D, 5t3j:A
15	5eyg:B	265	180	0.1860	0.1811	0.2667	2.64e-13	5eyg:A, 5eyh:A, 5eyh:B, 5f24:A, 5f24:B, 4g61:A, 4g61:B, 4i3e:A, 4i3e:B, 4i3y:A, 4i3y:B, 4i40:A, 4i40:B, 4ptk:A, 4ptk:B, 3ryd:A, 3ryd:C
16	8f9y:A	352	226	0.2558	0.1875	0.2920	2.01e-08
17	4hxv:A	317	186	0.2132	0.1735	0.2957	1.13e-06	4o7i:A
18	2wef:A	303	109	0.1395	0.1188	0.3303	9.01e-05	1jp4:A
19	1k9y:A	354	179	0.1938	0.1412	0.2793	3.06e-04	1k9z:A, 1ka0:A, 1ka1:A, 1qgx:A
20	5djj:A	257	78	0.1008	0.1012	0.3333	3.41e-04	5djg:A, 5djh:A, 5dji:A, 5djk:A
21	4qxd:B	289	256	0.2093	0.1869	0.2109	3.66e-04	4qxd:A
22	6jsj:A	625	35	0.0620	0.0256	0.4571	2.6	6jsj:B, 6jsj:C
23	4iok:A	557	163	0.1550	0.0718	0.2454	3.1	1fp7:A, 1fpm:A, 1fpm:B, 4iok:B, 4iol:A, 4iol:B, 4jjz:A, 4jjz:B, 4jki:A, 3qus:A, 3qus:B
24	4esa:A	142	75	0.0814	0.1479	0.2800	5.2	4esa:C, 6rp5:A
25	7xzo:C	561	88	0.0969	0.0446	0.2841	8.7	7xzo:A, 7xzo:B, 7xzo:D, 7xzp:A, 7xzp:B
26	2uz3:B	207	42	0.0543	0.0676	0.3333	9.1	2b8t:A, 2b8t:B, 2b8t:C, 2b8t:D, 2uz3:A, 2uz3:C, 2uz3:D

[Back]